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肺孢子菌肺炎的诊断与治疗 被引量:20
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作者 何礼贤 《中华结核和呼吸杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期802-805,共4页
一、肺孢子菌的命名及其生物学特点肺孢子菌于1909年和1910年分别由Chagas和Cafini在感染了锥虫的豚鼠和大鼠肺组织中发现,并认为是锥虫的一种类型。1912年Delanoe夫妇确定其是一种新的病原体,并命名为卡氏肺孢子(囊)虫(pneumocyst... 一、肺孢子菌的命名及其生物学特点肺孢子菌于1909年和1910年分别由Chagas和Cafini在感染了锥虫的豚鼠和大鼠肺组织中发现,并认为是锥虫的一种类型。1912年Delanoe夫妇确定其是一种新的病原体,并命名为卡氏肺孢子(囊)虫(pneumocystis cannii,PC)。在形态学上PC类似原虫,且对杀原虫药物喷他脒有效,长期以来被划归为原虫。直至1988年Edman等发现PC的16SRNA编码基因核苷酸序列与酿酒酵母菌具有高度同源性。有学者将之与其他38种真菌的分子进化树进行比较,证实PC为真菌中独立的一属, 展开更多
关键词 肺孢子菌 肺炎 治疗 诊断 16srna 生物学特点 大鼠肺组织 核苷酸序列
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金鱼嗜水气单胞菌的分离鉴定及药敏试验 被引量:15
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作者 周毅 张培培 +3 位作者 徐晔 曹洁 孟学平 段宏安 《水产科学》 CAS 北大核心 2014年第6期379-384,共6页
自病死金鱼肝脏中分离到一株优势菌,对其进行感染试验、培养特性观察、生化特性鉴定及16SrRNA序列分析。试验结果表明,该分离菌株为嗜水气单胞菌,与已报道的嗜水气单胞菌的16S rRNA序列同源性>99.3%。用纸片扩散法进行药敏试验,试验... 自病死金鱼肝脏中分离到一株优势菌,对其进行感染试验、培养特性观察、生化特性鉴定及16SrRNA序列分析。试验结果表明,该分离菌株为嗜水气单胞菌,与已报道的嗜水气单胞菌的16S rRNA序列同源性>99.3%。用纸片扩散法进行药敏试验,试验结果显示,该分离株对四环素类、喹诺酮类、磺胺类、头孢呋新、头孢他啶、头孢吡肟等21种药物敏感,对青霉素G、氨苄西林、阿莫西林、头孢氨苄、林可霉素、麦迪霉素耐药。本次金鱼发病是由嗜水气单胞菌感染引起,可选用强力霉素、麦迪霉素、复方新诺明、磺胺甲基异恶唑、阿奇霉素、恩诺沙星、诺氟沙星等多种药物进行防治。 展开更多
关键词 金鱼 嗜水气单胞菌 分离 鉴定 16srna 药敏试验
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禽滑液囊支原体WF224株的分离鉴定及其致病性的研究 被引量:10
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作者 王昆 宫晓炜 +3 位作者 郑福英 陈启伟 刘永生 杜晓华 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期472-478,共7页
摘要:用禽支原体16SrRNA引物对山东省潍坊市某养鸡场疑似禽滑液囊支原体(Mycoplasma synoviae,MS)感染的气管棉拭子病料进行了PCR鉴定。结果可扩增到特异性条带。通过分离纯化获得MS分离株CHN—WF224—2016;低倍显微镜观察到,菌... 摘要:用禽支原体16SrRNA引物对山东省潍坊市某养鸡场疑似禽滑液囊支原体(Mycoplasma synoviae,MS)感染的气管棉拭子病料进行了PCR鉴定。结果可扩增到特异性条带。通过分离纯化获得MS分离株CHN—WF224—2016;低倍显微镜观察到,菌落呈典型的“荷包蛋”状;生化鉴定结果表明,该分离株能发酵葡萄糖,不水解精氨酸,不利用尿素。然后,将测序后的16SrRNA序列上传GenBank。MEGA分析和构建的系统发育树表明,CHN—WF224—2016分离株与其他MS菌株在同一进化分支上,为禽滑液囊支原体;其中与MS标准菌株(WVU1853)和河南商丘分离株(CHN-SQ27—2017)的相似性分别为99%和98%。用MS分离株CHN-WF224—2016感染21日龄的鸡.攻毒后第11天和第21天进行实验室解剖,观察临床症状及气管粘膜病理形态学改变:结果表明.分离株CHN—WF224-2016能引起典型的足垫肿胀和关节滑液囊炎。本研究结果证实。CHN—WF224—2016分离株致病性强,可作为今后疫苗研究的候选菌株。 展开更多
关键词 禽滑液囊支原体 16srna 系统发育树 致病性
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高盐度废水处理中优势耐盐菌鉴定与生长特性研究 被引量:8
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作者 李海云 于德爽 张培玉 《青岛理工大学学报》 CAS 2009年第2期59-64,共6页
以海水比例为50%的模拟水产品加工废水为研究对象,从A/O工艺培养驯化出的耐盐活性污泥中分离出4株优势耐盐菌,并对其形态、生理生化特征和16sRNA序列同源性进行分析,试验结果表明:nyj1和nyj3同为Bacillus,nyj2为Arthrobacter,nyj4为Alca... 以海水比例为50%的模拟水产品加工废水为研究对象,从A/O工艺培养驯化出的耐盐活性污泥中分离出4株优势耐盐菌,并对其形态、生理生化特征和16sRNA序列同源性进行分析,试验结果表明:nyj1和nyj3同为Bacillus,nyj2为Arthrobacter,nyj4为Alcaligenes.在温度为30℃,pH为7.5的试验条件下,4株细菌在海水比例为30%和50%时的比生长速率和世代时间差距很小,在70%海水比例下生长相对缓慢,比生长速率最小,世代时间最长.这一结论对指导高盐度废水处理工程实践具有重要理论意义. 展开更多
关键词 耐盐菌 16srna 系统发育树 生长特性
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可形成生物膜的禽源产色葡萄球菌的分离鉴定及耐药性研究 被引量:8
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作者 马玲 谭义俊 +4 位作者 邵帅 吴健敏 廖文军 黄红梅 白安斌 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第2期703-707,共5页
从发病鸡关节腔内分离获得1株革兰氏阳性球菌,根据细菌形态、生理生化特性、动物试验,结合16S rRNA基因核苷酸序列测定、系统进化树分析及生物膜半定量检测,确定该分离菌株为可形成生物膜的的产色葡萄球菌,该菌在正常条件下不致病。药... 从发病鸡关节腔内分离获得1株革兰氏阳性球菌,根据细菌形态、生理生化特性、动物试验,结合16S rRNA基因核苷酸序列测定、系统进化树分析及生物膜半定量检测,确定该分离菌株为可形成生物膜的的产色葡萄球菌,该菌在正常条件下不致病。药物敏感试验和耐药基因检测发现,该菌对磺胺六甲、阿奇霉素、米诺环素等8种药物敏感,对环丙沙星、头孢噻肟钠和复方新诺明中敏,而对万古霉素等13种药物低敏甚至不敏感。检测到该分离菌株包含氨基糖苷类、四环素类和磺胺类的6个耐药基因,说明这是一株多重耐药菌株,推测其耐药性与生物膜的形成有密切关系。 展开更多
关键词 产色葡萄球菌 凝固酶阴性葡萄球菌 16srna 生物膜 耐药性
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基于16sRNA高通量测序技术分析粉尘接触与煤矿工人咽部菌群变化关联性
6
作者 张薛纯 王袁 +3 位作者 何海兰 沈福海 王宏丽 刘和亮 《中国职业医学》 CAS 2024年第2期177-182,共6页
目的探讨煤矿粉尘接触人群咽部菌群分布情况。方法采用判断抽样法,选择从事职业性粉尘接触工作20年以上的8名煤矿工人为接尘组,以工作中不接触粉尘的4名煤矿工人为对照组。采用咽拭子采集2组人群的咽拭子,提取咽部菌群,采用16sRNA基因... 目的探讨煤矿粉尘接触人群咽部菌群分布情况。方法采用判断抽样法,选择从事职业性粉尘接触工作20年以上的8名煤矿工人为接尘组,以工作中不接触粉尘的4名煤矿工人为对照组。采用咽拭子采集2组人群的咽拭子,提取咽部菌群,采用16sRNA基因高通量测序技术进行基因测序,分析菌群的多样性、菌群丰度和均匀度。结果对照组人群的咽部菌群组成的操作分类单元有254个,较接尘组多210个。与对照组比较,接尘组人群咽部菌落的Chao1指数、Shannon指数、PD-tree指数和Pielou指数均降低(P值均<0.01)。在门水平上,接尘组人群咽部拟杆菌门和梭杆菌门丰度均高于对照组(P值均<0.05);在属水平上,与对照组比较,接尘组人群咽部普氏菌属、奈瑟菌属和单胞菌属等丰度均增高(P值均<0.05),乳杆菌属丰度降低(P值<0.05)。受试者工作特征曲线分析结果显示,乳杆菌属、梭杆菌属和罗氏菌属对接尘工人咽部菌群失衡有较高的预测价值,曲线下面积均为1.00±0.00。结论煤矿粉尘接触人群咽部菌群物种多样性和菌群均匀度均降低,可能与煤尘的持续吸入扰乱了人体咽部的微生物环境有关。 展开更多
关键词 粉尘 煤矿工人 咽部菌群 16srna 高通量测序
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MALDI-TOF MS直接检测清洁中段尿液标本中病原菌的价值 被引量:6
7
作者 徐令清 张冈毅 +5 位作者 钟子莹 温伟洪 汤英贤 钟国权 李介华 刘丽忠 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第22期2748-2751,共4页
目的探讨基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)对清洁中段尿液标本中细菌的鉴定价值。方法收集300份清洁中段尿液标本,接种于血琼脂平板上,对尿液标本进行离心处理,采用MALDI-TOF MS对离心后的尿沉渣进行鉴定,同时对培养... 目的探讨基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)对清洁中段尿液标本中细菌的鉴定价值。方法收集300份清洁中段尿液标本,接种于血琼脂平板上,对尿液标本进行离心处理,采用MALDI-TOF MS对离心后的尿沉渣进行鉴定,同时对培养出的单个菌落进行鉴定,并用Vitek 2 Compact及BD phoenixM50全自动微生物分析系统进行鉴定复核。结果300份清洁中段尿液标本中,63份培养鉴定到1种细菌,MALDI-TOF MS的菌株鉴定结果与两种全自动微生物分析系统的细菌鉴定结果的符合率为100.0%;MALDI-TOF MS在以上63份尿沉渣中直接检出25株细菌,检出率为39.7%(25/63);其中大肠埃希菌15株,占60.0%(15/25);肺炎克雷伯菌4株,占16.0%(4/25);粪肠球菌2株,占8.0%(2/25);产气肠杆菌1株,里昂葡萄球菌1株,黏质沙雷菌1株,分别各占4.0%(1/25);20份标本培养出两种细菌,应用MALDI-TOF MS直接在2份尿沉渣中检出2株屎肠球菌,检出率为10.0%(2/20)。结论MALDI-TOF MS鉴定准确率高,可从临床标本直接检测病原菌,节省培养时间,对两种混合菌感染的标本也有一定鉴定能力。 展开更多
关键词 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 病原菌 中段尿 16srna
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基于16sRNA测序技术探讨不同体质腹型肥胖者肠道菌群特征
8
作者 袁梦华 扈新刚 赵燕 《山东中医杂志》 2024年第7期694-699,共6页
目的:探讨痰湿体质与非痰湿体质腹型肥胖人群肠道菌群的丰度及物种差异。方法:共纳入91例不同体质腹型肥胖受试者,收集了91例大便样本,其中痰湿体质受试者44例,非痰湿体质受试者47例。使用NovaSeq6000基因测序仪,对痰湿体质与非痰湿体... 目的:探讨痰湿体质与非痰湿体质腹型肥胖人群肠道菌群的丰度及物种差异。方法:共纳入91例不同体质腹型肥胖受试者,收集了91例大便样本,其中痰湿体质受试者44例,非痰湿体质受试者47例。使用NovaSeq6000基因测序仪,对痰湿体质与非痰湿体质受试者肠道菌群相对丰度、物种多样性进行分析。结果:痰湿体质与非痰湿体质腹型肥胖受试者的肠道菌群门纲目科属五个层级菌群相对丰度的差异显著。痰湿体质与非痰湿体质相比门纲目科属五个层级菌群相对丰度以及差别较大,其中拟杆菌、类杆菌、毛螺菌、肠杆菌相对丰度差异有统计学意义(P<0.05)。结论:痰湿体质与非痰湿体质腹型肥胖受试者肠道菌群存在差异,二者间菌群差异可能是形成体质差异的内在因素。 展开更多
关键词 中医体质 痰湿体质 非痰湿体质 肠道菌群 16srna 腹型肥胖 Alpha多样性
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脓毒症小鼠肠道菌群紊乱的研究 被引量:5
9
作者 李玮 林名瑞 +2 位作者 陈怀宇 文丹 林建东 《中国急救医学》 CAS CSCD 2021年第10期887-892,共6页
目的对比脓毒症组小鼠与正常对照组小鼠的肠道菌群,以明确肠道菌群组成特点。方法将60只BALB/C小鼠随机等分为对照组(CF组)和脓毒症组(SF组)(每组各30只)。SF组小鼠按脂多糖(LPS)10 mg/kg腹腔注射构建脓毒症模型,CF组则予等量生理盐水... 目的对比脓毒症组小鼠与正常对照组小鼠的肠道菌群,以明确肠道菌群组成特点。方法将60只BALB/C小鼠随机等分为对照组(CF组)和脓毒症组(SF组)(每组各30只)。SF组小鼠按脂多糖(LPS)10 mg/kg腹腔注射构建脓毒症模型,CF组则予等量生理盐水腹腔注射。术后24、72 h每组小鼠留取粪便标本行16sRNA测序。在72 h同时取盲肠组织做组织学检查。结果LPS干预后72 h小鼠结肠局部黏膜上皮缺失,肠腺结构消失,炎性细胞浸润,上皮细胞肿胀。肠道菌群方面:SF组较CF组小鼠的肠道菌群多样性明显减少。CF组小鼠肠道菌群主要以拟杆菌门和厚壁菌门为主,但SF组小鼠厚壁菌属比例总体呈现减少趋势,变形菌门则表现为增长的趋势。LPS干预后24 h SF组小鼠肠道菌群出现紊乱:粪肠球菌属、大肠杆菌属、弗格森埃希菌属、缓慢葡萄球菌属及不可培养的大肠杆菌属明显增多(P<0.05),梭状芽孢菌属、毛螺科菌属、未培养的梭菌属则明显减少(P<0.05)。LPS干预后72 h SF组小鼠肠道菌群的变化情况:铅黄肠球菌、粪肠球菌、大肠杆菌、费格森埃希菌、金氏拟杆菌、奇异变形杆菌、未培养的埃希菌属和肠球菌明显增多(P<0.05),鼠乳杆菌、未培养的拟杆菌属、约氏乳杆菌则明显减少(P<0.05)。结论脓毒症小鼠可致肠道微生态的紊乱,微生物的多样性减少,潜在致病菌的过度生长,同时炎症作用下肠道屏障的破坏可能为微生物移位创造条件,也可能成为病情进一步发展的重要推动力。 展开更多
关键词 脓毒症 脂多糖 小鼠 肠道菌群 16srna
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大黄对脓毒症小鼠早期肠道菌群的影响 被引量:5
10
作者 李玮 林名瑞 +3 位作者 郭小艳 陈怀宇 文丹 姚洁 《蛇志》 2021年第2期138-140,149,共4页
目的采用16sRNA测序技术检测大黄对脓毒症小鼠早期肠道菌群的变化情况,分析大黄对脓毒症小鼠的治疗作用机制。方法将45只BALB/C小鼠随机等分为3组,即对照组、脓毒症组、脓毒症大黄干预组。实验前正常饮食、饮水。术前2 d脓毒症大黄干预... 目的采用16sRNA测序技术检测大黄对脓毒症小鼠早期肠道菌群的变化情况,分析大黄对脓毒症小鼠的治疗作用机制。方法将45只BALB/C小鼠随机等分为3组,即对照组、脓毒症组、脓毒症大黄干预组。实验前正常饮食、饮水。术前2 d脓毒症大黄干预组按生药量50 mg/kg灌胃给药,每天2次;对照组、脓毒症组给予等量生理盐水灌胃。3组小鼠灌胃给药2 d后,脓毒症组及脓毒症大黄干预组小鼠按LPS 10 mg/kg腹腔注射构建脓毒症模型,对照组予等量生理盐水腹腔注射。建模后24 h取盲肠组织行病理检查以及粪便组织16sRNA检测。结果经大黄干预后,脓毒症小鼠盲肠组织结构的改变得到一定程度的缓解。脓毒症组小鼠厚壁菌属比例明显减少,拟杆菌属相对增多。脓毒症大黄干预组小鼠拟杆菌属、厚壁菌属、弯曲菌属均有减少,而变形菌属明显增多。结论大黄干预后,脓毒症小鼠肠道菌群进一步变化,变形杆菌属相对增多为优势菌群;结合病理结果,考虑大黄对脓毒症小鼠的治疗作用主要是通过保护肠道黏膜屏障而起到保护作用。 展开更多
关键词 脓毒症 LPS 小鼠 大黄 16srna
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阪崎肠杆菌检测技术研究进展 被引量:5
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作者 李锦程 王玉坤 曹远银 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期371-373,共3页
关键词 阪崎肠杆菌 检测技术 革兰阴性细菌 肠道正常菌群 16srna PCR法检测 PCR测定 生化鉴定
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乙型肝炎病毒感染性疾病患者肠道菌群结构和多样性分析
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作者 赵成燕 周欣怡 +3 位作者 高冉冉 韩丹 郑嵘炅 鲁晓擘 《肝脏》 2023年第11期1339-1345,1368,共8页
目的探究乙型肝炎病毒(HBV)感染性疾病患者肠道菌群间的差异性。方法收集2020年2—9月新疆医科大学第一附属医院肝病专科收治的133例肝病患者粪便,包括HBV携带者(HBV组)23例、乙型肝炎肝硬化(LC组)25例、肝细胞癌(HCC组)38例、慢加急性... 目的探究乙型肝炎病毒(HBV)感染性疾病患者肠道菌群间的差异性。方法收集2020年2—9月新疆医科大学第一附属医院肝病专科收治的133例肝病患者粪便,包括HBV携带者(HBV组)23例、乙型肝炎肝硬化(LC组)25例、肝细胞癌(HCC组)38例、慢加急性肝衰竭(ACLF组)16例、自身免疫性肝炎(AIH组)13例和原发性胆汁性肝硬化(PBC组)18例。提取粪便样本基因组DNA,特定性引物扩增DNA样本中16S rRNA基因的V3~V4可变区。Usparse软件分析扩增序列,并依据分析结果(相似度≥97%)划分OTU,Silva数据库对OTU进行分类信息标注;QIIME软件进行肠道菌群物种多样性和组间菌群差异性分析。结果6组样本中门水平上丰度前4的菌门依次为Firmicutes、Proteobacteria、Bacteroidota、Actinobacteria,HBV组、LC组、HCC组、ACLF组、AIH组和PBC组样本中4大菌门总占比分布为88.76%、97.22%、96.15%、92.88%、95.91%和93.36%。HBV组和HCC组Actinobacteria丰度显著高于LC组,HBV组Actinobacteriota和其他菌门丰度均显著高于LC组、HCC组和ACLF组,LC组和ACLF组的Actinobacteriota及ACLF组的其他菌门丰度均显著低于PBC组;LC组Bacteroidota丰度显著高于HCC组;HCC组的Firmicutes丰度显著高于HBV组。6组样本肠道菌群丰度依次为HBV组、PBC组、LC组、HCC组、ACLF组、AIH组。HBV组、LC组、HCC组和PBC组组内菌群差异性较大,组间肠道菌群群落结构差异较大,ACLF组和AIH组中肠道菌群群落比较集中,群落结构相似。HBV组物种数明显多于LC组、HCC组和ACLF组,LC组少于低于AIH组和PBC组,HCC组和ACLF组均显著低于PBC组(P<0.05);HBV组Shannon指数明显高于LC组和ACLF组,LC组、HCC组、ACLF组Shannon指数均明显低于PBC组(P<0.05)。结论HBV感染者随着肝损伤病情加重肠道菌群丰度和多样性下降,且HBV感染者肠道菌群丰度和多样性与AIH和PBC患者均均存在明显差异。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 肝损伤 肠道菌群 16srna
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肠道菌群与结直肠癌进展关系的临床研究探讨 被引量:3
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作者 张默涵 葛振宇 +3 位作者 谭杨 谷金华 史立宏 张小茜 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期293-298,共6页
目的:探讨结直肠癌不同进展过程中患者肠道的优势菌群以及对结直肠癌进展的影响。方法:回顾性分析2020年1月至2021年5月于潍坊医学院附属医院就诊的20例结直肠癌患者、20例腺瘤性息肉患者和20例健康受试者,分别设为C组、A组和N组,分别... 目的:探讨结直肠癌不同进展过程中患者肠道的优势菌群以及对结直肠癌进展的影响。方法:回顾性分析2020年1月至2021年5月于潍坊医学院附属医院就诊的20例结直肠癌患者、20例腺瘤性息肉患者和20例健康受试者,分别设为C组、A组和N组,分别收集粪便以及肿瘤组织、息肉组织及肠壁组织。利用16sRNA技术对收集的粪便进行高通量测序,比较微生物的丰度与多样性,并利用免疫组织化学法检测肿瘤组织、息肉组织以及肠壁组织白细胞介素-6(interleukin 6,IL-6)的表达水平。结果:稀释性曲线显示所有样本包含的OTU数目不同;采用α多样性、β多样性、PCoA等分析显示:不同样本间及组间菌群的丰度及多样性有显著性差异。LEfSe分析显示差异最显著的菌为C组Prevotellaceae、A组Enterobacteriaceae、Erysipelotrichaceae和N组Ruminococcaceae、Bifidobacteriaceae。免疫组织化学结果显示IL-6在C组中的阳性率高于A组和N组。结论:在C组、A组与N组中,每个样本的菌群的丰度与多样性并不相同,各组具有明显不同的群落结构,呈现出组内样本差异较小,组间样本差异较大的现象(P<0.05)。结直肠癌可能与Prevotellaceae有关,而腺瘤性息肉可能与Enterobacteriaceae、Erysipelotrichaceae有关。慢性炎症可能通过产生IL-6等炎性因子导致癌前病变,进而进展为结直肠癌。 展开更多
关键词 肠道菌群 结直肠癌 肠道腺瘤性息肉 16srna
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116株结核分枝杆菌链霉素耐药菌株rspL和rrs基因突变特征研究 被引量:5
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作者 谢彤 李桂莲 +4 位作者 巨韩芳 赵德福 赵慧 穆成 王撷秀 《中国防痨杂志》 CAS 2010年第10期636-638,共3页
关键词 rrs基因 耐药菌株 链霉素 结核分枝杆菌 突变特征 16srna 氨基糖苷类抗生素 RPSL基因
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溶磷细菌筛选及在复垦土壤上对难溶态磷的活化作用 被引量:3
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作者 乔志伟 刘超 邵晓贵 《地球与环境》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期558-564,共7页
为研究溶磷细菌在复垦土壤上对难溶态磷的活化作用,通过PVK平板法从石灰性土壤中分离筛选出7株溶磷细菌,7株菌株的溶磷能力在296.5~563.5 mg/L之间,菌株的溶磷能力与溶磷圈直径(D)与菌落直径(d)的比值呈显著正相关(p<0.01);16sRNA序... 为研究溶磷细菌在复垦土壤上对难溶态磷的活化作用,通过PVK平板法从石灰性土壤中分离筛选出7株溶磷细菌,7株菌株的溶磷能力在296.5~563.5 mg/L之间,菌株的溶磷能力与溶磷圈直径(D)与菌落直径(d)的比值呈显著正相关(p<0.01);16sRNA序列分析表明,W1、W6属于Enterobacter sp.,W2、W4属于Burkholderia sp.,W3、W5属于Rahnella sp.,W7属于Fluorescent pseudomonas.选择W3、W4、W7作为试验菌株,以磷酸三钙、磷矿粉为难溶态磷源,研究单菌株及组合菌株在配施难溶态磷酸盐条件下对复垦土壤有效磷、各形态无机磷含量及油菜产量的影响.结果表明,同一底物下溶磷细菌各处理复垦土壤有效磷含量和油菜产量显著高于基质处理(p<0.05),组合菌株处理优于单菌株处理,W3+W4+W7处理两项指标都最高;在溶磷细菌+磷酸三钙底物下,W3+W4+W7处理复垦土壤有效磷含量和油菜产量分别比单施溶磷细菌、溶磷细菌+磷矿粉两个底物下同一处理显著增加94.81%、40.25%和34.13%、9.43%;相同底物下溶磷细菌各处理复垦土壤Ca2-P、Ca8-P、A1-P、Fe-P含量都高于基质处理,Ca10-P含量小于基质处理,O-P含量与基质处理差异不显著.这一结果可为溶磷细菌在复垦土壤上应用技术的研发提供理论基础. 展开更多
关键词 溶磷细菌 16srna 复垦土壤 难溶态磷 活化
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高通量测序分析不同病理类型食管癌患者食管菌群的特征 被引量:3
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作者 刘晓波 高子夜 +7 位作者 徐文 屠新华 姜东升 王茂生 吴婷 周梦 李胜保 童强 《中华实用诊断与治疗杂志》 2020年第7期699-702,共4页
目的探讨不同病理类型食管癌患者的食管菌群特征。方法 37例食管癌患者依据手术组织病理分为鳞癌组29例和非鳞癌(腺癌和神经内分泌癌)组8例,对细菌16SrRNA基因序列V4高变区扩增,用Illumina HiSeq测序,可操作分类单元聚类分析2组菌群结... 目的探讨不同病理类型食管癌患者的食管菌群特征。方法 37例食管癌患者依据手术组织病理分为鳞癌组29例和非鳞癌(腺癌和神经内分泌癌)组8例,对细菌16SrRNA基因序列V4高变区扩增,用Illumina HiSeq测序,可操作分类单元聚类分析2组菌群结构、丰度和多样性。结果非鳞癌组Chao1指数(514.790±257.529)、Shannon指数(5.929±1.015)和Simpson指数(0.950±0.027)与鳞癌组(532.636±251.516、5.661±0.962、0.934±0.051)比较差异均无统计学意义(P>0.05),2组菌群丰度相似;非度量多维尺度分析显示2组样本分布有交叉,不能完全区分,2组菌群多样性无明显差异。在门水平,非鳞癌组放线菌门、绿菌门、脱铁杆菌门、梭杆菌门丰度较鳞癌组增多(P<0.05),其余菌门2组比较差异无统计学意义(P>0.05)。差异显著的29个属中,鳞癌组短杆菌属、弗兰克氏菌属、纤维菌属、桥杆菌属、香味菌属、糖杆菌属、芽孢八叠球菌属、寡源杆菌属、动胶杆菌属、硫曲菌属、军团菌属、盐单胞菌属缺失(丰度为0),与非鳞癌组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论通过Illumina HiSep高通量测序技术建立本地区食管癌微生态基因集,鳞癌和非鳞癌食管菌群多样性无明显差异,但在门水平和属水平上存在明显差异。 展开更多
关键词 食管鳞癌 16srna 食管微生态 宏基因组学 高通量测序
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结直肠癌高危人群蔬菜和红肉摄入频率与肠道菌群关系的研究
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作者 张克明 李春燕 +5 位作者 刘奕玮 赵菁 王奕潇 王媛 芦文丽 朱云 《营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期371-377,共7页
目的探索饮食中蔬菜、红肉摄入与肠道微生态的关系。方法本研究为横断面研究,纳入2020年1月至2021年8月在天津市南开医院进行肠镜筛查的居民147例,年龄40~75岁。受试者填写个人史问卷以收集其基本情况、饮食和生活习惯等信息,并提供一... 目的探索饮食中蔬菜、红肉摄入与肠道微生态的关系。方法本研究为横断面研究,纳入2020年1月至2021年8月在天津市南开医院进行肠镜筛查的居民147例,年龄40~75岁。受试者填写个人史问卷以收集其基本情况、饮食和生活习惯等信息,并提供一份粪便样品用于肠道菌群检测。按照周均摄食频次将受试者分为低蔬菜摄入组(60例)、高蔬菜摄入组(87例)、低红肉摄入组(75例)和高红肉摄入组(72例)。通过16S rRNA Illumina NovaSeq高通量测序技术检测分析受试者肠道菌群结构。结果在门水平上,高蔬菜摄入组较低蔬菜摄入组疣微菌门相对丰度显著升高。在属水平上,高蔬菜摄入组嗜黏蛋白阿克曼氏菌属相对丰度升高。高蔬菜摄入组相较于低蔬菜摄入组的特征菌多,且两组特征菌不同。高蔬菜摄入组中的特征菌为拟杆菌属、阿克曼氏菌属以及疣微菌属,而低蔬菜摄入组的特征菌为毛螺旋菌属。此外,低红肉摄入组产碱杆菌的相对丰度显著高于高红肉摄入组。低红肉摄入组的特征菌较多,包括伯克霍尔顿菌、β变形菌、明串珠菌以及产碱菌,而本研究在高红肉摄入组中未发现特征菌。结论在门水平上,高蔬菜摄入频次与疣微菌门相对丰度升高有关。在属水平上,高蔬菜摄入频次与嗜黏蛋白阿克曼氏菌属的相对丰度升高有关。低红肉摄入频次饮食可能更多的富集产碱杆菌属。 展开更多
关键词 肠道微生态 肠道菌群 16srna 蔬菜摄入频次 红肉摄入频次
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基于线粒体16SrRNA基因的14种造礁石珊瑚系统发育关系分析 被引量:4
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作者 廖宝林 肖宝华 +1 位作者 杨小东 谢子强 《广东海洋大学学报》 CAS 2016年第4期23-29,共7页
通过16SrRNA基因特异扩增测序,对惠州大亚湾大辣甲岛和小辣甲岛附近海域14种造礁石珊瑚16SrRNA基因片段序列进行了比较分析。结果表明,该片段序列的平均A+T含量为63.5%,所有物种的序列碱基AT含量大于GC含量,序列都处于高度饱和的状态。1... 通过16SrRNA基因特异扩增测序,对惠州大亚湾大辣甲岛和小辣甲岛附近海域14种造礁石珊瑚16SrRNA基因片段序列进行了比较分析。结果表明,该片段序列的平均A+T含量为63.5%,所有物种的序列碱基AT含量大于GC含量,序列都处于高度饱和的状态。14种造礁石珊瑚的平均遗传距离为0.179。采用NJ、ML和ME法构建系统发育树,结果显示蜂巢珊瑚科单独作为分支处于发育树的基部,而第二支分支包括菌珊瑚科、鹿角珊瑚科、滨珊瑚科和枇杷珊瑚科。裸肋珊瑚科的腐蚀刺柄珊瑚聚到了蜂巢珊瑚科中,与传统形态学分类存在差异,提示造礁石珊瑚表型的变异性可能对传统分类存在影响。 展开更多
关键词 造礁石珊瑚 16S RRNA 分子系统学
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一株嗜盐细菌的16SrRNA基因序列分析 被引量:4
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作者 汪长东 陈鹏 +1 位作者 闫旭 何光源 《生物技术》 CAS CSCD 2008年第6期1-3,共3页
目的:从舟山深海海泥中获得了底泥样品,并从中提取到了一株嗜盐细菌。方法:通过用不同盐浓度的培养基培养,挑取单菌落,反复划线纯化,得到了嗜盐菌的单菌落,通过菌株基因组DNA的提取、菌株的抗性实验、质粒的提取、16SrRNA的PCR扩增及克... 目的:从舟山深海海泥中获得了底泥样品,并从中提取到了一株嗜盐细菌。方法:通过用不同盐浓度的培养基培养,挑取单菌落,反复划线纯化,得到了嗜盐菌的单菌落,通过菌株基因组DNA的提取、菌株的抗性实验、质粒的提取、16SrRNA的PCR扩增及克隆、16SrRNA的全序列分析等手段。结果:得到该菌株的16SrRNA的基因序列。结论:该株嗜盐菌是一株新色盐杆菌。 展开更多
关键词 嗜盐菌 筛选 16srna PCR
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一株具有抗真菌活性的食酸丛毛单胞菌的分离和鉴定 被引量:3
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作者 秦磊 王恒安 +3 位作者 欧阳志明 顾翠妹 成志恒 赵国屏 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期72-76,共5页
在土壤中分离到一株细菌STRA ,菌块测定法显示该菌可显著抑制玉米小斑病菌和稻恶苗病菌 ,具有抗真菌活性。该菌可以在SFM和LB等多种培养基上生长 ,且菌落生长无明显终止现象 ;革兰氏染色为阴性 ,电镜观察可见 2~ 4根鞭毛。 (G +C) %在 ... 在土壤中分离到一株细菌STRA ,菌块测定法显示该菌可显著抑制玉米小斑病菌和稻恶苗病菌 ,具有抗真菌活性。该菌可以在SFM和LB等多种培养基上生长 ,且菌落生长无明显终止现象 ;革兰氏染色为阴性 ,电镜观察可见 2~ 4根鞭毛。 (G +C) %在 5 9%~ 6 7%范围内。生化指标的检测显示该菌株对所测试的多数糖类不能发酵 ,经BioMerieuxVitek的革兰氏阴性细菌检测试验卡 (GNI)鉴定为食酸丛毛单胞菌 (Delftiaacidovorans)。设计两对简并引物对其 16SRNA进行PCR扩增 ,16SRNA的序列及其相关生物信息学分析结果进一步确证生化鉴定结果。该分离株的抗真菌物质的特性鉴定。 展开更多
关键词 抗真菌活性 食酸丛毛单胞菌 分离 鉴定 16srna
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