目的位于染色体22q12.2区域的MTMR3(myotubularin related protein 3)基因是调控肌维管束蛋白表达的基因,MTMR3基因过度表达与肿瘤等疾病发生有关。本研究旨结合表达数量性状(expression Quati tatire Trait Loci,eQTL)信息探讨MTMR3基...目的位于染色体22q12.2区域的MTMR3(myotubularin related protein 3)基因是调控肌维管束蛋白表达的基因,MTMR3基因过度表达与肿瘤等疾病发生有关。本研究旨结合表达数量性状(expression Quati tatire Trait Loci,eQTL)信息探讨MTMR3基因多态性与非吸烟者肺癌易感性的关系,为探究肺癌的发病机制提供依据。方法对肺癌易感区域22q12.2进行连锁不平衡和eQTL分析,筛选具有调控基因表达的致病位点并预测其调控的基因。本研究采用病例对照研究方法,病例为2013-03-05-2014-12-30辽宁省肿瘤医院(96例)、中国医科大学附属第一医院(92例)、中国医科大学附属第四医院(90例)、沈阳军区总医院(95例)和人民解放军沈阳二0二医院(88例)5所三甲级医院的原发性肺癌患者461例(病例组),同期社区中健康对照472名(对照组)。应用TaqMan基因分型技术对rs36605位点进行基因分型。采用t检验比较年龄在病例组与对照组间分布的差异,采用χ~2检验比较性别、各基因型以及各环境暴露因素在病例组与对照组间分布的差异,应用Logistic回归计算OR值及其95%置信区间(CI)。结果经eQTL分析得到rs36605位点是MTMR3基因的一个顺式eQTL,rs36605位点可能与MTMR3基因的表达有关。以TT基因型为参照,AT基因型(OR=0.81,95%CI为0.60~1.10,P=0.178)和AA基因型(OR=1.85,95%CI为0.61~5.59,P=0.276)与肺癌的患病风险无统计学关联。也未发现在显性模型(OR=0.85,95%CI为0.63~1.15,P=0.291)以及隐形模型(OR=1.94,95%CI为0.64~5.86,P=0.238)中存在此关联。试验验证了烹饪油烟暴露增加了肺癌的患病风险,调整OR=1.61,95%CI为1.06~2.45,P=0.025,但未发现烹饪油烟暴露与rs36605位点多态性之间存在交互作用,P>0.05。结论试验未发现,22q12.2区域内的rs36605位点多态性与非吸烟者肺癌的易感性有关,尚不能得到MTMR3基因多态性与非吸烟者肺癌的易感性有关。展开更多
文摘目的位于染色体22q12.2区域的MTMR3(myotubularin related protein 3)基因是调控肌维管束蛋白表达的基因,MTMR3基因过度表达与肿瘤等疾病发生有关。本研究旨结合表达数量性状(expression Quati tatire Trait Loci,eQTL)信息探讨MTMR3基因多态性与非吸烟者肺癌易感性的关系,为探究肺癌的发病机制提供依据。方法对肺癌易感区域22q12.2进行连锁不平衡和eQTL分析,筛选具有调控基因表达的致病位点并预测其调控的基因。本研究采用病例对照研究方法,病例为2013-03-05-2014-12-30辽宁省肿瘤医院(96例)、中国医科大学附属第一医院(92例)、中国医科大学附属第四医院(90例)、沈阳军区总医院(95例)和人民解放军沈阳二0二医院(88例)5所三甲级医院的原发性肺癌患者461例(病例组),同期社区中健康对照472名(对照组)。应用TaqMan基因分型技术对rs36605位点进行基因分型。采用t检验比较年龄在病例组与对照组间分布的差异,采用χ~2检验比较性别、各基因型以及各环境暴露因素在病例组与对照组间分布的差异,应用Logistic回归计算OR值及其95%置信区间(CI)。结果经eQTL分析得到rs36605位点是MTMR3基因的一个顺式eQTL,rs36605位点可能与MTMR3基因的表达有关。以TT基因型为参照,AT基因型(OR=0.81,95%CI为0.60~1.10,P=0.178)和AA基因型(OR=1.85,95%CI为0.61~5.59,P=0.276)与肺癌的患病风险无统计学关联。也未发现在显性模型(OR=0.85,95%CI为0.63~1.15,P=0.291)以及隐形模型(OR=1.94,95%CI为0.64~5.86,P=0.238)中存在此关联。试验验证了烹饪油烟暴露增加了肺癌的患病风险,调整OR=1.61,95%CI为1.06~2.45,P=0.025,但未发现烹饪油烟暴露与rs36605位点多态性之间存在交互作用,P>0.05。结论试验未发现,22q12.2区域内的rs36605位点多态性与非吸烟者肺癌的易感性有关,尚不能得到MTMR3基因多态性与非吸烟者肺癌的易感性有关。
