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基于克隆测序技术的人类白细胞抗原基因高分辨率分型方法的建立
被引量:
3
1
作者
邢晓清
初亚男
+2 位作者
项铮
宋沁馨
周国华
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1574-1579,共6页
运用优化的扩增和克隆测序技术,建立了人类白细胞抗原(HLA-B)基因的高分辨率分型方法。针对HLA-B基因保守区序列设计引物进行等位基因扩增,基于质粒不相容原理将杂合型等位基因有效克隆入质粒DNA中,经细菌培养后进行Sanger测序,根据测...
运用优化的扩增和克隆测序技术,建立了人类白细胞抗原(HLA-B)基因的高分辨率分型方法。针对HLA-B基因保守区序列设计引物进行等位基因扩增,基于质粒不相容原理将杂合型等位基因有效克隆入质粒DNA中,经细菌培养后进行Sanger测序,根据测序结果经ClustalX2软件分析和IMTG/HLA数据库的BLAST比对即可完成HLA-B基因的高分辨率分型。利用建立的方法对7例临床样本进行了HLA-B基因分型,并且与第三方直接碱基序列分析基因分型技术(PCR-SBT)进行比对,结果完全一致。本方法无需专业分型软件,准确度高,成本低;采用通用引物进行等位基因的扩增和测序,无需传统方法中繁琐的引物设计和过程优化,实现了HLA-B基因的高分辨率分型。
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关键词
人类白细胞抗原-B
基因
克隆测序技术
Sanger测序
高分辨率
基因
分型
下载PDF
职称材料
题名
基于克隆测序技术的人类白细胞抗原基因高分辨率分型方法的建立
被引量:
3
1
作者
邢晓清
初亚男
项铮
宋沁馨
周国华
机构
药物质量与安全预警教育部重点实验室、中国药科大学
南京军区南京总医院药理科
出处
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1574-1579,共6页
基金
江苏省科技支撑计划社会发展项目(No.BE2012744)
中国博士后科学基金面上项目(No.2012M512179)
+1 种基金
药物质量与安全预警教育部重点实验室资助项目(No.MKLDP2013MS01)
南京军区南京总医院院内课题(No.2013053)资助
文摘
运用优化的扩增和克隆测序技术,建立了人类白细胞抗原(HLA-B)基因的高分辨率分型方法。针对HLA-B基因保守区序列设计引物进行等位基因扩增,基于质粒不相容原理将杂合型等位基因有效克隆入质粒DNA中,经细菌培养后进行Sanger测序,根据测序结果经ClustalX2软件分析和IMTG/HLA数据库的BLAST比对即可完成HLA-B基因的高分辨率分型。利用建立的方法对7例临床样本进行了HLA-B基因分型,并且与第三方直接碱基序列分析基因分型技术(PCR-SBT)进行比对,结果完全一致。本方法无需专业分型软件,准确度高,成本低;采用通用引物进行等位基因的扩增和测序,无需传统方法中繁琐的引物设计和过程优化,实现了HLA-B基因的高分辨率分型。
关键词
人类白细胞抗原-B
基因
克隆测序技术
Sanger测序
高分辨率
基因
分型
Keywords
Human leukocyte antigen-B gene
TA clone
Sanger Sequencing
High-resolution genotyping
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于克隆测序技术的人类白细胞抗原基因高分辨率分型方法的建立
邢晓清
初亚男
项铮
宋沁馨
周国华
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
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