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神木地区耐旱灌木和草本豆科植物根瘤菌遗传多样性 被引量：12
1
作者 聂刚 陈卫民 韦革宏 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1674-1680,共7页
豆科植物具有抗逆性强、耐瘠薄的特性,许多豆科植物是荒漠地区的先锋植物,在生态环境保护中起重要作用.以神木地区主要的灌木和草本豆科植物-根瘤菌共生体系为材料,采用16S rRNA PCR-RFLP和序列分析等方法,对分离得到的55株菌进行多样... 豆科植物具有抗逆性强、耐瘠薄的特性,许多豆科植物是荒漠地区的先锋植物,在生态环境保护中起重要作用.以神木地区主要的灌木和草本豆科植物-根瘤菌共生体系为材料,采用16S rRNA PCR-RFLP和序列分析等方法,对分离得到的55株菌进行多样性分析,其中,30株菌分离自灌木豆科植物紫穗槐和柠条,25株菌分离自草本豆科植物斜茎黄芪、苜蓿、草木樨黄芪等.结果表明:这些菌株共有11种16S rRNA PCR-RFLP遗传图谱类型,分离自草本豆科植物的菌株主要归属于中慢生根瘤菌属、剑菌属、根瘤菌属、叶瘤杆菌属和土壤杆菌属5个属,分别与华癸中慢生根瘤菌、地中海中慢生根瘤菌、刺槐中慢生根瘤菌、费氏剑菌、草木樨剑菌、木兰根瘤菌、放射根瘤菌、突尼斯叶杆菌和根癌土壤杆菌系统发育关系最近.分离自灌木豆科植物的菌株仅归属于中慢生根瘤菌属,分别与华癸中慢生根瘤菌和地中海中慢生根瘤菌系统发育关系最近.华癸中慢生根瘤菌和地中海中慢生根瘤菌是两类豆科植物的共生菌种,表明在干旱地区,根瘤菌对两种类型豆科植物的选择共生存在差异,这与豆科植物种类有关,还可能与其所处生态环境有关. 展开更多
关键词 耐旱植物根瘤菌16S rrna pcr-rflp多样性
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新疆棉花根际土壤铁载体产生菌的遗传多样性及系统发育研究 被引量：11
2
作者 朱彭玲 杜秉海 +3 位作者 丁延芹 杜志兵 于素芳 陈强 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期1568-1574,共7页
【目的】了解中国新疆地区铁载体产生菌的遗传多样性和系统发育,为筛选高效铁载体产生菌提供依据。【方法】采用BOXAIR-PCR、16S rRNA PCR-RFLP和16SrDNA全序列分析方法对分离自新疆地区棉花根际土壤的铁载体产生菌的遗传多样性进行分... 【目的】了解中国新疆地区铁载体产生菌的遗传多样性和系统发育,为筛选高效铁载体产生菌提供依据。【方法】采用BOXAIR-PCR、16S rRNA PCR-RFLP和16SrDNA全序列分析方法对分离自新疆地区棉花根际土壤的铁载体产生菌的遗传多样性进行分析。【结果】在BOXAIR-PCR分析中,68株供试菌分为11个遗传群;在16SrRNAPCR-RFLP分析中,68株供试菌分10个遗传群;代表菌株的16SrDNA全序列分析表明,供试菌分属于假单胞菌属(Pseudomonas)、肠杆菌属(Enterobacter)、不动细菌属(Acinetobacter)、芽孢杆菌属(Bacillus)、产碱杆菌属(Alcaligenes)、短状杆菌属(Brachybacterium)和泛菌属(Pantoea)。其中,假单胞菌属(Pseudomonas)为优势属。【结论】分离自新疆地区棉花根际土壤铁载体菌存在极大的遗传多样性。 展开更多
关键词 棉花 铁载体 遗传多样性 根际 16S rrna pcr-rflp BOXAIR-pcr
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我国主要生态区域绿豆慢生根瘤菌的遗传多样性和系统发育研究 被引量：7
3
作者 袁天英 杨江科 +1 位作者 张伟涛 周俊初 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期869-874,共6页
利用16SrRNAPCR-RFLP、16SrRNA序列分析以及16S-23SrRNAIGS(IntergeneticSpacer)PCR-RFLP技术对分离自中国主要生态区域的44株慢生型绿豆根瘤菌和5株参比菌株进行了遗传多样性和系统发育研究。16SrRNAPCR-RFLP分析表明:在76%的相似水平... 利用16SrRNAPCR-RFLP、16SrRNA序列分析以及16S-23SrRNAIGS(IntergeneticSpacer)PCR-RFLP技术对分离自中国主要生态区域的44株慢生型绿豆根瘤菌和5株参比菌株进行了遗传多样性和系统发育研究。16SrRNAPCR-RFLP分析表明:在76%的相似水平上,所有供试菌株可分为三大类群:群I由LYG1等13株慢生根瘤菌组成,该群在系统发育上与B.japonicum和B.liaoningense的参比菌株存在一定的差异;群Ⅱ由XJ1等21株供试菌株、B.japonicum和B.liaoningense的代表菌株组成;群Ⅲ由10株来自广东和广西的菌株和B.elkanii的代表菌株组成。16S-23SrRNAIGSPCR-RFLP分析将供试菌株分为A、B两大群。群A由34株供试菌株、B.japonicum和B.liaoningense的代表菌株组成。在85%的相似性水平上,可再分为AⅠ、AⅡ和AⅢ3个亚群。群B由10株分离自广西和广东的菌株和B.elkanii的代表菌株组成。在85%的相似性水平上,可再分为BI和BⅡ两亚群,表现出一定的多样性。与16SrRNAPCR-RFLP相比,16S-23SrRNAIGSPCR-RFLP具有更高的解析度,供试菌株表现出更加丰富的遗传多样性。分离自中国新疆、广东和广西等地的菌株在分群上具有较为明显的地域特征。 展开更多
关键词 慢生型根瘤菌 16S rrna PER-rflp 16S-23S rrna IGS PER rflp
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花生根瘤菌遗传多样性的RFLP分析 被引量：5
4
作者 康凯 徐艳 +1 位作者 李友国 周俊初 《湖北农业科学》 北大核心 2007年第5期677-680,共4页
利用16S rRNA PCR-RFLP和16S～23S rRNA IGS PCR-RFLP技术对分离自我国不同地区的55株花生慢生根瘤菌和6株参比菌株进行了遗传多样性研究。16S rRNA PCR-RFLP分析结果表明,在63%的相似性水平上,91%的供试花生慢生根瘤菌与B.japonicum和B... 利用16S rRNA PCR-RFLP和16S～23S rRNA IGS PCR-RFLP技术对分离自我国不同地区的55株花生慢生根瘤菌和6株参比菌株进行了遗传多样性研究。16S rRNA PCR-RFLP分析结果表明,在63%的相似性水平上,91%的供试花生慢生根瘤菌与B.japonicum和B.elkanii聚在一起;16S～23S rRNAIGS PCR-RFLP分析结果表明,供试花生慢生根瘤菌具有较丰富的遗传多样性,在65.8%的相似性水平上可分为3大类群。 展开更多
关键词 花生慢生根瘤菌 16Srrnapcr-rflp 16S^23SrrnaIGSpcr-rflp 遗传多样性
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用16S rRNA基因的内切酶图谱快速鉴别几种对虾病原菌 被引量：5
5
作者 孔杰 刘萍 +4 位作者 张岩 杨丛海 叶军 徐怀恕 郭华荣 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 1997年第5期449-452,共4页
坎普氏弧菌是青岛海洋大学生物系微生物实验室于1989－1990年自对虾养殖场中国对虾红腿病虾心脏及血淋巴中分离并鉴定的菌株，副溶血弧菌和溶藻胶弧菌两菌株于1994年9月得自中国科学院微生物研究所。为建立快速、准确的中国对虾病原菌... 坎普氏弧菌是青岛海洋大学生物系微生物实验室于1989－1990年自对虾养殖场中国对虾红腿病虾心脏及血淋巴中分离并鉴定的菌株，副溶血弧菌和溶藻胶弧菌两菌株于1994年9月得自中国科学院微生物研究所。为建立快速、准确的中国对虾病原菌的诊断技术，根据几种细菌的16SrRNA基因的序列，设计并合成该基因的多聚酶链反应的引物PLI和PL2。用该对引物分别从坎普氏弧菌、副溶血弧菌和溶藻胶弧菌的DNA样品中扩增出分子量与原设计相同的DNA片段，然后用AluI内切酶对3种细菌的多聚酶链反应产物进行酶切，形成3种不同的限制性内切酶图谱。研究结果证明，用16SrRNA基因的限制性内切酶图谱，可快速、准确地鉴别3种对虾病原菌。 展开更多
关键词 弧菌 基因 限制性 内切酶图谱 对虾 病原菌
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PCR产物的RFLP分析在大豆根瘤菌研究中的应用 被引量：2
6
作者 江木兰 宋玉萍 张学江 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第4期66-70,共5页
采用ＰＣＲ扩增１６—２３ｓｒＲＮＡ基因间序列和限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）法，分析了２７株属于快生、慢生二个类型的大豆根瘤菌。慢生大豆根瘤菌都产生了一条约１９０４ｐｂ大小的ＤＮＡ产物带。用ＨａｅⅢ、ＭｓｐⅠ和Ｃｏ... 采用ＰＣＲ扩增１６—２３ｓｒＲＮＡ基因间序列和限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）法，分析了２７株属于快生、慢生二个类型的大豆根瘤菌。慢生大豆根瘤菌都产生了一条约１９０４ｐｂ大小的ＤＮＡ产物带。用ＨａｅⅢ、ＭｓｐⅠ和ＣｏｆⅠ限制性酶处理２７株菌株ＰＣＲ扩增产物，除ＤＨ４４４和ＬＬ１６外，其余菌株３种酶处理的结果一致，可以分成９种遗传模式组。９种遗传模式组与菌株的地理起源相关，但与细菌的血清学分组无直接关系。利用大豆根瘤菌１６—２３ｓｒＲＮＡ基因序列间的多态性特性，采用ＰＣＲ—ＲＦＬＰ法分组，比血清学更能反映根瘤菌的遗传进化关系。 展开更多
关键词 大豆根瘤菌 pcr-rflp pcr产物
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