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玉米品种遗传多态性与根系内生细菌种群的相互关系 被引量：16
1
作者 高增贵 陈捷 +1 位作者 刘限 薛春生 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期1920-1925,共6页
对辽宁省14个玉米主栽品种根系内主要细菌种群的分析结果表明,芽孢杆菌属(Bucillusssp.)为玉米内生细菌的主要种群,其它种属包括肠杆菌属、沙雷氏杆菌属、假单孢菌属、黄单孢菌属和棍状杆菌属。内生细菌在不同玉米品种和不同生育期之间... 对辽宁省14个玉米主栽品种根系内主要细菌种群的分析结果表明,芽孢杆菌属(Bucillusssp.)为玉米内生细菌的主要种群,其它种属包括肠杆菌属、沙雷氏杆菌属、假单孢菌属、黄单孢菌属和棍状杆菌属。内生细菌在不同玉米品种和不同生育期之间存在程度不同的差异。从90条随机引物中筛选出条带清晰、重复性好的13个引物,对14个玉米主栽品种进行遗传多态性的RAPD分析,共扩增出条带139条,其中多态性条带101条,多态性比率72.7%。利用SPSS统计分析软件对14个玉米品种在DNA水平和内生细菌种群水平上进行聚类分析,结果表明,品种亲缘关系在这两个水平上表现基本一致,即品种内生细菌的种类及其数量在很大程度上受品种的遗传背景控制。 展开更多
关键词 玉米 内生细菌 遗传背景 随机扩增片段多态性
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亚欧美栗疫病菌群体的遗传多样性 被引量：5
2
作者 徐陈贤 周晓云 王克荣 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期232-236,共5页
从 12 0个随机引物中筛选出条带清晰、主带明显、重复性好的 9个引物 ,对来自不同地域和寄主的 7个群体的 14 2个栗疫病菌菌株进行 RAPD分析。 9个引物共扩增出条带 12 4条 ,其中多态性条带 111条 ,多态性比率为 89.5 2 %。利用 Popgen... 从 12 0个随机引物中筛选出条带清晰、主带明显、重复性好的 9个引物 ,对来自不同地域和寄主的 7个群体的 14 2个栗疫病菌菌株进行 RAPD分析。 9个引物共扩增出条带 12 4条 ,其中多态性条带 111条 ,多态性比率为 89.5 2 %。利用 Popgen3.2软件对供试群体进行遗传多样性分析和 UPGMA聚类。结果表明 ,中国地区 4个群体间的遗传相似性较大 ,与美国、意大利和日本群体间的相似性较小 ;美国和意大利群体间的遗传相似性较大 ,且它们与日本群体间的相似性大于与中国群体间的相似性。病原菌群体的遗传变异率为 0 .2 35 1,其中在地区水平上 ,82 .34%由群体内的变异引起 ,17.6 6 %由群体间的差异引起 ,群体间的基因流动值为 2 .3311;而在寄主水平上 ,则 79.4 2 %由群体内的变异引起 ,2 0 .5 8%由群体间的差异引起 ,群体间的基因流动值为 1.92 展开更多
关键词 栗疫病菌 随机扩增片段多态性 遗传多样性 基因流
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土生空团菌(Cenococcum geophilum Fr.)的菌种鉴定及其遗传多样性的初步分析 被引量：7
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作者 陈立红 闫伟 徐燕 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期2214-2220,共7页
【目的】鉴定外生菌根真菌土生空团菌(Cenococcum geophilum Fr.(Cg))菌种,分析土生空团菌的遗传多样性,探讨影响土生空团菌遗传分化的因素。【方法】采用形态特征结合PCR方法,从分离自6种寄主植物的27个中国菌株和来自法国的5个Cg菌株... 【目的】鉴定外生菌根真菌土生空团菌(Cenococcum geophilum Fr.(Cg))菌种,分析土生空团菌的遗传多样性,探讨影响土生空团菌遗传分化的因素。【方法】采用形态特征结合PCR方法,从分离自6种寄主植物的27个中国菌株和来自法国的5个Cg菌株中鉴定出20个Cg菌株。利用PCR-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和随机扩增片断多态性DNA(RAPD)两种分子标记方法对这20个Cg菌株进行遗传多样性分析。【结果】PCR-RFLP方法以通用引物ITS1和ITS4对20个Cg菌株的核糖体DNA转录间隔区(ITS)进行了PCR扩增,扩增产物用3种内切酶(EcoRⅠ、HinfⅠ和MboⅠ)酶切,酶切图谱显示菌株间有明显差异。RAPD方法用经过筛选的随机引物(5'-CGCACCGCAC-3')对20个菌株的基因组DNA进行PCR扩增,扩增产物的片段大小在300～2000bp范围之间,共产生19个多态性位点。根据电泳图谱上DNA带的数目、位置及强度进行数值化,用聚类分析软件计算菌株间的遗传距离和遗传相似性,根据遗传距离构建20个菌株的系统聚类图。【结论】来源于不同寄主及地域的20株Cg有着较丰富的遗传多样性;地理环境和寄主对Cg遗传多样性的影响不大。 展开更多
关键词 外生菌根真菌 土生空团菌 限制性片段长度多态性 随机扩增片段多态性DNA 遗传多样性
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口腔扁平苔藓患者白色念珠菌分离株的基因型分析 被引量：5
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作者 曾昕 陈谦明 +1 位作者 聂敏海 李秉琦 《四川大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期193-195,共3页
目的　研究健康人和口腔扁平苔藓 (oral lichen planus,OL P)患者口腔白色念珠菌分离株的基因型分布特征。方法　应用随机扩增片段多态性分析法 (random ly am plified polymorphic DNA,RAPD) ,对来自于健康人 (2 6株 )、糜烂型 OL P患... 目的　研究健康人和口腔扁平苔藓 (oral lichen planus,OL P)患者口腔白色念珠菌分离株的基因型分布特征。方法　应用随机扩增片段多态性分析法 (random ly am plified polymorphic DNA,RAPD) ,对来自于健康人 (2 6株 )、糜烂型 OL P患者 (6 2株 )以及非糜烂型 OL P患者 (2 4株 )共 112株白色念珠菌菌株做基因型分型 ,比较OL P患者与健康对照组白色念珠菌分离株的基因型分布差异。结果　本研究采用的 RAPD分析法可大致将所有白色念珠菌分离株分为 A、B、C、D四种基因型 ;健康对照组、糜烂型 OL P和非糜烂型 OL P患者组的白色念珠菌分离株的基因型构成具有差异 ,其中 ,健康对照组以 B、D型为主 ,糜烂型 OL P患者组以 A、C型为主 ,非糜烂型 OL P患者组以 A、D型为主。结论　某些具有特定基因型的白色念珠菌与 OL P的发生发展可能相关。 展开更多
关键词 白色念珠菌 基因型 随机扩增片段多态性分析法 口腔扁平苔藓
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