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慢性根尖周炎瘘管发生与根管内特殊细菌定植相关性的初步研究 被引量:5
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作者 李欣 王霄 张成飞 《口腔医学研究》 CAS CSCD 2012年第10期1004-1007,共4页
目的:检测和比较有瘘型与无瘘型根尖周病感染根管内优势菌丛的分布特点。方法:选择60位慢性根尖周炎患者共64颗患牙,在对每个患牙进行根管治疗的过程中,髓腔预备及根管初预备后,用无菌纸尖吸取根管内容物进行采样,置入无菌EP管,于10min... 目的:检测和比较有瘘型与无瘘型根尖周病感染根管内优势菌丛的分布特点。方法:选择60位慢性根尖周炎患者共64颗患牙,在对每个患牙进行根管治疗的过程中,髓腔预备及根管初预备后,用无菌纸尖吸取根管内容物进行采样,置入无菌EP管,于10min内送至-20℃冰箱保存。对根管内样本进行genomic DNA提取,使用27种选取的由基因公司提供的感染根管内优势菌的引物对上述64例样本进行多重模板扩增,根据扩增产物的有无判断各样本中含有的菌种类型。结果:瘘管的发生与Prevotella nigrescens(变黑普氏菌)、Porphyromonas spp.(卟啉单胞菌)、Peptostreptococcus stomatis(口炎消化链球菌)、革兰氏阴性球菌、Capnocytophaga ochracea(黄褐二氧化碳嗜纤维菌)、Corynebacterium matruchotii(马氏棒杆菌)、Hafnia spp.(哈夫尼菌属)及Eubacterium spp.(真杆菌属)的感染有关。结论:慢性根尖周炎瘘管发生与根管内分离到的Prevotella nigrescens、Porphyromonas spp.、Peptostreptococcus stomatis、革兰氏阴性球菌、Capnocytophaga ochracea、Corynebacterium matruchotii、Hafnia spp.及Eubacterium spp.的特异性定植有关。 展开更多
关键词 慢性根尖周炎 感染根管 优势菌丛 16S-rdna PCR
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上海地区不同植物根际荧光假单胞菌多样性 被引量:3
2
作者 张文茹 白燕 +1 位作者 彭珺 肖明 《上海师范大学学报(自然科学版)》 2008年第2期182-188,共7页
荧光假单胞菌是一种常见的植物根际促生细菌,有开发作为生物农药的潜质.以分离自上海周边地区12种植物根际的104株荧光假单胞菌为研究对象,进行了表型分类,并采用16S-rDNA RFLP和REP-PCR技术,系统地研究了荧光假单胞菌的遗传多样性.结... 荧光假单胞菌是一种常见的植物根际促生细菌,有开发作为生物农药的潜质.以分离自上海周边地区12种植物根际的104株荧光假单胞菌为研究对象,进行了表型分类,并采用16S-rDNA RFLP和REP-PCR技术,系统地研究了荧光假单胞菌的遗传多样性.结果表明:16S-rDNA RFLP酶切图谱聚类分析在85%相似性水平上,可将供试菌株划分为9群;REP-PCR指纹图谱聚类分析在76%相似性水平上,可将供试菌株划分为26群,说明上海地区的荧光假单胞菌具有丰富的遗传多样性;聚类分析结果还显示出菌株间亲缘关系与其分离地和所在植物具有相关性,表明环境条件对荧光假单胞菌的发育和遗传分化有重要影响. 展开更多
关键词 荧光假单胞菌 16S—rdna PCR—RFLP REP—PCR 遗传多样性
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基于16S-rDNA序列的核桃细菌性疫病病原菌遗传多态性分析 被引量:3
3
作者 傅本重 陈倩倩 +5 位作者 魏蜜 朱洁倩 杨新河 李国元 邹礼平 汪殿蓓 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期63-68,共6页
核桃细菌性疫病(Xanthomonas arboricola pv.juglandis)是世界范围内核桃产区最主要的细菌病害,对其病原菌16S-rDNA的序列进行分析,为阐明其遗传多样性提供参考。本研究从湖北省保康县和丹江口市多个核桃园采集病样,对不同核桃病组织样... 核桃细菌性疫病(Xanthomonas arboricola pv.juglandis)是世界范围内核桃产区最主要的细菌病害,对其病原菌16S-rDNA的序列进行分析,为阐明其遗传多样性提供参考。本研究从湖北省保康县和丹江口市多个核桃园采集病样,对不同核桃病组织样进行分离纯化,得到77个病原菌类似菌株,对部分菌株进行了接种和分子鉴定。用通用引物27F和1492R对其中有代表性的22株进行16S-rDNA的PCR扩增和测序。用软件MEGA7.0对所有测序结果进行遗传发育树分析,菌株之间平均遗传距离为0.244。用3种限制性内切酶MspI、AfeI和HinfI对16S-rDNA的PCR产物进行酶切,酶切结果用软件NTSYSpc2.1进行聚类分析。所有菌株之间相似系数大于52%,在76%的相似水平,可以将22个菌株划分为6个类群。用软件ApE对所有序列进行同样的3个酶切,RFLP分析结果与试验酶切结果相似。不同方法构建的聚类和发育树分析结果表明,湖北省不同地理来源和病组织的菌株存在一定的遗传多态性。 展开更多
关键词 核桃细菌性疫病 16S-rdna RFLP MEGA 遗传多样性
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丙酸测定与丙酸高产菌的筛选、鉴定 被引量:1
4
作者 叶文彬 郑毅 章新 《海峡科学》 2015年第4期3-5,共3页
采用表观筛选与丙酸HPLC测定方法,从富含丙酸菌与乳酸菌的奶酪中分离、筛选得到1株高产丙酸的菌株FS1026。对该菌株进行16S rDNA序列分析,构建相关序列进化树,鉴定该菌株为产酸丙酸杆菌(Propionibacterium acidipropionici sp.)
关键词 丙酸 16s-rdna 高效液相色谱法
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基于高通量测序的急性阑尾炎阑尾切除术后肠道微生态变化研究
5
作者 刘园园 努尔买买提 《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》 2022年第7期61-65,共5页
基于16S-rDNA高通量测序技术分析急性阑尾炎阑尾切除术后肠道微生态变化情况,探讨阑尾切除对患者肠道菌群物种多样性、肠道微生态结构的影响。方法:选取我院2020年1月~2021年6月收治的因急性阑尾炎行阑尾切除术后≥1年人群32例作为观察... 基于16S-rDNA高通量测序技术分析急性阑尾炎阑尾切除术后肠道微生态变化情况,探讨阑尾切除对患者肠道菌群物种多样性、肠道微生态结构的影响。方法:选取我院2020年1月~2021年6月收治的因急性阑尾炎行阑尾切除术后≥1年人群32例作为观察组,按术后时间分组为A(术后1~2年)、B(术后2~5年)、C(术后≥5年)三组,另选取同期入我院体检且未行阑尾切除术者30例作为对照组。所有人员均提取粪便标本及其微生物总DNA、检测DAN样品,采用16S-rDNA高通量测序技术对V3-V4区域行扩增测序,并对结果进行生物信息学分析,比较两组不同人群的肠道微生态状况。结果:两组肠道菌群丰富度相关变量(Ace、Chao1与Observed指数)、多样性相关变量(Shannon、Simpson指数)与均匀度相关变量(J指数)差异均有统计学意义(P<0.05),统计肠道菌群操作分类单元(operational taxonomic unit, OTU) 数目显示对照组OTU数目多于观察组。主坐标分析(Principal Coordinates Analysis,PCoA)、主成分分析(Principal Component Analysis, PCA)分析均显示两组肠道菌群有明显差异。A、B、C三组Ace、Chao1、Observed、Shannon、Simpson指数、J指数比较均有明显差异(P<0.05),PCA 分析显示三组肠道菌群存在差异。结论:急性阑尾炎阑尾切除术后人群肠道菌群多样性、丰富度和均匀度均显著下降,与健康人群相比其肠道微生态物种多样性降低,肠道菌群有显著差异;随着术后时间延长,阑尾切除术后患者肠道微生态多样性呈升高和恢复趋势。 展开更多
关键词 急性阑尾炎 肠道微生态 肠道菌群 16S-rdna 高通量测序
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薯蓣粥对T2DM大鼠肠道微生物、血糖、胰岛素的影响 被引量:5
6
作者 洪雪珮 庞书勤 +3 位作者 周建 陈芳 罗宗婷 张佳惠 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2021年第14期341-347,共7页
目的:探讨薯蓣粥对2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)大鼠肠道微生物、短链脂肪酸(shortchain fatty acids,SCFAs)血糖、胰岛素分泌的影响。方法:将60只SPF级Wister大鼠随机抽取10只为空白组,剩余50只腹部注射链脲佐菌素(STZ)制... 目的:探讨薯蓣粥对2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)大鼠肠道微生物、短链脂肪酸(shortchain fatty acids,SCFAs)血糖、胰岛素分泌的影响。方法:将60只SPF级Wister大鼠随机抽取10只为空白组,剩余50只腹部注射链脲佐菌素(STZ)制作T2DM模型,成模后大鼠随机分为模型组、薯蓣粥组、二甲双胍组、联合组;空白组和模型组每日用生理盐水灌胃5 mL,薯蓣粥组每日用薯蓣粥灌胃5 mL,二甲双胍组每日用二甲双胍水溶液灌胃,联合组用薯蓣粥+二甲双胍灌胃,共干预6周;干预期间每周检测大鼠空腹血糖(FBG),干预后检测大鼠肠道菌群构成以及FBG、空腹胰岛素(FINS)水平、粪便内SCFAs的含量。结果:与空白组相比,模型组大鼠空腹血糖、空腹胰岛素含量、胰岛素抵抗指数均升高(P<0.05),粪便中乙酸、丙酸、丁酸含量,以及OTUs(Operational Taxonomic Units)、Chao1指数、Shannon指数明显降低(P<0.05),厚壁菌门、疣微菌门、颤螺菌、阿克曼氏菌、梭菌的相对丰度降低(P<0.05),变形菌门相对丰度增加(P<0.05)。干预4周,薯蓣粥组大鼠空腹血糖出现明显降低(P<0.05)。干预结束后薯蓣粥组大鼠的空腹血糖、空腹胰岛素含量、胰岛素抵抗指数均低于模型组(P<0.01),空腹胰岛素含量、胰岛素抵抗指数与二甲双胍组、联合组相比没有统计学差异(P>0.05)。薯蓣粥组与模型组相比,粪便中乙酸、丙酸、丁酸的含量均升高(P<0.01);OTUs指数升高,厚壁菌门、疣微菌门、阿克曼氏菌、梭菌的相对丰度升高,变形菌门的相对丰度降低(P<0.05)。结论:薯蓣粥可能通过改善T2DM大鼠肠道微生物失调,增加SCFAs含量,从而改善胰岛素抵抗,降低血糖。 展开更多
关键词 薯蓣粥 2型糖尿病 肠道菌群 短链脂肪酸 16S-rdna测序
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运用454焦磷酸测序技术对病原菌16S-rDNA的分析 被引量:5
7
作者 林萍 周与华 +1 位作者 李擎天 郭晓奎 《检验医学》 CAS 北大核心 2011年第6期364-367,共4页
目的探讨运用测序技术鉴定临床感染标本中病原菌的应用价值。方法运用聚合酶链反应(PCR)扩增及454焦磷酸测序技术,对标本中病原菌16S-rDNA V3区进行多样性分析;并与细菌培养结果相比较。结果测序能检测出临床不宜培养的菌属,如支原体属... 目的探讨运用测序技术鉴定临床感染标本中病原菌的应用价值。方法运用聚合酶链反应(PCR)扩增及454焦磷酸测序技术,对标本中病原菌16S-rDNA V3区进行多样性分析;并与细菌培养结果相比较。结果测序能检测出临床不宜培养的菌属,如支原体属、嗜血杆菌属、莫拉菌属等;9种菌属为2种方法共同检测所得,7种菌属的P值均<0.05。结论 2种方法的检测敏感性差异有统计学意义;与细菌培养相结合是临床实践中的一种新的偿试。 展开更多
关键词 病原菌 16S—rdna基因 454焦磷酸测序技术
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16S-23SrDNA间隔区序列寡核苷酸探针对龟分枝杆菌暴发感染的鉴定 被引量:3
8
作者 张灵霞 庄玉辉 扈庆华 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 2001年第4期4-5,共2页
目的 :该研究旨在采用分子生物学技术 ,从基因水平上对深圳市某医院及河北辛集地区发生术后及注射后龟分枝杆菌暴发感染的临床分离株进行鉴定 ,并建立一套快速的的鉴定龟分枝杆菌脓肿亚种的探针杂交方法。方法 :根据龟分枝杆菌脓肿亚种... 目的 :该研究旨在采用分子生物学技术 ,从基因水平上对深圳市某医院及河北辛集地区发生术后及注射后龟分枝杆菌暴发感染的临床分离株进行鉴定 ,并建立一套快速的的鉴定龟分枝杆菌脓肿亚种的探针杂交方法。方法 :根据龟分枝杆菌脓肿亚种标准株 16S - 2 3SrDNA间隔区序列测序结果 ,设计一对寡核苷酸探针 ,对其敏感性、特异性及其对临床标本和临床分离株的检测进行了研究。结果 :探针检测PCR扩增产物敏感性为 1ng ,只与龟分枝杆菌脓肿亚种杂交 ,与 5 6株龟分枝杆菌脓肿亚种临床分离株全部杂交 ;检测 5 7株临床标本阳性率为 6 6 .6 %。结论 :探针检测从基因水平上再次确认引起这两次暴发感染的致病菌为龟分枝杆菌脓肿亚种 ,结果快速可靠。 展开更多
关键词 龟分枝杆菌暴发感染 寡核苷酸探针 PCR 16S-rdna间隔区 鉴定
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16SrRNA/rDNA序列分析在瘤胃微生物区系研究中的应用 被引量:1
9
作者 郭园 刘大程 张爱忠 《畜牧与饲料科学》 2005年第5期10-13,共4页
随着rRNA为主的分子生物学技术在瘤胃微生态研究中的不断应用与发展,动物瘤胃内环境微生物区系研究进入了一个新阶段,为动物营养学研究技术的发展提供了新的可靠的方法和手段。笔者综述了rRNA/rDNA序列分析技术应用于瘤胃微生物区系研... 随着rRNA为主的分子生物学技术在瘤胃微生态研究中的不断应用与发展,动物瘤胃内环境微生物区系研究进入了一个新阶段,为动物营养学研究技术的发展提供了新的可靠的方法和手段。笔者综述了rRNA/rDNA序列分析技术应用于瘤胃微生物区系研究中的理论依据,以及该项技术在瘤胃微生物区系分析中的应用现状和前景。 展开更多
关键词 瘤胃微生物 16SrRNA/rdna 序州分析
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微波法快速提取放线菌基因组DNA 被引量:171
10
作者 徐平 李文均 +1 位作者 徐丽华 姜成林 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期82-84,共3页
原有的放线菌基因组DNA提取方法费时、费力、费用高 ,且对极端环境放线菌成功率较低。利用微波热振惊提取固体培养基表面放线菌菌落基因组DNA ,具有快速、简便、费用低廉等优点。所得的基因组DNA可作为PCR反应的模板进行 1 6SrRNA基因... 原有的放线菌基因组DNA提取方法费时、费力、费用高 ,且对极端环境放线菌成功率较低。利用微波热振惊提取固体培养基表面放线菌菌落基因组DNA ,具有快速、简便、费用低廉等优点。所得的基因组DNA可作为PCR反应的模板进行 1 6SrRNA基因有效扩增。 展开更多
关键词 微波 基因组DNA提取 PCR 16S DNA
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养殖刺参腐皮综合征病原菌的分离与鉴定 被引量:118
11
作者 张春云 王印庚 荣小军 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期118-123,共6页
2003年春季,山东省青岛地区刺参养殖场暴发了较为严重的传染性疾病-“腐皮综合征”,该病引起的死亡造成约30%的损失。养殖刺参的发病症状表现为:厌食、摇头、肿嘴、排脏、身体萎缩、口部溃烂乃至体表大面积溃疡。从患病个体溃疡部位分... 2003年春季,山东省青岛地区刺参养殖场暴发了较为严重的传染性疾病-“腐皮综合征”,该病引起的死亡造成约30%的损失。养殖刺参的发病症状表现为:厌食、摇头、肿嘴、排脏、身体萎缩、口部溃烂乃至体表大面积溃疡。从患病个体溃疡部位分离得到一种优势细菌KL1,KL1经人工回接感染实验证明对健康刺参具有较强的致病性,且感染病参的症状与自然发病海参的症状相同。通过形态学、生理生化和16SrDNA分子生物学方法对该菌进行的分类鉴定表明,导致养成刺参“腐皮综合征”的致病菌是灿烂弧菌(Vibriosplendidus)。本文首次揭示了该地区“腐皮综合征”导致养成刺参大规模死亡的致病原因,对刺参病害防治和健康养殖具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 刺参 海水养殖 疾病 细菌 腐皮综合征 16S rdna
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红树林土壤细菌群落16SrDNAV3片段PCR产物的DGGE分析 被引量:65
12
作者 王岳坤 洪葵 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期201-204,共4页
从土壤中抽提微生物总DNA ,直接扩增 16SrDNAV3片段 ,应用变性梯度凝胶电泳 (DGGE)和分子克隆技术分析 16SrDNAV3片段的多态性 ,发现地域因素和红树品种都是影响土壤细菌群落结构的因素。通过对杯萼海桑土壤 16SrDNAV3片段PCR产物两个D... 从土壤中抽提微生物总DNA ,直接扩增 16SrDNAV3片段 ,应用变性梯度凝胶电泳 (DGGE)和分子克隆技术分析 16SrDNAV3片段的多态性 ,发现地域因素和红树品种都是影响土壤细菌群落结构的因素。通过对杯萼海桑土壤 16SrDNAV3片段PCR产物两个DGGE条带进行分子克隆、序列测定和Blast分析 ,发现每个DGGE条带包含着许多不同的 16SrDNAV3片段 ,并且其中多数为NCBI未收录的序列。这表明DGGE和克隆技术相结合的方法是研究土壤微生物群落结构的一种可行方法。 展开更多
关键词 红树林土壤 16S rdna DGGE
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甲基对硫磷降解菌假单胞菌WBC-3的筛选及其降解性能的研究 被引量:65
13
作者 陈亚丽 张先恩 +2 位作者 刘虹 王银善 夏祥明 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期490-497,共8页
从农药污染土样中分离出的一株细菌具有彻底降解甲基对硫磷的能力。该菌经生理生化特性分析和 1 6SrDNA序列同源性分析 ,鉴定为假单胞菌属 ,命名为Pseudomonassp .WBC 3。该菌在pH7~ 8、温度 2 3℃~ 3 0℃范围内均生长良好 ,对甲基对... 从农药污染土样中分离出的一株细菌具有彻底降解甲基对硫磷的能力。该菌经生理生化特性分析和 1 6SrDNA序列同源性分析 ,鉴定为假单胞菌属 ,命名为Pseudomonassp .WBC 3。该菌在pH7~ 8、温度 2 3℃~ 3 0℃范围内均生长良好 ,对甲基对硫磷的耐受浓度在单纯无机盐培养基中可达到 80 0mg L ,在含有 0 1 %葡萄糖的培养基中可达到 2 0 0 0mg L。该菌能够以甲基对硫磷作为唯一碳源、氮源 ,将其彻底降解作为生长基质 ,对于 3 0 0mg L甲基对硫磷的降解速度达 1 5mg L·h ,于 2 2h后达到其稳定生长期。该菌对于多种有机磷农药及部分芳烃类化合物具有生化代谢能力。从该菌的细胞周质组分中纯化出的有机磷水解酶在SDS PAGE胶上显示为分子量约为 3 3 5× 1 0 3 的条带。 展开更多
关键词 甲基对硫磷降解菌 假单胞菌 WBC-3 筛选 降解性能 有机磷水解酶 农药
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不同16SrDNA靶序列对DGGE分析活性污泥群落的影响 被引量:66
14
作者 邢德峰 任南琪 +2 位作者 宋佳秀 曲敏 徐香玲 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第7期1424-1428,共5页
为探讨不同通用引物扩增16S rDNA靶序列对活性污泥微生物群落分析的影响,更合理的利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术分析活性污泥样品.从连续流搅拌槽式反应器(CSTR)中获取活性污泥,以3对通用引物341f/534r、968f/1 401r和341f/926r扩增16... 为探讨不同通用引物扩增16S rDNA靶序列对活性污泥微生物群落分析的影响,更合理的利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术分析活性污泥样品.从连续流搅拌槽式反应器(CSTR)中获取活性污泥,以3对通用引物341f/534r、968f/1 401r和341f/926r扩增16S rDNA序列,用DGGE分离PCR扩增产物.研究表明采用不同引物对进行DGGE分析时,群落多样性和动态存在显著的差异.341f/534r和968f/1 401r的靶序列分离效果较好,341f/926r的靶序列分离效果较差.引物341f/534r和341f/926r DGGE图谱显示S2和S3相似性高,引物968f/1 401r DGGE图谱显示S1和S2相似性高.由此可见采用不同引物对进行DGGE分析时,群落结构之间的相似性和动态是不一致的.341f/534r的DGGE图谱中条带丰富,多样性最好,968f/1 401r的DGGE图谱次之,341f/926r DGGE图谱条带最少,多样性也较差.因此,在利用DGGE分析活性污泥样品时采用引物341f/534r和968f/1 401r是比较适宜的. 展开更多
关键词 DGGE 16S rdna 活性污泥 群落动态 群落多样性
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重金属复合污染农田土壤的微生物群落遗传多样性研究 被引量:62
15
作者 赵祥伟 骆永明 +3 位作者 滕应 李振高 宋静 吴龙华 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期186-191,共6页
采集了浙江省富阳市环山乡某冶炼厂小高炉附近受铜、锌、铅、镉不同程度复合污染的4个农田土壤样品,首先扩增土壤总DNA中的16SrDNA,然后进行变性梯度凝胶电泳(DenaturingGradientGelElectrophoresis),分析了长期受重金属复合污染的农田... 采集了浙江省富阳市环山乡某冶炼厂小高炉附近受铜、锌、铅、镉不同程度复合污染的4个农田土壤样品,首先扩增土壤总DNA中的16SrDNA,然后进行变性梯度凝胶电泳(DenaturingGradientGelElectrophoresis),分析了长期受重金属复合污染的农田土壤的微生物群落遗传多样性变化.结果表明,不同程度的重金属复合污染明显改变了农田土壤的微生物群落遗传多样性,但与多样性的改变不是简单的负相关关系,最大的多样性指数出现在中等污染程度的土壤中. 展开更多
关键词 农田土壤 遗传多样性 微生物群落 总DNA 多样性指数 采集 变性梯度凝胶电泳 重金属复合污染 污染程度 冶炼厂
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养殖大菱鲆溃疡症病原菌的分离鉴定及系统发育分析 被引量:67
16
作者 范文辉 黄倢 +2 位作者 王秀华 史成银 刘莉 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期665-670,共6页
2004年夏季山东海阳一带养殖大菱鲆(Scophthalmus maximusL.)暴发溃疡病。症状主要表现为体表病灶部位出血、肌肉溃烂、眼球凸出等,解剖可见鳃丝贫血,肝脏充血,肾脏和胆囊肿大,肠壁充血并呈透明状,从出现发病症状起,大约一周后开始出现... 2004年夏季山东海阳一带养殖大菱鲆(Scophthalmus maximusL.)暴发溃疡病。症状主要表现为体表病灶部位出血、肌肉溃烂、眼球凸出等,解剖可见鳃丝贫血,肝脏充血,肾脏和胆囊肿大,肠壁充血并呈透明状,从出现发病症状起,大约一周后开始出现死亡。从病鱼体表溃疡部位及内脏分离出优势菌并命名为H1,经人工感染证实H1即为引起本次养殖大菱鲆体表溃疡症的病原菌。对病原菌进行鉴定揭示该菌革兰氏染色阴性,菌体呈短杆状,极生单鞭毛。综合该菌在形态、生理生化、API20NE与API20E自动鉴定结果、16S rDNA同源性等方面的特性,确认H1为哈维氏弧菌(Vibrio harveyi),该菌对呋喃妥因、菌必治等多种抗生素敏感。哈维氏弧菌是海水养殖鱼类的常见致病菌,但作为养殖大菱鲆的病原菌属首次报道。 展开更多
关键词 哈维氏弧菌 大菱鲆 溃疡症 病原菌 16S rdna
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应用变性梯度凝胶电泳和16SrDNA序列分析对山羊瘤胃细菌多样性的研究 被引量:53
17
作者 姚文 朱伟云 +3 位作者 韩正康 Antoon D L Akkermans Barbara Williams Seerp Tamminga 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第9期1374-1378,共5页
以取自3头安装有永久性瘤胃瘘管的土种山羊的瘤胃内容物为材料,经过DNA抽提和PCR扩增,扩增产物利用变性梯度凝胶电泳技术(DGGE,一种DNA指纹技术)分析瘤胃细菌在两种日粮条件下的多样性.同时利用基因序列分析技术,分析了16个在DGGE胶上... 以取自3头安装有永久性瘤胃瘘管的土种山羊的瘤胃内容物为材料,经过DNA抽提和PCR扩增,扩增产物利用变性梯度凝胶电泳技术(DGGE,一种DNA指纹技术)分析瘤胃细菌在两种日粮条件下的多样性.同时利用基因序列分析技术,分析了16个在DGGE胶上有匹配带的克隆的16S rDNA序列,并与现有的数据库进行了比较.结果表明,饲喂基础日粮时3头山羊瘤胃内容物的DGGE图谱有一定的相似性(43%~55%);饲料中添加大豆黄酮一定程度上影响了瘤胃细菌的组成,DGGE 谱带变化程度分别为 1 号 36% 、2 号 46% 、3 号 30%。基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有5个基因序列与基因数据库登录的相关序列的相似性大于97%,8个基因序列的相似性在90%~96%,余下的低于90%。相似性大于97%的5个克隆中,只有1个被鉴定为Prevotella sp .,其余 4 个都属于未被鉴定的瘤胃细菌。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳 16Srdna序列分析 山羊 瘤胃细菌 多样性
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黄芪多糖对肥胖小鼠的减肥作用与调节肠道菌群的关系研究 被引量:72
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作者 何旭云 贺姣姣 +2 位作者 郑宁宁 王顺春 李后开 《世界中医药》 CAS 2016年第11期2379-2384,2388,共7页
目的:观察黄芪多糖(Astragalus Polysaccharides,APS)对于高脂饮食诱导的肥胖小鼠的减肥作用与调节肠道菌群的关系。方法:1)将50只C57bl/6J小鼠随机分为5组(n=10),分别为正常对照组(Con)、HFD(high-fat diet)组和APS低中高(在高脂饮食... 目的:观察黄芪多糖(Astragalus Polysaccharides,APS)对于高脂饮食诱导的肥胖小鼠的减肥作用与调节肠道菌群的关系。方法:1)将50只C57bl/6J小鼠随机分为5组(n=10),分别为正常对照组(Con)、HFD(high-fat diet)组和APS低中高(在高脂饮食中添加分别添加2%,4%,或8%的APS)剂量组。利用高脂饮食连续喂养8周诱导出小鼠肥胖模型,给药组同步喂养,每周进行称重。实验周期结束后,收集各组粪便样本,利用基于细菌16S r DNA测序的元基因组学方法,分析了APS对于高脂喂养小鼠肠道菌的影响。2)将10只C57bl/6J小鼠随机分为2组(n=5),分别为HFD_R组(HFD_Receptor)和APS_R组(APS_Receptor),每天分别灌胃来自HFD组和APS低剂量组(2%APS)小鼠的新鲜粪便提取液进行肠道菌移植,前八周给予正常饮食,后四周更换为HFD。结果:APS能够明显抑制高脂喂养小鼠肥胖的形成、减轻肝脏脂肪变性、降低肝脏TG水平、改善胰岛素敏感性、显著恢复高脂喂养小鼠的肠道菌群紊乱,增加拟杆菌(Bacteroidetes)与厚壁门(Firmicutes)菌的相对丰度、降低变形菌门(Proteobacteria)细菌的相对丰度,并且,APS的减肥效应能够通过肠道菌移植转移给高脂喂养受体小鼠。结论:APS对高脂喂养小鼠具有减肥作用,且APS的减肥作用与调节肥胖小鼠的肠道菌群有关。 展开更多
关键词 黄芪多糖 肥胖 肠道菌群 胰岛素敏感性 脂肪变性 16S rdna
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一株苯酚降解菌的分离和鉴定 被引量:59
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作者 徐玉泉 张维 +3 位作者 陈明 林敏 李浚明 方宣钧 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期450-455,共6页
:从工业废水中分离到一株高效降解苯酚的菌株PHEA 2 ,它能够在以苯酚为单一碳源和能源的无机培养基上生长 ,其最高苯酚降解率为 394nmol/ (mg·min) .经Biolog细菌自动鉴定仪鉴定 ,该菌株为醋酸钙不动杆菌 (Acinetobactercalcoaceti... :从工业废水中分离到一株高效降解苯酚的菌株PHEA 2 ,它能够在以苯酚为单一碳源和能源的无机培养基上生长 ,其最高苯酚降解率为 394nmol/ (mg·min) .经Biolog细菌自动鉴定仪鉴定 ,该菌株为醋酸钙不动杆菌 (Acinetobactercalcoaceti cus) .采用PCR扩增获得的该菌 16SrDNA片段 ,核苷酸序列分析结果表明 ,该菌株的 16SrDNA的核苷酸序列与醋酸钙不动杆菌同源性为 98% .在细菌系统发育分类学上 ,PHEA 2归属变形细菌γ亚类、不动杆菌属、醋酸钙不动杆菌 . 展开更多
关键词 苯酚 生物降解 16Srdna 醋酸钙不动杆菌
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生防菌株2P24与CPF-10的鉴定及其生防相关性状的初步分析 被引量:55
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作者 魏海雷 王烨 +1 位作者 张力群 唐文华 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期80-85,共6页
从山东省小麦根围土壤中分离到具有生防活性的细菌菌株2P24、CPF-10。通过对其16S rDNA序列同源性分析及生理生化测定鉴定为荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens),其中菌株2P24为生物型I,CPF-10为生物型V。对这2株细菌的生防相关性状... 从山东省小麦根围土壤中分离到具有生防活性的细菌菌株2P24、CPF-10。通过对其16S rDNA序列同源性分析及生理生化测定鉴定为荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens),其中菌株2P24为生物型I,CPF-10为生物型V。对这2株细菌的生防相关性状分析表明,二者均可产生多种抗菌物质,如2,4-二乙酰基间苯三酚(2,4-DAPG)、氢氰酸(HCN)、嗜铁素、蛋白酶等。平板对峙测定表明2株细菌对番茄青枯菌(Rastonia solanacearum)、棉花立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)、棉花枯萎菌(Fusarium oxysporum)具有明显的拮抗作用。温室生测表明2P24对番茄青枯病的防效达63.0%。CPF-10达62.4%,且持续稳定。 展开更多
关键词 生物防治 菌株2P24 CPF-10 鉴定技术 相关性状
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