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微小RNA在甲状腺乳头状癌中的作用及其研究现状 被引量:3
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作者 秦小静 薛刚 吴靖芳 《中国耳鼻咽喉颅底外科杂志》 CAS 2020年第3期349-354,共6页
微小RNA(micro RNA,miRNA)是一类长度范围为18~22个核苷酸的单链内源性非编码RNA分子。MiRNA在调节基因表达中发挥着重要作用,通过诱导翻译抑制或靶向mRNA的互补结合以达到沉默的效果。他们可能作为抑癌基因或致癌基因参与癌症的生物学... 微小RNA(micro RNA,miRNA)是一类长度范围为18~22个核苷酸的单链内源性非编码RNA分子。MiRNA在调节基因表达中发挥着重要作用,通过诱导翻译抑制或靶向mRNA的互补结合以达到沉默的效果。他们可能作为抑癌基因或致癌基因参与癌症的生物学调控。其中一些miRNA也参与了甲状腺乳头状癌(PTC)患者的基因调控。MiRNA可能对PTC的诊断、预后判断和预测PTC的复发有重要意义。本文就miRNA的生物起源、生物功能以及他们在PTC中的表达模式、作用靶点、分子调控机制和临床价值作一综述。 展开更多
关键词 微小RNA 甲状腺乳头状癌 非编码RNA 3’-非翻译区
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豌豆肌动蛋白异型体基因的特异性表达 被引量:9
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作者 凌毅 赵武玲 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2001年第1期76-80,共5页
将分属三类豌豆 (Pisumsativum)卷须肌动蛋白异型体 (PEAc)的基因 3’端进行了亚克隆 ,并利用限制性内切酶从中切取了完整的 3’非翻译区片段 ,将之做为特异性探针进行DIG标记 ,并对不同发育时间豌豆根、茎、叶及花粉中提取的总RNA进行... 将分属三类豌豆 (Pisumsativum)卷须肌动蛋白异型体 (PEAc)的基因 3’端进行了亚克隆 ,并利用限制性内切酶从中切取了完整的 3’非翻译区片段 ,将之做为特异性探针进行DIG标记 ,并对不同发育时间豌豆根、茎、叶及花粉中提取的总RNA进行点杂交分析。发现其中I类 (PEAcI)和II类 (PEAcII)在根、茎、叶中都有表达 ,但存在发育时间上的表达特异性 ,尤其在叶中的差异较明显。而III类 (PEAcIII)与前二者的差别更大 ,仅发现其在 2d及 2 8d的根、7d的茎及 1 8d的叶中有表达。在花粉中 ,只有PEAcII有少量的表达 ,说明三类异型体基因的表达还存在组织特异性。 展开更多
关键词 肌动蛋白基因 异型体 3'非翻译区 特异性表达 豌豆
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关岭牛MSTN基因3'-UTR与bta-miR-27b的靶向验证
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作者 卢贤君 许厚强 +1 位作者 许家利 阮涌 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1235-1243,共9页
【目的】明确关岭牛bta-miR-27b与肌肉生长抑制素基因(MSTN)的结合位点及靶向调控关系,为通过调控miRNA改良关岭牛产肉量提供理论依据,也为贵州地方黄牛分子遗传改良工作提供新的切入点。【方法】通过TargetScan预测牛MSTN基因3'端... 【目的】明确关岭牛bta-miR-27b与肌肉生长抑制素基因(MSTN)的结合位点及靶向调控关系,为通过调控miRNA改良关岭牛产肉量提供理论依据,也为贵州地方黄牛分子遗传改良工作提供新的切入点。【方法】通过TargetScan预测牛MSTN基因3'端非翻译区(3'-UTR)的潜在miRNA结合区域及互作miRNA,对比关岭牛与不同关岭牛杂交品种的生理表型及MSTN基因和3'-UTR端miRNA表达差异,并分析bta-miR-27b在不同关岭牛杂交群体中的靶位点特异性。将MSTN基因3'-UTR序列野生型(WT)和3'-UTR序列突变型(MUT)分别克隆至pMIR-REPORT Luciferase(H306)载体构建重组双荧光素酶报告基因载体,与bta-miR-27b共转染293T细胞以验证bta-miR-27b与MSTN基因的作用关系,并利用实时荧光定量PCR验证bta-miR-27b对MSTN基因表达的影响。【结果】在牛MSTN基因3'-UTR端发现7个miRNA结合位点;关岭牛各系杂交品种的3个miRNA(bta-miR-27a-3p、bta-miR-27b和bta-miR-128)相对表达量均极显著高于关岭牛(P<0.01,下同),MSTN基因相对表达量极显著低于关岭牛,体质量、体高、体斜长、胸围等生长指标却明显优于关岭牛。关岭牛及其杂交牛MSTN基因3'-UTR端的bta-miR-27b结合区域均无突变、无缺失;MSTN-3'-UTR(WT)与bta-miR-27bmimics共转染293T细胞后其相对荧光值下降53.80%,极显著低于MSTN-3'-UTR(MUT)+bta-miR-27bmimics共转染;转染bta-miR-27b mimics后,bta-miR-27b在关岭牛原代成肌细胞株(N2)中成功超表达,而MSTN基因相对表达量呈极显著下调趋势,表明bta-miR-27b能抑制MSTN基因表达。【结论】bta-miR-27b与MSTN基因的结合区域位于3'-UTR端第62~69位碱基处,且靶位点保守性较高。bta-miR-27b对MSTN基因有很强的靶向调控作用,表现为bta-miR-27b能抑制MSTN基因表达。 展开更多
关键词 关岭牛 MSTN基因 3'端非翻译区(3'-utr) bta-miR-27b 双荧光靶向验证
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高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒弱毒疫苗株作为外源基因表达活病毒载体的研究 被引量:1
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作者 陈金霞 张宽 +9 位作者 张玉娇 杜楠楠 郑海红 李丽薇 周艳君 虞凌雪 童武 郑浩 童光志 高飞 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2023年第3期12-19,共8页
利用反向遗传操作技术,猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)也可以被用作外源基因表达的活载体。前期研究将猪瘟病毒E2蛋白的编码基因插入了高致病性PRRSV弱毒疫苗株HuN4-F112的非结构蛋白和结构蛋白编码间区,所拯救的重组病毒rPRRSV-E2能够... 利用反向遗传操作技术,猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)也可以被用作外源基因表达的活载体。前期研究将猪瘟病毒E2蛋白的编码基因插入了高致病性PRRSV弱毒疫苗株HuN4-F112的非结构蛋白和结构蛋白编码间区,所拯救的重组病毒rPRRSV-E2能够在体外和体内高效表达E2蛋白。能够为猪瘟和HP-PRRS的感染提供100%的免疫保护。本研究利用rPRRSV-E2的全长感染性克隆平台,在PRRSV基因组ORF7和3'非翻译区之间插入了转录调控序列6(TRS6)和绿色荧光蛋白的编码基因,构建并拯救了重组病毒rPRRSV-E2-EGFP,该病毒感染MARC-145细胞后,可以同时表达猪瘟E2蛋白和EGFP。外源序列在载体中能够保持遗传稳定。本研究为开发PRRSV作为病毒活载体疫苗提供了一个新的外源基因插入位点和构建策略,对今后多价疫苗的研发有重要意义。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 3'非翻译区 转录调控序列 外源基因表达
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Identification of selenocyst-eine insertion sequence(SECIS) element in eukaryotic selenoproteins by RNA Draw program 被引量:2
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作者 XU Huibi HUANG Kaixun +4 位作者 QU Xianghu GAO Zhonghong LIU Qiong CHEN Runsheng XUAN Zhenyu 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2001年第14期1159-1161,共3页
The computer program RNA Draw was used to identify the secondary structures in the 3’untranslated regions (3’UTRs) of the mRNAs from 46 eukaryotic seleno-proteins among 7 species. The program found one or two possib... The computer program RNA Draw was used to identify the secondary structures in the 3’untranslated regions (3’UTRs) of the mRNAs from 46 eukaryotic seleno-proteins among 7 species. The program found one or two possible SECIS elements in these selenoproteins. The SECIS element consists of a stem-loop or hairpin structure with three conserved sequences of AUGA-(A)AA-GA. SECIS element was not found by the RNA Draw program in randomly selected non-selenoproteins. The results showed that SECIS element is the unique character of the genes ofeukaryotic selenoproteins. Thus it is possible to use RNA Draw to search the SECIS elements in gene bank for potential new selenoproteins. 展开更多
关键词 selenoprotein eukaryotes 3 untranslated region (3 utr) SELENOCYSTEINE insertion sequence (SECIS) RNA DRAW program.
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人和动物SON基因3’非编码区的PCR测序分析 被引量:2
6
作者 邵武 姜先华 +1 位作者 于蛟 赵贺群 《中国法医学杂志》 CSCD 2003年第2期87-89,共3页
目的 研究人和猕猴、阿拉伯狒狒、猪、牛、羊、马、驴、骡、狗、猫、兔、大白鼠、小白鼠、豚鼠等14种哺乳类动物SON基因3’非编码区(3’UTR)的种属特异性碱基序列差异。方法 对人和上述14种哺乳类的SON基因3’非编码区中的部分种属特异... 目的 研究人和猕猴、阿拉伯狒狒、猪、牛、羊、马、驴、骡、狗、猫、兔、大白鼠、小白鼠、豚鼠等14种哺乳类动物SON基因3’非编码区(3’UTR)的种属特异性碱基序列差异。方法 对人和上述14种哺乳类的SON基因3’非编码区中的部分种属特异性区域进行PCR测序分析。结果 人有2条扩增片段和14种哺乳类动物各有1条扩增片段的碱基序列;人无关个体和同一种属不同个体动物DNA扩增片段的碱基序列相同,人、猕猴、阿拉伯狒狒、猪、牛、羊、马、驴、骡、狗、猫、兔、大白鼠、小白鼠、豚鼠DNA的SON基因3’UTR扩增片段之间存在碱基序列差异。结论 SON基因3’UTR是一个具有良好种属特异性的遗传标记,采用SON基因3’UTR扩增测序技术可以对人和上述14种哺乳类动物进行准确的种属鉴定。 展开更多
关键词 法医学 SON基因 3’非编码区 PCR测序法 哺乳类动物 种属鉴定
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Laptm5 3'UTR对小鼠B细胞淋巴瘤38B9细胞增殖与凋亡的影响 被引量:2
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作者 张艳青 李艳 +4 位作者 朱明明 丁懿 庞磊 王继军 郁多男 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期237-241,共5页
目的:通过建立稳定过表达溶酶体相关穿膜蛋白5(lysosomal associated protein transmembrane 5,Laptm5)3'不翻译区(3'UTR)的B细胞淋巴瘤38B9细胞株,探讨Laptm5 3'UTR对小鼠B细胞淋巴瘤38B9细胞株增殖、凋亡的影响。方法:荧... 目的:通过建立稳定过表达溶酶体相关穿膜蛋白5(lysosomal associated protein transmembrane 5,Laptm5)3'不翻译区(3'UTR)的B细胞淋巴瘤38B9细胞株,探讨Laptm5 3'UTR对小鼠B细胞淋巴瘤38B9细胞株增殖、凋亡的影响。方法:荧光定量PCR及Western blotting检测小鼠B细胞及38B9细胞中Laptm5 miRNA及其蛋白质的表达水平;将小鼠Laptm5 3'UTR及其含有的microRNA结合位点突变的突变型基因片段构建入逆转录病毒表达载体p MSCV-PIG,包装成逆转录病毒,感染小鼠B细胞淋巴瘤细胞38B9,流式细胞术检测逆转录病毒感染率,细胞计数法及流式细胞术观察Laptm5 3'UTR或其突变型过表达后389B9细胞的增殖、凋亡情况。结果:相比小鼠B细胞,B细胞淋巴瘤细胞中Laptm5的miRNA及蛋白均显著降低(P<0.01)。成功获得稳定过表达Laptm5 3'UTR(突变型)的38B9细胞株。Laptm5 3'UTR细胞株比Laptm5 3'UTR突变型过表达细胞株的增殖能力显著减慢,凋亡率显著增加[(7.87±1.08)%vs(0.45±0.07)%,P<0.01]。结论:小鼠Laptm53'UTR具有抑制B细胞淋巴瘤增殖、促进其凋亡的作用,该作用可能与其影响相关microRNA的调控有关。 展开更多
关键词 溶酶体相关跨膜蛋白5 3'不翻译区 B细胞淋巴瘤细胞 3889株细胞
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单股正链RNA病毒基因组3'非编码区功能 被引量:1
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作者 刘长龙 袁世山 《中国动物传染病学报》 CAS 2010年第3期76-81,共6页
单股正链RNA病毒数量众多,对人、动物和植物造成很大的危害。病毒基因组3'末端都具有一段非编码区,基因组3'非编码区在病毒的复制过程中发挥着重要的作用。本文简单介绍了单股正链RNA病毒基因组3'非编码区结构的预测、测定... 单股正链RNA病毒数量众多,对人、动物和植物造成很大的危害。病毒基因组3'末端都具有一段非编码区,基因组3'非编码区在病毒的复制过程中发挥着重要的作用。本文简单介绍了单股正链RNA病毒基因组3'非编码区结构的预测、测定和功能的研究方法,并重点概括了不同单股正链RNA病毒3'非编码区一级序列、茎-环结构、假结体、TLS等结构在病毒基因组的复制、转录和翻译中的调控作用以及目前存在的问题。 展开更多
关键词 3'非编码区(3'utr) RNA复制 亚基因组RNA转录 翻译 茎-环结构 假结体
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脂联素基因3'非编码区遗传变异与中国人群2型糖尿病的相关性研究 被引量:1
9
作者 卢廷莲 杨曼 +6 位作者 杨莹 陶文玉 徐凡 陈郊丽 杨海英 何思琦 李奕平 《中国糖尿病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期669-674,共6页
目的探讨APN基因3’非编码区(3’UTR)变异与中国人群T2DM的相关性。方法对50名非DM人群(NDM)进行APN基因3’UTR测序。根据测序结果,对T2DM患者730例(T2DM组)和NDM人群612名(NDM组)的APN基因3’UTR 8个变异位点(rs56354395、rs6773957、r... 目的探讨APN基因3’非编码区(3’UTR)变异与中国人群T2DM的相关性。方法对50名非DM人群(NDM)进行APN基因3’UTR测序。根据测序结果,对T2DM患者730例(T2DM组)和NDM人群612名(NDM组)的APN基因3’UTR 8个变异位点(rs56354395、rs6773957、rs1063537、rs2082940、rs1063538、rs4686804、rs1063539和rs17846865)进行基因分型和比较。结果两组APN基因3’UTR rs56354395、rs6773957、rs1063537、rs2082940、rs1063538、rs4686804、rs1063539和rs17846865基因型频率和等位基因频率经Bonferroni校正后,差异无统计学意义(P>0.006)。NDM组中,与rs17846865位点C/C+C/T基因型相比,T/T基因型具有更低的FPG[(4.84±0.56)vs(5.03±0.51)mmol/L,P<0.01]和Hb A1c[(5.10±0.39)%vs(5.21±0.35)%,P=0.01)],更高的LDL-C[(2.23±0.71)vs(2.06±0.55)mmol/L,P=0.01]。结论 APN基因3’UTR变异与中国人群T2DM无相关性,rs17846865位点可能与中国人群糖脂代谢指标相关。 展开更多
关键词 糖尿病 2型 脂联素基因 3’非编码区 变异 关联
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PD-L1基因3’UTR单核苷酸多态性与膀胱尿路上皮癌关系的病例对照研究 被引量:1
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作者 刘静 王永华 +3 位作者 于仑 牛海涛 刘勇 孙立江 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期762-766,共5页
目的:探讨免疫关卡点分子程序性死亡配体1(programmed death ligand 1,PD-L1)基因3’端非翻译区(3’untranslated region,3’UTR)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,B... 目的:探讨免疫关卡点分子程序性死亡配体1(programmed death ligand 1,PD-L1)基因3’端非翻译区(3’untranslated region,3’UTR)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BUC)发病风险及临床病理特征之间的关系。方法:采用病例-对照研究方法,PCR-LDR技术分别检测2013年6月至2015年12月在青岛大学附属医院泌尿外科住院手术治疗的213例BUC患者和251例同期健康体检者PD-L1基因3’UTR的rs4143815位点和rs2297136位点基因型分布频率,采用卡方检验和非条件多因素Logistic回归分析不同基因型与BUC发病风险以及临床病理特征之间的关系。结果:BUC组PD-L1基因3’UTR的rs4143815位点基因型分布频率与对照组相比存在明显差异,GG基因型个体发生BUC的风险是CC基因型的2.83倍(95%CI:1.82~4.64,P<0.01),携带G突变基因(CG/GG基因型)个体BUC发病风险是CC型基因个体的1.53倍(95%CI:1.01~2.24,P<0.01),同时BUC组rs4143815位点携带G突变基因频率与BUC病理分级和临床分期具有相关性(P<0.05或P<0.01);而在rs2297136位点,BUC组和对照组基因型分布频率无显著差异,CC、CT及TT基因型个体之间发生BUC的风险亦无显著差异(均P>0.05)。结论:PD-L1基因3’UTR的rs4143815位点SNP与BUC的发病风险和恶性进展可能具有相关性。 展开更多
关键词 膀胱肿瘤 程序性死亡配体1 3’端非翻译区 单核苷酸多态性
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可选择性多聚腺苷酸化与肿瘤的相关研究进展
11
作者 郭丽霞 孙伟杰 赵卉 《昆明医科大学学报》 CAS 2019年第9期130-135,共6页
可选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation, APA)普遍存在于真核生物中。具有多个APA位点的基因,可产生结构不同和长度不一的mRNA异构体。不同的异构体可通过miRNA和RNA结合蛋白等影响转录本的稳定、细胞定位和翻译效率等,从... 可选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation, APA)普遍存在于真核生物中。具有多个APA位点的基因,可产生结构不同和长度不一的mRNA异构体。不同的异构体可通过miRNA和RNA结合蛋白等影响转录本的稳定、细胞定位和翻译效率等,从而影响转录组和蛋白组的表达。十多年来的研究,特别是高通量测序技术的应用,拓宽了笔者对APA参与调控的重要生物学过程的认识,如肿瘤的发生和转移、疾病、动物发育、免疫应答和神经反应等。本文将从APA机制对转录本产生的影响、组织特异性表达、以及APA对疾病的响应,特别是APA在肿瘤中的作用进行综述,并探讨APA调控的未来研究趋势。 展开更多
关键词 可选择性多聚腺苷酸化(APA) 肿瘤 3'非编码区(3'utr) 转录后调控
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大鼠Prestin-3'UTR双荧光素酶报告基因载体的构建与鉴定
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作者 王军义 夏源 +2 位作者 张川 朱艳丽 杨湘宁 《中国工业医学杂志》 CAS 2015年第1期8-10,37,共4页
目的构建大鼠Prestin基因(SLC26A5)3'端UTR区双荧光素酶报告系统,为研究Prestin基因的microRNA调控提供基础平台。方法以C6细胞基因组DNA为模板PCR扩增SLC26A5基因的3'UTR序列,并连接至pmri-RBREPORTTM双荧光素酶报告载体多克... 目的构建大鼠Prestin基因(SLC26A5)3'端UTR区双荧光素酶报告系统,为研究Prestin基因的microRNA调控提供基础平台。方法以C6细胞基因组DNA为模板PCR扩增SLC26A5基因的3'UTR序列,并连接至pmri-RBREPORTTM双荧光素酶报告载体多克隆位点,测序验证插入序列并转染入293T细胞检测其荧光素酶活性。结果测序结果表明PMIR-3'UTR的插入序列正确,在转染入293T细胞后其荧光素酶能正常表达。结论大鼠Prestin-3'UTR双荧光素酶报告基因载体构建成功。 展开更多
关键词 PRESTIN 3'非编码区 双荧光素酶报告载体 大鼠
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PCR扩增SON基因3’非编码区进行种属鉴定 被引量:3
13
作者 邵武 姜先华 《中国法医学杂志》 CSCD 2000年第2期69-71,共3页
根据人 DNA的 SON基因碱基序列选择性设计一对特异性引物 ,并对人和猕猴、阿拉伯狒狒、猪、牛、羊、马、驴、骡、狗、猫、兔、大白鼠、小白鼠、豚鼠等 14种哺乳类动物染色体 DNA的 SON基因 3’非编码区中的种属特异性区域进行 PCR扩增 ... 根据人 DNA的 SON基因碱基序列选择性设计一对特异性引物 ,并对人和猕猴、阿拉伯狒狒、猪、牛、羊、马、驴、骡、狗、猫、兔、大白鼠、小白鼠、豚鼠等 14种哺乳类动物染色体 DNA的 SON基因 3’非编码区中的种属特异性区域进行 PCR扩增 ,扩增产物经 SSCP分离银染色技术检测 ,观察到人和 14种哺乳类动物的 SSCP图谱有明显不同。本方法可以对人和上述 14种哺乳类动物进行种属鉴定 。 展开更多
关键词 种属鉴定 SON基因3'非编码 PCR扩增 法医鉴定
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