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罕见的CisAB与B(A)血型的基因型研究 被引量：81
1
作者 郭忠慧 向东 +7 位作者 朱自严 刘曦 王健莲 陈和平 张嘉敏 沈伟 王晨 刘达庄 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2004年第4期321-324,共4页
目的　研究ABO血型系统中血清定型与基因型不一致的情况 ,通过核苷酸序列分析 ,最终阐明其真正血型。方法　应用吸收放散等实验 ,研究血清学实验中ABO正反定型不一致的情况 ,同时采用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性方法 ,进行ABO... 目的　研究ABO血型系统中血清定型与基因型不一致的情况 ,通过核苷酸序列分析 ,最终阐明其真正血型。方法　应用吸收放散等实验 ,研究血清学实验中ABO正反定型不一致的情况 ,同时采用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性方法 ,进行ABO初步基因分型 ,对二者结果矛盾的特殊标本则通过克隆测序了解他们的ABO基因第 6和第 7外显子的核苷酸序列构成。结果　在近年来收集到的并且做过基因分型的 3 5例ABO亚型标本中 ,有 7例标本血清学与基因分型不一致 ,血清学为AB亚型但基因分型却具有O基因。4例ABx ,基因分型均为A 10 2 /O ,其A基因在A 10 1的基础上 ,均有nt467(C→T)和nt80 3位 (G→C)的点突变 ,即都属于CisAB 0 1等位基因 ,真正的基因型是CisAB/O ;另外 3例血清学疑为AxB ,基因分型为BO的个体 ,除皆具有正常O基因外 ,其B基因在正常B等位基因的基础上 ,均发生单碱基突变 ,其中 1例存在nt70 0 (C→G) ,属于已经报道的B(A) 70 0等位基因 ;另外 2例无亲缘关系标本的B基因均存在新的nt64 0 (A→G)的点突变 ,导致 2 14位甲硫氨酸被缬氨酸置换。结论　通过核苷酸序列分析 ,证实 7例血清学表现为AB亚型而具有正常O基因的个体 ,4例是罕见的CisAB ,3例为B(A )型 ;同时在中国汉族ABO亚型人群中 ,检出一种新的B(A) 展开更多
关键词 基因分型 罕见 正常 等位基因 血清学 标本 血型 b基因 单碱基突变 甲硫氨酸
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湖北地区乙型肝炎病毒基因型分布与临床的相关性 被引量：52
2
作者 雷延昌 郝友华 +5 位作者 田拥军 孟忠吉 王宝菊 田德英 赵西平 杨东亮 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期109-112,共4页
目的 了解湖北地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分布及其与临床的相关性。 方法 选择湖北地区HBV DNA阳性的慢性HBV感染者190例,其中乙型肝炎表面抗原(HBsAg)携带者52例、慢性乙型肝炎56例、重型肝炎32例、肝硬化22例、原发性肝癌28例,应... 目的 了解湖北地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分布及其与临床的相关性。 方法 选择湖北地区HBV DNA阳性的慢性HBV感染者190例,其中乙型肝炎表面抗原(HBsAg)携带者52例、慢性乙型肝炎56例、重型肝炎32例、肝硬化22例、原发性肝癌28例,应用多对型特异性引物-聚合酶链反应检测HBV的基因型。 结果 多对HBV型特异性引物法可快速准确鉴定HBV的基因型。190份HBV DNA阳性血清标本中,B基因型140例(73.7％),C基因型42例(22.1％),BC混合型8例(4.2％),未发现A、D和E基因型;B基因型在重型肝炎和肝癌患者中占绝对优势,分别为87.5％和89.3％,显著高于HBsAg携带者的67.3％;B基因型患者血清丙氨酸氨基转移酶水平(253.1±306.7)U／L高于C基因型患者的(154.1±192.9)U／L,差异有统计学意义(P<0.05);除HBsAg携带者外的慢性HBV感染者中,B基因型患者血清抗-HBe阳性率50.5％(53／105)显著高于C基因型的18.5％(5／27),P<0.01。 结论 多对型特异性引物同时进行聚合酶链反应的基因分型方法可用于HBV基因型的流行病学调查;湖北地区存在HBV的B、C和BC混合基因型,B型为本地区的优势基因型并在严重肝病和肝癌中的比例较高,基因型的分布可能有较大的地区差异。 展开更多
关键词 慢性HbV感染 b基因 C基因 乙型肝炎病毒基因型 临床 HbSAG携带者 HbVDNA 结论 优势 准确
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4种鳕鱼线粒体16SrRNA、COI和Cytb基因片段序列的比较研究 被引量：50
3
作者 毕潇潇 高天翔 +1 位作者 肖永双 李永振 《南方水产》 2009年第3期46-52,共7页
对狭鳕(Theragra chalcogramma)、太平洋鳕(Gadus macrocephalus)、蓝鳕(Micromesistius poutassou)和远东宽突鳕(Eleginus gracilis)4种不同属鳕鱼的线粒体16S rRNA、Cytochrome oxidase subunit I(COI)和细胞色素b(Cytb)基因片段序列... 对狭鳕(Theragra chalcogramma)、太平洋鳕(Gadus macrocephalus)、蓝鳕(Micromesistius poutassou)和远东宽突鳕(Eleginus gracilis)4种不同属鳕鱼的线粒体16S rRNA、Cytochrome oxidase subunit I(COI)和细胞色素b(Cytb)基因片段序列进行了测定,分析比较了不同鳕鱼种间的序列差异。通过PCR扩增和序列测定,得到4种鳕鱼线粒体3个基因片段的总长度分别为539bp(16S rRNA)、601bp(COI)和385bp(Cytb),其基因片段的A+T含量都较高。4种鳕鱼种内个体间序列变异较小,3个基因片段的核苷酸替代速率依次为Cytb>COI>16S rRNA。Cytb基因片段序列的分析结果显示太平洋鳕和狭鳕间分歧时间约为219万年,发生于中新世(Mio-cene);宽突鳕与蓝鳕间分歧时间约为653万年,发生在上新世(Pliocene)。根据遗传距离构建的NJ系统树表明,狭鳕与太平洋鳕的亲缘关系较近,与蓝鳕的亲缘关系较远。 展开更多
关键词 鳕鱼 16S rRNA基因 COI基因 CYT b基因 序列分析
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鹿类中药材的位点特异性PCR鉴定研究 被引量：37
4
作者 刘向华 王义权 +2 位作者 周开亚 刘忠权 曹琳 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第8期631-635,共5页
目的　建立一种简便、准确的鹿类中药材鹿茸、鹿鞭、鹿筋、鹿胎的DNA分子标记鉴定方法。方法　在对鹿类中药材的正品原动物梅花鹿、马鹿及其混伪品原动物的Cytb基因全序列分析的基础上 ,设计了一对专用于鉴定正品鹿类药材的位点特异性... 目的　建立一种简便、准确的鹿类中药材鹿茸、鹿鞭、鹿筋、鹿胎的DNA分子标记鉴定方法。方法　在对鹿类中药材的正品原动物梅花鹿、马鹿及其混伪品原动物的Cytb基因全序列分析的基础上 ,设计了一对专用于鉴定正品鹿类药材的位点特异性鉴别引物ILu0 1 L和ILu0 1 H。结果　在 6 4℃的复性温度下 ,用鉴别引物对原动物样品进行鉴别PCR ,仅正品能得到约 36 5bp阳性扩增带 ;对鹿茸、鹿鞭及鹿筋正、伪品药材进行PCR鉴定 ,结果表明 :3批鹿茸仅一批为正品 ,2批鹿鞭皆为伪品 ,鹿筋正、伪品药材PCR鉴定与形态鉴定结果一致。随机选取 2枚鹿茸及一个原动物做Cytb基因片段序列分析 ,其结果与PCR鉴定完全一致。结论　对市售鹿类商品药材需加强质量监督和管理。所设计的鉴别引物对梅花鹿、马鹿有高度特异性 ,可应用于以其为原动物的鹿类中药材的鉴定。 展开更多
关键词 鹿类中药材 CYT b基因 鉴别引物 PCR鉴定
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我国南方地区鱼源气单胞菌不同种类的流行特征 被引量：29
5
作者 张德锋 刘礼辉 +4 位作者 李宁求 任燕 林强 石存斌 吴淑勤 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期673-682,共10页
为加深对我国南方地区养殖鱼类中不同种类气单胞菌流行特征的认识,选取2009年至2014年间我国南方地区70口池塘患病的草鱼、鲢鱼、鳙鱼、鲫鱼、鳜鱼、斑点叉尾和乌鳢等15种鱼类体内分离的143株气单胞菌为研究对象,通过细菌生理生化特征... 为加深对我国南方地区养殖鱼类中不同种类气单胞菌流行特征的认识,选取2009年至2014年间我国南方地区70口池塘患病的草鱼、鲢鱼、鳙鱼、鲫鱼、鳜鱼、斑点叉尾和乌鳢等15种鱼类体内分离的143株气单胞菌为研究对象,通过细菌生理生化特征分析以及保守基因gyr B和rpo D的序列测序分析进行病原菌的鉴定,143株气单胞菌中有维氏气单胞菌80株,嗜水气单胞菌40株,简氏气单胞菌9株,舒氏气单胞菌10株和水生气单胞菌4株。调查分析结果表明,近年来我国南方地区养殖鱼类气单胞菌病的病原具有较高的种类多样性,其中维氏气单胞菌(80/143,56%)的出现比例最高,该菌主要感染草鱼、鲢鱼和鳜鱼等;嗜水气单胞菌次之(40/143,28%),其主要感染鳙鱼、团头鲂和斑点叉尾等;简氏气单胞菌(9/143,6%)亦常常在感染的草鱼、鳙鱼、广东鲂和锦鲤等鱼类中检出;目前,舒氏气单胞菌(10/143,7%)的感染宿主则较为单一,仅在患病乌鳢中分离得到该病原;水生气单胞菌(4/143,3%)目前仅在患病美国红鱼中发现。研究结果表明,我国南方地区鱼类气单胞菌败血症主要是由维氏气单胞菌和嗜水气单胞菌感染引起,并且常出现这两种菌的复合感染。本研究将为我国南方地区养殖鱼类气单胞菌病的流行病学分析、疾病预防和治疗奠定理论基础。 展开更多
关键词 气单胞菌 gyr b基因 RPO D基因 流行病学
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从Cyt b基因全序列分析中国10个黄牛品种的系统进化关系 被引量：21
6
作者 蔡欣 陈宏 +4 位作者 雷初朝 王珊 张志清 薛恺 王新庄 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期168-171,共4页
基于Cyt b基因全长序列,对我国10个地方黄牛品种的遗传多态性和系统发育关系进行了分析.中国黄牛Cyt b基因序列富含碱基A和T,A+T平均含量为56.7%,密码子第3位点核苷酸表现出较强的碱基组成偏倚,该位点上G的含量最低,为3.5%,而A的含量最... 基于Cyt b基因全长序列,对我国10个地方黄牛品种的遗传多态性和系统发育关系进行了分析.中国黄牛Cyt b基因序列富含碱基A和T,A+T平均含量为56.7%,密码子第3位点核苷酸表现出较强的碱基组成偏倚,该位点上G的含量最低,为3.5%,而A的含量最高,为44.6%,核苷酸组成偏差指数为0.45.在47个个体1 140 bp的序列中检测到30个变异位点,约占核苷酸总数的2.63%,密码子第3位点的突变率(76.7%)远高于第1位点(16.7%)和第2位点(6.6%),第2位点的非同义替代率(100%)远高于第1位点(40%)和第3位点(4.3%).定义了15种单倍型.将10个品种作为一个大的种群分析时,发现中国黄牛Cyt b基因具有较高的单倍型多样性(Hd=0.783±0.046)和一定程度的核苷酸多样性(Pi=0.00828±0.00030),这与中国黄牛地理分布广、种群庞大和起源复杂有关系.基于Kimura 2-parameter距离采用UPGMA法构建的10个黄牛品种分子系统树中将47个个体分别与瘤牛和普通牛聚在一起,说明中国黄牛主要起源于瘤牛和普通牛.北方牛受普通牛的影响较大,南方牛受瘤牛的影响较大,但是对于亲缘关系复杂的中原地区黄牛而言,瘤牛和普通牛对它们的影响力大小因品种而异,因而它们分别和北方牛和南方牛之间的亲缘关系远近程度也存在差异.不同品种之间的亲缘关系差异可能与它们的地理分布差异具有一定的关系. 展开更多
关键词 黄牛 CYT b基因 遗传多态性 系统进化
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海南罗非鱼致病性维氏气单胞菌分离鉴定及药敏特性研究 被引量：27
7
作者 李聪 蔡岩 +6 位作者 周永灿 袁卫 曹可 刘海天 谢珍玉 郭伟良 王世锋 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期640-646,共7页
2014年3—5月海南省罗非鱼主养区多个养殖场发生爆发性疾病,从患病尼罗罗非鱼不同组织中分离获得12株优势菌。经人工回归感染试验,从肝脏和脑中分离获得的HN-G-03和HN-B-02菌株具较强的致病力,HN-G-03和HN-B-02菌株对罗非鱼的的半致死... 2014年3—5月海南省罗非鱼主养区多个养殖场发生爆发性疾病,从患病尼罗罗非鱼不同组织中分离获得12株优势菌。经人工回归感染试验,从肝脏和脑中分离获得的HN-G-03和HN-B-02菌株具较强的致病力,HN-G-03和HN-B-02菌株对罗非鱼的的半致死密度分别为7.12×105cfu/尾和1.32×105cfu/尾。经16S rRNA和gyr B基因序列分析,同时结合细菌的形态学特征、生理生化特征,菌株HN-G-03和HN-B-02分别被鉴定为维氏气单胞菌的维氏生物型和温和生物型。体外药物药敏试验结果显示,两株菌均对左氧氟沙星、强力霉素、氟苯尼考、恩诺沙星、庆大霉素等5种药物高度敏感,对呋喃妥因等3种药物中度敏感,对青霉素等12种药物较强耐药。 展开更多
关键词 罗非鱼 维氏气单胞菌 16S RRNA gyr b基因 药物敏感性
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山东小麦品种中矮秆基因Rht-B1b、Rht-D1b分布的分子鉴定 被引量：19
8
作者 慕美财 刘勇 +4 位作者 郭小丽 张曰秋 于凯 刘冬成 张爱民 《分子植物育种》 CAS CSCD 2005年第4期473-478,共6页
利用小麦矮秆基因Rht-B1b、Rht-D1b的4对特异分子标记,NH-BF和MR1、NH-BF和WR1.2、DF和MR2、DF和WR2,对山东小麦品种中矮秆基因Rht-B1b及Rht-D1b的分布情况进行了分子标记鉴定,结果表明在鉴定的150个品种中有20.67%含有Rht-B1b基因,有54... 利用小麦矮秆基因Rht-B1b、Rht-D1b的4对特异分子标记,NH-BF和MR1、NH-BF和WR1.2、DF和MR2、DF和WR2,对山东小麦品种中矮秆基因Rht-B1b及Rht-D1b的分布情况进行了分子标记鉴定,结果表明在鉴定的150个品种中有20.67%含有Rht-B1b基因,有54.00%含有Rht-D1b基因,二者合计为74.67%;同时含有Rht-B1b和Rht-D1b2个矮秆基因的仅占3.33%。表明山东小麦矮化育种中Rht-D1b基因的利用远高于Rht-B1b。 展开更多
关键词 矮秆基因 小麦品种 山东 分子鉴定 b分布 b基因 分子标记 标记鉴定 分布情况 矮化育种
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我国斑鳜六个群体mtDNA Cyt b序列的遗传变异 被引量：23
9
作者 王伟伟 赵金良 李思发 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期589-593,共5页
采用PCR技术扩增了鸭绿江、海河、长江、钱塘江、闽江、西江6个群体31尾斑鳜(Sinipercascherzeri)mtDNACytb基因的部分序列。在长度为781bp的同源序列中,共检测到78个变异位点,占分析位点数的9.6%,碱基替换大都发生在密码子的第三位点上... 采用PCR技术扩增了鸭绿江、海河、长江、钱塘江、闽江、西江6个群体31尾斑鳜(Sinipercascherzeri)mtDNACytb基因的部分序列。在长度为781bp的同源序列中,共检测到78个变异位点,占分析位点数的9.6%,碱基替换大都发生在密码子的第三位点上;在31个体中共检出16种单倍型。鸭绿江、海河群体与长江、钱塘江、闽江、西江群体间的遗传距离较大。分子方差分析表明,斑鳜6个群体间总的遗传分化水平FST为0.9307(P<0.01),差异极显著。构建的NJ分子系统发育树表明,海河群体和鸭绿江群体构成了一支北方群体;长江群体、闽江群体和西江群体构成了南方群体;而钱塘江群体单独聚为一支。这表明我国斑鳜不同地理群体间已产生明显的遗传分化,但未与其自然地理分布格局呈完全对应关系。 展开更多
关键词 斑鳜 群体 CYT b基因 遗传变异
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棉花基因克隆研究进展 被引量：16
10
作者 胡根海 喻树迅 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2005年第4期240-244,共5页
棉花的基因克隆主要集中在纤维品质、抗逆、棉酚相关基因、叶绿体基因、调控元件和发育相关酶蛋白等六个方面。在纤维品质方面,我国已克隆了β-微管蛋白基因、E6基因、GhbZ-IP、GhIAA16和40个棉纤维特异表达基因,同时还得到一批性质不... 棉花的基因克隆主要集中在纤维品质、抗逆、棉酚相关基因、叶绿体基因、调控元件和发育相关酶蛋白等六个方面。在纤维品质方面,我国已克隆了β-微管蛋白基因、E6基因、GhbZ-IP、GhIAA16和40个棉纤维特异表达基因,同时还得到一批性质不清楚的cDNA克隆。国外已分离出Fbl2A、Rac13、.Rac9、MYB基因和20余个纤维发育相关基因。在抗逆性方面已得到了LRR-RC基因、14-3-3蛋白和PR蛋白基因等以及一些cDNA克隆。 展开更多
关键词 基因克隆 研究进展 棉花 β-微管蛋白基因 14-3-3蛋白 cDNA克隆 特异表达基因 发育相关基因 纤维品质 叶绿体基因 调控元件 酶蛋白 棉纤维 b基因 抗逆性 PR
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雀形目15种鸟类CoⅠ与Cyt b基因序列的比较 被引量：18
11
作者 梁刚 张卫 +3 位作者 雷富民 尹祚华 黄原 李天宪 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2007年第3期613-620,共8页
对雀形目Passeriformes6科15种鸟类线粒体DNA的Cyt b基因全序列(1143bp)和CoⅠ基因部分序列(1176bp)进行了比较,结果显示Cyt b和CoⅠ基因序列的变异位点分别为454个和366个,简约信息位点为337个和303个,而且CoⅠ基因比Cytb基因略微保守... 对雀形目Passeriformes6科15种鸟类线粒体DNA的Cyt b基因全序列(1143bp)和CoⅠ基因部分序列(1176bp)进行了比较,结果显示Cyt b和CoⅠ基因序列的变异位点分别为454个和366个,简约信息位点为337个和303个,而且CoⅠ基因比Cytb基因略微保守,进化速率也较低。采用邻接法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法分别构建了CoⅠ和Cyt b基因两组数据集的分子系统发生树及其合一树,并对建树结果进行了比较分析。基于以上两点,本文认为CoⅠ基因比Cyt b基因更适合于确定雀形目科级阶元之间的系统发生关系,而且它也能够作为雀形目物种鉴定的分子标记,但在物种鉴定方面不如Cyt b基因稳定和准确。 展开更多
关键词 雀形目 CoⅠ基因 CYT b基因 序列比较
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基于线粒体COⅠ和Cyt b基因的粉蝶亚科及黄粉蝶亚科(粉蝶科)部分类群的分子系统发生 被引量：20
12
作者 许丽 郝家胜 +4 位作者 朱国萍 殷先兵 潘鸿春 黄敦元 张小平 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2007年第4期842-850,共9页
测定了粉蝶科的粉蝶亚科和黄粉蝶亚科14属共24种线粒体COⅠ和Cyt b基因部分序列,并从GenBank中下载了2种粉蝶的同源序列,以眼蝶科的2个物种为外类群,运用NJ法、贝叶斯法分别重建了分子系统树,探讨了它们的系统发生关系。基因序列分析结... 测定了粉蝶科的粉蝶亚科和黄粉蝶亚科14属共24种线粒体COⅠ和Cyt b基因部分序列,并从GenBank中下载了2种粉蝶的同源序列,以眼蝶科的2个物种为外类群,运用NJ法、贝叶斯法分别重建了分子系统树,探讨了它们的系统发生关系。基因序列分析结果表明,经比对和处理后的序列总长度为1111bp,其中变异位点478个,简约位点382个,碱基T、C、A、G平均含量为39.9%、16.9%、30.9%、12.3%,A+T含量和C+G含量分别为70.8%和29.2%。分子系统树显示:黄粉蝶亚科不是单系群,但其中迁粉蝶属和豆粉蝶属在不同的分析方法中均聚合在一起。粉蝶亚科形成一个独立的支系,其中,襟粉蝶族为并系群;粉蝶族的粉蝶属、飞龙粉蝶属和云粉蝶属具有较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 粉蝶亚科 黄粉蝶亚科 COⅠ基因 CYT b基因 分子系统发生
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无载体主干序列的bar和cecropin B基因表达框共转化水稻 被引量：16
13
作者 赵艳 于彦春 +2 位作者 钱前 颜美仙 黄大年 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第2期135-141,共7页
基因枪等直接转化法可将去除质粒载体主干序列的外源基因表达框导入植物基因组 ,消除质粒主干序列对植物基因组的影响 ,同时由于转基因分子较小 ,比较容易实现多个基因的共转化 ,在植物基因工程育种上有重要的应用价值。研究了基因枪介... 基因枪等直接转化法可将去除质粒载体主干序列的外源基因表达框导入植物基因组 ,消除质粒主干序列对植物基因组的影响 ,同时由于转基因分子较小 ,比较容易实现多个基因的共转化 ,在植物基因工程育种上有重要的应用价值。研究了基因枪介导外源基因表达框 (包括启动子、基因开放阅读框和终止子 )转化水稻的影响因素和转基因的整合模式 ,结果表明 :(1)基因枪介导外源基因表达框转化水稻的频率约在 0 1%～ 0 5 %之间 ,非选择标记基因与选择标记基因的共转化频率约为 5 0 %～ 6 0 % ,增加基因表达框DNA浓度可提高转化率。相同基因构建物对不同品种水稻的转化率不同 ,基因构建物的侧边序列对基因枪转化的品种差异可能具有重要影响。 (2 )非选择标记基因cecropinB表达框在水稻基因组内整合模式简单 ,仅有 1～ 3个拷贝 ;筛选标记基因bar表达框却比完整质粒转化后的整合模式复杂得多 ,插入拷贝数在 4～ 14个之间。线形基因表达框的游离DNA末端和CaMV 展开更多
关键词 无载体主干序列 bAR CECROPIN b基因 表达框 共转化 水稻
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天蚕抗菌肽B基因在广霍香抗病育种中的应用 被引量：16
14
作者 周鹏 郑学勤 陈向民 《热带作物学报》 CSCD 1998年第2期27-31,共5页
用天蚕抗菌肽B基因转化广霍香，以期产生抗广霍香青枯病的转基因株系。通过农杆菌介导的叶盘法将抗菌肽B基因转入广霍香的组织细胞，在Kan的筛选培养基上经过丛芽途径获得转基因植株；采用DNADotblot、Southernblot、RNADotblot和大田... 用天蚕抗菌肽B基因转化广霍香，以期产生抗广霍香青枯病的转基因株系。通过农杆菌介导的叶盘法将抗菌肽B基因转入广霍香的组织细胞，在Kan的筛选培养基上经过丛芽途径获得转基因植株；采用DNADotblot、Southernblot、RNADotblot和大田攻毒试验证实抗菌肽B基因已整合到再生植株的核基因组中，获得了高水平的表达，产生较强的抗病效果。 展开更多
关键词 广霍香 天蚕抗菌肽 b基因 抗病育种 转基因植株
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基于线粒体cox1和Cyt b基因对四川地区多头带绦虫的种群遗传多样性研究 被引量：20
15
作者 郝桂英 杨应东 +1 位作者 周英姿 杨光友 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期631-638,共8页
为研究四川地区多头带绦虫的种群遗传多样性和系统发生关系,用线粒体cox1基因和Cyt b基因全序列分析了20株四川山羊源多头蚴(11株寄生于脑,9株寄生于肌间)的遗传变异,并构建了系统发育树。结果显示:20株多头蚴cox1和Cyt b基因全序列长... 为研究四川地区多头带绦虫的种群遗传多样性和系统发生关系,用线粒体cox1基因和Cyt b基因全序列分析了20株四川山羊源多头蚴(11株寄生于脑,9株寄生于肌间)的遗传变异,并构建了系统发育树。结果显示:20株多头蚴cox1和Cyt b基因全序列长度分别为1 623和1 068bp,分别有59个和9个变异位点,其碱基变异率分别为0.1%~2.5%和0.1%~0.7%;分别检测到17个和6个单倍型,总的单倍型多样性分别为0.968±0.033和0.737±0.068,核苷酸多样性分别为0.005 98±0.001 33和0.003 06±0.000 79,平均遗传距离分别为0.006和0.003。构建的系统进化树均显示来源于脑部和肌间的20株四川山羊源多头蚴与多头带绦虫同在一个支系,均为多头带绦虫,且多头带绦虫四川分离株与伊朗、土耳其分离株亲缘关系较近,而与中国甘肃、中国广州、意大利分离株亲缘关系较远。研究结果表明线粒体cox1和Cyt b基因均可作为检测多头带绦虫种群遗传多样性的有效分子标记,且Cyt b基因的多样性水平低于cox1基因。 展开更多
关键词 多头带绦虫 cox1基因 CYT b基因 遗传多样性 四川
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VDR基因型分布及其与骨矿含量的关系 被引量：11
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作者 闫丽娅 王晓红 +2 位作者 张卉 侯菊倩 韩延柏 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 1997年第2期19-21,共3页
近年来，在骨质疏松研究领域，维生素Ｄ受体基因（ＶＤＲ）与骨量及骨代谢的研究受到许多国外学者的重视。我们利用国际合作的机会，对９６名沈阳妇女ＶＤＲ基因进行了分析。研究对象来自于一项正在进行的骨代谢影响因素研究课题。采用... 近年来，在骨质疏松研究领域，维生素Ｄ受体基因（ＶＤＲ）与骨量及骨代谢的研究受到许多国外学者的重视。我们利用国际合作的机会，对９６名沈阳妇女ＶＤＲ基因进行了分析。研究对象来自于一项正在进行的骨代谢影响因素研究课题。采用标准方法（Ｎｕｃｌｅｏｎｋｉｔ，ｓｃｏｔｌａｂ，ＵＫ）从白细胞中提取ＤＮＡ，以聚合酶链反应（ＰＣＲ）来扩增特定基因段。用ＢｓａＭＩ限制性内切酶消化ＰＣＲ产物，以２％琼脂糖电泳分离判定ＶＤＲ基因型。使用ＤＰＸ－Ｌ（ＬｕｎａｒＵＳＡ）骨矿测定仪测定研究对象的腰椎（Ｌ２～４）及髋部骨矿含量（ＢＭＣ）。结果：与其他国家人群相比，该人群ＶＤＲ基因的分布状态不同。ＶＤＲ基因的ｂｂ型占总数的９１．７％；Ｂｂ型仅占８．３％，而且ＢＢ基因型完全不存在。在青年妇女中发现ｂｂ基因型组股骨颈ＢＭＣ高于Ｂｂ型组股骨颈ＢＭＣ（Ｐ＝０．０２７）。老年妇女ｂｂ基因型组股骨颈ＢＭＣ也高于Ｂｂ型组，但差异无统计学意义，没有发现其他部位ＢＭＣ与ＶＤＲ基因型有关。 展开更多
关键词 骨矿含量 基因型分布 股骨颈 骨代谢 人群 bMC b基因 VDR 琼脂糖电泳 维生素D受体基因
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中国黄颡鱼的线粒体DNA多样性及其分子系统学 被引量：16
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作者 库喜英 周传江 何舜平 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期262-274,共13页
基于体侧色斑、背鳍前部形态、吻长及尾柄长的差异,Ng和Kottelat(2007)将分布于中国的黄颡鱼群体划为两个物种:北方群体为Pseudobagrus sinensis,南方群体为P.fulvidraco。本研究通过对70个黄颡鱼标本相关形态特征的测量及对线粒体cyt ... 基于体侧色斑、背鳍前部形态、吻长及尾柄长的差异,Ng和Kottelat(2007)将分布于中国的黄颡鱼群体划为两个物种:北方群体为Pseudobagrus sinensis,南方群体为P.fulvidraco。本研究通过对70个黄颡鱼标本相关形态特征的测量及对线粒体cyt b基因序列的分析,探讨了P.sinensis物种的有效性问题。结果表明:依据体侧色斑和背鳍前部形态的差异,可将黄颡鱼分为对应于P.sinensis和P.fulvidraco的两种形态类型,但对尾柄长、吻长的测量发现二者没有差异。对70条cyt b基因序列的分析结果为:两种鱼类有1个共同的单倍型;两种鱼类的单系性在系统发育分析中都没有得到重现,而二者聚在一起形成获得100%支持率的单系群;两种鱼类群体之间存在持续的基因交流(Nm=4.7);两种鱼类在单倍型的巢式支系分析(nested clade analysis,NCA)中没有形成各自独立的进化谱系,所有的单倍型以不超过5步的突变全部被纳入同一个进化网络中。因此我们认为P.sinensis不是有效物种,而应被视为黄颡鱼的一种形态类型。基于cyt b基因的序列变异,本研究对黄颡鱼群体的遗传多样性和种群结构作了初步分析。群体的核苷酸不配对分布及Tajima's D中性检验表明,约在10.1-14.1万年前,黄颡鱼在其分布范围内经历过群体扩张,推测这可能是导致黄颡鱼群体单倍型多样度高(h=0.857±0.0014)而核苷酸多样度低(π=0.0023±0.0003)的主要原因。此外,分析结果显示黄颡鱼群体缺乏明显的地理结构,推测原因可能是历史上水系的连通促进了不同地理群体之间的基因交流。 展开更多
关键词 Pseudobagrusfulvidraco Pseudobagrus sinens CYT b基因 遗传多样性 种群扩张 基因流
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沙氏下(鱼箴)鱼卵的形态学及遗传学鉴别 被引量：15
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作者 卞晓东 张秀梅 +1 位作者 高天翔 肖永双 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期342-352,共11页
为了准确鉴别在南黄海海区（33°49′N，122°10′E）采集的附着在海藻上的鱼卵种类，利用光学显微镜、扫描电镜和遗传学方法开展了综合鉴别研究。在光学显微镜下：卵呈微扁圆形，卵径1．95～2．38mm，粘着沉性；卵黄间隙较窄... 为了准确鉴别在南黄海海区（33°49′N，122°10′E）采集的附着在海藻上的鱼卵种类，利用光学显微镜、扫描电镜和遗传学方法开展了综合鉴别研究。在光学显微镜下：卵呈微扁圆形，卵径1．95～2．38mm，粘着沉性；卵黄间隙较窄，卵黄囊呈乳白色，无龟裂；卵膜平滑，在其表面有5～7根细长角质管状卵膜丝；多油球数不定（4～145），油球径0．05-0．50mm，油球在卵黄囊中的位置随不同发育时期而不断发生变化；胚体处在不同的发育阶段，其特征符合颌针鱼目鱼卵的特征。在扫描电镜（SEM）下观察：鱼卵受精孔明显，位于动物极的卵膜丝之间，外缘孔径12．3μm；卵膜壁孔不明显，在卵膜表面有大量颗粒状突起，密度约为50ind·100μm^-2。遗传学分析结果显示：鱼卵与沙氏下鲼鱼mtDNACytb基因片段序列之间无差异，遗传距离为0，而与其它颌针鱼目鱼类序列间差异达18．72％～21．3％，遗传距离在21．9％～26．4％之间。NJ分子系统树的聚类结果也显示鱼卵与沙氏下鲼鱼序列聚为一支，它们共享一个单倍型，而与其它颌针鱼目鱼类序列分为两大支，其亲缘关系较远。以上分析结果表明该鱼卵为沙氏下鲢鱼卵。 展开更多
关键词 沙氏下鲼鱼 鱼卵 鉴别 形态学 CYT b基因 序列
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线粒体Cyt b基因与昆虫分子系统学研究 被引量：13
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作者 戴金霞 《四川动物》 CSCD 北大核心 2005年第2期222-225,共4页
细胞色素b (cytochromeb,Cyt b)是线粒体13个蛋白质编码基因中结构和功能被研究得最为清楚的基因之一,该基因的进化速度适中,适合研究种内到种间甚至科间的系统发育关系,研究内容涉及种及种下阶元的分类鉴定、种上阶元的系统发育分析、... 细胞色素b (cytochromeb,Cyt b)是线粒体13个蛋白质编码基因中结构和功能被研究得最为清楚的基因之一,该基因的进化速度适中,适合研究种内到种间甚至科间的系统发育关系,研究内容涉及种及种下阶元的分类鉴定、种上阶元的系统发育分析、种群的遗传变异和进化研究、分子进化研究等方面,本文对Cytb基因的分子特点及其在昆虫系统学研究中的应用进行综述。 展开更多
关键词 CYT b基因 分子特征 昆虫 分子系统学
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中国3个牛种cyt b基因多态性及其系统发育研究 被引量：13
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作者 蔡欣 陈宏 +2 位作者 雷初朝 胡沈荣 苏利红 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2007年第2期43-46,52,共5页
基于mtDNA cyt b基因全长序列,对中国黄牛、牦牛和水牛的遗传多态性和系统发育关系进行了分析。结果表明,中国黄牛、牦牛和水牛cyt b基因序列中碱基A和T的含量均比较高,A+T的平均含量分别为56.6%,58.2%和56.0%。黄牛在cyt b基因全长序... 基于mtDNA cyt b基因全长序列,对中国黄牛、牦牛和水牛的遗传多态性和系统发育关系进行了分析。结果表明,中国黄牛、牦牛和水牛cyt b基因序列中碱基A和T的含量均比较高,A+T的平均含量分别为56.6%,58.2%和56.0%。黄牛在cyt b基因全长序列具有较丰富的核苷酸多样性(Pi=0.016 84),水牛的核苷酸多样性相对贫乏(Pi=0.003 51),牦牛的核苷酸多样性介于二者之间(Pi=0.012 28)。中国黄牛与牦牛和欧洲野牛之间的亲缘关系相对较近,而与水牛间的亲缘关系则相对较远,黄牛有普通牛和瘤牛2个母系起源;中国牦牛和斑腾牛以及羯牛的亲缘关系相对较近;中国水牛和沼泽型水牛具有较近的亲缘关系,也可能有2个或者2个以上的母系起源。 展开更多
关键词 中国黄牛 中国牦牛 中国水牛 CYT b基因 遗传多态性
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