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我国耐力运动员线粒体DNA高变区Ⅰ序列多态性分析 被引量:17
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作者 常芸 于长隆 +3 位作者 刘爱杰 高晓嶙 何子红 胡水清 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期4-10,共7页
为了探讨人类运动能力相关的基因标记与分子机制 ,对mtDNA高变区I作了序列多态性分析。研究选取汉族耐力运动员 95人 ,相应汉人对照 92人 ,对其mtDNA高变区I特异性片段进行扩增、测序 ,分析其序列多态性改变。结果显示 :中国汉族耐力运... 为了探讨人类运动能力相关的基因标记与分子机制 ,对mtDNA高变区I作了序列多态性分析。研究选取汉族耐力运动员 95人 ,相应汉人对照 92人 ,对其mtDNA高变区I特异性片段进行扩增、测序 ,分析其序列多态性改变。结果显示 :中国汉族耐力运动员的多态位点有 83个 ,其中 ,碱基替换位点 6 8,缺失位点 5个 ,插入位点 10个 ,位点 16 2 2 8碱基缺失及 16 113- 16 114和 16 335 -16 336碱基插入为运动员独有 ;中国汉族运动员mtDNA高变区I同质性多态主要表现为碱基转换、碱基颠换、缺失及插入四种类型 ,其中 ,碱基转换发生率最高 ,碱基颠换发生率次之 ,碱基缺失及插入频率最低。运动员碱基颠换频率明显高于常人 (P <0 0 5 ) ,而碱基缺失及插入频率则显著低于常人 (P <0 0 5 )。运动员T -C转换频率显著高于常人 (P <0 0 5 ) ,运动员A -G转换频率则显著低于常人 (P <0 0 1)。研究结果还提示 ,mtDNA扩增产物直接测序分析作为一种简便快捷的mtD NA序列多态性和单核苷酸多态性研究方法 ,为运动能力遗传标记的筛选与研究提供了有效方法 。 展开更多
关键词 中国 耐力运动员 线粒体DNA 高变区 基因序列 基因多态性
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毛球线粒体DNA的检测及临床应用研究 被引量:8
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作者 李霞 周新 +3 位作者 李杰 郭清莲 鄢盛恺 鲁敏翔 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期595-598,共4页
目的比较肌肉、血液和毛球线粒体DNA(mtDNA)的异质性多态水平,探讨毛球在线粒体相关疾病基因分析中的应用价值。方法收集50名无血缘关系汉族个体的肌肉、血液和毛发标本,采用聚合酶链反应(PCR)扩增mtDNA的高变区Ⅰ(HVⅠ)1603316368bp片... 目的比较肌肉、血液和毛球线粒体DNA(mtDNA)的异质性多态水平,探讨毛球在线粒体相关疾病基因分析中的应用价值。方法收集50名无血缘关系汉族个体的肌肉、血液和毛发标本,采用聚合酶链反应(PCR)扩增mtDNA的高变区Ⅰ(HVⅠ)1603316368bp片段并测序,比较3种不同组织的异质性多态水平。同时采用PCR限制性长度多态性(RFLP)检测3例线粒体脑肌病合并乳酸血症及卒中发作综合征(MELAS)患者的mtDNAtRNAleu基因nt.3243(A→G)突变,比较不同组织的突变检测率。结果肌肉标本异质性检测率为18%(9/50),毛球为16%(8/50),两者较接近,但均明显高于血液的10%检测率(5/50)。3例MELAS患者的肌肉和毛球标本均检出A3243G突变,仅两例患者的血液标本中检出此突变。结论毛球mtDNA的异质性多态水平接近肌肉,高于血液;毛球标本的线粒体点突变检测率高于血液,因此在线粒体相关疾病的基因分析中具有较高的临床应用价值。 展开更多
关键词 临床应用研究 线粒体DNA 聚合酶链反应(PCR) 限制性长度多态性 mtDNA 线粒体脑肌病 临床应用价值 基因分析 相关疾病 毛球标本 无血缘关系 MELAS 异质性 检测率 高变区 乳酸血症 血液标本 肌肉 水平 患者 综合征 G突变
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中国内蒙古鄂伦春族线粒体DNA高变区Ⅰ和高变区Ⅱ遗传多态性 被引量:1
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作者 阎春霞 陈峰 +4 位作者 党永辉 李涛 郑海波 陈腾 李生斌 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期439-447,共9页
收集50份鄂伦春族无关人群外周血样本,用ABIPRISM377测序仪对其mtDNAHVRⅠ和HVRⅡ进行测序,计算多态性位点数、单倍型数目、单倍型频率、平均核苷酸差异数目等多态性指标;结合已发表的其他民族mtDNA遗传资料,根据Nei法计算鄂伦春族与各... 收集50份鄂伦春族无关人群外周血样本,用ABIPRISM377测序仪对其mtDNAHVRⅠ和HVRⅡ进行测序,计算多态性位点数、单倍型数目、单倍型频率、平均核苷酸差异数目等多态性指标;结合已发表的其他民族mtDNA遗传资料,根据Nei法计算鄂伦春族与各群体之间的遗传距离,进行聚类分析,绘制系统发生树。鄂伦春族群体mtDNA两个高变区与CRS序列比对,分别发现52和24个多态性位点,分别界定了38和27种单倍型,单倍型多态性分别为0.964±0.018和0.929±0.019;平均核苷酸差异分别为7.379和2.408;用HVRⅠ序列多态性数据计算Fst和dA两种遗传距离,相关系数r为0.993(P<0.01);基于HVRⅠ序列的系统树显示鄂伦春族与中国台湾、南方汉族和中国香港人群遗传距离较近,与北方汉族、蒙古族及其国外人群遗传距离相对较远。我国鄂伦春族人群mtDNA具有相对独特的遗传特征,其遗传多态性和个体识别力较高,可用于民族起源、迁徙、法医学个体识别等领域研究。 展开更多
关键词 鄂伦春族 线粒体DNA 高变区 高变区 遗传多态性 遗传距离 聚类分析
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线粒体DNA HVR区Ⅰ序列突变与肺鳞癌关系的研究 被引量:1
4
作者 刘丽红 胡义德 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期652-654,共3页
目的 分析肺鳞癌患者外周血白细胞及其癌组织线粒体DNA(mitochondrialDNA ,mtDNA)非编码区(又称D 环)高变区Ⅰ(hypervariableregionⅠ,HVRⅠ)序列的突变情况并探讨其意义。方法 应用改良一步法制备13例肺鳞癌患者外周血白细胞及肺鳞... 目的 分析肺鳞癌患者外周血白细胞及其癌组织线粒体DNA(mitochondrialDNA ,mtDNA)非编码区(又称D 环)高变区Ⅰ(hypervariableregionⅠ,HVRⅠ)序列的突变情况并探讨其意义。方法 应用改良一步法制备13例肺鳞癌患者外周血白细胞及肺鳞癌组织mtDNA ,PCR产物直接测序,对比分析HVRⅠ区序列突变情况。结果 13例肺鳞癌患者癌组织mtDNAHVRⅠ区中,有8例出现了突变,占61 5 4% ;在2 5个不同位点上共发现3 0个突变,其中点突变占5 6 67% (17/3 0 ) ,插入和缺失突变占43 3 3 % (13 /3 0 ) ,并发现1例肺鳞癌病人存在10bp片段的缺失。结论 肺鳞癌患者癌组织细胞mtDNAHVRⅠ区突变发生率高,其中点突变占有重要地位,插入和缺失突变也不可忽视。 展开更多
关键词 肺鳞癌 线粒体DNA D-环区 高变区 突变
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遵义地区HIV/AIDS患者mtDNA HVSⅠ序列多态性分析
5
作者 谌宏运 《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》 2022年第12期155-158,共4页
通过检测HIV/AIDS患者线粒体基因(mtDNA)高变Ⅰ区(HVSⅠ)单核苷酸多态性,探讨HIV/AIDS患者功能下降和耐药机制。方法:选择中国遵义市CDC提供的HIV/AIDS患者56例,采集其外周血,提取全血基因组,mtDNA HVSⅠ序列进行PCR扩增,将测序结果与... 通过检测HIV/AIDS患者线粒体基因(mtDNA)高变Ⅰ区(HVSⅠ)单核苷酸多态性,探讨HIV/AIDS患者功能下降和耐药机制。方法:选择中国遵义市CDC提供的HIV/AIDS患者56例,采集其外周血,提取全血基因组,mtDNA HVSⅠ序列进行PCR扩增,将测序结果与线粒体剑桥序列进行比对,分析HVSⅠ突变位点及各位点的突变频率。结果 HIV/AIDS患者mtDNA HVSⅠ(即核苷酸位点15879-16553区域内)有51个位点存在多态性,大多为C/T或T/C突变,其中位点16223、16362出现频率较高。结论 遵义地区HIV/AIDS患者HVSⅠ突变频率增高。 展开更多
关键词 HIV/AIDS 线粒体DNA 高变区 多态性
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新疆维吾尔族群体线粒体DNA高变区Ⅰ遗传多态性
6
作者 古丽巴努.阿不来提 木耶赛尔.伊斯马依力 +3 位作者 佐日古丽.伊斯马伊力 苏比奴尔.艾力 熊发政 马合木提.哈力克 《生物技术》 CAS 2018年第1期49-53,12,共6页
[目的]研究维吾尔族群体线粒体DNA高变区Ⅰ序列遗传多态性。[方法]收集240份新疆8个地域维吾尔族无关个体mt DNA高变区Ⅰ进行测序分析。[结果]发现多态性位点数为:喀什、和田、库车、且木、伊犁、哈密、吐鲁番、尉犁维吾尔族分别为75、9... [目的]研究维吾尔族群体线粒体DNA高变区Ⅰ序列遗传多态性。[方法]收集240份新疆8个地域维吾尔族无关个体mt DNA高变区Ⅰ进行测序分析。[结果]发现多态性位点数为:喀什、和田、库车、且木、伊犁、哈密、吐鲁番、尉犁维吾尔族分别为75、98、59、111、75、46和94。单倍型多样性分别为:喀什群体为0.996±0.014,和田群体为0.993±0.014,库车群体为0.993±0.015,且木群体为0.993±0.014,伊犁群体为0.993±0.013,哈密群体为0.995±0.012,吐鲁番群体为0.993±0.012,尉犁群体为0.994±0.023。用HVRⅠ序列多态性数据计算Fst和d A两种遗传距离,相关系数为r=0.993(P<0.01)。[结论]中国的维吾尔族人群mt DNA其遗传多态性和个体识别力比较高,并且维吾尔族群体是东亚与欧洲人群的过渡人群,这些数据可用于法医学、人类学、遗传制图个体识别等领域研究。 展开更多
关键词 维吾尔族 线粒体DNA 高变区 遗传距离 遗传多态性
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广西1985年~2008年IBV分离株S1基因高变区Ⅰ和N基因的序列和系统进化分析 被引量:16
7
作者 磨美兰 李孟 +6 位作者 韦正吉 陈秋英 范文胜 郎亚辉 黄柏成 韦平 韦天超 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期761-765,799,共6页
为了解广西传染性支气管炎病毒(IBV)的纤突蛋白S1基因高变区Ⅰ(HVRⅠ)和核(N)蛋白基因变异情况及S1和N基因变异的相关性,本研究应用RT-PCR方法扩增了广西1985年~2008年的21株IBV的S1基因HVRⅠ和N基因,并进行了克隆、序列测定及分析。... 为了解广西传染性支气管炎病毒(IBV)的纤突蛋白S1基因高变区Ⅰ(HVRⅠ)和核(N)蛋白基因变异情况及S1和N基因变异的相关性,本研究应用RT-PCR方法扩增了广西1985年~2008年的21株IBV的S1基因HVRⅠ和N基因,并进行了克隆、序列测定及分析。结果发现:广西存在着多种基因型IBV流行;广西IBV分离株S1基因存在广泛的点突变和插入现象;N基因序列存在氨基酸替代现象。21株IBV中12株在S1基因HVRⅠ和N基因遗传进化树中均归属相同群,其余毒株却归属不同的群。2005年分离的GX-NN5存在基因重组现象。以上结果表明了广西IBV毒株存在基因突变和基因重组现象,S1和N基因的变异不完全平行,有些毒株间的S1和N基因差异很大。 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 S1基因高变区 N基因 系统进化分析 基因突变 基因重组
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我国耐力运动员mtDNA高变区I单核苷酸多态性与最大有氧能力的关联分析 被引量:11
8
作者 常芸 于长隆 +1 位作者 刘爱杰 高晓嶙 《体育科学》 CSSCI 北大核心 2005年第5期35-38,共4页
为了探讨人类运动能力相关的基因标记与分子机制,对线粒体基因(mt DNA)高变区I作了序列多态性分析。研究选取汉族耐力运动员94人,相应汉族对照92人,对其mt DNA高变区I特异性片段进行扩增、测序,分析其单核苷酸多态性(SNPs)改变及其与最... 为了探讨人类运动能力相关的基因标记与分子机制,对线粒体基因(mt DNA)高变区I作了序列多态性分析。研究选取汉族耐力运动员94人,相应汉族对照92人,对其mt DNA高变区I特异性片段进行扩增、测序,分析其单核苷酸多态性(SNPs)改变及其与最大有氧能力的相关性。结果显示我国汉族及其耐力运动员mt DNA HVR- I多态频率大于10 %的19个SNPs位点中,运动员有3个SNPs位点与最大摄氧量关联(np16 2 97、np16 36 2、np16 0 85 ) ,其中,位点16 36 2和16 0 85剑桥序列女性VO2 max/ kg均显著高于非剑桥序列组(P<0 .0 5 ) ;位点16 2 97剑桥序列组男性的VO2 max/ kg也显著高于非剑桥序列组(P<0 .0 5 )。结果提示,mt DNA高变区ISNPs位点16 36 2 ,16 0 85和16 2 97可能作为对人类运动能力的遗传标记,决定了个体有氧耐力水平及其对训练高敏感性。 展开更多
关键词 人类运动能力 最大摄氧量 线粒体高变区 单核苷酸多态性 剑桥序列
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华坪乌骨鸡mtDNA D-loop遗传多样性分析 被引量:12
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作者 刘丽仙 苗永旺 +6 位作者 孙利民 李大林 袁峰 杨永军 贺明仙 倪有崇 陈官国 《畜牧与兽医》 北大核心 2012年第10期30-33,共4页
为了阐明华坪乌骨鸡群体遗传背景信息,采用PCR产物直接测序技术对36只华坪乌骨鸡样品的线粒体DNA控制区高变区Ⅰ(长520 bp)进行了测序和序列分析。结果:在所检测华坪乌骨鸡序列中,碱基T、C、A和G平均含量分别为30.1%、29.8%、27.4%和12.... 为了阐明华坪乌骨鸡群体遗传背景信息,采用PCR产物直接测序技术对36只华坪乌骨鸡样品的线粒体DNA控制区高变区Ⅰ(长520 bp)进行了测序和序列分析。结果:在所检测华坪乌骨鸡序列中,碱基T、C、A和G平均含量分别为30.1%、29.8%、27.4%和12.6%;共检测到31个核苷酸多态位点,占检测核苷酸位点总数的5.96%,其中22个为简约信息位点,9个为单一信息位点。在该群体中共检测到12种单倍型,单倍型多样度(H)为(0.867±0.038),核苷酸多样度(π值)为(0.01547±0.00085),群体内遗传距离和序列间平均核苷酸差异数分别为(0.016±0.004)和8.044。系统发育分析显示,华坪乌骨鸡包含A、B、C、E、F和G等6个mtDNA世系。结果揭示华坪乌骨鸡群体内遗传变异较丰富,在遗传组成上具有6个母系血统来源。 展开更多
关键词 华坪乌骨鸡 线粒体DNA控制区高变区 遗传变异 遗传分化
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中国耐力运动员线粒体DNA高变区Ⅰ单核苷酸多态性分析 被引量:9
10
作者 常芸 于长隆 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期252-255,265,共5页
为了探讨人类运动能力相关的基因标记与分子机制 ,对线粒体基因 (mtDNA)高变区Ⅰ作了序列多态性分析。研究选取汉族耐力运动员 94人 ,相应汉人对照 92人 ,对其mtDNA高变区Ⅰ特异性片段进行扩增、测序 ,分析其单核苷酸多态性 (SNPs)改变 ... 为了探讨人类运动能力相关的基因标记与分子机制 ,对线粒体基因 (mtDNA)高变区Ⅰ作了序列多态性分析。研究选取汉族耐力运动员 94人 ,相应汉人对照 92人 ,对其mtDNA高变区Ⅰ特异性片段进行扩增、测序 ,分析其单核苷酸多态性 (SNPs)改变 ,并对不同人群mtDNA高度区Ⅰ的基因多态性特点作了比较。结果显示 :中国汉族耐力运动员mtDNA高变区Ⅰ同质性SNPs频率大于 10 %的位点有 13个 ,大于 2 0 %的位点有 5个 ,属常见SNPs。C16 2 2 3T和T16 36 2C两个位点发生明显的同质性多态 ,其多态性频率明显高于其他SNP位点 (80 30 % ,4 7 6 2 % )。中国汉族耐力运动员mtDNA高变区Ⅰ异质性SNPs频率大于 10 %的位点有 4个 ,所有异质性多态频率均小于 2 0 % ,属稀有SNPs。位点C16 16 7A和C16 0 85G为运动员特有 ,位点T16 12 4A多态频率分布在汉族耐力运动员显著高于汉人对照 (P <0 .0 1)。结果提示 ,mtDNA高变区ⅠSNPs位点C16 16 7A、C16 0 85G及T16 12 4A可能成为人类运动能力相关的基因标记。不同人群间mtDNA高变区ⅠSNP存在明显差异 ,相关的基因标记可能也存有差异。 展开更多
关键词 中国 耐力运动员 线粒体DNA DNA高变区 单核苷酸 多态性 线粒体基因 MTDNA
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上海地区汉族优秀游泳运动员mtDNA高变区Ⅰ单核苷酸多态性研究 被引量:6
11
作者 高炳宏 陈佩杰 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期133-138,共6页
目的:探讨上海地区汉族优秀游泳运动员mtDNA高变区ⅠSNPs的分布特点,并与上海地区汉族普通人进行比较研究。方法:分别以89名上海籍汉族优秀游泳运动员和71名普通人为研究对象,采用PCR产物纯化后直接测序的方法,应用DNASTAR6.10版... 目的:探讨上海地区汉族优秀游泳运动员mtDNA高变区ⅠSNPs的分布特点,并与上海地区汉族普通人进行比较研究。方法:分别以89名上海籍汉族优秀游泳运动员和71名普通人为研究对象,采用PCR产物纯化后直接测序的方法,应用DNASTAR6.10版序列分析软件对不同人群的序列多态性进行分析,并与剑桥序列进行比对,确定SNPs的位点、类型及频率。结果:(1)游泳运动员和普通入mtDNA高变区ⅠSNPs分布频率高于10%的位点分别为15个和13个,大于20%位点分别有6个和7个,其它均为常见SNPs;其中位点C16168A为普通入所独有;(2)游泳运动员位点C16167A频率显著高于普通入(P〈0.05~0.001);(3)游泳运动员独有插入位点(I—C16188),其频率为11.2%,同时,该位点健将和一级运动员的频率均大于10%;(4)上海地区汉族游泳运动员、我国优秀皮划艇运动员以及中国不同地区汉族人与亚洲入mtDNA的多态性无明显差异(P〉0.05),但与欧美和非洲人群均存在明显差异(P〈0.05~0.001)。提示:(1)位点C16167A可能是上海地区汉族游泳运动员运动能力相关的基因标记,但仍需深入进行与运动能力表型关联的研究;(2)插入位点(I—C16188)可能成为新的标记上海汉族游泳运动员运动能力的SNPs位点;(3)不同种族间mtDNA高变区工的多态性存在差异,从而相关的基因标记也可能不同。 展开更多
关键词 上海 汉族 游泳运动员 mtDNA高变区 单核苷酸多态性
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那曲地区藏族mtDNA D-环区高变区Ⅰ序列多态性 被引量:5
12
作者 冯强 席焕久 +2 位作者 温有锋 任甫 苏荣健 《解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期150-152,共3页
目的:研究藏族人群线粒体DNA D-环区序列遗传多态性。方法:应用PCR扩增产物直接测序法,对36名藏族无关个体线粒体DNA D-环区高变区Ⅰ(hypervariable regionⅠ,HVR-Ⅰ)进行测序分析。结果:HVR-Ⅰ中404个核苷酸序列与Anderson相应序列比... 目的:研究藏族人群线粒体DNA D-环区序列遗传多态性。方法:应用PCR扩增产物直接测序法,对36名藏族无关个体线粒体DNA D-环区高变区Ⅰ(hypervariable regionⅠ,HVR-Ⅰ)进行测序分析。结果:HVR-Ⅰ中404个核苷酸序列与Anderson相应序列比较共发现有51处突变,构成34种单倍型。藏族线粒体DNA的HVR-Ⅰ基因差异度为0.996 1,偶合概率为0.031 6。结论:线粒体DNA D-环区HVR-Ⅰ序列的多态性在人类学、法医学领域具有较高的应用价值。 展开更多
关键词 线粒体DNA 那曲藏族 D-环区高变区 序列多态性
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上海地区汉族优秀游泳运动员mtDNA高变区I序列多态性分析 被引量:3
13
作者 高炳宏 陈佩杰 杨震 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期696-702,共7页
目的:探讨上海地区汉族不同水平优秀游泳运动员mtDNA高变区I序列多态性分布特点。方法:分别以89名上海籍汉族优秀游泳运动员和71名上海籍普通人为研究对象,采用PCR产物纯化后直接测序的方法,应用DNASTAR 6.10版序列分析软件对不同人群... 目的:探讨上海地区汉族不同水平优秀游泳运动员mtDNA高变区I序列多态性分布特点。方法:分别以89名上海籍汉族优秀游泳运动员和71名上海籍普通人为研究对象,采用PCR产物纯化后直接测序的方法,应用DNASTAR 6.10版序列分析软件对不同人群的序列多态性进行分析,并与剑桥序列进行比对,确定多态位点、类型及频率。结果:(1)普通人mtDNA高变区I多态位点、碱基变异数及变异率高于运动员,但无明显差异(P>0.05);(2)普通人和不同等级运动员的多态位点和碱基变异数及变异率存在明显差异(P<0.05),变化趋势为普通人>总体运动员>一级>健将;运动员和普通人独有位点在本群体中的频率分布都很低(低于5%);(3)游泳运动员和普通人mtDNA高变区I序列多态性主要表现为碱基转换、颠换、插入和缺失4种类型;(4)普通人碱基转换发生频率显著高于健将和一级运动员(P<0.05),颠换发生频率明显低于运动员(P<0.05)。结论:上海地区汉族优秀游泳运动员mtDNA高变区I序列的突变率明显低于上海汉族普通人,表现出较为明显的人群特征;游泳运动员独有的多态位点数高于普通人,但在本群体中的频率分布均低于总体多态的5%;游泳运动员和普通人在碱基替换、插入和缺失类型与频率方面存在一定差异,同时与我国其它耐力性项目的优秀运动员也存在一定差异。 展开更多
关键词 上海 汉族 优秀游泳运动员 mtDNA高变区 序列多态性
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恩施悬棺人骨mtDNA初步分析 被引量:2
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作者 徐智 张帆 +3 位作者 李辉 王晓宁 金建中 金力 《中央民族大学学报(自然科学版)》 2005年第2期124-129,共6页
 本文以恩施宋代悬棺的骨骼或牙齿样品为对象,经过一系列的处理,获得并扩增了mtDNA的HVSI区的部分序列,通过几个实验初步认定是古DNA.同时通过与部分现代人mtDNA数据的比较参照,对所研究样品单倍群归属进行了初步确定,发现他们主要属...  本文以恩施宋代悬棺的骨骼或牙齿样品为对象,经过一系列的处理,获得并扩增了mtDNA的HVSI区的部分序列,通过几个实验初步认定是古DNA.同时通过与部分现代人mtDNA数据的比较参照,对所研究样品单倍群归属进行了初步确定,发现他们主要属于南方类型,但也可能有北方成分. 展开更多
关键词 线粒体DNA(mtDNA) 高变区(HVSI) 悬棺 古DNA 聚合酶链式反应(PCR) 测序 单倍群
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传染性支气管炎病毒的分离及其S1基因高变区Ⅰ的遗传变异性分析 被引量:1
15
作者 磨美兰 韦正吉 +2 位作者 韦平 韦天超 李康然 《养禽与禽病防治》 北大核心 2007年第2期2-5,共4页
应用鸡胚尿囊腔接种的方法,从广西某一鸡场两群分别为48日龄和7日龄疑患传染性支气管炎的鸡中分离到两株传染性支气管炎病毒(IBV)(分别命名为GX-NN1和GX-NN2);利用反转录-聚合酶链式反应技术对分离株S1基因高变区Ⅰ(HVRⅠ)进行扩增并测... 应用鸡胚尿囊腔接种的方法,从广西某一鸡场两群分别为48日龄和7日龄疑患传染性支气管炎的鸡中分离到两株传染性支气管炎病毒(IBV)(分别命名为GX-NN1和GX-NN2);利用反转录-聚合酶链式反应技术对分离株S1基因高变区Ⅰ(HVRⅠ)进行扩增并测定其核苷酸序列,以分析分离株遗传变异的情况。结果表明,两个分离毒株HVRⅠ核苷酸之间的同源性仅为76.3%,分离毒株与参考毒株的同源性在69.3%~99.1%之间;其中分离株GX-NN2与疫苗株H120、H52、Ma5、D41和标准株M41、Beaudette的同源性比较高(95.6%~99.1%),同属一个分支;而分离株GX-NN1则与这些参考毒株的同源性比较低(74.6%~75.4%),独自成为另一个分支。本研究的结果提示,广西养鸡业现场流行的IBV毒株已经发生了变异。 展开更多
关键词 传染性支气管炎病毒 分离株 S1基因高变区 遗传变异性分析
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