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基于网络药理学与分子对接的“鬼箭羽-白花蛇舌草”治疗子宫内膜异位症的作用机制研究
被引量:
1
1
作者
王珺
徐传花
《医学信息》
2023年第9期21-29,共9页
目的应用网络药理学与分子对接技术揭示“鬼箭羽-白花蛇舌草”药对治疗子宫内膜异位症的分子机制,为其临床应用提供新的理论依据及研究思路。方法从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取“鬼箭羽-白花蛇舌草”药对主要活性成分,利...
目的应用网络药理学与分子对接技术揭示“鬼箭羽-白花蛇舌草”药对治疗子宫内膜异位症的分子机制,为其临床应用提供新的理论依据及研究思路。方法从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取“鬼箭羽-白花蛇舌草”药对主要活性成分,利用PubChem及SwissTargetPrediction数据库获取主要活性成分的药物靶点;利用GeneCards、TTD、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取子宫内膜异位症相关靶点,与药物靶点进行交集获得共有靶点。利用DAVID 2021在线数据库对共有靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,应用STRING11.5在线数据库构建共有靶点蛋白互作网络(PPI),通过Discovery Studio2019对靶点蛋白与关键化合物进行分子对接评价。结果共筛选出13个“鬼箭羽-白花蛇舌草”主要活性成分,药物靶点366个,与疾病靶点取交集得到130个共有靶点,其中核心靶点有STAT3、SRC、EGFR、AKT1、MAPK3等。GO富集分析显示:生物学过程(BP)共富集到493个条目,主要为凋亡过程的负调控、蛋白质磷酸化、基因表达的负调控、炎症反应、对药物的反应等;细胞组分(CC)共富集到63个条目,主要为细胞质、胞质溶胶、质膜、细胞外空间、质膜的组成部分等;分子功能(MF)共富集到126个条目,主要为相同蛋白质结合、ATP结合、酶结合、蛋白激酶活性、血红素结合等。KEGG富集分析得到129个条目,主要为癌症通路、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药、化学致癌-受体激活、脂质和动脉粥样硬化、化学致癌-活性氧等。通过PPI互作网络并拓扑分析得出度值排名靠前的靶点有STAT3、SRC、EGFR、AKT1、MAPK3等,这些蛋白靶点是其治疗EMT的关键靶点。分子对接结果显示,MAPK3与5,7-二羟基-2-(3-羟基-4-甲氧基苯基)色满-4-酮、山柰酚、槲皮素,AKT1与5,7-二羟基-2-(3-羟基-4-甲氧基�
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关键词
鬼箭羽
-
白花
蛇舌草
子宫内膜异位症
网络药理学
分子对接
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职称材料
题名
基于网络药理学与分子对接的“鬼箭羽-白花蛇舌草”治疗子宫内膜异位症的作用机制研究
被引量:
1
1
作者
王珺
徐传花
机构
南京中医药大学研究生院
南京中医药大学附属常州市中医医院妇科
出处
《医学信息》
2023年第9期21-29,共9页
基金
第五批全国中医临床优秀人才研修项目(编号:国中医药人教函〔2022〕1号)。
文摘
目的应用网络药理学与分子对接技术揭示“鬼箭羽-白花蛇舌草”药对治疗子宫内膜异位症的分子机制,为其临床应用提供新的理论依据及研究思路。方法从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取“鬼箭羽-白花蛇舌草”药对主要活性成分,利用PubChem及SwissTargetPrediction数据库获取主要活性成分的药物靶点;利用GeneCards、TTD、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取子宫内膜异位症相关靶点,与药物靶点进行交集获得共有靶点。利用DAVID 2021在线数据库对共有靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,应用STRING11.5在线数据库构建共有靶点蛋白互作网络(PPI),通过Discovery Studio2019对靶点蛋白与关键化合物进行分子对接评价。结果共筛选出13个“鬼箭羽-白花蛇舌草”主要活性成分,药物靶点366个,与疾病靶点取交集得到130个共有靶点,其中核心靶点有STAT3、SRC、EGFR、AKT1、MAPK3等。GO富集分析显示:生物学过程(BP)共富集到493个条目,主要为凋亡过程的负调控、蛋白质磷酸化、基因表达的负调控、炎症反应、对药物的反应等;细胞组分(CC)共富集到63个条目,主要为细胞质、胞质溶胶、质膜、细胞外空间、质膜的组成部分等;分子功能(MF)共富集到126个条目,主要为相同蛋白质结合、ATP结合、酶结合、蛋白激酶活性、血红素结合等。KEGG富集分析得到129个条目,主要为癌症通路、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药、化学致癌-受体激活、脂质和动脉粥样硬化、化学致癌-活性氧等。通过PPI互作网络并拓扑分析得出度值排名靠前的靶点有STAT3、SRC、EGFR、AKT1、MAPK3等,这些蛋白靶点是其治疗EMT的关键靶点。分子对接结果显示,MAPK3与5,7-二羟基-2-(3-羟基-4-甲氧基苯基)色满-4-酮、山柰酚、槲皮素,AKT1与5,7-二羟基-2-(3-羟基-4-甲氧基�
关键词
鬼箭羽
-
白花
蛇舌草
子宫内膜异位症
网络药理学
分子对接
Keywords
Winged Euonymus Branchlet and Spreading Hedyotis Herb
Endometriosis
Network pharmacology
Molecular docking
分类号
R711.71 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学与分子对接的“鬼箭羽-白花蛇舌草”治疗子宫内膜异位症的作用机制研究
王珺
徐传花
《医学信息》
2023
1
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