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启动子克隆方法研究进展 被引量:20
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作者 李姗姗 迟彦 +4 位作者 李凌飞 马玺 平文祥 于冲 周东坡 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期9-16,共8页
启动子是基因表达调控的重要顺式元件,也是基因工程表达载体的一个重要组成部分。启动子的克隆对于构建基因工程载体,表达目的蛋白有着重要的意义。启动子克隆的方法很多,从常用的利用启动子探针型载体筛选启动子到PCR方法的应用,此后... 启动子是基因表达调控的重要顺式元件,也是基因工程表达载体的一个重要组成部分。启动子的克隆对于构建基因工程载体,表达目的蛋白有着重要的意义。启动子克隆的方法很多,从常用的利用启动子探针型载体筛选启动子到PCR方法的应用,此后相继问世的一些基于PCR法的克隆启动子技术,像I-PCR、P-PCR、SSP-PCR、YADE、TAIL-PCR等,为克隆启动子提供了更可靠,更合理的方法。对这几种方法进行了简要综述,比较了不同方法的优缺点,并展望了今后的研究前景。 展开更多
关键词 研究进展 克隆方法 启动子探针型载体 TAIL-PCR SSP-PCR 基因表达调控 基因工程载体 启动子克隆 PCR方法 顺式元件 组成部分 表达载体 目的蛋白 PCR法 研究前景 优缺点
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玉米Cat1基因顺式元件ABRE2结合蛋白ABP9的基因克隆及功能分析 被引量:21
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作者 王磊 赵军 范云六 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第15期1167-1171,共5页
构建了授粉后17d(17dpp)的玉米幼胚cDNA基因文库,用玉米Catl基因顺式元件ABRE2通过酵母单杂交的方法筛选文库,获得3个完全相同的阳性克隆,命名为ABP9,用5’RACE的方法得到了该基因的全长cDNA序列。研究结果表明,ABP9属于bZIP类转录因... 构建了授粉后17d(17dpp)的玉米幼胚cDNA基因文库,用玉米Catl基因顺式元件ABRE2通过酵母单杂交的方法筛选文库,获得3个完全相同的阳性克隆,命名为ABP9,用5’RACE的方法得到了该基因的全长cDNA序列。研究结果表明,ABP9属于bZIP类转录因子,与玉米Catl基因顺式元件ABRE2具有结合特异性,且在酵母细胞中具有转录激活功能。 展开更多
关键词 玉米 Cat1基因 顺式元件 ABRE2 结合蛋白 ABP9 基因克隆 转录因子 功能分析 结合特异性 基因文库
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植物Dof基因家族功能研究进展 被引量:25
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作者 蔡晓锋 张余洋 +2 位作者 张俊红 李汉霞 叶志彪 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期1-12,共12页
Dof(DNA-binding with one finger)蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育过程中起着重要的作用。在其N-末端有一个52氨基酸残基组成的高度保守的C2-C2单锌指结构,称为Dof保守域,能够特异性的识别植物启动子序列中的AAAG/CTTT作... Dof(DNA-binding with one finger)蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育过程中起着重要的作用。在其N-末端有一个52氨基酸残基组成的高度保守的C2-C2单锌指结构,称为Dof保守域,能够特异性的识别植物启动子序列中的AAAG/CTTT作用元件,从而激活或抑制植物基因的表达;其C-末端的转录调控结构域,氨基酸序列较为多变,不具有保守性,是Dof蛋白在植物中功能多样性的基础;同时Dof蛋白也具有和蛋白相互作用的功能。在过去的十几年里,大量的Dof基因被克隆鉴定或从基因组数据库中预测出来,Dof蛋白在植物生长发育中的作用也受到更多关注。本文就Dof转录因子的特点,各物种中已经报道的Dof转录因子的数目、系统进化关系和分类及其生物学功能的进展进行了综述。 展开更多
关键词 DOF 转录因子 植物 锌指结构 顺式元件 基因组
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报告基因及其应用研究进展 被引量:22
4
作者 杨宇 李江江 +1 位作者 王项 邱冠周 《生命科学研究》 CAS CSCD 2011年第3期277-282,共6页
报告基因是现代分子生物学研究领域中用于分析结构基因旁侧区域潜在的顺式元件(如启动子、增强子和沉默子等)和反式作用因子相互作用关系的一种重要工具,在解析基因时空表达调控的内在规律中发挥着重要作用,它具有便捷、可靠、灵敏度高... 报告基因是现代分子生物学研究领域中用于分析结构基因旁侧区域潜在的顺式元件(如启动子、增强子和沉默子等)和反式作用因子相互作用关系的一种重要工具,在解析基因时空表达调控的内在规律中发挥着重要作用,它具有便捷、可靠、灵敏度高和适用于大规模检测等优点.对目前已发展的多种报告基因(氯霉素转乙酰酶、β-半乳糖苷酶、荧光素酶以及荧光蛋白等)在动物、植物、微生物以及医学等领域的应用情况进行综述,为该技术的进一步拓展应用提供新线索和新思路. 展开更多
关键词 报告基因 顺式元件 反式作用因子 基因时空表达调控
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真鲷脂蛋白脂肪酶基因顺式元件PPRE及在肝脏活体调控作用 被引量:16
5
作者 梁旭方 李月琴 +4 位作者 李贵生 白俊杰 劳海华 Hiromi Oku Hiroshi Y.Ogata 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期49-55,共7页
从血液提取总DNA并构建基因组文库,克隆海水鱼真鲷(Pagrosomusmajor)脂蛋白脂肪酶(LPL)基因5′侧翼区序列,再通过竞争性聚合酶链式反应(PCR)方法,定量研究饲料中添加不同饱和度脂肪酸对其肝脏LPL基因mRNA表达水平的影响。结果表明,真鲷... 从血液提取总DNA并构建基因组文库,克隆海水鱼真鲷(Pagrosomusmajor)脂蛋白脂肪酶(LPL)基因5′侧翼区序列,再通过竞争性聚合酶链式反应(PCR)方法,定量研究饲料中添加不同饱和度脂肪酸对其肝脏LPL基因mRNA表达水平的影响。结果表明,真鲷LPL基因5′侧翼区序列中存在顺式元件过氧化物酶体增殖物反应元件,其序列为TGAAGA TGACAT,与TATA(CATAA)盒序列相隔211bp;与喂饲料对照组比较,添加10%油酸可增加真鲷肝脏LPL基因表达水平,但差异并不显著(p>0.05)。用亚油酸或n 3高不饱和脂肪酸混合物取代添加油酸的一半(占饲料添加量的5%)后,导致真鲷肝脏LPL基因表达水平升高并出现显著性变化(p<0.05)。对真鲷肝脏LPL基因诱导表达随饲料中的脂肪酸不饱和度增加而增加,表明在活体条件下脂肪酸对真鲷肝脏LPL基因表达的诱导作用可能与脂肪酸的氧化代谢有关。n 3高不饱和脂肪酸通过过氧化物酶体增殖物激活受体诱导真鲷肝脏LPL基因表达,使真鲷食物脂质供应水平与其肝脏脂肪酸氧化代谢强度调控偶联起来,可能是真鲷对高脂食物(特别是富含n 3高不饱和脂肪酸食物)的一种适应。 展开更多
关键词 真鲷(Pngrosomus major) 脂蛋白脂肪酶基因 顺式元件 转录调控 高不饱和脂肪酸 肝脏
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抗逆相关DREB转录因子的研究进展及应用 被引量:11
6
作者 高峰 熊爱生 +4 位作者 彭日荷 刘金戈 蔡斌 陈建民 姚泉洪 《上海农业学报》 CSCD 2008年第1期118-123,共6页
DREB转录因子即干旱应答元件结合蛋白,可以特异地与DRE顺式作用元件结合,在非生物逆境胁迫(干旱、低温、高盐)中激活胁迫诱导基因的表达,使植物能够耐受水分胁迫的影响。本文介绍DREB转录因子的结构特点和生物学功能,表达调控以及在抗... DREB转录因子即干旱应答元件结合蛋白,可以特异地与DRE顺式作用元件结合,在非生物逆境胁迫(干旱、低温、高盐)中激活胁迫诱导基因的表达,使植物能够耐受水分胁迫的影响。本文介绍DREB转录因子的结构特点和生物学功能,表达调控以及在抗逆基因工程方面的研究进展,同时对DREB转录因子在信号传递和调控网络方面的复杂性进行了讨论。 展开更多
关键词 转录因子 DREB 基因调控 顺式元件 胁迫耐性
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水稻Dof基因家族的组织表达谱及胁迫诱导表达特征分析 被引量:11
7
作者 周淑芬 颜静宛 +4 位作者 刘华清 林智敏 陈睿 杨绍华 王锋 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期635-643,共9页
基因的表达与调控是一个复杂的分子网络,受许多转录因子的时空表达调节。Dof蛋白是一类植物特有的转录因子,在多种植物特有生物学过程中起着关键的调控作用。水稻全基因组中发现含30个Dof基因,但对其绝大部分基因的功能尚缺少了解。本... 基因的表达与调控是一个复杂的分子网络,受许多转录因子的时空表达调节。Dof蛋白是一类植物特有的转录因子,在多种植物特有生物学过程中起着关键的调控作用。水稻全基因组中发现含30个Dof基因,但对其绝大部分基因的功能尚缺少了解。本研究对30个水稻Dof基因及启动子区进行生物信息学分析,发现OsDof基因上游1.5kb启动子区含有大量的光反应、组织器官表达、植物激素反应及逆境反应等重要的顺式作用元件。进一步通过荧光定量RT-PCR技术分析,结果表明了大部分OsDof基因呈多器官较低丰度表达,少部分为器官优势或高丰度表达。另外,与未胁迫处理的水稻幼苗相比较,28个OsDof基因的表达受光、ABA、NaCl或PEG等胁迫处理的调节,其中27个OsDof基因可以对2种或2种以上的胁迫条件产生响应,表明这些成员可能在生理水平上参与不同胁迫相关信号途径之间的交互作用。 展开更多
关键词 水稻 Dof基因家族 顺式元件 表达调控 胁迫
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水稻WRKY89中的亮氨酸拉链结构增强蛋白与W盒元件的相互作用 被引量:4
8
作者 王海华 郝中娜 +2 位作者 谢科 吴坤陆 郭泽建 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第10期970-978,共9页
WRKY蛋白是一类参与植物生物和非生物胁迫反应、代谢、发育等过程的转录调节因子.水稻WRKY89与其他的WRKY成员同源性较低,推测由263个氨基酸组成,其N端带1个可能的亮氨酸拉链结构.采用pET-29b载体原核表达了OsWRKY89和其3个N端缺失的衍... WRKY蛋白是一类参与植物生物和非生物胁迫反应、代谢、发育等过程的转录调节因子.水稻WRKY89与其他的WRKY成员同源性较低,推测由263个氨基酸组成,其N端带1个可能的亮氨酸拉链结构.采用pET-29b载体原核表达了OsWRKY89和其3个N端缺失的衍生物,并采用Ni柱的方法对表达的蛋白进行了纯化.凝胶阻滞结果表明,OsWRKY89能与含顺式元件W盒的DNA序列特异结合,而缺失N端亮氨酸拉链的OsWRKY89与该元件的结合能力显著下降.酵母双杂交结果表明,亮氨酸拉链样结构参与OsWRKY89蛋白的同源相互作用.进一步缺失OsWRKY89至部分WRKY结构域导致表达的蛋白完全丧失与上述元件的结合活性,表明WRKY结构域是DNA结合中不可缺少的.这些结果说明亮氨酸拉链结构在蛋白质与蛋白质互作和DNA与蛋白质中起重要作用. 展开更多
关键词 亮氨酸拉链结构 相互作用 增强蛋白 水稻 转录调节因子 氨基酸组成 DNA序列 酵母双杂交 DNA结合 蛋白质 胁迫反应 原核表达 特异结合 顺式元件 结合能力 结合活性 结构域 非生物 同源性 N端 衍生物 缺失 植物 载体
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植物基因转录的组合控制 被引量:2
9
作者 王新力 索桂英 彭学贤 《生物工程进展》 CSCD 2001年第2期40-45,共6页
植物基因的转录调控是以组合控制方式进行的。本文以不同类型启动子中顺式元件与反式作用因子为例来说明植物基因转录的组合调控机制。
关键词 植物基因启动子 顺式元件 反式作用因子 转录调控
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高等植物不同类型启动子及其相关顺式元件研究进展 被引量:2
10
作者 张雪 程荔书 +2 位作者 张军 魏爽 赵艳 《高师理科学刊》 2023年第4期60-67,共8页
启动子是重要的调控序列,是植物转基因工程研究中的有利工具.综述了高等植物中不同类型的启动子及各种类型启动子中相关顺式元件的研究进展,尤其对逆境诱导型启动子和各类组织特异性启动子的结构及其应用进行了介绍,它们在提高高等植物... 启动子是重要的调控序列,是植物转基因工程研究中的有利工具.综述了高等植物中不同类型的启动子及各种类型启动子中相关顺式元件的研究进展,尤其对逆境诱导型启动子和各类组织特异性启动子的结构及其应用进行了介绍,它们在提高高等植物(特别是粮食作物)的抗逆性和营养价值等方面具有重要意义.此外,对高等植物不同类型启动子及其特有顺式元件的功能进行介绍,为启动子的结构和功能的深入研究及其进一步应用提供参考,为人工筛选及构建新型启动子提供理论依据,为启动子在高等植物分子育种中的有效应用奠定基础. 展开更多
关键词 启动子 顺式元件 分子育种
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拟南芥GA2ox基因家族启动子分析 被引量:6
11
作者 段秋红 赵小英 +4 位作者 贺热情 郭明 刘德荣 唐冬英 刘选明 《生物信息学》 2013年第4期275-281,共7页
赤霉素是一类重要的植物激素,它参与调节植物生长发育的各个阶段。真核基因的表达受多种因素的调控,其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要,但是目前对拟南芥GA2ox基因家族上游顺式元件的详细分析较少。本研究分析了AtGA2ox基因家... 赤霉素是一类重要的植物激素,它参与调节植物生长发育的各个阶段。真核基因的表达受多种因素的调控,其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要,但是目前对拟南芥GA2ox基因家族上游顺式元件的详细分析较少。本研究分析了AtGA2ox基因家族染色体定位、进化关系、蛋白模体以及顺式元件。分析结果表明:AtGA2ox基因家族分为2个亚类;具有相对集中的染色体分布;具有相似的内含子和外显子结构;AtGA2ox基因家族成员进化关系越相近,模体和顺式元件则越保守且分布位置更接近。PLACE和Plant CARE以及DMB分析显示,AtGA2ox基因家族存在许多保守元件,受多因素的调控,在此家族的上游调控区域普遍存在组织和器官特异性表达元件、光响应元件、激素响应元件以及其他环境响应元件。基因表达谱分析结果表明,在激素诱导下,AtGA2ox基因家族均有响应。这些元件不仅作为正调控元件,诱导部分AtGA2ox基因的表达,而且还能作为负调控元件,抑制其他AtGA2ox基因的表达。 展开更多
关键词 AtGA2ox基因家族 启动子 顺式元件 进化 基因表达调控
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黄瓜CBL基因的鉴定和特征分析 被引量:6
12
作者 曹齐卫 刘明毓 +4 位作者 陈伟 王永强 杨桂兰 孙小镭 李利斌 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期2127-2132,共6页
植物CBL基因在逆境应答及发育过程中具有重要功能。为了挖掘黄瓜CBL基因并预测CBL的功能,利用生物信息学的方法,从黄瓜基因组中鉴定出6个CBL基因,并对其染色体定位、基因结构、系统进化和顺式调控元件进行了系统分析。结果表明,黄瓜的CB... 植物CBL基因在逆境应答及发育过程中具有重要功能。为了挖掘黄瓜CBL基因并预测CBL的功能,利用生物信息学的方法,从黄瓜基因组中鉴定出6个CBL基因,并对其染色体定位、基因结构、系统进化和顺式调控元件进行了系统分析。结果表明,黄瓜的CBL基因有2个分布在2号染色体上,4个分布在3号染色体上,外显子多为8个,编码区序列为603~759 bp。黄瓜CBL编码的蛋白存在一些保守的位点和基序。在黄瓜CBL基因的上游序列中,存在一些应答多种激素和逆境的顺式元件,且不同成员各不相同。这说明黄瓜CBL家族成员可能具有不同的生物学功能。本试验结果为进一步研究黄瓜CBL基因在逆境应答中的功能提供了科学依据。 展开更多
关键词 黄瓜 CBL 特征 系统进化 顺式元件
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花生AhGPAT9基因启动子克隆及其功能分析 被引量:1
13
作者 沈悦 沈一 +3 位作者 刘永惠 梁满 张旭尧 陈志德 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期533-541,共9页
为研究花生油脂合成功能基因AhGPAT9的调控机理,分析其启动子功能,从花生品种Tifrunner基因组中扩增获得AhGPAT9基因启动子序列,构建AhGPAT9全长启动子及其多个5’缺失启动子融合GUS基因的重组表达载体,利用农杆菌介导的植物转化体系,... 为研究花生油脂合成功能基因AhGPAT9的调控机理,分析其启动子功能,从花生品种Tifrunner基因组中扩增获得AhGPAT9基因启动子序列,构建AhGPAT9全长启动子及其多个5’缺失启动子融合GUS基因的重组表达载体,利用农杆菌介导的植物转化体系,分析启动子的活性和表达模式,结果表明:AhGPAT9启动子序列全长1750 bp,核心区位于-257 bp~-128 bp,该启动子除了具备核心元件CAAT-box和TATA-box,还包含多种响应激素调控、胁迫诱导、光反应、胚乳特异表达和生长调控相关的顺式作用元件。此外,AhGPAT9主要在转基因拟南芥的幼苗中,以及抽薹期的茎和茎生叶、小花、9-12DAP角果和对应的成熟胚中表达。本研究结果将为进一步阐释AhGPAT9在花生油脂合成途径中的生物学功能提供新的理论依据。 展开更多
关键词 花生 AhGPAT9 启动子 顺式元件 GUS活性
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茶树PEBP基因家族结构与功能特征分析 被引量:5
14
作者 刘合霞 刘秦 +2 位作者 周兴文 朱宇林 李博 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第20期6657-6664,共8页
磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine binding protein, PEBP)在控制花的发育和形成过程中起着重要作用,为了解茶树PEBP基因家族在茶树开花中的作用,本研究利用生物信息学方法从茶树基因组数据库中检索出了7个PEBP基因,并... 磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine binding protein, PEBP)在控制花的发育和形成过程中起着重要作用,为了解茶树PEBP基因家族在茶树开花中的作用,本研究利用生物信息学方法从茶树基因组数据库中检索出了7个PEBP基因,并对其蛋白质理化性质、基因结构、进化关系、保守功能域、启动子顺式作用元件和表达模式进行了分析。结果表明,茶树PEBP基因编码的氨基酸数相对较少,分子量较小,主要介于14.39~20.19 kD之间,大部分为碱性蛋白;对茶树PEBP基因结构进行分析,发现该基因家族中有6个成员具有4个外显子及3个内含子的结构,基因结构比较保守;系统进化分析发现,茶树PEBP基因家族可以分为FT、TFL1、MFT亚基因家族,每个亚族所含有的基因数分别为1个、3个、3个,编码的蛋白序列均含有motif 1、motif 3、motif 4等保守基序;启动子元件分析的结果显示,PEBP基因的启动子元件类型主要以光响应元件及激素响应元件为主;分析茶树PEBP基因家族在不同组织的表达情况,发现其主要存在3种类型的表达模式,其中MFT-like亚家族的基因CsMFT与CsMFT2在生殖器官及营养器官都具有非常高的表达量。本研究获取了茶树PEBP基因家族成员的序列和部分功能信息,为进一步研究PEBP基因家族参与茶树开花调控的分子机制提供了参考。 展开更多
关键词 茶树(Camellia sinensis) PEBP基因家族 启动子 顺式元件 表达量分析
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水稻DA1基因的生物信息学分析 被引量:4
15
作者 李爱芹 李利斌 +1 位作者 方志军 刘国明 《山东农业科学》 2009年第8期5-8,共4页
本文采用比较基因组学和生物信息学的方法,首次从水稻基因组中鉴定出一个与拟南芥控制种子和器官大小的基因DA1同源的基因,命名为OsDA1,并对这个基因的序列特征、编码蛋白的结构域、顺式元件以及遗传进化进行了分析。结果表明,OsDA1编... 本文采用比较基因组学和生物信息学的方法,首次从水稻基因组中鉴定出一个与拟南芥控制种子和器官大小的基因DA1同源的基因,命名为OsDA1,并对这个基因的序列特征、编码蛋白的结构域、顺式元件以及遗传进化进行了分析。结果表明,OsDA1编码的蛋白具有LIM结构域、泛素互作位点和锌指结构域,与拟南芥DA1蛋白的结构一致,推测二者在控制器官发育上具有类似的功能。本研究还发现,在水稻OsDA1基因的启动子区存在多个响应不同激素和逆境信号的顺式元件,但这些元件的类型与拟南芥DA1基因的顺式元件有所不同,OsDA1与AtDA1可能在表达调控上有所不同;OsDA1基因不仅能够控制种子等器官的大小和发育,而且还可能与植物的激素信号转导和逆境响应有关。本文为下一步研究OsDA1在水稻生长发育和逆境响应中的功能以及与水稻杂种优势的关系奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 DA1 结构 顺式元件 遗传进化
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甜瓜CBL基因的鉴定和特征分析 被引量:5
16
作者 刘明毓 纪复勤 +3 位作者 马强 胡向树 李利斌 董玉梅 《山东农业科学》 2015年第10期17-21,共5页
CBL 基因在植物逆境应答和生长发育中具有重要功能,但有关甜瓜 CBL 基因的研究尚未见报道。本文利用比较基因组学的方法,从甜瓜基因组中鉴定出7个 CBL 基因,并对其基因组分布、基因结构、系统进化和顺式调控元件进行了分析。结果显示... CBL 基因在植物逆境应答和生长发育中具有重要功能,但有关甜瓜 CBL 基因的研究尚未见报道。本文利用比较基因组学的方法,从甜瓜基因组中鉴定出7个 CBL 基因,并对其基因组分布、基因结构、系统进化和顺式调控元件进行了分析。结果显示,7个甜瓜 CBL 基因分布在不同的染色体上,均含有8个外显子,编码区在642~738 bp,编码的蛋白均含有3个结合钙离子的 EF 手结构和能够与 CIPK 互作的 FPSF 位点。而且,在它们的上游基因序列中存在多个环境应答元件,且各不相同,暗示它们可能具有多种生物学功能。本文为进一步研究甜瓜 CBL 基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 甜瓜 结构 进化 顺式元件
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中华猕猴桃全基因组MADS-box基因家族鉴定及表达分析
17
作者 高欢 郑珂昕 +6 位作者 廖光联 王海令 陈璐 贾东峰 黄春辉 曲雪艳 徐小彪 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期2307-2324,共18页
【目的】鉴定并分析中华猕猴桃MADS-box基因家族成员,探明MADS-box基因家族成员在果实生长发育及芽休眠中的表达模式。【方法】基于中华猕猴桃红阳V3基因组数据库,利用生物信息学方法对中华猕猴桃MADS-box全基因组进行鉴定,分析其家族... 【目的】鉴定并分析中华猕猴桃MADS-box基因家族成员,探明MADS-box基因家族成员在果实生长发育及芽休眠中的表达模式。【方法】基于中华猕猴桃红阳V3基因组数据库,利用生物信息学方法对中华猕猴桃MADS-box全基因组进行鉴定,分析其家族成员的理化性质、系统进化树、保守基序、顺式作用元件,并对其在果实生长发育及不同组织中的表达模式进行分析。【结果】在中华猕猴桃红阳基因组中鉴定到了68个AcMADS-box基因,共包含11个亚家族,不均匀地分布于22条染色体上,成员间共存在32对共线性基因对;在基因家族上游启动子区域发现与光响应、激素响应、逆境胁迫响应等相关的顺式元件;17个AcMADS-box基因在组织间高表达且有表达特异性,推测是参与调控中华猕猴桃生长发育的关键基因。【结论】初步鉴定并提供了AcMADS-box家族成员信息,16个AcMADS-box家族成员在根、枝、茎、叶、花中高表达,8个家族成员在花芽中高表达。结果为进一步研究AcMADS-box参与中华猕猴桃的生长发育调控机制提供参考。 展开更多
关键词 中华猕猴桃 MADS-BOX 光响应 顺式元件 生长发育
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毛竹IDD基因家族启动子分析 被引量:4
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作者 陈虹君 高臻毅 郭小勤 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2016年第4期427-433,共7页
IDD基因家族编码一种混合型的转录因子,多数参与植物的生长发育.真核基因的表达受多种因素的调控,其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要.本研究截取毛竹IDD家族8个基因(Ph IDD1-2,Ph IDD4-8和Ph ID1)起始密码子前2 000 bp序列,顺... IDD基因家族编码一种混合型的转录因子,多数参与植物的生长发育.真核基因的表达受多种因素的调控,其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要.本研究截取毛竹IDD家族8个基因(Ph IDD1-2,Ph IDD4-8和Ph ID1)起始密码子前2 000 bp序列,顺式作用元件分析显示,这些基因启动子中均存在TATA框和CAAT框,除此之外,上游调控区域还存在光响应元件、激素响应元件、逆境胁迫元件以及其他响应元件,其中有些元件是某个基因所特有的,表现出该基因家族各基因独特的表达模式,也表明该家族基因的功能分化,参与植物发育的各个阶段. 展开更多
关键词 毛竹 IDD基因家族 启动子 顺式元件
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番茄SlNAC1基因启动子低温、高温和ABA应答顺式元件分析
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作者 李德鑫 乐露 +3 位作者 陶向 廖海 周嘉裕 黄维藻 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期16-26,共11页
番茄转录因子SlNAC1调控多种生物和非生物胁迫应答,但其上游转录调控因子至今不明,限制了对其胁迫应答机制的理解。构建了系列5'-缺失的SlNAC1启动子(起始密码子上游2039 bp、1508 bp、1373 bp和777 bp)驱动的GUS转基因烟草,并定量... 番茄转录因子SlNAC1调控多种生物和非生物胁迫应答,但其上游转录调控因子至今不明,限制了对其胁迫应答机制的理解。构建了系列5'-缺失的SlNAC1启动子(起始密码子上游2039 bp、1508 bp、1373 bp和777 bp)驱动的GUS转基因烟草,并定量分析了其在低温、高温和ABA诱导下的GUS酶活,以鉴定SlNAC1启动子中的低温、高温和ABA应答顺式元件。结果显示,低温和高温诱导后,2039 bp启动子转基因烟草GUS酶活的增长显著高于其他转基因烟草和野生型烟草;而ABA诱导后,1508 bp启动子转基因烟草GUS酶活的增长显著高于其他转基因烟草和野生型烟草。这些结果说明低温和高温应答顺式元件位于-2039~-1508 bp区间,而ABA应答顺式元件位于-1508~-1373 bp区间。启动子顺式元件预测分析显示,-2039 bp~-1508 bp区间只有1个低温/高温/干旱/盐应答顺式元件DRE/CRT,而-1508 bp~-1373 bp区间只有1个ABA应答顺式元件ABRE。因此,这两个顺式元件将作为候选元件用于后续SlNAC1上游调控转录因子的筛选。 展开更多
关键词 转录因子 SlNAC1 启动子 顺式元件 胁迫应答
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烟草重要基因篇:10.烟草转录因子基因 被引量:4
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作者 闫宁 张洪博 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2015年第4期117-120,共4页
转录因子(transcription factor,TF),又称反式作用因子,可特异识别并结合顺式元件的核心序列,从而调控靶基因的转录效率[1-3].在植物中,转录因子广泛参与生物胁迫(病害、虫害等)和非生物胁迫(低温、干旱、高温等)应答以及生长发... 转录因子(transcription factor,TF),又称反式作用因子,可特异识别并结合顺式元件的核心序列,从而调控靶基因的转录效率[1-3].在植物中,转录因子广泛参与生物胁迫(病害、虫害等)和非生物胁迫(低温、干旱、高温等)应答以及生长发育调控.作为植物信号传导途径的关键环节,转录因子的调控机理-直是植物学研究的重要领域[4-5]. 展开更多
关键词 转录因子基因 烟草 非生物胁迫 反式作用因子 信号传导途径 发育调控 植物学 顺式元件
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