目的:采用网络药理学方法对菟丝子主要活性成分的作用机制进行分析,探讨其成分、多靶点、靶点相关信号通路及生物学过程的相互关系。方法:首先借助中药系统药理学分析平台(Chinese medicine system pharmacology analysis platform,TCM...目的:采用网络药理学方法对菟丝子主要活性成分的作用机制进行分析,探讨其成分、多靶点、靶点相关信号通路及生物学过程的相互关系。方法:首先借助中药系统药理学分析平台(Chinese medicine system pharmacology analysis platform,TCMSP)筛选出菟丝子中的活性成分及相关作用靶点,然后通过Uniprot数据库对提取靶点进行筛选与转化,并利用CTD网络在线分析平台获取与靶点相关的疾病,利用Cytoscape 3.6.1及其插件ClueGO构建“活性成分-靶点”“靶点-疾病”“靶点-生物学通路”网络图,最后利用Cytoscape 3.6.1中的Network Analyzer插件分析网络图,获取相关拓扑异构信息,建立菟丝子成分-靶点-通路网络模型。结果:筛选得到菟丝子8个活性成分,涉及靶点118个,靶点相关疾病516种;对所得靶点进行GO分析,再经Kappa算法聚类,共获得79类相关生物学过程和57类信号相关信号通路。结论:初步探讨菟丝子主要活性成分的作用机制,为深入研究菟丝子的药效作用及其机制提供参考。展开更多
目的应用网络药理学方法探究川芎-当归药对的主要活性成分、靶点和药理作用机制。方法研究时间为2020年9—12月。首先以“川芎”“当归”为关键词,在TCMSP 2.3数据库中检索药材的成分、靶点和对应疾病数据,构建“药物-成分靶点-疾病”网...目的应用网络药理学方法探究川芎-当归药对的主要活性成分、靶点和药理作用机制。方法研究时间为2020年9—12月。首先以“川芎”“当归”为关键词,在TCMSP 2.3数据库中检索药材的成分、靶点和对应疾病数据,构建“药物-成分靶点-疾病”网络,进行基因本体(gene ontology,GO)分类富集分析、京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,探究“川芎-当归”药对作用机制。结果“药物-成分-靶点-疾病”网络包含2个药物、10个活性成分,71个作用靶点,191种疾病。关键靶点涉及环氧化酶2(PTGS2)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG)、雌激素受体(ESR1)、β2肾上腺素能受体(ADRB2)、周期蛋白依赖激酶2(CDK2)、热休克蛋白90(HSP90)、促分裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)、胆碱能受体2(CHRM2)、5羟色胺受体2A(HTR2A)、凝血因子Ⅱ受体(F2R)、盐皮质激素受体(NR3C2)、内皮型一氧化氮合酶(NOS3)等,关键疾病涉及疼痛、心血管疾病、乳腺癌、阿尔茨海默病、炎症、癌症、焦虑症、精神分裂症、前列腺癌、实体肿瘤、脑损伤等。GO富集分析得到237个条目,包括生物过程178个,分子功能26个,细胞组成33个。通路富集分析包含66条通路,主要涉及神经活性配体-受体相互作用、钙离子信号通道、癌症通路、5-羟色胺能突触、大肠癌、雌激素信号通路、心肌细胞的肾上腺素能信号、甲状腺激素信号通路、cAMP信号通路、血管内皮生长因子信号通路等。结论“川芎-当归”药对中多个成分作用于多个靶点和通路,对疼痛、心血管疾病、乳腺癌、阿尔茨海默病、炎症、癌症等多种疾病均一定的治疗作用。展开更多
文摘目的:采用网络药理学方法对菟丝子主要活性成分的作用机制进行分析,探讨其成分、多靶点、靶点相关信号通路及生物学过程的相互关系。方法:首先借助中药系统药理学分析平台(Chinese medicine system pharmacology analysis platform,TCMSP)筛选出菟丝子中的活性成分及相关作用靶点,然后通过Uniprot数据库对提取靶点进行筛选与转化,并利用CTD网络在线分析平台获取与靶点相关的疾病,利用Cytoscape 3.6.1及其插件ClueGO构建“活性成分-靶点”“靶点-疾病”“靶点-生物学通路”网络图,最后利用Cytoscape 3.6.1中的Network Analyzer插件分析网络图,获取相关拓扑异构信息,建立菟丝子成分-靶点-通路网络模型。结果:筛选得到菟丝子8个活性成分,涉及靶点118个,靶点相关疾病516种;对所得靶点进行GO分析,再经Kappa算法聚类,共获得79类相关生物学过程和57类信号相关信号通路。结论:初步探讨菟丝子主要活性成分的作用机制,为深入研究菟丝子的药效作用及其机制提供参考。
文摘目的应用网络药理学方法探究川芎-当归药对的主要活性成分、靶点和药理作用机制。方法研究时间为2020年9—12月。首先以“川芎”“当归”为关键词,在TCMSP 2.3数据库中检索药材的成分、靶点和对应疾病数据,构建“药物-成分靶点-疾病”网络,进行基因本体(gene ontology,GO)分类富集分析、京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,探究“川芎-当归”药对作用机制。结果“药物-成分-靶点-疾病”网络包含2个药物、10个活性成分,71个作用靶点,191种疾病。关键靶点涉及环氧化酶2(PTGS2)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG)、雌激素受体(ESR1)、β2肾上腺素能受体(ADRB2)、周期蛋白依赖激酶2(CDK2)、热休克蛋白90(HSP90)、促分裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)、胆碱能受体2(CHRM2)、5羟色胺受体2A(HTR2A)、凝血因子Ⅱ受体(F2R)、盐皮质激素受体(NR3C2)、内皮型一氧化氮合酶(NOS3)等,关键疾病涉及疼痛、心血管疾病、乳腺癌、阿尔茨海默病、炎症、癌症、焦虑症、精神分裂症、前列腺癌、实体肿瘤、脑损伤等。GO富集分析得到237个条目,包括生物过程178个,分子功能26个,细胞组成33个。通路富集分析包含66条通路,主要涉及神经活性配体-受体相互作用、钙离子信号通道、癌症通路、5-羟色胺能突触、大肠癌、雌激素信号通路、心肌细胞的肾上腺素能信号、甲状腺激素信号通路、cAMP信号通路、血管内皮生长因子信号通路等。结论“川芎-当归”药对中多个成分作用于多个靶点和通路,对疼痛、心血管疾病、乳腺癌、阿尔茨海默病、炎症、癌症等多种疾病均一定的治疗作用。
