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应用iTRAQ定量蛋白质组学技术筛选无乳链球菌鱼源株与牛源株差异表达蛋白 被引量：4
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作者 郭长明 袁橙 +3 位作者 朱善元 刘广锦 陆承平 刘永杰 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第4期868-873,共6页
为揭示不同宿主来源无乳链球菌致病机制,提取无乳链球菌鱼源株GD201008-001和牛源株ATCC13813的全菌蛋白质,经iTRAQ试剂标记后进行质谱鉴定,质谱数据用软件Mascot2.2和Proteome Discoverer1.4进行查库(UniProt数据库)鉴定及定量分析,并... 为揭示不同宿主来源无乳链球菌致病机制,提取无乳链球菌鱼源株GD201008-001和牛源株ATCC13813的全菌蛋白质,经iTRAQ试剂标记后进行质谱鉴定,质谱数据用软件Mascot2.2和Proteome Discoverer1.4进行查库(UniProt数据库)鉴定及定量分析,并利用blast2go软件对差异蛋白质进行GO(gene ontology)功能注释。共鉴定出在鱼源株GD201008-001和牛源株ATCC13813中差异表达的蛋白质17个(P<0.05),其中在ATCC13813中上调表达的蛋白质3个(比值>1.500),下调表达的蛋白质14个(比值<0.667)。GO分析预测结果表明这些蛋白质主要参与15个生物学功能,涉及代谢过程、细胞成分、结合、催化活性、结构分子活性等。其中cpsIVK在牛源株ATC13813中下调最显著,其功能为荚膜生物合成蛋白质,与无乳链球菌荚膜合成相关。进一步验证发现,鱼源株GD201008-001抵抗小鼠巨噬细胞RAW264.7吞噬的能力显著高于cpsIVK下调的牛源株ATCC13813(P<0.01),提示cpsIVK可能在鱼源无乳链球菌逃避宿主免疫细胞吞噬过程中发挥功能。 展开更多
关键词 无乳链球菌 鱼源株 牛源株 ITRAQ cpsIVK基因 蛋白质组学
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应用iTRAQ定量蛋白质组学技术筛选无乳链球菌鱼源株与人源株差异表达蛋白 被引量：3
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作者 郭长明 袁橙 +4 位作者 武彩红 朱善元 刘广锦 陆承平 刘永杰 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期442-451,共10页
以斑马鱼和巨噬细胞作为体内、外感染模型,比较无乳链球菌鱼源株GD201008-001与人源株A909的致病性差异,利用iTRAQ技术和质谱分析技术进行差异表达蛋白鉴定,以期为揭示无乳链球菌不同宿主来源株致病机制提供新思路。实验通过测定菌株GD2... 以斑马鱼和巨噬细胞作为体内、外感染模型,比较无乳链球菌鱼源株GD201008-001与人源株A909的致病性差异,利用iTRAQ技术和质谱分析技术进行差异表达蛋白鉴定,以期为揭示无乳链球菌不同宿主来源株致病机制提供新思路。实验通过测定菌株GD201008-001、A909的斑马鱼半数致死量和巨噬细胞吞噬率,比较二者致病性差异;提取全菌蛋白,经iTRAQ试剂标记后进行质谱鉴定,质谱数据用软件Mascot 2.2和Proteome Discoverer 1.4进行查库(Uni Prot数据库)鉴定及定量分析,并对差异蛋白进行GO功能注释和KEGG通路分析。结果显示,GD201008-001毒力显著高于A909;通过iTRAQ分析两株菌差异表达蛋白,发现差异蛋白涉及的生物学功能较为广泛,在鉴定出的368个差异表达蛋白中,GD201008-001中上调表达蛋白193个(比值>1.5),下调表达蛋白175个(比值<0.667)。生物信息学分析预测这些蛋白主要涉及26个生物学功能,14个通路,推测Clp X、Glm S和Cps IVK可能在两株菌致病性差异中发挥重要作用。本研究为阐明无乳链球菌不同宿主来源株致病性差异奠定了基础。 展开更多
关键词 无乳链球菌 鱼源株 人源株 ITRAQ 蛋白质组学
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