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三种分子标记技术对有毒植物鉴定效能的评价 被引量:3
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作者 龙鑫 孙承业 +2 位作者 谢立璟 王英伟 刘冰 《药物不良反应杂志》 CSCD 2013年第1期11-16,共6页
目的评价3种不同的分子标记技术对植物属级的鉴定能力以选出最适合在中毒现场快速鉴定有毒植物的分子技术。方法选取毛茛科、大戟科共18种19份有毒植物叶片样品,用改良十六烷基三甲基溴化铵法提取基因组DNA,分别使用随机扩增多态性DNA标... 目的评价3种不同的分子标记技术对植物属级的鉴定能力以选出最适合在中毒现场快速鉴定有毒植物的分子技术。方法选取毛茛科、大戟科共18种19份有毒植物叶片样品,用改良十六烷基三甲基溴化铵法提取基因组DNA,分别使用随机扩增多态性DNA标记(RAPD)、简单重复序列问标记(ISSR)和DNA条形码技术进行物种鉴定(属级),使用NYSTS、SPSS、PAUP、MEGA软件进行聚类分析,比较3种DNA分子标记技术的准确性、可靠性、时效性和可操作性。结果准确性:RAPD技术未能鉴定样品的属级,ISSR技术和DNA条形码技术的鉴定准确率分别为68%和100%。可靠性:RAPD技术与ISSR技术主观影响率分别为44%、26%,条带重复率分别为47%、45%;DNA条形码技术trnH-psbA片段扩增成功率与测序成功率均为100%。时效性:从总DNA提取开始至得到最终鉴定结果,RAPD、ISSR、DNA条形码技术耗时分别为8.5、9.0、42.2 h。可操作性:RAPD与ISSR技术的鉴定工作可在普通实验室完成,DNA条形码技术的鉴定工作则需要特殊的测序设备。结论初步认为DNA条形码技术是比较适用于突发有毒植物中毒事件中快速病因判定的分子鉴定技术。 展开更多
关键词 有毒植物 随机扩增多态性dna标记技术 简单重复序列间标记技术 dna 条形码技术
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格尔德霉素(GDA)能导致小麦基因组DNA多态性和甲基化修饰增加 被引量:1
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作者 王闪 郑禹轩 +2 位作者 刘冬杪 张彩云 张飞雄 《种子》 北大核心 2016年第5期1-4,共4页
刚露白的普通小麦(Triticum aestivum L.)种子用150μmol/L格尔德霉素溶液处理后,小麦根的生长受到抑制。随机扩增多态性DNA标记技术和双限制性内切酶酶切-随机扩增法检测显示,小麦根端分生细胞基因组DNA的多态性和甲基化比例均增加。... 刚露白的普通小麦(Triticum aestivum L.)种子用150μmol/L格尔德霉素溶液处理后,小麦根的生长受到抑制。随机扩增多态性DNA标记技术和双限制性内切酶酶切-随机扩增法检测显示,小麦根端分生细胞基因组DNA的多态性和甲基化比例均增加。本研究从分子生物学和表观遗传学水平探讨了格尔德霉素抑制小麦生长的机制。 展开更多
关键词 格尔德霉素(GDA) 随机扩增多态性dna标记技术 双限制内切酶酶切-随机扩增 dna变化 小麦
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Trichostatin A能导致小麦基因组DNA改变及甲基化修饰
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作者 赵峥 黄豫谦 张飞雄 《首都师范大学学报(自然科学版)》 2015年第6期60-64,共5页
为了研究组蛋白去乙酰化酶抑制剂的作用机制,本实验以组蛋白去乙酰化酶抑制剂Trichostatin A处理小麦根尖,通过随机扩增多态性DNA标记技术(random amplified polymorphic DNA,RAPD)和双限制性内切酶酶切-随机扩增法(Coupled Restriction... 为了研究组蛋白去乙酰化酶抑制剂的作用机制,本实验以组蛋白去乙酰化酶抑制剂Trichostatin A处理小麦根尖,通过随机扩增多态性DNA标记技术(random amplified polymorphic DNA,RAPD)和双限制性内切酶酶切-随机扩增法(Coupled Restriction Enzyme Digestion-Random Amplification,CRED-RA)进行探究的结果发现,与对照组相比,处理组10个随机引物的RAPD扩增条带出现83条多样性差异,多样性比例达到87.4%,同时处理组DNA甲基化比例增加.本研究证实Trichostatin A能使小麦基因组DNA发生改变,并出现了表观修饰,从而从分子和表观水平探讨了该抑制剂的作用机理. 展开更多
关键词 TRICHOSTATIN A 随机扩增多态性dna标记技术 双限制内切酶酶切-随机扩增 dna甲基化 小麦
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一种新的梨基因组DNA提取方法及其应用 被引量:8
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作者 曹丽 曲柏宏 王成 《湖北农业科学》 北大核心 2006年第3期273-275,共3页
摸索出一种新的DNA提取方法——CTAB改良法,从梨成熟叶片中提取到高质量、高纯度的DNA。同时,分析了模板DNA和dNTPs浓度、TaqDNA聚合酶用量等对RAPD反应体系的影响,建立了一套适合梨基因组RAPD分析的技术体系。
关键词 dna提取方法 随机扩增多态性dna分子标记技术 RAPD反应体系
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广西产鸡血藤遗传多样性的RAPD与ISSR标记方法的比较研究 被引量:5
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作者 田辉 蒋嫦月 +4 位作者 朱华 王孝勋 周敏 崔健 封毅 《中国药房》 CAS 北大核心 2015年第31期4348-4350,共3页
目的:比较随机扩增多态性DNA分子标记技术(RAPD)和简单重复序列间区扩增技术(ISSR)两种标记方法,研究广西不同居群鸡血藤遗传多样性的优劣。方法:分别采用RAPD和ISSR标记方法,利用POPGENE 32软件、Ntsys软件、SPSS 17.0软件,对广西不同... 目的:比较随机扩增多态性DNA分子标记技术(RAPD)和简单重复序列间区扩增技术(ISSR)两种标记方法,研究广西不同居群鸡血藤遗传多样性的优劣。方法:分别采用RAPD和ISSR标记方法,利用POPGENE 32软件、Ntsys软件、SPSS 17.0软件,对广西不同采集地的9份鸡血藤的遗传多样性进行研究。结果:筛选出的3条RAPD引物及4条ISSR引物扩增后,共得到198和315个位点,多态性位点37和80个,多态性位点比率为18.7%和25.4%,有效等位基因数为1.416 8、1.584 0,基因多样性指数为0.269 4、0.351 3,Shannon多样性指数为0.431 6、0.529 9。ISSR标记均高于RAPD标记,RAPD和ISSR的平均遗传相似系数为0.757 64、0.683 80,表明ISSR检测遗传多样性更灵敏。二者的聚类结果相近,相关系数r为0.847,说明其在0.001水平呈极显著正相关。结论:ISSR标记方法比RAPD标记反映出更多的遗传多样性信息,更适合于广西产不同居群鸡血藤的遗传多样性研究。 展开更多
关键词 广西产鸡血藤 随机扩增多态性dna分子标记技术 简单重复序列间区扩增技术 遗传多样
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平菇基因组DNA的提取及RAPD体系的优化 被引量:1
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作者 王年久 马爱民 《湖北农业科学》 北大核心 2007年第4期507-509,共3页
应用SDS与β-SH乙醇结合的方法对平菇菌丝体、原基、菇蕾和成熟子实体4种材料的基因组DNA进行了提取,并对影响RAPD反应的各因素进行了优化,20μL反应体系中,模板加入量为6~10ng,引物加入量10pmol,dNTPs(各2.5 mmol)加入量为1.5~2μL,... 应用SDS与β-SH乙醇结合的方法对平菇菌丝体、原基、菇蕾和成熟子实体4种材料的基因组DNA进行了提取,并对影响RAPD反应的各因素进行了优化,20μL反应体系中,模板加入量为6~10ng,引物加入量10pmol,dNTPs(各2.5 mmol)加入量为1.5~2μL,Taq酶加入量为0.5U,退火温度设置在略低于引物Tm值的范围。 展开更多
关键词 平菇 基因组dna 随机扩增多态性dna分子标记技术 优化
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