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反流性食管炎严重程度与食管黏膜菌群结构变化的关系初探 被引量：18
1
作者 余英 张杰 +2 位作者 高峰 陈雪 孙亚梅 《中国医药》 2019年第10期1519-1523,共5页
目的探讨反流性食管炎(RE)的严重程度与食管黏膜菌群结构变化的关系。方法选取2017年5-10月于首都医科大学附属北京安贞医院首次就诊的RE患者32例,经胃镜检查确诊为RE,根据RE洛杉矶分型分为轻度RE组(A和B级,21例)和重度RE组(C和D级,11例... 目的探讨反流性食管炎(RE)的严重程度与食管黏膜菌群结构变化的关系。方法选取2017年5-10月于首都医科大学附属北京安贞医院首次就诊的RE患者32例,经胃镜检查确诊为RE,根据RE洛杉矶分型分为轻度RE组(A和B级,21例)和重度RE组(C和D级,11例)。招募17名健康志愿者作为健康对照组。提取受试者食管下段黏膜样本细菌基因组DNA,采用16S r DNA基因扩增和Illumina测序技术将细菌归类。结果轻度RE组、重度RE组与健康对照组之间比较,γ-变形菌纲、普氏菌属、螺杆菌属和莫氏杆菌属丰度差异均有统计学意义[9. 0(8. 5,9. 7)%比9. 9(9. 0,11. 1)%比8. 7(8. 3,9. 2)%、0. 12(0. 06,0. 16)%比0. 13 (0. 09,0. 18)%比0. 20 (0. 14,0. 35)%、0. 04 (0. 02,0. 07)%比0. 02 (0. 02,0. 04)%比0. 10 (0. 03,0. 14)%、0 (0,0)%比0 (0,0)%比0. 002 (0,0. 019)%](P=0. 049、0. 001、0. 034、0. 013)。重度RE组胃食管反流病量表(GERDQ)评分较轻度RE组明显升高[8(8,11)分比4(2,8)分],差异有统计学意义(Z=-2. 876,P=0. 004)。Spearman相关性分析结果显示,RE患者GERDQ评分与厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门、变形菌门均无明显相关性,相关系数分别为0. 213(P=0. 242),-0. 082(P=0. 657),0. 068(P=0. 712),0. 204(P=0. 262)。结论 RE患者食管下段黏膜菌群构成较健康受试者出现明显变化,这可能为RE的防治提供新的方向。 展开更多
关键词 反流性食管炎 食管黏膜菌群结构 高通量dna测序技术
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反流性食管炎治疗效果与食管下段菌群构成变化的关系研究 被引量：14
2
作者 余英 高峰 张杰 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2020年第2期243-248,共6页
目的研究食管下段菌群变化与反流性食管炎患者治疗效果的关系。方法对反流性食管炎患者给予质子泵抑制剂规范治疗,在治疗前、后分别采集食管下段黏膜样本,根据治疗效果分为愈合组和愈合不良组,采用宏基因组学高通量DNA测序和生物信息学... 目的研究食管下段菌群变化与反流性食管炎患者治疗效果的关系。方法对反流性食管炎患者给予质子泵抑制剂规范治疗,在治疗前、后分别采集食管下段黏膜样本,根据治疗效果分为愈合组和愈合不良组,采用宏基因组学高通量DNA测序和生物信息学分析技术,比较治疗前、后食管下段黏膜菌群构成变化。结果对愈合组患者治疗前与治疗后食管下段黏膜菌群丰度进行比较发现:乳杆菌科、乳杆菌属、双歧杆菌属、螺杆菌属丰度差异有统计学意义[2.7%(1.5%~3.2%)vs 4.8%(3.0%~10.7%)、2.7%(1.5%~3.2%)vs 4.8%(3.0%~10.7%)、0.7%(0.6%~10.7%)vs 1.4%(1.0%~2.2%)、0.08%(0.04%~0.13%)vs 0.12%(0.08%~0.21%)](P=0.001、P=0.001、P=0.042、P=0.049)。同时对愈合组和愈合不良组治疗后食管下段黏膜菌群丰度进行比较发现:双歧杆菌属、螺杆菌属丰度差异有统计学意义[1.4%(1.0%~2.2%)vs 0.7%(0.4%~1.1%)、0.12%(0.08%~0.21%)vs 0.07%(0.03%~0.09%)](P=0.003、P=0.014)。结论质子泵抑制剂治疗反流性食管炎的治疗效果与食管下段黏膜菌群构成变化相关,愈合组有益菌丰度明显增高。 展开更多
关键词 反流性食管炎 高通量dna测序技术 菌群构成 治疗效果
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奥美拉唑治疗对反流性食管炎模型大鼠食管菌群构成的影响 被引量：6
3
作者 高峰 贾梦真 孙玥 《基础医学与临床》 2021年第3期370-375,共6页
目的探讨质子泵抑制剂(PPI)治疗对反流性食管炎大鼠食管菌群构成的影响。方法采用幽门部分结扎及前胃完全结扎手术建立反流性食管炎大鼠模型。SD大鼠随机分为假手术对照组、反流性食管炎对照组和质子泵抑制剂奥美拉唑治疗组;术后1周开... 目的探讨质子泵抑制剂(PPI)治疗对反流性食管炎大鼠食管菌群构成的影响。方法采用幽门部分结扎及前胃完全结扎手术建立反流性食管炎大鼠模型。SD大鼠随机分为假手术对照组、反流性食管炎对照组和质子泵抑制剂奥美拉唑治疗组;术后1周开始灌胃,灌胃2周后处死大鼠获取食管黏膜组织2块,1块用于细菌16S rDNA基因测序,另1块用于病理检查。结果每组6只大鼠入选研究,假手术对照组、反流性食管炎对照组和质子泵抑制剂治疗组食管黏膜的属水平菌群构成检测如下:消化链球菌属(Peptostre-ptococcus)丰度值分别为2.5%±0.5%、1.7%±0.7%和1.9%±0.5%;螺杆菌属(Heliobacter)丰度值分别为1.5%±0.1%、1.0%±0.5%和1.2%±0.3%;苏黎世杆菌属(Turicibacter)丰度值分别为1.0%±0.2%、0.5%±0.2%和1.0%±0.4%(P<0.05);反流性食管炎对照组的以上3组菌属丰度值明显低于假手术对照组(P<0.05)。反流性食管炎对照组和质子泵抑制剂治疗组病理分级(轻/中/重)分别为0/4/2和5/1/0(P<0.05)。结论反流性食管炎大鼠食管菌群构成发生改变,有益菌减少;灌服质子泵抑制剂奥美拉唑治疗后,食管黏膜损伤减轻,有益菌增加,菌群构成恢复正常。 展开更多
关键词 反流性食管炎 质子泵抑制剂 高通量dna测序技术 食管菌群
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香连片治疗反流性食管炎大鼠后食管黏膜菌群构成变化研究 被引量：4
4
作者 贾梦真 高峰 +2 位作者 孙玥 陈雪 张杰 《中国医药》 2019年第12期1842-1846,共5页
目的探讨香连片灌服对反流性食管炎(RE)大鼠食管黏膜菌群构成的影响.方法采用“幽门部分结扎及前胃完全结扎手术”建立大鼠RE模型;24只健康雄性SD大鼠用随机数字表法分为假手术组、蒸馏水组(RE对照组)、香连片组(RE观察组),每组8只.术后... 目的探讨香连片灌服对反流性食管炎(RE)大鼠食管黏膜菌群构成的影响.方法采用“幽门部分结扎及前胃完全结扎手术”建立大鼠RE模型;24只健康雄性SD大鼠用随机数字表法分为假手术组、蒸馏水组(RE对照组)、香连片组(RE观察组),每组8只.术后1周后香连片组每日灌服香连片蒸馏水溶液,假手术组、蒸馏水组每日给予相同容量蒸馏水灌胃,2周后获取2块食管下段黏膜组织,1块用于提取黏膜样本细菌基因组DNA,采用16S rDNA基因扩增和Illumina测序技术将细菌归类;1块进行苏木精-伊红染色和RE病理分级.比较各组食管黏膜菌群构成差别,比较各组食管黏膜病理学改变.结果每组6只完成研究,假手术组、蒸馏水组和香连片组食管下段黏膜属水平菌群构成:消化链球菌属丰度值分别为(2.5±0.5)%、(1.7±0.7)%和(2.5±0.3)%(P=0.040),螺杆菌属丰度值分别为(1.5±0.1)%、(0.9±0.4)%和(1.6±0.1)%(P=0.003);乳球菌属丰度值分别为(0.8±0.1)%、(0.4±0.2)%和(0.7±0.1)%(P=0.018).蒸馏水组RE病理分级轻度1例、中度3例、重度2例;香连片组轻度6例,无中度及重度;2组间比较差异有统计学意义(P=0.015).结论RE大鼠灌服香连片后食管下段黏膜菌群构成发生改变,有益菌比例增加,从而起到治疗作用,这可能为RE的治疗提供新的方向. 展开更多
关键词 反流性食管炎 香连片 高通量dna测序技术 食管黏膜菌群构成 疗效
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高通量DNA测序技术在抗体新药研发中的应用 被引量：1
5
作者 余馨 刘启刚 王明蓉 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期322-331,258,共10页
自2005年首次报道了一种基于微乳液PCR技术的高通量DNA测序技术(high-throughput DNA se-quencing technology)以来,高通量DNA测序平台已经发展为基因组和各种基因文库序列检测的强大工具。大容量的抗体基因库是目前获得抗体新药的基础... 自2005年首次报道了一种基于微乳液PCR技术的高通量DNA测序技术(high-throughput DNA se-quencing technology)以来,高通量DNA测序平台已经发展为基因组和各种基因文库序列检测的强大工具。大容量的抗体基因库是目前获得抗体新药的基础,高通量DNA测序技术为从海量的抗体基因库中快速发现功能抗体分子提供了可能。本文就近几年高通量DNA测序技术在抗体基因库的多样性分析,抗体CDR3区的高通量测序、频率分析、功能基因发现及各种展示技术与高通量DNA测序技术的对接应用等方面进行了综述,以期为抗体新药的研发提供一条新的技术路线。 展开更多
关键词 高通量dna测序技术 单链抗体库 抗体多样性 抗体CDR区 抗体新药
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