期刊文献+
共找到20篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
16S rRNA、23S rRNA及16S~23S rRNA基因在细菌分离与鉴定中的应用 被引量:30
1
作者 李鹏 马艳娇 赵云 《现代畜牧兽医》 2008年第7期49-52,共4页
在细菌的进化过程中,rRNA结构既具保守性又具高变性。保守性反映生物物种的亲缘关系,高变性则揭示生物物种的特征核酸序列,rRNA是属种鉴定的分子基础。因此,可以利用保守区设计通用引物扩增细菌的相应靶序列,再利用可变区的差异鉴别菌... 在细菌的进化过程中,rRNA结构既具保守性又具高变性。保守性反映生物物种的亲缘关系,高变性则揭示生物物种的特征核酸序列,rRNA是属种鉴定的分子基础。因此,可以利用保守区设计通用引物扩增细菌的相应靶序列,再利用可变区的差异鉴别菌种。文章就16S rRNA、23S rRNA和16S~23S rRNA基因在细菌分离与鉴定中的应用做以下综述。 展开更多
关键词 16S RRNA基因 23S RRNA基因 ^16S^23S RRNA基因 细菌
下载PDF
腐败醋中微生物的分离鉴定及乳酸链球菌素对其抑制作用 被引量:20
2
作者 李伟丽 赵超 +3 位作者 车建途 李东乐 易武华 赵丽娟 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第1期174-178,共5页
从腐败醋中分离出84株不同微生物菌株,通过对其形态学观察、革兰氏染色、16S rDNA测序,并与Gen Bank中已知序列进行比对,以及进一步测定16S^23S ITS,发现其由20株解淀粉芽孢杆菌、12株地衣芽孢杆菌、6株芽孢杆菌属1NLA3E、12株蜡样芽孢... 从腐败醋中分离出84株不同微生物菌株,通过对其形态学观察、革兰氏染色、16S rDNA测序,并与Gen Bank中已知序列进行比对,以及进一步测定16S^23S ITS,发现其由20株解淀粉芽孢杆菌、12株地衣芽孢杆菌、6株芽孢杆菌属1NLA3E、12株蜡样芽孢杆菌、4株巨大芽孢杆菌、3株短短芽孢杆菌、2株短小芽孢杆菌、11株凝结芽孢杆菌、12株类芽孢杆菌、1株耐酸乳酸菌、1株产气荚膜梭菌组成。除耐酸乳酸菌外,均为革兰氏阳性芽孢杆菌。通过管碟法和比浊法测定了乳酸链球菌素(Nisin)对以上菌株的抑菌效价,显示Nisin对腐败醋中分离得到的微生物菌株均具有明显的抑菌或杀菌活性。 展开更多
关键词 腐败醋 16S RDNA ^16S^23S ITS 分离鉴定 乳酸链球菌素
下载PDF
樟树内生细菌EBS05的鉴定及其抗菌活性物质性质的研究 被引量:8
3
作者 文才艺 尹志刚 +1 位作者 陈建光 李洪连 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期988-993,共6页
在形态学分类的基础上,通过16S^23S rRNA ISR(Intergenic spacer regions)序列分析,对樟树内生细菌EBS05进行了分类鉴定,结果表明EBS05为枯草芽孢杆菌。测定了EBS05代谢活性物质的理化性质,结果表明,活性组分在λ213.5nm处有最大光吸收... 在形态学分类的基础上,通过16S^23S rRNA ISR(Intergenic spacer regions)序列分析,对樟树内生细菌EBS05进行了分类鉴定,结果表明EBS05为枯草芽孢杆菌。测定了EBS05代谢活性物质的理化性质,结果表明,活性组分在λ213.5nm处有最大光吸收峰;在pH5~8范围内其抗菌活性稳定,当pH<4.0或pH>9.0时,抗菌活性显著降低;热稳定性良好,60°C^80°C处理2h后,抗菌活性不变,1×105Pa灭菌30min后,抗菌活性仍然保持在65%以上;具有较强的抗紫外线照射能力,对蛋白酶K不敏感;具有较好的醇溶性,易溶于甲醇和乙醇,不溶于乙酸乙酯、乙腈和石油醚等有机溶剂。 展开更多
关键词 植物内生细菌 枯草芽孢杆菌 ^16S^23S rRNA间隔区 抗菌活性
原文传递
奇异变形杆菌、洛菲氏不动杆菌16s rRNA3’-23s rRNA 5’间序列的克隆及测序 被引量:5
4
作者 石磊 沈宜 +2 位作者 顾大勇 王华 周元国 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 2006年第6期783-786,835,共5页
目的:对奇异变形杆菌、洛菲氏不动杆菌16s rRNA 3’~23s rRNA 5’间序列(16S^23S rRNA intergenic spacer region,ISR)进行克隆测序,为分子探针技术鉴定两菌奠定基础。方法:针对临床常见致病菌16s rRNA 3’~23s rRNA 5’间序列两端的16S... 目的:对奇异变形杆菌、洛菲氏不动杆菌16s rRNA 3’~23s rRNA 5’间序列(16S^23S rRNA intergenic spacer region,ISR)进行克隆测序,为分子探针技术鉴定两菌奠定基础。方法:针对临床常见致病菌16s rRNA 3’~23s rRNA 5’间序列两端的16S及23S rRNA保守序列设计PCR扩增的通用引物,对两菌进行扩增,利用PMD-18TVector质粒对两菌的PCR产物进行T载体克隆构建,测序后申报Genbank。结果:两菌的通用引物扩增产物构建的T载体克隆,测序结果经Blast分析,确定为两菌的ISR序列,申报Genbank获得接收。结论:成功的对奇异变形杆菌、洛菲氏不动杆菌ISR序列进行了克隆测序,该序列可以用于两种菌的通用引物PCR扩增技术鉴定。 展开更多
关键词 奇异变形杆菌 洛菲氏不动杆菌 ^16s^23s rRNA间区 T载体
下载PDF
羊源屎肠球菌的分离鉴定与生物学特性研究 被引量:4
5
作者 温峰琴 项海涛 +3 位作者 郝宝成 邢小勇 包世俊 胡永浩 《中兽医医药杂志》 2020年第5期13-16,共4页
某养殖场羔羊突然死亡,为了查明死亡原因,采集病死羔羊病变肺脏等进行细菌的分离培养,分离到1株革兰阳性、短链状排列的球菌,在血琼脂培养基上呈β溶血。通过对该菌的16S r RNA进行扩增和序列分析,其与屎肠球菌的同源性高达99%,应用通... 某养殖场羔羊突然死亡,为了查明死亡原因,采集病死羔羊病变肺脏等进行细菌的分离培养,分离到1株革兰阳性、短链状排列的球菌,在血琼脂培养基上呈β溶血。通过对该菌的16S r RNA进行扩增和序列分析,其与屎肠球菌的同源性高达99%,应用通用引物对16S^23S rRNA的序列进行PCR扩增产生2个条带,分别为522 bp和619 bp。用Vitek 2全自动微生物分析仪鉴定为屎肠球菌,可能性为98%。该菌对万古霉素和米诺环素敏感,对青霉素、庆大霉素等药物表现耐药。结果显示,分离到的细菌为屎肠球菌,且该菌具有多重耐药性,本实验为兽医临床肠球菌的分离和鉴定提供了参考。 展开更多
关键词 屎肠球菌 16S rRNA ^16S^23S rRNA 生化试验 药敏试验
下载PDF
聚丙烯酰胺降解菌株分离及其系统发育分析 被引量:2
6
作者 魏利 马放 +2 位作者 陈忠喜 刘广民 敖蕾娜日 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第8期1262-1265,1296,共5页
应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采油五厂十三区聚合物配注站的母液罐中分离到一株聚丙烯酰胺降解菌株CMW,该菌株为G+,杆状,黑色圆形菌落,最适温度为38℃,最佳pH为7.8,具有硫酸盐还原功能,产H2S,严格厌氧.研究表明,该菌株能以聚丙烯酰... 应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采油五厂十三区聚合物配注站的母液罐中分离到一株聚丙烯酰胺降解菌株CMW,该菌株为G+,杆状,黑色圆形菌落,最适温度为38℃,最佳pH为7.8,具有硫酸盐还原功能,产H2S,严格厌氧.研究表明,该菌株能以聚丙烯酰胺为唯一碳源,降解侧链,部分官能团发生改变,质量浓度为500 mg/L时菌株具有较高的聚丙烯酰胺降解能力,其溶液黏度下降效果显著.通过形态、生理生化、16S rDNA以及16S^23S rDNA间隔区序列鉴定,可能为梭菌属的新种,暂时命名为Clostridium.sticklandiiCMW(GenBank登录号为DQ011249).16S rRNA基因序列较为保守更适合属间的鉴定,16S^23S rDNA间隔区序列包含tRNAIle和tRNAAla基因,更适合属内种间鉴定. 展开更多
关键词 聚丙烯酰胺降解菌 聚丙烯酰胺 16S RDNA ^16S^23S rDNA间隔区 系统发育
下载PDF
细胞系中支原体检测及分型 被引量:5
7
作者 戴悦 吕允威 +4 位作者 张春凤 曹邦伟 柴庆波 马明信 柯杨 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期207-210,共4页
目的:对细胞系中支原体的感染情况进行检测并分型。方法:利用支原体 16S^23S保守区域扩增来检出细胞系中支原体感染率,并利用 16S^23S保守区间的间隔区(spacer)长度不同进行巢式PCR扩增,结合测序达到分型的目的。结果:在检测的 22株细... 目的:对细胞系中支原体的感染情况进行检测并分型。方法:利用支原体 16S^23S保守区域扩增来检出细胞系中支原体感染率,并利用 16S^23S保守区间的间隔区(spacer)长度不同进行巢式PCR扩增,结合测序达到分型的目的。结果:在检测的 22株细胞系中,有 77. 3% (17株)的细胞系有支原体感染,其中 5株有 2种或 2种以上支原体感染,在分布上以M.fermentans和M.hyorhinis支原体多见。结论:支原体在细胞系中的高感染率提示,在以细胞系作为模型的研究中,对支原体感染所造成的影响应有充分认识。检测及分型技术的建立为进一步研究不同型别支原体的致病力提供了可能。 展开更多
关键词 细胞系 支原体检测 ^16S^23S 支原体感染 巢式PCR扩增 感染情况 高感染率 不同型别 分型技术 间隔区 致病力 步研究 保守
下载PDF
PCR为基础的反向线点杂交及16S~23S rDNA间区测序分析5种少见类型奴卡菌 被引量:2
8
作者 王晓彦 孔繁荣 连石 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2011年第4期469-475,共7页
目的探讨5种新出现的奴卡菌种16S~23S rDNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)DNA基因序列的多态性,筛查特异的奴卡菌种逆向线点杂交(reverse line blot,RLB)探针。方法对6例奴卡菌标本进行ITS基因扩增、克隆、测序,设计... 目的探讨5种新出现的奴卡菌种16S~23S rDNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)DNA基因序列的多态性,筛查特异的奴卡菌种逆向线点杂交(reverse line blot,RLB)探针。方法对6例奴卡菌标本进行ITS基因扩增、克隆、测序,设计奴卡菌种特异探针及ITS间区rDNA基因特异的探针,进行以PCR为基础的RLB(PCR/RLB)杂交试验,不同的RLB型进行ITS基因测序分析,以鉴别不同的奴卡菌种及种内分型。结果发现2个Nocardia beijingensis菌株ITS间区有8个基因序列型,4个RLB型;N.thailandica有4个基因序列型及RLB型;N.blacklockiae有5个基因序列型,3个RLB型,其中N-bla RLBⅢ型与所有Nbla-ITS探针杂交没有信号;N.elegans有5个基因序列型,3个RLB型;N.vinacea有5个基因序列型,2个RLB型。结论通过PCR/RLB试验,准确的ITS基因测序认识了新出现的菌种,即N.beijingensis,N.blacklockiae,N.elegans,N.thailandica及N.vinacea。同时建立了可以大量筛查奴卡菌种的PCR/RLB方法,以进行快速临床诊断及流行病学研究。 展开更多
关键词 奴卡菌 ^16S^23S rDNA基因内转录间隔区 内转录间隔区基因序列型 逆向线点杂交 内转录区逆向线点杂交型
下载PDF
16s~23s rDNA间隔区序列RFLP分析在分枝杆菌分类鉴定中的应用 被引量:2
9
作者 张灵霞 庄玉辉 +3 位作者 张小刚 何秀云 李国利 吴雪琼 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 1999年第12期35-35,37,共2页
目的:通过对分枝杆菌16s~23srDNA间隔区序列DNAPCR扩增和限制性酶切分析,评价其在分枝杆菌分类鉴定中的价值。方法:对21种分枝杆菌和9种亲缘关系较远的非分枝杆菌和4种亲缘关系较近的非分枝杆菌的16s-23... 目的:通过对分枝杆菌16s~23srDNA间隔区序列DNAPCR扩增和限制性酶切分析,评价其在分枝杆菌分类鉴定中的价值。方法:对21种分枝杆菌和9种亲缘关系较远的非分枝杆菌和4种亲缘关系较近的非分枝杆菌的16s-23srDNA间隔区序列DNA进行PCR扩增并对扩增产物进行限制性内切酶HaeⅢ.MspI消化反应,分析不同菌种扩增片段及其限制性片段长度多态性的差异。结果:PCR扩增结果显示:分枝杆菌一般扩增出1~2带,非分支杆菌一般有1~3条带。80%的缓慢生长分枝杆菌扩增片段集中在340~400bp,快速生长分枝杆菌扩增片段集中在470~575bp。单从扩增产物的琼脂糖凝胶电泳只能鉴定42%的受试菌种。酶切结果显示:3种分枝杆菌酶切图谱没有区别,大部分分枝杆菌的酶切图谱彼此不同,而大部分非分枝杆菌不能被HaeⅢ.MSPⅠ消化。结论:说明16s~23srDNA间隔区序列DNAPCR扩增和限制性片段长度多态性分析是分枝杆菌菌种分类鉴定的一种快速、有效的方法。 展开更多
关键词 间隔区序列 分类鉴定 分枝杆菌 ^16s^23s RDNA
下载PDF
利用16S~23S rDNA间隔序列对葡萄酒中的酒酒球菌的鉴定 被引量:1
10
作者 周利国 刘树文 +1 位作者 李西柱 王坐京 《酿酒科技》 2009年第5期39-41,共3页
对从宁夏银川地区自然发酵的葡萄酒中分离得到30株菌株,并对菌株进行分子鉴定、生理生化鉴定和酿酒适应性的筛选。从中优选出4株菌株,对筛选出的4株菌株分别进行了PCR扩增,得到它们的16S~23SrDNAITS片段,并测定所得到片段的DNA序列。... 对从宁夏银川地区自然发酵的葡萄酒中分离得到30株菌株,并对菌株进行分子鉴定、生理生化鉴定和酿酒适应性的筛选。从中优选出4株菌株,对筛选出的4株菌株分别进行了PCR扩增,得到它们的16S~23SrDNAITS片段,并测定所得到片段的DNA序列。将测定结果与GenBankDNA数据库已知的菌种对比,确定4株菌株均为酒酒球菌。 展开更多
关键词 微生物 菌株鉴定 ^16S^23S rDNA间隔序列 PCR 葡萄酒 酒酒球菌
下载PDF
基于末端产物和基因序列的SRB菌系统发育分析
11
作者 赵立军 魏利 +2 位作者 马放 李芬 张建祺 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1965-1968,共4页
为实现细菌的多相分类,应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采出液中分离到8株硫酸盐还原菌.通过对菌株的气相色谱末端产物测定,16S rDNA、16S~23S rDNA间隔区(ISR)序列克隆进行菌株的系统发育分析.结果表明:8株菌分别属于Salmonella(D2、... 为实现细菌的多相分类,应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采出液中分离到8株硫酸盐还原菌.通过对菌株的气相色谱末端产物测定,16S rDNA、16S~23S rDNA间隔区(ISR)序列克隆进行菌株的系统发育分析.结果表明:8株菌分别属于Salmonella(D2、I7)、Clostridium(F4、D10、H1)、Anaerofilum(A8、A18)、Enterobacter(E1).聚类分析表明,菌株的ISR序列长度差异较大,包含的tRNA种类和数目不同,间隔区序列可以作为16S rDNA序列系统发育分类的一个有力的补充;气相色谱末端产物相似的菌株,亲源关系比较接近,可以作为细菌鉴定的依据;其中16S rDNA序列作为细菌分类的主要依据,对存在争议的菌株,应该结合形态、生理生化特征和ISR序列以及气相色谱末端产物等综合对其进行系统分类. 展开更多
关键词 硫酸盐还原菌 16S RDNA ^16S^23S rDNA间隔区(ISR) 系统发育分析
下载PDF
牦牛漫游球菌的分离与生物学特性鉴定
12
作者 温峰琴 项海涛 +3 位作者 郝宝成 邢小勇 包世俊 胡永浩 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期421-425,共5页
为探究1只牦牛屠宰后肝脏有干酪样结节形成的原因,对肝脏进行细菌的分离培养,对分离到的1株细菌的16S rRNA和16S~23S rRNA基因序列用通用引物扩增和并用NCBI blast和MEGA 7进行序列分析,并用Vitek 2全自动微生物鉴定仪进行生化表型的鉴... 为探究1只牦牛屠宰后肝脏有干酪样结节形成的原因,对肝脏进行细菌的分离培养,对分离到的1株细菌的16S rRNA和16S~23S rRNA基因序列用通用引物扩增和并用NCBI blast和MEGA 7进行序列分析,并用Vitek 2全自动微生物鉴定仪进行生化表型的鉴定,用K-B法进行药敏试验,结果显示:该菌的16S rRNA为1 524 bp,NCBI GenBank登录号为MG753544.1,与水獭漫游球菌的同源性较高,16S~23S rRNA有大小不同的2个片段,分别为522,425 bp,NCBI GenBank登录号分别为MG758122.1和MG758123.1。Vitek 2全自动微生物鉴定仪鉴定为迟缓葡萄球菌。该菌对妥布霉素、头孢哌酮、米诺环素等多种药物高度敏感,对苯唑西林、头孢西丁有抗性。结果表明,分离出的细菌为漫游球菌,该菌是否具有致病性还有待进一步试验验证。 展开更多
关键词 漫游球菌 16SrRNA ^16S^23S RRNA 生化试验 药敏试验
原文传递
随机扩增多态性DNA技术对绿色气球菌的相关性分析
13
作者 王羽 董文龙 +2 位作者 张喜庆 马红霞 高云航 《中国兽药杂志》 北大核心 2017年第12期19-23,共5页
随着分子生物学的发展,16S、23S rRNA以及16S^23S rRNA已应用于菌种鉴定。16S^23S rRNA的基因间隔区相对于前两者有较高的变异性,弥补了16S和23S rRNA保守性强,分化程度不够的缺点。本研究对7株绿色气球菌和两株屎肠球菌扩增16S^23S rRN... 随着分子生物学的发展,16S、23S rRNA以及16S^23S rRNA已应用于菌种鉴定。16S^23S rRNA的基因间隔区相对于前两者有较高的变异性,弥补了16S和23S rRNA保守性强,分化程度不够的缺点。本研究对7株绿色气球菌和两株屎肠球菌扩增16S^23S rRNA基因间隔序列。通过随机扩增多态性DNA技术分析绿色气球菌DNA,评价不同菌株间的克隆相关性及耐药性。 展开更多
关键词 绿色气球菌 ^16S^23S RRNA 随机扩增多态性DNA技术
下载PDF
溶脲脲原体生物分型方法的建立及应用 被引量:11
14
作者 鲁梅格 石建莉 徐晨 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2005年第3期175-178,184,共5页
目的: 建立检测溶脲脲原体(Uu)生物型别的方法,研究两种Uu生物型(Parvo型和T960型 )感染与人精液质量之间的关系。 方法: 根据Uu两个生物型在 16S^23SrRNA间隔区基因序列,分别设计了Uu种族特异性引物及Uu两种生物型共 3对引物,检测了 ... 目的: 建立检测溶脲脲原体(Uu)生物型别的方法,研究两种Uu生物型(Parvo型和T960型 )感染与人精液质量之间的关系。 方法: 根据Uu两个生物型在 16S^23SrRNA间隔区基因序列,分别设计了Uu种族特异性引物及Uu两种生物型共 3对引物,检测了 949例生殖门诊男性患者的精液常规和精液Uu。 结果: 精液Uu培养阳性且UuPCR检测也呈阳性者 199例 (感染率 21. 1% ),其中Parvo型 136例 ( 136 /199, 68. 3% ),T960型 54例 ( 54 /199,27. 1% ),Parvo型和T960型同时阳性者 9例(9 /199, 4. 5% )。Uu感染T960型组与Parvo组和阴性组相比,精子活动力则明显下降(P<0. 05)。而精子活动率和精子密度无统计学差异。 结论: Uu感染的生物型与人精液质量有关,T960型Uu感染与精子活动力明显相关。 展开更多
关键词 溶脲脲原体 生物型 精液质量 聚合酶链反应 16S-23S RRNA
下载PDF
甘蔗宿根矮化病PCR检测技术优化分析 被引量:13
15
作者 周丹 谢晓娜 +2 位作者 陈明辉 杨丽涛 李杨瑞 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期616-620,共5页
【目的】在PCR的基本程序上,以甘蔗宿根矮化病菌Lxx16S~23S rDNA内部转录间隔区特异性引物,优化PCR反应条件,以建立稳定、快速、灵敏度高的甘蔗宿根矮化病PCR检测技术。【方法】以Lxx基因组DNA为模板,采用TaKaRa的Ex Taq Polymerase和2... 【目的】在PCR的基本程序上,以甘蔗宿根矮化病菌Lxx16S~23S rDNA内部转录间隔区特异性引物,优化PCR反应条件,以建立稳定、快速、灵敏度高的甘蔗宿根矮化病PCR检测技术。【方法】以Lxx基因组DNA为模板,采用TaKaRa的Ex Taq Polymerase和2×GCBufferⅡ,调整退火温度和引物浓度等主要因子,优化PCR反应体系;稀释Lxx基因组DNA模板的浓度,检测优化PCR的灵敏度;用优化的PCR对田间生长的甘蔗品种GT11叶片总DNA进行RSD测定。【结果】优化的PCR得到清晰特异的条带为Lxx16S~23S rDNA内部转录间隔区序列;能从稀释1000倍的Lxx基因组DNA(15.9pg/μL)中检测到Lxx,而常规的PCR只能从稀释100倍的Lxx基因组DNA(159pg/μL)中检测到Lxx,且出现假阴性,不稳定。对田间生长的甘蔗品种GT11叶片总DNA进行PCR检测,结果用优化后的PCR检测RSD感染率为66.7%,而常规的PCR检测RSD感染率为0。【结论】优化的PCR体系为:2×GCBufferⅡ12.5μL,Ex Taq DNA酶(5U/μL)0.2μL;dNTP(2.5mmol/L)1.5μL;Lxx1(10μmol/L)1.0μL,Lxx2(10μmol/L)1.0μL,DNA模板1.0μL,用ddH2O双蒸水补足至25.0μL。PCR反应程序为:95℃预变性10min,94℃15s,57℃15s,72℃30s,40个循环;72℃延伸10min。优化的PCR比常规PCR的灵敏度高、结果稳定、检测效率高,更适合于田间大批量样品快速检测。 展开更多
关键词 甘蔗 宿根矮化病 PCR检测 ^16S^23SrDNA 优化体系
下载PDF
16S~23S rRNA基因序列在细菌鉴定中的应用 被引量:12
16
作者 于超 郭海勇 +1 位作者 魏嘉良 钱爱东 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第2期57-60,共4页
近些年围绕16S~23SrRNA基因间隔区发展起来的分子生物学技术为细菌多样性的研究开辟了新的途径,使得人们在细菌多样性的研究中得以摆脱传统分离培养的束缚,进而使分析方法得以长足拓展,并为指导实践提供可靠的理论依据,作者就16S~23Sr... 近些年围绕16S~23SrRNA基因间隔区发展起来的分子生物学技术为细菌多样性的研究开辟了新的途径,使得人们在细菌多样性的研究中得以摆脱传统分离培养的束缚,进而使分析方法得以长足拓展,并为指导实践提供可靠的理论依据,作者就16S~23SrRNA基因间隔区序列的特点、应用及发展前景作一简述。 展开更多
关键词 ^16S^23SrRNA基因间隔区 细菌 多样性
下载PDF
沙冬青根瘤菌遗传多样性和系统发育分析 被引量:7
17
作者 毕江涛 贺达汉 +2 位作者 陈卫民 谢瑞梅 韦革宏 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期695-703,共9页
利用16S rDNA RFLP、16S-23S rDNA RFLP和16S rDNA序列分析方法,对分离自宁夏和内蒙古阿拉善地区的沙冬青根瘤菌进行了遗传多样性和系统发育分析。结果表明,分离自不同地区沙冬青根瘤菌的44株测试菌株分别归属于中慢生根瘤菌属(Mesorhiz... 利用16S rDNA RFLP、16S-23S rDNA RFLP和16S rDNA序列分析方法,对分离自宁夏和内蒙古阿拉善地区的沙冬青根瘤菌进行了遗传多样性和系统发育分析。结果表明,分离自不同地区沙冬青根瘤菌的44株测试菌株分别归属于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、叶杆菌属(Phylobacterium)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)、根瘤菌属(Rhizobium)、土壤杆菌属(Agrobacterium)5个属种。受寄主和地理环境因素的影响,沙冬青根瘤菌具有丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 沙冬青 根瘤菌 16SrDNA RFLP ^16S^23SrDNA RFLP 序列分析 遗传多样性 系统发育树
下载PDF
花生根瘤菌遗传多样性的RFLP分析 被引量:5
18
作者 康凯 徐艳 +1 位作者 李友国 周俊初 《湖北农业科学》 北大核心 2007年第5期677-680,共4页
利用16S rRNA PCR-RFLP和16S~23S rRNA IGS PCR-RFLP技术对分离自我国不同地区的55株花生慢生根瘤菌和6株参比菌株进行了遗传多样性研究。16S rRNA PCR-RFLP分析结果表明,在63%的相似性水平上,91%的供试花生慢生根瘤菌与B.japonicum和B... 利用16S rRNA PCR-RFLP和16S~23S rRNA IGS PCR-RFLP技术对分离自我国不同地区的55株花生慢生根瘤菌和6株参比菌株进行了遗传多样性研究。16S rRNA PCR-RFLP分析结果表明,在63%的相似性水平上,91%的供试花生慢生根瘤菌与B.japonicum和B.elkanii聚在一起;16S~23S rRNAIGS PCR-RFLP分析结果表明,供试花生慢生根瘤菌具有较丰富的遗传多样性,在65.8%的相似性水平上可分为3大类群。 展开更多
关键词 花生慢生根瘤菌 16SrRNAPCR-RFLP ^16S^23SrRNAIGSPCR-RFLP 遗传多样性
下载PDF
二重PCR方法鉴别气肿疽梭菌和腐败梭菌 被引量:6
19
作者 彭小兵 李旭妮 +3 位作者 王楠 何宇 丁家波 蒋玉文 《中国兽药杂志》 2011年第3期20-22,共3页
用包含16S~23S rDNA间隔区和23S rDNA的部分序列作为气肿疽梭菌特异性标志,以α毒素部分序列作为腐败梭菌特异性标志,建立了鉴别气肿疽梭菌和腐败梭菌的二重PCR方法。结果显示:气肿疽梭菌C54-1株扩增出大小为509 bp的条带,腐败梭菌C55-... 用包含16S~23S rDNA间隔区和23S rDNA的部分序列作为气肿疽梭菌特异性标志,以α毒素部分序列作为腐败梭菌特异性标志,建立了鉴别气肿疽梭菌和腐败梭菌的二重PCR方法。结果显示:气肿疽梭菌C54-1株扩增出大小为509 bp的条带,腐败梭菌C55-1株、C55-16株均扩增出大小为148 bp的条带,均与预期吻合;而产气荚膜梭菌C57-1株、C59-37株,肉毒梭菌C62-4株,诺维梭菌C61-4株均未扩增出任何条带。扩增产物的测序结果进一步证实了本方法的特异性。菌株的生物学特性试验结果也符合相应气肿疽梭菌和腐败梭菌的特点。本研究所建立的二重PCR方法可用于气肿疽梭菌和腐败梭菌的快速鉴定。 展开更多
关键词 气肿疽梭菌 腐败梭菌 ^16S^23SrDNA 二重PCR
下载PDF
沙门菌PCR-dHPLC基因分型方法建立 被引量:1
20
作者 张东方 袁飞 +5 位作者 王娉 杨海荣 胡玥 赵勇胜 陈颖 葛毅强 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1515-1518,共4页
目的建立沙门菌聚合酶链反应-变性高效液相色谱(PCR-dHPLC)基因分型方法。方法采用16S~23S rRNA内转录间隔(ITS)作为沙门菌分型目的基因,确定特异性扩增引物,进行PCR扩增,扩增产物经dHPLC分离,根据dHPLC图谱峰型差异进行分型,并与血清... 目的建立沙门菌聚合酶链反应-变性高效液相色谱(PCR-dHPLC)基因分型方法。方法采用16S~23S rRNA内转录间隔(ITS)作为沙门菌分型目的基因,确定特异性扩增引物,进行PCR扩增,扩增产物经dHPLC分离,根据dHPLC图谱峰型差异进行分型,并与血清学和生化分型结果比较。结果 89株沙门菌共分为12个dHPLC型(D型);所有沙门菌均有1个相同色谱峰,克隆测序结果表明,其片断大小为600 bp,其他8种食源性致病菌对照株无此色谱峰,应为沙门菌16S~23S rRNA基因序列的特征性条带,分型结果与血清学差异较大,与生化分型结果有一定一致性。结论所建立的沙门菌PCR-dHPLC基因分型方法具快速、操作方便、重复性好、成本低廉、高通量和自动化的特点。 展开更多
关键词 聚合酶链反应-变性高效液相色谱(PCR-DHPLC) 沙门菌 ^16S^23SrRNA基因区间 分子分型
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部