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题名低密度cDNA芯片技术的优化
被引量：2
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作者
赵雨杰
黄宝俊
徐惠绵
何群
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机构
中国医科大学生物芯片中心
中国医科大学附属第一医院肿瘤外科
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出处
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2004年第4期322-328,共7页
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基金
辽宁省自然科学基金"基因工程关键技术研究"资助项目(2001101001)
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文摘
为了建立稳定的低密度cDNA芯片技术平台,研究靶基因的最适长度、浓度、点样溶液种类及杂交反应动力学,并了解该芯片的重复性与可靠性.结果表明,杂交具有较好的特异性,不同长度(189～1078bp)、浓度(0.5g/L、1.0g/L、1.5g/L)的同一靶基因杂交信号强度无明显差别;以50%DMSO为点样溶液者杂交信号最好(P=0.0001).60℃杂交18h信号最佳(P<0.001).重复2次检测结果差异无显著性(P=0.348),重复性较好,其相关系数为0.588.与RT-PCR结果相比,相关系数为-0.778(P<0.0001),特异性为100%,灵敏度为80%(16/20),可靠性较好.
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关键词
CDNA芯片
靶基因长度和浓度
点样溶液
杂交动力学
可靠性
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Keywords
cDNA microarray
target gene length and concentration
spotting solution
hybridizing dynamics
reliability
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分类号
Q7
[生物学—分子生物学]
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