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北京基因型结核分枝杆菌的研究
被引量：
7
1
作者
孙蕾
杨立军
+2 位作者
郑锦辉
杨文涛
王莉
《中国防痨杂志》
CAS
2008年第3期223-226,共4页
关键词
北京
基因型
结核
分枝杆菌
毒性
毒力
结核
分枝杆菌
分枝杆菌
属
结核
杆菌
下载PDF
职称材料
潜伏期结核分枝杆菌HLA-A~*0201限制性CD8^+CTL表位的高通量筛选
被引量：
4
2
作者
孙燕妮
王一松
+3 位作者
王海霞
平国玲
王甦民
张力平
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2013年第1期26-29,共4页
目的采用生物信息学软件预测并筛选结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。方法以标准株H37Rv和北京基因型结核分枝杆菌为研究对象,利用结核分枝杆菌全基因组芯片技术筛选缺氧培养后表达上调的基因...
目的采用生物信息学软件预测并筛选结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。方法以标准株H37Rv和北京基因型结核分枝杆菌为研究对象,利用结核分枝杆菌全基因组芯片技术筛选缺氧培养后表达上调的基因,应用SYFPEITHI生物信息学软件分析相关基因编码的多肽序列中可能存在的HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位;利用T2细胞进行HLA-A2结合试验,检测候选表位肽的结合亲和性,以HLA-A2解离试验检测其结合稳定性,从而筛选出HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。结果从SYFPEITHI数据库预测到的表位肽中筛选出4条能够结合HLA-A*0201分子的表位肽,通过HLA-A2结合试验得到Rv0440-1(KLQER-LAKL)、Rv0440-9(TLLKGAKEV)、RV0350-6(VLKGEVKDV)与HLA-A*0201分子之间均有较高的亲和性(FR>1.5),通过HLA-A2解离试验得到候选表位肽Rv0440-1和Rv0440-9与HLA-A*0201分子的结合具有较高的稳定性(DC50>4h)。结论经生物信息学技术预测以及HLA-A2结合与解离试验初步筛选出的Rv0440-1(KLAGGVAVI)和Rv0440-9(TLLKGAKEV)是潜伏期结核分枝杆菌HLA-A*0201限制性CD8+CTL的优势表位,但有待进一步实验验证。
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关键词
H37RV
北京
基因型
结核
分枝杆菌
潜伏感染
基因
芯片技术
生物信息学软件
CTL表位
预测
原文传递
北京和非北京基因型结核分枝杆菌生长曲线及mazEF系统的研究
3
作者
谢婉莹
赵继利
+2 位作者
杨赛丽
刘微
袁俐
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期502-508,共7页
目的研究北京与非北京基因型结核分枝杆菌的生长曲线、mazEF3,6,9系统表达有无差异。方法测绘上述菌株及其mazEF3,6,9基因缺失和过表达菌株在标准、低氧和营养饥饿培养条件下的生长曲线。使用qRT-PCR技术检测各菌株的mazEF3, 6, 9、mazF...
目的研究北京与非北京基因型结核分枝杆菌的生长曲线、mazEF3,6,9系统表达有无差异。方法测绘上述菌株及其mazEF3,6,9基因缺失和过表达菌株在标准、低氧和营养饥饿培养条件下的生长曲线。使用qRT-PCR技术检测各菌株的mazEF3, 6, 9、mazF3, 6,9和mazE3, 6,9基因mRNA表达水平;利用Western Blot技术检测MazF9蛋白表达水平。结果在标准和低氧条件下培养的第4、6、8、10 d,营养饥饿条件下培养的第2、4、6、8 d,北京基因型菌株的OD值(细菌数量)均高于非北京基因型菌株,差异有统计学意义(P<0.05);在上述3种培养条件下,北京和非北京基因型mazEF3,6,9缺失突变株和过表达株菌数均低于其亲本株。在mRNA、蛋白水平上,与非北京基因型菌株相比,北京基因型菌株mazEF3高表达9.55倍、mazF3高表达4.86倍、mazF6高表达2.64倍、mazF9高表达5.27倍和mazE9低表达0.16倍;mazF9蛋白高表达1.62倍,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论北京与非北京基因型结核分枝杆菌的生长曲线、mazEF3,6,9系统表达存在差异,mazEF系统与北京基因型菌株流行相关。
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关键词
北京
基因型
结核
分枝杆菌
非
北京
基因型
结核
分枝杆菌
毒素-抗毒素mazEF系统
生长曲线
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职称材料
题名
北京基因型结核分枝杆菌的研究
被引量：
7
1
作者
孙蕾
杨立军
郑锦辉
杨文涛
王莉
机构
辽宁省疾病预防控制中心
沈阳军区二二医院
出处
《中国防痨杂志》
CAS
2008年第3期223-226,共4页
关键词
北京
基因型
结核
分枝杆菌
毒性
毒力
结核
分枝杆菌
分枝杆菌
属
结核
杆菌
分类号
R52 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
潜伏期结核分枝杆菌HLA-A~*0201限制性CD8^+CTL表位的高通量筛选
被引量：
4
2
作者
孙燕妮
王一松
王海霞
平国玲
王甦民
张力平
机构
首都医科大学基础医学院病原生物学系
北京结核病控制研究所
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2013年第1期26-29,共4页
文摘
目的采用生物信息学软件预测并筛选结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。方法以标准株H37Rv和北京基因型结核分枝杆菌为研究对象,利用结核分枝杆菌全基因组芯片技术筛选缺氧培养后表达上调的基因,应用SYFPEITHI生物信息学软件分析相关基因编码的多肽序列中可能存在的HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位;利用T2细胞进行HLA-A2结合试验,检测候选表位肽的结合亲和性,以HLA-A2解离试验检测其结合稳定性,从而筛选出HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。结果从SYFPEITHI数据库预测到的表位肽中筛选出4条能够结合HLA-A*0201分子的表位肽,通过HLA-A2结合试验得到Rv0440-1(KLQER-LAKL)、Rv0440-9(TLLKGAKEV)、RV0350-6(VLKGEVKDV)与HLA-A*0201分子之间均有较高的亲和性(FR>1.5),通过HLA-A2解离试验得到候选表位肽Rv0440-1和Rv0440-9与HLA-A*0201分子的结合具有较高的稳定性(DC50>4h)。结论经生物信息学技术预测以及HLA-A2结合与解离试验初步筛选出的Rv0440-1(KLAGGVAVI)和Rv0440-9(TLLKGAKEV)是潜伏期结核分枝杆菌HLA-A*0201限制性CD8+CTL的优势表位,但有待进一步实验验证。
关键词
H37RV
北京
基因型
结核
分枝杆菌
潜伏感染
基因
芯片技术
生物信息学软件
CTL表位
预测
Keywords
H37Rv
Beijing genotype Mtb
latent-phase Mtb
gene chip techniques
bioinformatics software
CTL epitope peptides
prediction
分类号
R378.911 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
北京和非北京基因型结核分枝杆菌生长曲线及mazEF系统的研究
3
作者
谢婉莹
赵继利
杨赛丽
刘微
袁俐
机构
石河子大学医学院病原微生物学与免疫学教研室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期502-508,共7页
基金
国家自然科学基金(No.81560264)资助~~
文摘
目的研究北京与非北京基因型结核分枝杆菌的生长曲线、mazEF3,6,9系统表达有无差异。方法测绘上述菌株及其mazEF3,6,9基因缺失和过表达菌株在标准、低氧和营养饥饿培养条件下的生长曲线。使用qRT-PCR技术检测各菌株的mazEF3, 6, 9、mazF3, 6,9和mazE3, 6,9基因mRNA表达水平;利用Western Blot技术检测MazF9蛋白表达水平。结果在标准和低氧条件下培养的第4、6、8、10 d,营养饥饿条件下培养的第2、4、6、8 d,北京基因型菌株的OD值(细菌数量)均高于非北京基因型菌株,差异有统计学意义(P<0.05);在上述3种培养条件下,北京和非北京基因型mazEF3,6,9缺失突变株和过表达株菌数均低于其亲本株。在mRNA、蛋白水平上,与非北京基因型菌株相比,北京基因型菌株mazEF3高表达9.55倍、mazF3高表达4.86倍、mazF6高表达2.64倍、mazF9高表达5.27倍和mazE9低表达0.16倍;mazF9蛋白高表达1.62倍,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论北京与非北京基因型结核分枝杆菌的生长曲线、mazEF3,6,9系统表达存在差异,mazEF系统与北京基因型菌株流行相关。
关键词
北京
基因型
结核
分枝杆菌
非
北京
基因型
结核
分枝杆菌
毒素-抗毒素mazEF系统
生长曲线
Keywords
Beijing genotype Mycobacterium tuberculosis
non-Beijing genotype Mycobacterium tuberculosis
toxin-antitoxin mazEF system
growth curve
分类号
R378.91 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
北京基因型结核分枝杆菌的研究
孙蕾
杨立军
郑锦辉
杨文涛
王莉
《中国防痨杂志》
CAS
2008
7
下载PDF
职称材料
2
潜伏期结核分枝杆菌HLA-A~*0201限制性CD8^+CTL表位的高通量筛选
孙燕妮
王一松
王海霞
平国玲
王甦民
张力平
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2013
4
原文传递
3
北京和非北京基因型结核分枝杆菌生长曲线及mazEF系统的研究
谢婉莹
赵继利
杨赛丽
刘微
袁俐
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
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