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真核mRNA3′非翻译区在基因表达中的作用 被引量：10
1
作者 石统东 吴玉章 朱锡华 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1998年第3期195-196,共2页
真核生物ｍＲＮＡ的３′非翻译区（３′ＵＴＲ）在基因表达调控中发挥重要作用．它不仅调控ｍＲＮＡ在体内的稳定性和降解速率，控制着ｍＲＮＡ的利用效率，还参与ｍＲＮＡ翻译过程的调控．
关键词 真核生物 MRNA 3'非翻译区 基因表达调控
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我国新分离盖塔病毒的部分基因组分子特征研究 被引量：12
2
作者 陈维欣 王环宇 +7 位作者 付士红 李铭华 刘桂芳 姜红月 王力华 王海岩 王志玉 梁国栋 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期399-404,共6页
目的 通过分子生物学方法研究我国山东省2008年分离的盖塔病毒（DY0824）基因组分子生物学特征.方法 应用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）扩增出结构区基因和3＇ UTR片段,连接到载体中进行序列测定,然后用Clustal X1.83和MegaAlign软件对... 目的 通过分子生物学方法研究我国山东省2008年分离的盖塔病毒（DY0824）基因组分子生物学特征.方法 应用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）扩增出结构区基因和3＇ UTR片段,连接到载体中进行序列测定,然后用Clustal X1.83和MegaAlign软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用Mega4软件绘制系统发生树.结果 DY0824病毒株衣壳蛋白由804个核苷酸组成,编码268个氨基酸,与国内外其他分离株的核苷酸同源性为95.4%～99.9%,氨基酸同源性为97.4%～100%.E2蛋白全长1266个核苷酸,编码422个氨基酸,与其他株的核苷酸同源性为94.8%～99.5%,氨基酸同源性为97.6%～100%.该病毒3＇ UTR由401个核苷酸组成,存在3个重复序列.结论 山东省新分离盖塔病毒衣壳蛋白和E蛋白基国与该病毒原型分离株相比分别存在7个和10个氨基酸差异位点,病毒3＇UTR区域存在多个核苷酸差异位点. 展开更多
关键词 盖塔病毒 衣壳蛋白基因 E2蛋白基因 3’非翻译区 核苷酸序列
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豌豆肌动蛋白异型体基因的特异性表达 被引量：9
3
作者 凌毅 赵武玲 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2001年第1期76-80,共5页
将分属三类豌豆 (Pisumsativum)卷须肌动蛋白异型体 (PEAc)的基因 3’端进行了亚克隆 ,并利用限制性内切酶从中切取了完整的 3’非翻译区片段 ,将之做为特异性探针进行DIG标记 ,并对不同发育时间豌豆根、茎、叶及花粉中提取的总RNA进行... 将分属三类豌豆 (Pisumsativum)卷须肌动蛋白异型体 (PEAc)的基因 3’端进行了亚克隆 ,并利用限制性内切酶从中切取了完整的 3’非翻译区片段 ,将之做为特异性探针进行DIG标记 ,并对不同发育时间豌豆根、茎、叶及花粉中提取的总RNA进行点杂交分析。发现其中I类 (PEAcI)和II类 (PEAcII)在根、茎、叶中都有表达 ,但存在发育时间上的表达特异性 ,尤其在叶中的差异较明显。而III类 (PEAcIII)与前二者的差别更大 ,仅发现其在 2d及 2 8d的根、7d的茎及 1 8d的叶中有表达。在花粉中 ,只有PEAcII有少量的表达 ,说明三类异型体基因的表达还存在组织特异性。 展开更多
关键词 肌动蛋白基因 异型体 3'非翻译区 特异性表达 豌豆
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microRNA与mRNA不同位点结合后的生物学效应研究进展 被引量：10
4
作者 伍华东 丁颖 徐广峰 《山东医药》 CAS 北大核心 2017年第30期111-113,共3页
microRNA(miRNA)是一类单链非编码小RNA,主要参与功能基因的转录后调控,具有广泛、多样的生物功能,在真核生物体内对基因表达具有重要的调控作用。miRNA既可以抑制编码基因mRNA的表达,又可以激活mRNA的作用;既可以在细胞质中作用于mRNA... microRNA(miRNA)是一类单链非编码小RNA,主要参与功能基因的转录后调控,具有广泛、多样的生物功能,在真核生物体内对基因表达具有重要的调控作用。miRNA既可以抑制编码基因mRNA的表达,又可以激活mRNA的作用;既可以在细胞质中作用于mRNA的不同区域,也可以返回细胞核中发挥重要的生物学功能;同一个miRNA不一定只是一种作用模式,它可以同时作用于3'UTR、5'UTR和ORF区域。在细胞质中,miRNA通过与mRNA 3个区域中存在的识别位点互补配对并结合一些辅助蛋白发挥作用;在细胞核中,miRNA通过与lncRNA的相互作用起到调节基因功能的作用;miRNA还可与DNA的启动子序列相结合,诱导基因转录与翻译。 展开更多
关键词 MICRORNA 3'非翻译区 5'非翻译区 启动子 开放阅读框
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回复系RR中一种与回复相关的蛋白表达增强 被引量：6
5
作者 刘定干 李载平 +1 位作者 审良静男 岸本忠三 《中国科学（B辑）》 CSCD 北大核心 1995年第4期372-378,共7页
发现前文所述的质粒p14-6的插入片段是人白介素6转录因子NF-IL6的3＇非翻译区(3'-UTR);在含有整合入基因组DNA的p14-6质粒的回复突变细胞系RR中,该3'-UTR被高转录,同时一组专一结合于该3'-UTR的蛋白因子BNF的表达量显著增加... 发现前文所述的质粒p14-6的插入片段是人白介素6转录因子NF-IL6的3＇非翻译区(3'-UTR);在含有整合入基因组DNA的p14-6质粒的回复突变细胞系RR中,该3'-UTR被高转录,同时一组专一结合于该3'-UTR的蛋白因子BNF的表达量显著增加,其高表达明显地与细胞恶性表型的逆转相关,对BNF的性质和高表达的原因进行了讨论,并提出关于RR回变机制的假说. 展开更多
关键词 IL6 3'非翻译区 BNF蛋白 回复突变 肿瘤坏死因子
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四川省首株盖塔病毒SC1210的鉴定 被引量：6
6
作者 李伟 潘明 +7 位作者 周兴余 林世华 刘学成 付士红 陈丹林 曹一欧 梁国栋 张佳珂 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2017年第1期2-7,共6页
目的 对四川省从蚊虫分离到的病毒SC1210进行鉴定并分析其基因组特征.方法 利用披膜病毒科甲病毒属特异性引物进行RT-PCR鉴定,并采用二代测序平台Ion Torrent PGM进行基因组全序列测定,然后利用Mega Align软件对测定的核苷酸和推测的氨... 目的 对四川省从蚊虫分离到的病毒SC1210进行鉴定并分析其基因组特征.方法 利用披膜病毒科甲病毒属特异性引物进行RT-PCR鉴定,并采用二代测序平台Ion Torrent PGM进行基因组全序列测定,然后利用Mega Align软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,利用Mega 6软件绘制系统发生树.结果 SC1210为盖塔病毒（Getah virus,GETV）,该株病毒基因组全长11 690nt,与国内外其他分离株的核苷酸同源性为99.2％-99.7％,氨基酸同源性为96.5％-99.4％.衣壳蛋白全长为804nt,编码268个氨基酸,与其他株的核苷酸同源性为94.9％-99.2％,氨基酸同源性97％-99.6％.E2基因全长1 266 nt,编码422个氨基酸,与其他株的核苷酸同源性为94.6％-99.6,氨基酸同源性为97.1％-99.5％.3＇UTR全长402 nt,具有GETV病毒独特的3个完整的重复序列元件和19 nt的保守序列.结论 四川省分离到的首株GETV SC1210与云南分离株YN0540亲缘关系较近,而与马来西亚原始株MM2021亲缘关系较远. 展开更多
关键词 盖塔病毒 衣壳蛋白基因 E2蛋白基因 3’非翻译区 核苷酸序列
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真核mRNA3′非翻译区的功能研究进展 被引量：3
7
作者 刘定干 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1994年第3期215-217,共3页
真核ｍＲＮＡ的３′非翻译区的功能比人们目前认为的更为复杂。近年来的研究揭示，ｍＲＮＡ３′非翻译区不但决定该ｍＲＮＡ的稳定性，而且还控制着该特定ｍＲＮＡ的翻译时间、翻译地点和翻译产物。值得注意的是真核ｍＲＮＡ３′非翻译... 真核ｍＲＮＡ的３′非翻译区的功能比人们目前认为的更为复杂。近年来的研究揭示，ｍＲＮＡ３′非翻译区不但决定该ｍＲＮＡ的稳定性，而且还控制着该特定ｍＲＮＡ的翻译时间、翻译地点和翻译产物。值得注意的是真核ｍＲＮＡ３′非翻译区内的突变可能导致肿瘤的发生。文章介绍了１９９１—１９９２年间国际上关于３′非翻译区的一些新发现。 展开更多
关键词 真核 MRNA 3'非翻译区 功能 遗传病
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高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒弱毒疫苗株作为外源基因表达活病毒载体的研究 被引量：1
8
作者 陈金霞 张宽 +9 位作者 张玉娇 杜楠楠 郑海红 李丽薇 周艳君 虞凌雪 童武 郑浩 童光志 高飞 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2023年第3期12-19,共8页
利用反向遗传操作技术,猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)也可以被用作外源基因表达的活载体。前期研究将猪瘟病毒E2蛋白的编码基因插入了高致病性PRRSV弱毒疫苗株HuN4-F112的非结构蛋白和结构蛋白编码间区,所拯救的重组病毒rPRRSV-E2能够... 利用反向遗传操作技术,猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)也可以被用作外源基因表达的活载体。前期研究将猪瘟病毒E2蛋白的编码基因插入了高致病性PRRSV弱毒疫苗株HuN4-F112的非结构蛋白和结构蛋白编码间区,所拯救的重组病毒rPRRSV-E2能够在体外和体内高效表达E2蛋白。能够为猪瘟和HP-PRRS的感染提供100%的免疫保护。本研究利用rPRRSV-E2的全长感染性克隆平台,在PRRSV基因组ORF7和3'非翻译区之间插入了转录调控序列6(TRS6)和绿色荧光蛋白的编码基因,构建并拯救了重组病毒rPRRSV-E2-EGFP,该病毒感染MARC-145细胞后,可以同时表达猪瘟E2蛋白和EGFP。外源序列在载体中能够保持遗传稳定。本研究为开发PRRSV作为病毒活载体疫苗提供了一个新的外源基因插入位点和构建策略,对今后多价疫苗的研发有重要意义。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 3'非翻译区 转录调控序列 外源基因表达
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人EZH2基因编码区及3'非翻译区融合蛋白重组慢病毒表达载体构建及其在293T细胞中的表达 被引量：4
9
作者 彭攸 赵卫卫 +4 位作者 李晓娇 王玉平 卢晓佳 邬美玉 冯景 《中华临床医师杂志（电子版）》 CAS 2012年第24期8151-8155,共5页
目的构建携带人EZH2基因编码区(coding region,CDS)及3'非翻译区(3'untranslated region,3'UTR)融合红色荧光蛋白(red fluorescent protein,RFP)重组慢病毒表达载体,使mCherry-EZH2融合蛋白在293T细胞中稳定表达。方法运用I... 目的构建携带人EZH2基因编码区(coding region,CDS)及3'非翻译区(3'untranslated region,3'UTR)融合红色荧光蛋白(red fluorescent protein,RFP)重组慢病毒表达载体,使mCherry-EZH2融合蛋白在293T细胞中稳定表达。方法运用In-Fusion定向克隆技术构建人EZH2基因CDS区及3'UTR融合蛋白重组慢病毒表达载体,测序无误后抽提质粒,转染293T细胞,包装病毒,测定病毒滴度。Western blot检测mCherry-EZH2的表达。结果测序证实重组慢病毒表达载体基因序列完全正确;病毒颗粒包装成功,滴度为1.59×109IU/ml;Western blot检测293T细胞中可以表达mCherry-EZH2融合蛋白。结论成功构建人EZH2基因CDS区及3'UTR融合蛋白重组慢病毒表达载体及病毒,其mCherry-EZH2可以在293T细胞中稳定表达。为进一步分析可能调控EZH2基因CDS区及3'UTR表达的miRNA奠定前期实验基础。 展开更多
关键词 3’非翻译区 EZH2基因 红色荧光蛋白 慢病毒载体
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Sox2基因3'非翻译区保守元件对基因表达的调控作用 被引量：4
10
作者 马莉 孔清华 +2 位作者 赵树华 魏云虎 毛炳宇 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期633-638,共6页
转录因子Sox2是脊椎动物早期发育中最早表达的神经系统特异性基因之一,同时在干细胞的维持中也起着关键作用。通过生物信息学分析,作者发现在脊椎动物Sox2mRNA3'非翻译区中存在4段非常保守的富含AU的区域。将这些片段按照不同的组... 转录因子Sox2是脊椎动物早期发育中最早表达的神经系统特异性基因之一,同时在干细胞的维持中也起着关键作用。通过生物信息学分析,作者发现在脊椎动物Sox2mRNA3'非翻译区中存在4段非常保守的富含AU的区域。将这些片段按照不同的组合克隆到GFP和荧光素酶两种报告基因载体中,在非洲爪蟾胚胎和培养细胞中检测了这些片段对报告基因表达的影响。结果显示,Sox2的3'UTR可影响报告基因的表达水平,特别是其中的保守片段2可显著提高报告基因的表达水平,表明Sox23'非翻译区有可能参与Sox2表达的转录后调控。 展开更多
关键词 SOX2 3’非翻译区 转录后调控 非洲爪蟾
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DNA修复基因RAD52 miRNA靶序列单核苷酸多态性与肝细胞癌遗传易感性研究 被引量：4
11
作者 王坚武 于祥远 +7 位作者 王倩倩 秦林原 贝春华 谭盛葵 何松青 唐博 廖维甲 余红平 《中国癌症防治杂志》 CAS 2018年第2期99-104,共6页
目的探讨DNA修复基因RAD52 3'非翻译区(3'-untranslated region,3'-UTR)miRNA靶序列单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与广西地区人群肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)遗传易感性的关系。方法采... 目的探讨DNA修复基因RAD52 3'非翻译区(3'-untranslated region,3'-UTR)miRNA靶序列单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与广西地区人群肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)遗传易感性的关系。方法采用病例-对照研究,对1 002例确诊的HCC新发病例和1 013例非肿瘤患者RAD52基因3'-UTR区域miRNA靶序列SNPs(rs1051669、rs1051672、rs7301931和rs7310449)进行基因分型,并分析其基因型频率分布及其与HCC遗传易感性的关系。结果 RAD52基因各SNP基因型在病例组和对照组中的分布频率差异均无统计学意义(P>0.05)。调整年龄、性别、吸烟、饮酒和HBV感染等因素后,未发现各SNP与HCC易感性有关联;分层分析发现,在女性人群中,与携带rs1051669 C等位基因相比,TT基因型可显著降低个体罹患HCC的风险(TT vs CT/CC:OR=0.03,95%CI:0.00~0.62,P=0.03);与携带rs1051672 G等位基因相比,AA基因型可显著降低个体罹患HCC的风险(AA vs GA/GG:OR=0.03,95%CI:0.01~0.88,P=0.04)。结论 RAD52基因3'-UTR区域miRNA靶序列SNPs rs1051669、rs1051672位点可能与广西地区女性人群HCC易感性有关。 展开更多
关键词 肝肿瘤 RAD52基因 3'非翻译区 单核苷酸多态性 遗传易感性
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MiRNA-24、miRNA-34a和miRNA-375抑制小鼠胰岛β细胞系MIN6细胞中Neurod1／BETA2的蛋白表达 被引量：3
12
作者 张许 朱云霞 韩晓 《医学分子生物学杂志》 CAS 2015年第4期197-201,共5页
目的在小鼠胰岛β细胞系MIN6细胞中分析miRNA-24、miRNA-34a和miRNA-375对Neurod1／BETA2的表达调控以及作用方式。方法设计并合成针对小鼠Neurod1基因3’非翻译区（3’untranslated region,3’UTR）序列的引物，克隆于pMIR-REPORT^TM... 目的在小鼠胰岛β细胞系MIN6细胞中分析miRNA-24、miRNA-34a和miRNA-375对Neurod1／BETA2的表达调控以及作用方式。方法设计并合成针对小鼠Neurod1基因3’非翻译区（3’untranslated region,3’UTR）序列的引物，克隆于pMIR-REPORT^TM荧光素酶报告基因载体中；用miranda软件预测可能调控Neurod1表达的miRNAs，挑选在B细胞中有相关功能研究的miRNAs并委托公司合成pre—miRNAs；脂质体法转染至MIN6细胞中。荧光素酶报告基因技术分析这些miRNA对Neurod1的作用；定量RT．PCR分析Neurod1的mRNA水平；Western印迹检测Neurod1的蛋白表达水平；GSIS检测干扰Neurod1后MIN6细胞的功能。结果成功制备小鼠Neurod1基因的3’UTR荧光素酶报告基因载体；选取了预测在Neurod1的3’UTR有互补结合位点的3个miRNAs（miRNA-24、miR-34a和miR．375），并挑选一个没有互补结合位点的miRNA（miR-29a）作为阴性对照；在MIN6细胞中过表达pre-miRNA-24、pre-miR-34a和pre-miR-375能够抑制Neurod1基因3’UTR荧光素酶报告基因的活性，而过表达阴性对照miRNA-29a则不能抑制其活性；pre—miRNA-24、pre-miR-34a和pre-miR-375还可以不同程度抑制Neumd1的蛋白表达；在MIN6细胞中干扰Neurod1蛋白表达能够降低细胞的GSIS功能。结论miRNA-24、miR-34a和miR-375能够抑制小鼠胰岛B细胞系MIN6细胞中Neurod1的蛋白表达。 展开更多
关键词 miRNA-24 miRNA-34a miRNA-375 Neurod1 3’非翻译区 胰岛Β细胞
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盐藻cbr基因启动子及其3'-非翻译区序列的克隆 被引量：3
13
作者 张贵星 潘卫东 +4 位作者 王宁 贾岩龙 陈小让 王建民 薛乐勋 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2005年第2期242-244,共3页
目的:克隆盐藻cbr基因启动子和3' -非翻译区(3' -UTR)片段。方法:设计2对引物,通过2轮巢式PCR 反应,扩增cbr基因启动子,其中首轮PCR反应使用改良的降落PCR程序,第二轮巢式PCR反应的模板是第一轮 PCR产物,使用普通PCR程序;cb... 目的:克隆盐藻cbr基因启动子和3' -非翻译区(3' -UTR)片段。方法:设计2对引物,通过2轮巢式PCR 反应,扩增cbr基因启动子,其中首轮PCR反应使用改良的降落PCR程序,第二轮巢式PCR反应的模板是第一轮 PCR产物,使用普通PCR程序;cbr基因3' -UTR片段的克隆采用一对引物,通过一般PCR程序得到。结果:通过巢 式PCR得到长约1.1kb的cbr基因启动子片段,DNA测序结果表明碱基序列与文献记载完全相同,无任何碱基突 变;克隆的长0.3kb的cbr基因3' -UTR片段经人工比较,与收录的序列吻合,无碱基突变。结论:利用普通Taq酶 对用PCR方法克隆得到了盐藻胡萝卜素生物合成相关基因cbr的2个基因表达调控序列;结合使用巢式PCR和改 良降落PCR,可以非常有效地克隆具有复杂二级结构的DNA片段;通过两端人工添加的限制序列,将cbr基因启动 子和3' -UTR2个调控片段构建到同一个载体上,形成cbr基因表达盒,为构建转基因盐藻表达载体打下了基础。 展开更多
关键词 盐藻 胡箩卜素生物合成相关基因 启动子 3-非翻译区
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微小RNA-106b靶向下调腺瘤性息肉病基因表达促进Hep-2细胞的增殖 被引量：3
14
作者 段继惠 杨磊 +2 位作者 王巍 穆红 唐志琴 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1650-1652,共3页
目的 探讨微小RNA（miRNA,miR）-106b影响喉鳞状细胞癌Hep-2细胞株增殖的分子机制.方法 应用噻唑蓝（MTT）法分析miR-106b对Hep-2细胞株增殖的影响;通过实时荧光定量聚合酶链反应（FQ-PCR）和Western blot技术检测miR-106b各转染组腺瘤... 目的 探讨微小RNA（miRNA,miR）-106b影响喉鳞状细胞癌Hep-2细胞株增殖的分子机制.方法 应用噻唑蓝（MTT）法分析miR-106b对Hep-2细胞株增殖的影响;通过实时荧光定量聚合酶链反应（FQ-PCR）和Western blot技术检测miR-106b各转染组腺瘤性息肉病基因（APC） mRNA和蛋白表达水平;将APC基因3＇非翻译区（3＇UTR）-荧光素酶表达载体及其突变体与miR-106b共转染至Hep-2细胞,采用双荧光素酶检测系统检测荧光素酶的活性.结果 与miR-106b inhibitor和对照组比较,转染miR-106b-mimics能明显促进Hep-2细胞的增殖;APC蛋白在miR-106b-mimics转染组、对照组和miR-106b inhibitor中的表达水平分别为0.586 ±0.023,0.734 ±0.024和0.927±0.018,3组间差异有统计学意义（P＜0.05）;而APC mRNA的表达水平在3组间差异无统计学意义（P＞0.05）;在共转染野生型APC基因3＇UTR-荧光素酶表达载体的Hep-2细胞中,上述3组荧光素酶的活性分别为4.37±1.04,8.376±1.23和23.75±1.63,3组间差异有统计学意义（P＜0.05）;而在共转染突变型APC基因3＇UTR-荧光素酶表达载体的Hep-2细胞中,上述3组荧光素酶的活性差异无统计学意义（P＞0.05）.结论 在喉鳞状细胞癌Hep-2细胞株中,miR-106b可结合到APC基因3＇UTR,在转录后水平负性调控APC基因的表达,从而促进Hep-2细胞的增殖. 展开更多
关键词 喉肿瘤 微小RNA 腺瘤性息肉病基因 3'非翻译区
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mRNA的3′非翻译区控制硒代半胱氨酸参入多肽链 被引量：1
15
作者 刘定干 《生命的化学》 CAS CSCD 1997年第3期16-17,共2页
ｍＲＮＡ的３′非翻译区控制硒代半胱氨酸参入多肽链刘定干（中国科学院上海生物化学研究所，上海２０００３１）关键词ｍＲＮＡ３′非翻译区硒代半胱氨酸多肽链真核生物ｍＲＮＡ的３′非翻译区是决定各个ｍＲＮＡ专有功能特征的调控元... ｍＲＮＡ的３′非翻译区控制硒代半胱氨酸参入多肽链刘定干（中国科学院上海生物化学研究所，上海２０００３１）关键词ｍＲＮＡ３′非翻译区硒代半胱氨酸多肽链真核生物ｍＲＮＡ的３′非翻译区是决定各个ｍＲＮＡ专有功能特征的调控元件。３′非翻译区除能决定ｍＲＮＡ的... 展开更多
关键词 MRNA 3'非翻译区 硒代半胱氨酸 多肽链
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一个遗传性凝血因子Ⅶ缺陷症家系F7基因信号肽区L12R和3＇＇非翻译区c11814-insAA复合性突变与表型分析 被引量：2
16
作者 刘珊 张敬宇 +3 位作者 李峥嵘 王艳 牛志云 林凤茹 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期508-515,共8页
目的:通过对一个遗传性凝血因子Ⅶ(FⅦ)缺陷症患者家系成员表型与基因型分析,研究其基因突变与临床表型的关系,探讨其分子发病机制。方法:对先证者及其父母进行活化部分凝血酶时间(APTT)、凝血酶原时间(PT)、纤维蛋白原和FⅦ活性(FⅦ:C)... 目的:通过对一个遗传性凝血因子Ⅶ(FⅦ)缺陷症患者家系成员表型与基因型分析,研究其基因突变与临床表型的关系,探讨其分子发病机制。方法:对先证者及其父母进行活化部分凝血酶时间(APTT)、凝血酶原时间(PT)、纤维蛋白原和FⅦ活性(FⅦ:C)、FⅦ抗原(FⅦ:Ag)检测,对其F7基因的全部外显子及侧翼、启动子区进行测序,以寻找致病基因突变。根据信号肽预测数据库构建包含所发现突变的FVII蛋白分子模型,进行功能预测,推断其对蛋白合成和功能的影响。结果:先证者APTT正常,PT明显延长(58.3 s),FⅦ:C显著下降(1.1%),FⅦ:Ag重度降低(0.9%),其父母的APTT、PT、FⅦ:C和FⅦ:Ag均在正常范围内。先证者和其父亲的F7基因第1a外显子第556位核苷酸发生杂合性T/G突变,导致相应氨基酸由亮氨酸(L)变成精氨酸(R),即L12R。功能预测分析提示,L12R突变影响到信号肽区不同区域的分割及其相应功能,进而导致成熟蛋白质的合成减少和因子活性明显降低。同时,先证者F7基因还存在自发性3'非翻译区c11814-ins AA杂合性突变,而其父母均无此突变。结论:发现1例F7基因L12R突变,位于信号肽区的该杂合突变是导致此例遗传性FVII缺乏症发生的主要分子基础,而位于3'非翻译区的自发性c11814-ins AA突变则进一步造成了FⅦ合成的减低。 展开更多
关键词 凝血因子Ⅶ缺陷 F7基因 信号肽区L12R 3'非翻译区 c11814-insAA复合性突变
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胰岛素样生长因子2受体基因3'非翻译区的单核苷酸多态性及其生物信息学分析 被引量：2
17
作者 陈凤霞 张文文 +1 位作者 杨芳 管晓翔 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2014年第12期1262-1265,共4页
目的基因3'非翻译区(3'untranslated region,3'UTR)中miRNA结合区域的遗传突变能够影响基因的表达调控,文中利用生物信息学技术预测胰岛素样生长因子2受体(insulin-like growth factor 2 receptor,IGF2R)基因3'UTR的遗... 目的基因3'非翻译区(3'untranslated region,3'UTR)中miRNA结合区域的遗传突变能够影响基因的表达调控,文中利用生物信息学技术预测胰岛素样生长因子2受体(insulin-like growth factor 2 receptor,IGF2R)基因3'UTR的遗传突变,并检测其对基因表达的影响。方法运用多个在线数据库,获取IGF2R基因3'UTR中具有最小等位基因频率(minor allele frequency,MAF)的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),计算其在不同人种中的频率分布及各SNPs之间的连锁不平衡,并预测与其相应结合的miRNA。最后,检测在淋巴母细胞系中不同变体基因型对IGF2R基因mRNA表达的影响。结果在IGF2R基因3'UTR的33个SNPs中,仅有5个SNPs(rs8191959、rs200237825、rs3832385、rs201568808、rs1050015)具有>0.05的MAF,其中只有rs1050015基因型突变对mRNA表达水平差异具有统计学意义(P=0.010)。结论IGF2R基因3'UTR的rs1050015突变能够促进其表达,可作为帮助预测癌症风险的遗传标志物及个体化治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 胰岛素样生长因子2受体基因 3'非翻译区 单核苷酸多态性 生物信息学
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miR-122靶向调控心肌样细胞诱导分化过程中GATA4基因的表达 被引量：2
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作者 郭励京 张志 +2 位作者 刘紫东 付伟 季州 《天津医药》 CAS 北大核心 2014年第4期333-336,I0006,共5页
目的实现大鼠骨髓间充质干细胞(bMSCs)向心肌样细胞的诱导分化,并验证分化过程中miR-122靶向调控GATA4基因的表达。方法首先,分离培养bMSCs,应用5-氮杂胞苷(5-azacytidine)将其诱导分化为心肌样细胞。然后,采用靶基因预测软件miRanda和T... 目的实现大鼠骨髓间充质干细胞(bMSCs)向心肌样细胞的诱导分化,并验证分化过程中miR-122靶向调控GATA4基因的表达。方法首先,分离培养bMSCs,应用5-氮杂胞苷(5-azacytidine)将其诱导分化为心肌样细胞。然后,采用靶基因预测软件miRanda和TargetScan对miR-122和GATA4基因的靶向匹配关系进行预测并通过双荧光素酶报告基因系统鉴定。qRT-PCR检测诱导分化过程中miR-122和GATA4的表达。结果诱导分化后的细胞平行排列,紧密相连,形态规则均一,免疫荧光化学显示有心肌肌钙蛋白I(cTnI)表达。生物信息学方法预测发现miR-122和GATA4基因两者匹配良好,通过双荧光素酶报告基因系统检测发现miR-122能结合到GATA4 mRNA的3′UTR并有效抑制其表达。qRT-PCR检测结果表明,miR-122的表达水平与GATA4表达呈负相关。结论 miR-122能调控心肌样细胞诱导分化过程中GATA4的表达。 展开更多
关键词 间质干细胞 微RNAs GATA4转录因子 3’非翻译区 计算生物学 大鼠 SPRAGUE-DAWLEY MIR-122 心 肌样细胞
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严重急性呼吸综合征冠状病毒2膜蛋白对宿主细胞pre-mRNA 3'UTR加工的影响 被引量：1
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作者 欧阳歆 曾先燕 +7 位作者 谷斌 娄哲琦 黄进 谭正宗 于倩 车雨 钱昱舟 朱勇 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第10期1866-1873,共8页
目的研究严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)膜蛋白对宿主细胞mRNA前体(pre-mRNA)3’非翻译区(UTR)加工的影响。方法本研究以人肺上皮细胞系A549为模型,利用瞬时转染在细胞内过表达SARS-CoV-2膜蛋白;利用RNA-Seq测序技术及生物信... 目的研究严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)膜蛋白对宿主细胞mRNA前体(pre-mRNA)3’非翻译区(UTR)加工的影响。方法本研究以人肺上皮细胞系A549为模型,利用瞬时转染在细胞内过表达SARS-CoV-2膜蛋白;利用RNA-Seq测序技术及生物信息学分析方法,系统性描绘宿主细胞选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)事件;Metascape数据库对发生显著APA变化的基因进行功能富集分析;RT-qPCR验证靶基因3’UTR长度变化;蛋白质免疫印迹(Western blot)检测目的蛋白表达水平。结果SARS-CoV-2膜蛋白外源表达后宿主细胞内共813个基因发生显著APA变化。GO和KEGG分析显示,差异APA基因广泛参与有丝分裂细胞周期、调节细胞应激等生物过程,涉及病毒感染和蛋白质加工等。从中进一步筛选出AKT1基因,在IGV软件中显示3’UTR延长;RT-qPCR验证AKT1基因的3’UTR长度变化趋势;Western blot结果显示AKT1蛋白磷酸化水平增加。结论SARS-CoV-2膜蛋白潜在影响宿主pre-mRNA的3’UTR加工,其中参与多种病毒性生物过程的AKT1基因3’UTR延长,且其编码的蛋白质功能在细胞内被激活。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2膜蛋白 选择性多聚腺苷酸化 PRE-MRNA 3’非翻译区
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SNP芯片联合质谱筛检胃癌相关基因3′UTR区SNPs的病例-对照研究 被引量：2
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作者 韩仁杰 吴传城 +2 位作者 刘宝英 郭赛熊 陈昱 《癌变．畸变．突变》 CAS CSCD 2018年第5期359-364,共6页
目的:探讨胃癌发生相关基因3′非翻译区(3′UTR)单核苷酸多态性位点(SNPs),为寻找有价值的胃癌分子标志物提供新的依据。方法:采用1∶1配对病例-对照研究的方法。应用SNP芯片对福建省胃癌高发区仙游县96例胃腺癌患者与96例健康对照人群... 目的:探讨胃癌发生相关基因3′非翻译区(3′UTR)单核苷酸多态性位点(SNPs),为寻找有价值的胃癌分子标志物提供新的依据。方法:采用1∶1配对病例-对照研究的方法。应用SNP芯片对福建省胃癌高发区仙游县96例胃腺癌患者与96例健康对照人群基因组中消化道肿瘤相关基因3′UTR区SNPs位点进行检测,应用飞行时间质谱分析质谱技术对芯片筛检出来的SNPs位点在622例胃癌患者和622例正常健康基因组中进行验证。结果:SNP芯片及生物信息学分析选取EGFR rs884225、EGFR rs10277413、FAS rs1468063、MSH2 rs17502941和MSH2 rs11125144为候选基因位点。对622对病例-对照组样本的上述候选基因位点进行SNP分型,均未发现上述5个位点与胃癌易感性相关。进一步分层分析结果发现EGFR rs884225中含有T等位基因的基因型(CT+TT)与贲门癌相关(OR=0.67,95%CI:0.46～0.99),而其他位点与贲门癌、非贲门癌的风险关联无统计学意义(P>0.05)。结论:EGFR基因3′非翻译区的rs884225多态性位点与福建省仙游县的贲门癌发生存在关联,T等位基因可能是贲门癌发生的一个遗传保护因素。 展开更多
关键词 3’非翻译区 靶基因 单核苷酸多态性 胃癌
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