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支气管哮喘合并肺炎支原体感染患儿Th17/Treg细胞失衡及支原体23S rRNA基因突变情况 被引量:16
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作者 缪鑫霞 蒋雯 +2 位作者 孔令军 翁翠琦 王培 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1229-1233,共5页
目的 探讨支气管哮喘合并肺炎支原体感染患儿外周血辅助性T细胞17(Th17)/调节性T细胞(Treg)水平、支原体23S rRNA基因突变情况及其与病情程度关系。方法 选取2017年8月-2020年8月医院收治的支气管哮喘合并肺炎支原体感染患儿120例(感染... 目的 探讨支气管哮喘合并肺炎支原体感染患儿外周血辅助性T细胞17(Th17)/调节性T细胞(Treg)水平、支原体23S rRNA基因突变情况及其与病情程度关系。方法 选取2017年8月-2020年8月医院收治的支气管哮喘合并肺炎支原体感染患儿120例(感染组)和未合并肺炎支原体感染支气管哮喘患儿104例(未感染组),将感染组患儿分为轻症组和重症组,流式细胞法检测外周血Th17细胞和Treg细胞百分比,酶联免疫法检测外周血白细胞介素(IL)-17、IL-6、IL-10水平,聚合酶链式反应扩增肺炎支原体23S rRNA并测序观察突变情况,Spearman分析IL-17、IL-6、IL-10与Th17、Treg关系,受试者工作特征曲线(ROC)分析Th17、Treg对重症肺炎支原体感染的鉴别价值。结果 感染组Th17细胞比例、IL-17、IL-6水平高于未感染组(P<0.05),Treg细胞、IL-10水平低于未感染组(P<0.05);重症组Th17细胞比例、IL-17、IL-6水平和23S rRNA突变检出率高于轻症组(P<0.05),Treg细胞、IL-10水平低于轻症组(P<0.05);IL-17、IL-6水平与Th17细胞比例呈正相关(P<0.05),IL-10水平与Treg细胞比例呈正相关(P<0.05);Th17、Treg细胞比例对重症肺炎支原体感染的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.820和0.871。结论 肺炎支原体感染可加重支气管哮喘患儿的Th17/Treg细胞失衡,支原体23S rRNA基因突变在重症患儿中的检出率较高,Th17、Treg细胞比例对重症患儿有较高的鉴别价值。 展开更多
关键词 支气管哮喘 肺炎支原体 辅助性T细胞17 调节性T细胞 23S rrna基因 病情程度
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长春地区幽门螺杆菌耐药性和克拉霉素耐药基因突变位点分析 被引量:14
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作者 铁丹丹 赵春燕 +2 位作者 范聪聪 江海洋 王丽波 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期264-269,共6页
目的探讨幽门螺杆菌对常用抗生素的耐药性及对克拉霉素耐药菌株进行耐药基因突变位点分析,为临床根除幽门螺杆菌选择敏感抗生素以及为患者提供个体化治疗提供参考。方法利用琼脂稀释法检测幽门螺杆菌对常见抗生素的耐药情况,PCR法扩增... 目的探讨幽门螺杆菌对常用抗生素的耐药性及对克拉霉素耐药菌株进行耐药基因突变位点分析,为临床根除幽门螺杆菌选择敏感抗生素以及为患者提供个体化治疗提供参考。方法利用琼脂稀释法检测幽门螺杆菌对常见抗生素的耐药情况,PCR法扩增克拉霉素耐药菌株的23S rRNA基因,测序并对其基因突变位点进行分析。结果本研究成功分离出幽门螺杆菌69株,阳性率为23.1%。对7种常用抗生素的耐药性分析结果显示,幽门螺杆菌对克拉霉素耐药率最高为52.2%,对替硝唑、左氧氟沙星、盐酸四环素、呋喃唑酮和甲硝唑的耐药率依次为47.8%、37.7%、33.3%、30.4%和30.4%,对阿莫西林的耐药率最低为5.8%,可继续作为一线抗菌药物继续使用。在克拉霉素耐药菌株中发现23S rRNA基因有7个突变位点:A1821G、G1826A、T1830C、G1940A、A2143G、T2182C、A2223G。其中A2143G位点突变占54.2%,是本地区幽门螺杆菌分离株对克拉霉素耐药的主要突变位点。结论本地区分离的幽门螺杆菌对克拉霉素的耐药率最高,耐药机制多以23S rRNA基因A2143G位点突变为主。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 克拉霉素耐药性 23S rrna 基因突变
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不同动物种源肺炎克雷伯氏菌分离株23S rRNA序列分析 被引量:10
3
作者 钟世勋 王迪 +5 位作者 曲亭合 潘德琴 黄璇 李奕芙 邵明旭 朱瑞良 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期937-939,共3页
为分析动物种源肺炎克雷伯氏菌分离株(K.p妇)的进化特点,本研究通过PCR扩增不同动物种源K.pn的23SrRNA基因片段,克隆测序,进行BLAST比对;构建K-pm菌株的系统进化树。结果显示,本实验室保存的12株K.p力核苷酸序列与GenBank收录... 为分析动物种源肺炎克雷伯氏菌分离株(K.p妇)的进化特点,本研究通过PCR扩增不同动物种源K.pn的23SrRNA基因片段,克隆测序,进行BLAST比对;构建K-pm菌株的系统进化树。结果显示,本实验室保存的12株K.p力核苷酸序列与GenBank收录的X87284株K-pm核苷酸序列同源性为96.8%~99.0%,而与沙门氏菌和奇异变形杆菌同源性只有90.0%~92.7%;8株毛皮动物K.加核苷酸序列同源性为98.1%~99.9%,与猪源、鸡源K.p力的核苷酸序列同源性分别为95.5%~98.1%、96.7%~97.9%;猪源与鸡源K.pn的核苷酸序列同源性为95.9%~97.4%。结果表明,不同动物种源K-pn23SrRNA基因序列同源性差异明显,具有种属的特异性,23SrRNA基因序列可以作为鉴定K-pm的一种快速、简便的方法。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯氏菌 23S rrna 同源性 进化 基因分析
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儿童肺炎支原体23S rRNA基因位点突变检测分析 被引量:9
4
作者 潘芬 孟磊俊 +3 位作者 秦惠宏 张天栋 石迎迎 张泓 《国际检验医学杂志》 CAS 2017年第6期760-762,共3页
目的了解儿童肺炎支原体(MP)大环内酯类耐药基因(23SrRNA)位点突变,以及与临床资料的相关性。方法收集该院354份肺炎患儿的呼吸道标本,采用实时荧光定量PCR法检测MP及23SrRNA位点突变(A2063G或/和A2064G)情况,并将MP阳性患儿分成位点突... 目的了解儿童肺炎支原体(MP)大环内酯类耐药基因(23SrRNA)位点突变,以及与临床资料的相关性。方法收集该院354份肺炎患儿的呼吸道标本,采用实时荧光定量PCR法检测MP及23SrRNA位点突变(A2063G或/和A2064G)情况,并将MP阳性患儿分成位点突变组和未突变组,比较两组之间的临床资料。结果 354份呼吸道标本中,166份检测为MP阳性(46.9%),且135份MP阳性标本中存在23SrRNA基因位点突变(阳性检出率81.3%),31份未检测到23SrRNA基因位点突变。分析突变组和非突变组的临床资料发现两组在年龄和性别方面比较差异无统计学意义(P>0.05),但突变组的重症肺炎和肺外并发症发生率高于未突变组(P<0.05),且平均住院时间和平均发热时间均较未突变组长(P<0.05)。结论 MP 23SrRNA基因位点突变的较高检出率提示MP对大环内酯类耐药率较高,这为临床MP的感染、治疗提供一定的参考依据。 展开更多
关键词 肺炎支原体 23Srrna 耐药基因 临床资料
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吉林地区儿童肺炎支原体耐药状况检测分析 被引量:5
5
作者 张雁冰 《中国卫生检验杂志》 CAS 2017年第23期3357-3359,共3页
目的了解吉林地区支原体肺炎患儿耐大环内酯类抗菌药物状况及探讨可能存在的耐药机制。方法收集来本院就诊的1 272例0岁~15岁急性呼吸道感染患儿的咽拭子标本。进行支原体快速培养与药敏试验;抽取耐红霉素的支原体培养液100例提取DNA,进... 目的了解吉林地区支原体肺炎患儿耐大环内酯类抗菌药物状况及探讨可能存在的耐药机制。方法收集来本院就诊的1 272例0岁~15岁急性呼吸道感染患儿的咽拭子标本。进行支原体快速培养与药敏试验;抽取耐红霉素的支原体培养液100例提取DNA,进行16S rRNA基因PCR扩增;抽取16S rRNA基因PCR扩增阳性标本30例进行23S rRNA基因PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳、回收目的片段测序,测序结果与Gen Bank已登录的肺炎支原体标准株(M129)23S rRNA基因进行比对。观察其有无耐药基因位点的突变。结果吉林地区呼吸道感染的患儿肺炎支原体快速鉴定培养阳性率为35.30%;肺炎支原体耐药率最高的是红霉素(61.1%);耐药肺炎支原体19株的分子机制均为23S rRNA结构域V区2063位点A-G的突变。结论首次证明吉林地区耐药肺炎支原体的分子机制为23S rRNA结构域V区2063位点AG的突变。 展开更多
关键词 支原体肺炎 16S rrna基因 23S rrna基因 大环内酯类抗生素 耐药机制
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幽门螺杆菌相关萎缩性胃炎的区域耐药性分析 被引量:6
6
作者 贺新国 郭保根 《海南医学》 CAS 2021年第5期571-573,共3页
目的观察幽门螺杆菌(HP)相关萎缩性胃炎对常用抗生素的耐药性,并就克拉霉素、左氧氟沙星耐药菌株的耐药基突变点位进行分析,为临床治疗Hp相关萎缩性胃炎敏感抗生素的选择提供参考。方法选取2019年6月至2020年6月在成都市双流区中医医院... 目的观察幽门螺杆菌(HP)相关萎缩性胃炎对常用抗生素的耐药性,并就克拉霉素、左氧氟沙星耐药菌株的耐药基突变点位进行分析,为临床治疗Hp相关萎缩性胃炎敏感抗生素的选择提供参考。方法选取2019年6月至2020年6月在成都市双流区中医医院消化内科经胃镜检查确诊的Hp相关萎缩性胃炎患者210例,分离菌株,用体外药敏试验观察其对常用抗生素的耐药性,采用RT-PCR法检测Hp23s rRNA基因V区A2142G、A2143G突变和gyrA基因N87K(C261A)、D91N(G271A)突变。结果对分离的200株菌株进行7种常用抗生素的药敏试验,甲硝唑耐药140株(70.0%),左氧氟沙星耐药77株(38.5%),克拉霉素耐药31株(15.5%),阿莫西林耐药20株(10.0%),呋喃唑酮、庆大霉素和四环素耐药各2株(1.0%);N87K(C261A)突变耐药菌株15株,敏感组0株,差异具有统计学意义(P<0.05);D91N(G271A)突变耐药菌株13株,敏感组0株,差异具有统计学意义(P<0.05);A2142G突变耐药菌株17株,敏感菌株2株,差异具有统计学意义(P<0.05);A2143G突变耐药菌株13株,敏感菌株1株,差异具有统计学意义(P<0.05);T2182C突变耐药菌株15株,敏感菌株4株,差异无统计学意义(P>0.05)。结论本地区分离的HP耐药菌株中,对克拉霉素耐药率最高的以23S r RNA基因V区中的A2143G位点突变为主,对左氧氟沙星耐药率最高的以gyrA基因C261A、G271A位点突变为主。 展开更多
关键词 H.pylori相关萎缩性胃炎 耐药 点突变 23s rrna基因 GYRA基因
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杭州地区耐甲氧西林表皮葡萄球菌对利奈唑胺耐药机制研究 被引量:5
7
作者 汪强 王寅 +4 位作者 刘建芳 陈雪静 黄晨静 孙爱华 严杰 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期593-597,共5页
目的:了解杭州地区耐甲氧西林表皮葡萄球菌( MRSE)临床菌株对利奈唑胺耐药机制。方法2013年5月—2015年4月从杭州地区多家医院败血症、泌尿道感染、感染性胸膜炎患者标本中分离出23株对利奈唑胺耐药表皮葡萄球菌( LRSE )。采用 E-t... 目的:了解杭州地区耐甲氧西林表皮葡萄球菌( MRSE)临床菌株对利奈唑胺耐药机制。方法2013年5月—2015年4月从杭州地区多家医院败血症、泌尿道感染、感染性胸膜炎患者标本中分离出23株对利奈唑胺耐药表皮葡萄球菌( LRSE )。采用 E-test测定13种抗生素对上述LRSE菌株的最低抑菌浓度( MIC)。采用脉冲场凝胶电泳( PFGE)和聚类分析确定上述LRSE菌株的同源性。采用PCR及其产物测序了解上述LRSE菌株23S rRNA 基因第5功能区G2576T突变和cfr基因与利奈唑胺耐药的关系。结果23株LRSE中,15株利奈唑胺MIC〉256μg/ml,8株利奈唑胺MIC分别为6或8μg/ml,但均对苯唑西林和头孢西丁耐药。利奈唑胺高耐药( MIC〉256μg/ml) LRSE菌株中,LRSE1和LRSE2、LRSE3~LRSE6、LRSE9~LRSE12分别为来自同一医院的同一克隆系。所有LRSE菌株均携带cfr基因,但利奈唑胺高耐药( MIC〉256μg/ml)的15株LRSE菌株同时存在23S rRNA基因第5功能区G2576T突变,但利奈唑胺低耐药( MIC=6或8μg/ml)的8株LRSE菌株则否。结论本地区分离的LRSE菌株对利奈唑胺耐药水平差异较大,但分布较广且均为耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌。 LRSE对利奈唑胺耐药性与其23S rRNA基因第5功能区G2576T突变和携带cfr基因有关。 展开更多
关键词 表皮葡萄球菌 利奈唑胺 耐药 23S rrna基因 cfr基因
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肺炎支原体23S rRNA突变与患儿临床特征及耐药性的相关性 被引量:5
8
作者 吴超雄 王爱敏 蔡振荡 《中华全科医学》 2021年第4期603-606,共4页
目的观察肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)肺炎患儿23S rRNA基因突变特征,探讨该基因突变与患儿临床特征及耐药性的相关性。方法对2016年1月—2019年1月于温州市中西医结合医院住院治疗的214例小儿肺炎支原体肺炎病例MP菌株进行23S... 目的观察肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)肺炎患儿23S rRNA基因突变特征,探讨该基因突变与患儿临床特征及耐药性的相关性。方法对2016年1月—2019年1月于温州市中西医结合医院住院治疗的214例小儿肺炎支原体肺炎病例MP菌株进行23S rRNA基因突变检测,并分别纳入无突变组(36例)和突变组(178例),通过病历收集患儿的一般信息、临床资料和药敏试验结果,分析23S rRNA基因突变与患儿临床特征及耐药性的相关性。结果共检测到23S rRNA基因突变178例(83.18%)。与无突变组相比,突变组患儿的重症肺炎比例(83.18%)更高,平均发热时间[(7.22±2.13)d]、住院时间[(8.30±3.25)d]及体温恢复正常的时间[(6.45±2.33)d]更长,差异均有统计学意义(均P<0.05)。药敏试验结果显示突变组阿奇霉素、罗红霉素的耐药率(38.20%、25.84%)显著高于无突变组(13.89%、8.33%,均P<0.05)。多因素logistic回归分析显示肺炎严重程度、体温恢复正常时间和23S rRNA基因突变是MP耐药性的独立相关因素(OR=1.693、1.285、3.338,均P<0.05)。结论 23S rRNA的A2063G基因突变是MP的主要突变类型,对大环内酯类抗生素具有明显耐药性,可导致重症肺炎患儿比例增高,并可显著延长患儿的临床治疗时间。 展开更多
关键词 肺炎支原体 23S rrna 耐药性 基因突变
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闽浙边界地区上消化道症状者幽门螺杆菌耐药性及相关基因突变研究
9
作者 吴以龙 谢晶晶 +4 位作者 黄丽静 夏宁宁 江志俊 黄兆许 陈津津 《国际消化病杂志》 CAS 2023年第2期114-120,共7页
目的调查闽浙边界地区上消化道症状者幽门螺杆菌(Hp)耐药情况及其与临床特征的关系,探讨克拉霉素耐药菌株23S rRNA基因及左氧氟沙星耐药菌株gyrA基因的突变特性。方法选择2019年10月至2020年1月闽浙边界地区417例因上消化道症状于福建... 目的调查闽浙边界地区上消化道症状者幽门螺杆菌(Hp)耐药情况及其与临床特征的关系,探讨克拉霉素耐药菌株23S rRNA基因及左氧氟沙星耐药菌株gyrA基因的突变特性。方法选择2019年10月至2020年1月闽浙边界地区417例因上消化道症状于福建中医药大学附属福鼎医院消化内镜中心行胃镜检查及胃黏膜活体组织检查者,行Hp菌株分离、培养和鉴定。使用6种抗菌药物对Hp菌株进行药物敏感度体外实验,分析单药、双重及三重耐药情况,并探讨Hp耐药情况与患者年龄的关系。随机选取50株克拉霉素耐药菌株和50株左氧氟沙星耐药菌株,采用PCR法和Sanger测序法分析耐药相关基因23S rRNA和gyrA的突变情况。结果247株Hp菌株的总体耐药率为98.8%,其中甲硝唑的耐药率(96.4%)最高,其次为左氧氟沙星(45.7%),克拉霉素的耐药率达40.9%,未发现阿莫西林、呋喃唑酮和四环素耐药菌株。Hp菌株对左氧氟沙星的耐药率、对甲硝唑和左氧氟沙星的双重耐药率,以及对甲硝唑、左氧氟沙星和克拉霉素的三重耐药率均随年龄增长呈升高趋势(P均<0.05)。50株克拉霉素耐药菌株均发生23S rRNA基因V区突变,共发现4种突变类型,其中A2143G的突变率为100%,T2182C的突变率为60%,A2302G的突变率为24%,G2864A的突变率为98%。50株左氧氟沙星耐药菌株均发生gyrA基因喹诺酮类药物耐药决定区(QRDR)突变,突变位置是第87位和第91位氨基酸。结论闽浙边界地区Hp菌株对克拉霉素耐药的主要原因可能是23S rRNA基因的A2143G突变和T2182C突变,而A2302G突变和G2864A突变可能与该地区克拉霉素高耐药率相关;该地区Hp菌株对左氧氟沙星耐药的主要原因可能是gyrA基因第87位和第91位氨基酸突变。 展开更多
关键词 闽浙边界地区 幽门螺杆菌耐药性 基因突变 23S rrna基因 GYRA基因
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应用变性高效液相色谱法检测幽门螺杆菌对克拉霉素的耐药性 被引量:3
10
作者 吴文冰 蔡鹏威 +2 位作者 方超英 沈菁 陈雯 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1050-1053,共4页
目的建立DHPLC快速检测Hp对克拉霉素耐药性的新方法。方法抽提56份经纸片琼脂扩散法鉴定为克拉霉素耐药的Hp菌株DNA及其对应的胃粘膜组织标本DNA,通过PCR技术扩增23SrRNA区187bp基因,运用DHPLC技术对PCR产物进行突变分析,并进行DNA测序... 目的建立DHPLC快速检测Hp对克拉霉素耐药性的新方法。方法抽提56份经纸片琼脂扩散法鉴定为克拉霉素耐药的Hp菌株DNA及其对应的胃粘膜组织标本DNA,通过PCR技术扩增23SrRNA区187bp基因,运用DHPLC技术对PCR产物进行突变分析,并进行DNA测序。结果 56份克拉霉素耐药的Hp菌株DNA经DHPLC分析,有51份存在异源双链峰,测序证实均存在点突变,5份无异源双链峰,测序证实无点突变,故DHPLC对基因突变耐药菌株的敏感性和特异性为100%,而且56份组织标本DNA检测结果与菌株DNA检测结果一致。结论 DHPLC可应用于Hp对克拉霉素耐药性的快速检测,具有广阔的临床应用前景。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 23S rrna 克拉霉素耐药 变性高效液相色谱法 基因突变
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用于检测仔猪致病菌的23S rRNA基因芯片的研制 被引量:3
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作者 伍诚意 曹峰子 +5 位作者 梁之昶 章振华 杨兵 周宏专 季海峰 陈小玲 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期258-264,共7页
以副猪嗜血杆菌、胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌、大肠杆菌、肠道沙门氏菌、猪链球菌等12种仔猪致病菌为目标细菌,23SrRNA基因为靶基因,从GenBank中下载其23SrDNA全序列,在其变异区设计特异性探针,在保守区设计通用引物。通过序列... 以副猪嗜血杆菌、胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌、大肠杆菌、肠道沙门氏菌、猪链球菌等12种仔猪致病菌为目标细菌,23SrRNA基因为靶基因,从GenBank中下载其23SrDNA全序列,在其变异区设计特异性探针,在保守区设计通用引物。通过序列分析、PCR靶标与探针杂交试验,建立了有13条寡核苷酸探针和2对通用引物的仔猪常见致病菌基因芯片检测方法。以参考菌株粗提基因组DNA的10倍系列稀释模板做PCR,扩增产物与探针杂交,检出芯片的灵敏度为100fg。对33个参考菌株用芯片检测,结果有1例不正确,只鉴定到属;在61个野外分离株中,55株的芯片检测结果与生化或测序结果一致,有6例不一致,符合率为90%。初步研究证明,该检测方法能快速、有效地鉴定多种仔猪常见致病菌,但要区分某些细菌的致病株与非致病株,还要检测毒力/毒素基因。 展开更多
关键词 仔猪 致病菌 23S rrna基因 芯片 寡核苷酸探针
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军团菌双重荧光定量PCR检测方法的建立与应用 被引量:2
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作者 牛莉娅 程欣 +4 位作者 郭玉梅 王颖童 阮杰 亢继文 孙殿兴 《环境卫生学杂志》 北大核心 2014年第1期76-80,共5页
目的建立一种特异、快速、敏感,同时能区分嗜肺和非嗜肺军团菌的荧光定量PCR方法,用于检测临床和环境样品。方法利用军团菌属特异性23S rRNA基因和嗜肺军团菌种mip基因的保守序列,设计引物和TaqMan探针。提取嗜肺军团菌标准菌株(LP1)DNA... 目的建立一种特异、快速、敏感,同时能区分嗜肺和非嗜肺军团菌的荧光定量PCR方法,用于检测临床和环境样品。方法利用军团菌属特异性23S rRNA基因和嗜肺军团菌种mip基因的保守序列,设计引物和TaqMan探针。提取嗜肺军团菌标准菌株(LP1)DNA,分别构建2个含有目的基因的标准质粒作为阳性模板。优化荧光PCR反应条件和反应体系,对方法的特异性、敏感性、重复性进行评价。并对环境水样及80份临床痰样进行检测。结果该方法检测灵敏度达10标准质粒拷贝数/反应,具有高度特异性、稳定性。整个过程约需2 h。对35份环境水样进行检测,检出3株嗜肺军团菌和3株非嗜肺军团菌,所有水样经传统分离培养法和普通PCR法检测均显示为阴性。对临床80份随机痰液标本进行检测,2份嗜肺军团菌阳性。结论 TaqMan探针荧光定量PCR双管检测是一种可同时区分嗜肺与非嗜肺军团菌的特异、敏感、稳定的方法,可用于基层医院对环境标本及临床痰样的检测。 展开更多
关键词 军团菌 荧光定量PCR TAQMAN探针 23S rrna基因 MIP基因
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关节液中细菌16srRNA与23s rRNA诊断膝关节置换术后感染的价值 被引量:1
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作者 郑忠 蔡碰德 +3 位作者 顾恩毅 李超雄 林向全 陈国龄 《福建医药杂志》 CAS 2017年第2期51-54,共4页
目的探讨利用关节液中细菌16s rRNA与23s rRNA诊断全膝关节置换术后感染的效率及两种基因诊断方法的差异。方法对33例无菌性松动及19例假体周围感染行人工膝关节翻修的患者,通过RT-PCR检测关节液中细菌16s rRNA、23s rRNA保守基因片段... 目的探讨利用关节液中细菌16s rRNA与23s rRNA诊断全膝关节置换术后感染的效率及两种基因诊断方法的差异。方法对33例无菌性松动及19例假体周围感染行人工膝关节翻修的患者,通过RT-PCR检测关节液中细菌16s rRNA、23s rRNA保守基因片段诊断假体周围感染。比较两种诊断策略的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值及准确性。结果以国外关于假体周围感染诊断方法的文献判定假体周围感染,利用16s rRNA进行诊断的敏感性78.8%,特异性93.9%,阳性预测值88.2%,阴性预测值为88.6%,准确性为88.5%;而采用23s rRNA扩增方法诊断的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值及准确性分别为68.4%、78.8%、65.0%、81.2%和75.0%。两种基因诊断的各指标比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论通过检测关节液中细菌16s rRNA或23s rRNA诊断人工膝关节置换术后感染,具有较高的诊断效率,且两者差异无统计学意义。 展开更多
关键词 16s rrna 23s rrna 关节置换 感染 基因诊断
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聚合酶链反应检测175例早期钩端螺旋体病患者血清钩体DNA的研究 被引量:3
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作者 张燕华 戴保民 《华西医科大学学报》 CSCD 1992年第3期256-260,共5页
作者设计并合成了钩端螺旋体(简称钩体)犬群大型Moulton株23S rRNA基因的一对引物,即引物A_1 5'GAT CTA ATT CGC TGT AGC AGG^3'及引物B_1 5'ACT TTC ACCCTC TAT GGT CGG^3'用于聚合酶链反应(PCR)检测不同群型的问号状... 作者设计并合成了钩端螺旋体(简称钩体)犬群大型Moulton株23S rRNA基因的一对引物,即引物A_1 5'GAT CTA ATT CGC TGT AGC AGG^3'及引物B_1 5'ACT TTC ACCCTC TAT GGT CGG^3'用于聚合酶链反应(PCR)检测不同群型的问号状钩体,结果该引物不能使双曲钩体、细螺旋体和其它致病微生物及人白细胞DNA等扩增特异性片段,并用该对引物扩增早期钩体病患者和正常人及其它疾病患者的血清标本(以临床确诊、血培养及MAT阳性为金标准),检测结果表明:PCR诊断钩体病的敏感性为92.00%,特异性为94.35%,准确性为92.54%,阳性预测值为98.17%,阴性预测值为78.13%,阳性拟然比为16.25,阴性拟然比为0.0848。由此表明PCR扩增钩体235 rRNA基因,是早期钩体病诊断的一种敏感、特异、快速而简便的方法。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 钩端螺旋体病 诊断
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动物性食品源弓形菌23S rRNA基因PCR检测方法的建立 被引量:2
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作者 毕水莲 《湖北农业科学》 北大核心 2014年第14期3419-3423,共5页
建立了一种快速、准确检测弓形菌(Arcobacter)的PCR方法。根据弓形菌23S rRNA基因序列设计引物,对弓形菌标准菌株、弓形菌食品分离株及非弓形菌属菌株进行PCR扩增。结果表明,弓形菌标准菌株和35株弓形菌食品分离株扩增后均可得到688 bp... 建立了一种快速、准确检测弓形菌(Arcobacter)的PCR方法。根据弓形菌23S rRNA基因序列设计引物,对弓形菌标准菌株、弓形菌食品分离株及非弓形菌属菌株进行PCR扩增。结果表明,弓形菌标准菌株和35株弓形菌食品分离株扩增后均可得到688 bp的目的条带,11株非弓形菌属菌株均未见任何扩增条带,对弓形菌的最低检测限为1.12×103CFU/mL。该方法操作简单、检测周期短、灵敏度高、特异性好,可用于食品中弓形菌的快速检测。 展开更多
关键词 食源性致病菌 弓形菌(Arcobacter) 聚合酶链式反应 23S rrna基因
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大环内酯类耐药卡他莫拉菌23SrRNA基因突变位点与临床特点分析 被引量:2
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作者 陈霞 王彩虹 +3 位作者 杨海娟 吴佳辉 陈玉兰 曹素芬 《儿科药学杂志》 CAS 2016年第9期30-34,共5页
目的:研究大环内酯类耐药卡他莫拉菌的临床特点、药敏及耐药机制。方法:留取住院社区获得性下呼吸道感染患儿痰标本分离48株卡他莫拉菌,建株保存,分析卡他莫拉菌对大环内酯类敏感及耐药患儿的临床特点;采用K-B法进行药敏试验,头孢硝噻... 目的:研究大环内酯类耐药卡他莫拉菌的临床特点、药敏及耐药机制。方法:留取住院社区获得性下呼吸道感染患儿痰标本分离48株卡他莫拉菌,建株保存,分析卡他莫拉菌对大环内酯类敏感及耐药患儿的临床特点;采用K-B法进行药敏试验,头孢硝噻吩色原法测定β-内酰胺酶,聚合酶链反应(PCR)及序列分析大环内酯类耐药机制。结果:48株卡他莫拉菌β-内酰胺酶的产酶率为93.8%(45/48);卡他莫拉菌对红霉素和阿奇霉素耐药率分别为56.3%和41.7%。在23S rRNA突变位点检测中,A2982T、C3132T等突变位点与大环内酯类耐药可能有关,未发现erm A、erm B、mef A及mer E等耐药基因。耐药组更多表现为喘息、肺部喘鸣音,与敏感组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论:卡他莫拉菌β-内酰胺酶的产酶率、对大环内酯类的耐药性均日益增加,大环内酯类耐药组患儿更多表现为喘息,卡他莫拉菌耐药机制可能与23S rRNA位点发生突变有关。 展开更多
关键词 卡他莫拉菌 大环内酯类 耐药性 23S rrna 基因突变
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利奈唑胺体外诱导粪肠球菌V区突变及耐药相关性研究 被引量:2
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作者 高睿 张美兰 +2 位作者 杜丽 蒲清泉 夏云 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期824-828,共5页
目的观察利奈唑胺是否能在体外诱导肠球菌产生高水平耐药,同时探索其耐药机制与23S rRNA的V区突变的关系,以及突变的基因拷贝数是否与耐药程度(MIC值)相关。方法 5株耐药机制未明的利奈唑胺低水平耐药粪肠球菌(MIC:4-16μg/m L)持... 目的观察利奈唑胺是否能在体外诱导肠球菌产生高水平耐药,同时探索其耐药机制与23S rRNA的V区突变的关系,以及突变的基因拷贝数是否与耐药程度(MIC值)相关。方法 5株耐药机制未明的利奈唑胺低水平耐药粪肠球菌(MIC:4-16μg/m L)持续给予利奈唑胺进行体外诱导,观察其耐药水平变化;采用PCR技术扩增诱导菌和ATCC 29212的23S rRNA的V区片段以及编码核糖体蛋白L3、L4基因片段,分析有无V区和L3、L4突变及V区突变拷贝数。结果通过利奈唑胺持续诱导,5株耐药菌的MIC值较原菌株获得8-32倍增加,最高MIC值超过256 mg/L;其中有3株菌23S rRNA的V583区发生G2576T突变,其余2株菌未发现V区突变;所有诱导菌未发现L3、L4核糖体蛋白氨基酸改变。结论利奈唑胺在体外可诱导粪肠球菌MIC值迅速增加,其V区G2576T突变与高水平耐药密切相关,且突变拷贝数量与MIC值增高呈正相关。 展开更多
关键词 利奈唑胺 粪肠球菌 23S核糖体RNA基因 基因突变
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根瘤菌参比菌株23S rRNA基因数量和定位及其系统发育群 被引量:1
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作者 郑君芳 刘桂荣 +1 位作者 刘树林 贺俊崎 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期482-490,共9页
为了明确23S rRNA基因数量和定位是否可更好地揭示根瘤菌参比菌株的系统发育关系,采用I-CeuI酶切和脉冲场凝胶电泳(PFGE)结合的方法,对根瘤菌株23S rRNA基因的数量和定位进行分析,并依据其相似性进行聚群.结果显示,根瘤菌参比菌株可聚... 为了明确23S rRNA基因数量和定位是否可更好地揭示根瘤菌参比菌株的系统发育关系,采用I-CeuI酶切和脉冲场凝胶电泳(PFGE)结合的方法,对根瘤菌株23S rRNA基因的数量和定位进行分析,并依据其相似性进行聚群.结果显示,根瘤菌参比菌株可聚为19个系统发育群.其中,在属的水平上,13个系统发育群与现行分类群(不包括依据16S rRNA基因序列分析结果)一致,6个不一致.在种的水平上,现行分类群中同种的根瘤菌可进一步细分为不同的系统发育群.这表明:I-CeuI酶切和PFGE结合的方法能从基因组特征角度对根瘤菌参比菌株进行更加细化的系统发育分类,并使其属种间的同质性更好. 展开更多
关键词 根瘤菌 23S rrna基因 系统发育分析 脉冲场电泳 I-CeuI
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应用限制性片段长度多态性检测幽门螺杆菌对克拉霉素的耐药性 被引量:1
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作者 吴文冰 方超英 +1 位作者 陈雯 吴绍莲 《山西医科大学学报》 CAS 2019年第8期1161-1164,共4页
目的建立限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)快速检测HP对克拉霉素耐药性的方法。方法抽提37例经纸片琼脂扩散法鉴定为克拉霉素耐药的HP菌株DNA及其对应的胃黏膜组织标本DNA,通过PCR技术扩增23S rRNA... 目的建立限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)快速检测HP对克拉霉素耐药性的方法。方法抽提37例经纸片琼脂扩散法鉴定为克拉霉素耐药的HP菌株DNA及其对应的胃黏膜组织标本DNA,通过PCR技术扩增23S rRNA区425 bp基因,运用RFLP技术,采用BbsⅠ和BsaⅠ内切酶对PCR产物进行酶切分析,并进行DNA测序。结果37例克拉霉素耐药的HP菌株DNA经RFLP分析,21例能被BbsⅠ内切酶切开,13例能被BsaⅠ内切酶切开,3例不能被BbsⅠ和BsaⅠ内切酶切开,而且37例组织标本DNA检测结果与菌株DNA检测结果一致。结论RFLP可应用于HP对克拉霉素耐药性的快速检测,为临床用药提供指导。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 23S rrna 克拉霉素耐药 限制性片段长度多态性 基因突变
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肺炎支原体23SrRNA基因突变与婴幼儿肺炎支原体肺炎临床相关性研究 被引量:1
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作者 陈俐丽 林苗苗 +1 位作者 施李芬 余坚 《中国卫生检验杂志》 CAS 2018年第12期1434-1436,共3页
目的探讨肺炎支原体23S rRNA基因突变与婴幼儿肺炎支原体肺炎的临床相关性,从而提高临床诊疗能力。方法选取确诊为肺炎支原体肺炎的婴幼儿115例,根据肺炎支原体23S rRNA结构域V区是否发生点突变将患儿分为大环内酯类耐药组和大环内酯类... 目的探讨肺炎支原体23S rRNA基因突变与婴幼儿肺炎支原体肺炎的临床相关性,从而提高临床诊疗能力。方法选取确诊为肺炎支原体肺炎的婴幼儿115例,根据肺炎支原体23S rRNA结构域V区是否发生点突变将患儿分为大环内酯类耐药组和大环内酯类敏感组,分析比较2组患儿临床特征及实验室结果。结果 115例患儿的肺炎支原体Ig M抗体阳性率为51.30%,肺炎支原体DNA阳性率为100%;93例肺炎支原体23S rRNA结构域V区发生A2063G点突变,22例未发生突变,大环内酯类耐药率为80.87%;大环内酯类耐药组患儿的总热程、住院时间、C-反应蛋白(CRP)、乳酸脱氢酶(LDH)均高于大环内酯类敏感组患儿,差异均有统计学意义(P均<0.05)。结论大环内酯类耐药肺炎支原体所致的婴幼儿肺炎支原体肺炎病程相对较长,需引起临床医生的重视,CRP、LDH升高有助于预测大环内酯类耐药肺炎支原体感染。 展开更多
关键词 大环内酯类耐药肺炎支原体 肺炎支原体肺炎 23S rrna基因 婴幼儿
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