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用3′RACE方法扩增并克隆口蹄疫病毒基因组3′末端序列 被引量：3
1
作者 刘光清 刘在新 谢庆阁 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期524-526,共3页
应用 3′RACE方法扩增并克隆了口蹄疫病毒 ( FMDV) OH99株基因组 3′端真实序列。测序结果表明 ,所扩增的目的基因片段长 15 0 0 nt,包括 3D基因部分序列、3′端非编码区 ( Non- Coding Region,NCR)和 Poly( A)尾巴 ,其中 3′NCR位于终... 应用 3′RACE方法扩增并克隆了口蹄疫病毒 ( FMDV) OH99株基因组 3′端真实序列。测序结果表明 ,所扩增的目的基因片段长 15 0 0 nt,包括 3D基因部分序列、3′端非编码区 ( Non- Coding Region,NCR)和 Poly( A)尾巴 ,其中 3′NCR位于终止密码子 TAA之后 ,长 93nt,Poly( A)尾序列至少含有 5 6个 A。与参考毒株进行序列比较 ,结果显示 ,OH99株与 OTY TW/ 97株的核苷酸同源性较高 ,为 91.4 % ,而与 O1K、CHINA99、A12等毒株的核苷酸同源性较低 ,其同源性分别为 6 8.1%、71.0 %、70 .2 %。 3′NCR的末端存在保守性较高的基序 :CCCTCAGATG,TTTTCCC-CGCTTCCT。本研究为进一步研究 FMDV基因组的功能、构建 OH99株的反向遗传操作系统奠定了基础。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 3’端非编码区 序列分析 3’RACE方法 基因克隆 同源性 3’末端序列
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一种侵染滇重楼的Potexvirus病毒分离物分子鉴定及其3′末端序列分析 被引量：3
2
作者 董家红 丁铭 +5 位作者 方琦 罗延青 张仲凯 李展 杨斌 李晓明 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期237-241,共5页
从云南武定的滇重楼上得到一个病毒分离物Paris-YN,病毒粒体为弯曲线状。利用RT-PCR扩增获得一条1074bp的片段,序列比较分析发现其与马铃薯X病毒属(Potexvirus)病毒3′末端的结构最为相似,且与属内的白三叶草花叶病毒等20个不同分离物3... 从云南武定的滇重楼上得到一个病毒分离物Paris-YN,病毒粒体为弯曲线状。利用RT-PCR扩增获得一条1074bp的片段,序列比较分析发现其与马铃薯X病毒属(Potexvirus)病毒3′末端的结构最为相似,且与属内的白三叶草花叶病毒等20个不同分离物3′末端有36.7%～58.9%的同源性;该病毒cp基因长639个核苷酸,编码212个氨基酸(22.8kDa),与20个Potexvirus病毒分离物的CP氨基酸序列比较发现,Paris-YN与白三叶草花叶病毒的CP氨基酸同源性最高(60.1%)。证据表明,该分离物可能为Potexvirus的新成员,暂命名为重楼X病毒(Paris polyphylla virus X)。 展开更多
关键词 滇重楼 马铃薯X病毒属 3’末端序列
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对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(福建株)基因组的克隆 被引量：5
3
作者 吴昊 徐丽美 杨丰 《台湾海峡》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期147-151,共5页
对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖和野生对虾的重要病原之一.目前,GenBank已收录了分离自夏威夷、加利福尼亚、泰国、中国台湾等地的IHHNV全长或部分基因组序列.虽然中国大陆在养殖对虾中也普遍检测到了IHHNV,但... 对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖和野生对虾的重要病原之一.目前,GenBank已收录了分离自夏威夷、加利福尼亚、泰国、中国台湾等地的IHHNV全长或部分基因组序列.虽然中国大陆在养殖对虾中也普遍检测到了IHHNV,但未见其基因组序列报道.本文首先利用DNA末端加尾和嵌套PCR克隆了IHHNV基因组两末端序列,并根据测定的末端序列设计引物,PCR扩增出中国福建株IHHNV基因组序列. 展开更多
关键词 传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV) 嵌套PCR 病毒基因组 5’和3’末端序列
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两步PCR快速扩增东亚钳蝎BmKIT3 3'cDNA末端序列 被引量：8
4
作者 朱顺义 李文鑫 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第1期94-96,共3页
对3′RACE方法进行了修改,采用一条特异性引物和一条通用OligodT引物成功地克隆了东亚钳蝎BmKIT33′cDNA末端,与常规3′RACE方法相比,两步PCR方法具有节约成本、节省时间、增加反应特异性等优点,尤其适用于生物活性肽基因的快速克隆和鉴定.
关键词 3'cDNA末端序列 东亚祖蝎 两步PCR BmKIT3
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杭州郊区马铃薯A病毒分离物的基因组3’-末端序列测定及系统进化分析 被引量：8
5
作者 程晔 陈炯 陈剑平 《浙江农业学报》 CSCD 2002年第2期71-75,共5页
采用马铃薯Y病毒属通用引物Sprimer扩增了引起浙江杭州郊区发生的马铃薯病毒基因组 3’ 末端 16 87核苷酸序列 ,它包括NIb ,CP和 3’ UTR ,3’ 末端含Poly(A)尾 ,蚜传基序DAG位于多聚蛋白第 2 15～ 2 17氨基酸。BLAST分析表明该病毒为... 采用马铃薯Y病毒属通用引物Sprimer扩增了引起浙江杭州郊区发生的马铃薯病毒基因组 3’ 末端 16 87核苷酸序列 ,它包括NIb ,CP和 3’ UTR ,3’ 末端含Poly(A)尾 ,蚜传基序DAG位于多聚蛋白第 2 15～ 2 17氨基酸。BLAST分析表明该病毒为马铃薯A病毒 (PVA) ,它与已报道的 19个PVA分离物CP氨基酸进行比较 ,PVA浙江分离物与荷兰Alc分离物同源性最高 ,为 99.6 %。系统进化树分析表明 ,PVA分离物间存在一些明显的进化群体。 展开更多
关键词 分离物 基因组 3'-末端序列 马铃薯A病毒 序列分析 系统进化
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鹅催乳素受体基因3′-末端序列克隆
6
作者 邢光东 王根林 +2 位作者 刘庆华 傅泽红 刘铁铮 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2007年第6期608-611,共4页
通过比对鸡、火鸡、鸽、猪、大鼠5种动物及人催乳素受体(PRLR),并根据它们的基因cDNA保守区设计兼并引物,先扩增了鹅催乳素受体基因(gPRLR)cDNA一段606 bp保守区序列,再以此设计基因特异性引物,利用3′-RACE技术克隆了gPRLRcDNA3′-末... 通过比对鸡、火鸡、鸽、猪、大鼠5种动物及人催乳素受体(PRLR),并根据它们的基因cDNA保守区设计兼并引物,先扩增了鹅催乳素受体基因(gPRLR)cDNA一段606 bp保守区序列,再以此设计基因特异性引物,利用3′-RACE技术克隆了gPRLRcDNA3′-末端序列。序列分析表明,获得的gPRLRcDNA 3′-末端长1 876 bp,含编码区后1 656 bp的编码核苷酸、终止密码子TAA和220 bp的3′-UTR。参照鸡催乳素受体基因(cPRLR),此gPRLRcDNA3′-末端序列可分成6个外显子,其长度分别为148 bp、170 bp、145 bp、100 bp、70 bp和1 243 bp,与cPRLRcDNA最后6个外显子高度同源,终止密码子位于最后1个外显子的1 021 bp处。编码区后1 653 bp编码的551个氨基酸gPRLR C-末端与鸡PRLR同源部分的同源性达到87.7%。 展开更多
关键词 鹅 催乳素受体基因 3’-末端序列 RACE
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