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龙眼HD-Zip家族固有无序蛋白的预测与分析
1
作者
张春渝
许小琼
+3 位作者
张梓浩
陈裕坤
林玉玲
赖钟雄
《园艺与种苗》
CAS
2020年第5期3-7,共5页
[目的]探究龙眼HD-Zip中是否存在固有无序蛋白(intrinsically disordered protein,IDPs)。[方法]以龙眼基因组数据库提取的19个龙眼HD-Zip家族成员为对象进行固有无序蛋白的预测、无序区特征以及无序区与有序区的氨基酸偏好性分析。[结...
[目的]探究龙眼HD-Zip中是否存在固有无序蛋白(intrinsically disordered protein,IDPs)。[方法]以龙眼基因组数据库提取的19个龙眼HD-Zip家族成员为对象进行固有无序蛋白的预测、无序区特征以及无序区与有序区的氨基酸偏好性分析。[结果]龙眼HD-Zip的19个成员中共有15个成员为部分无序的固有无序蛋白;龙眼HD-Zip固有无序蛋白的无序区中含有蛋白质的结合位点;20种氨基酸对无序区域以及有序区域的形成各有所偏向。[结论]龙眼HD-Zip固有无序蛋白可能通过分子调控网络参与应激反应;龙眼HD-Zip固有无序蛋白具有氨基酸偏好性。最后,还对人工智能(AI,Artificial Intelligence)在无序蛋白发展的应用前景进行了展望。
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关键词
固有无序蛋白
龙眼
hd
-
zip
氨基酸偏好性
应激胁迫
分子调控
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职称材料
题名
龙眼HD-Zip家族固有无序蛋白的预测与分析
1
作者
张春渝
许小琼
张梓浩
陈裕坤
林玉玲
赖钟雄
机构
福建农林大学园艺植物生物工程研究所
出处
《园艺与种苗》
CAS
2020年第5期3-7,共5页
基金
国家自然科学基金项目(NO.31572088,31672127)
福建省高原学科建设经费(NO.102/71201801101)
+1 种基金
福建农林大学科技创新专项基金(NO.KF2015108,CXZX2017189
CXZX2016118、CXZX2017314、CXZX2018076)。
文摘
[目的]探究龙眼HD-Zip中是否存在固有无序蛋白(intrinsically disordered protein,IDPs)。[方法]以龙眼基因组数据库提取的19个龙眼HD-Zip家族成员为对象进行固有无序蛋白的预测、无序区特征以及无序区与有序区的氨基酸偏好性分析。[结果]龙眼HD-Zip的19个成员中共有15个成员为部分无序的固有无序蛋白;龙眼HD-Zip固有无序蛋白的无序区中含有蛋白质的结合位点;20种氨基酸对无序区域以及有序区域的形成各有所偏向。[结论]龙眼HD-Zip固有无序蛋白可能通过分子调控网络参与应激反应;龙眼HD-Zip固有无序蛋白具有氨基酸偏好性。最后,还对人工智能(AI,Artificial Intelligence)在无序蛋白发展的应用前景进行了展望。
关键词
固有无序蛋白
龙眼
hd
-
zip
氨基酸偏好性
应激胁迫
分子调控
Keywords
Intrinsically disordered protein
Longan
hd
-
zip
Amino acid preference
Stress
Molecular regulation
分类号
S667.2 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
龙眼HD-Zip家族固有无序蛋白的预测与分析
张春渝
许小琼
张梓浩
陈裕坤
林玉玲
赖钟雄
《园艺与种苗》
CAS
2020
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