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SARS-CoV寡核苷酸基因芯片在SARS病例咽拭或咽漱液检测中的应用
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作者 黄吉城 马文丽 +5 位作者 石嵘 欧阳谦 陈秋霞 周珏宇 丁大鹏 郑文岭 《广东医学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期483-485,共3页
目的采用SARS-CoV寡核苷酸基因芯片对200份临床确诊SARS病例的咽拭或咽漱液、401例非SARS感染的呼吸道患者的咽拭或咽漱液样品进行检测,评价该方法用于SARS-CoV核酸检测的灵敏度、特异性及其应用于早期诊断的可能性。方法200例临床确诊S... 目的采用SARS-CoV寡核苷酸基因芯片对200份临床确诊SARS病例的咽拭或咽漱液、401例非SARS感染的呼吸道患者的咽拭或咽漱液样品进行检测,评价该方法用于SARS-CoV核酸检测的灵敏度、特异性及其应用于早期诊断的可能性。方法200例临床确诊SARS患者样品,401阴性对照样品采用双盲法进行测定,抽提可能存在的病毒RNA,采用限制性荧光标记法标记,在同等条件下,进行基因芯片杂交、清洗和芯片扫描检测。通过对杂交结果的数据分析,比照临床诊断和血清学的检测结果,对该方法的灵敏度和特异性及应用于SARS早期诊断的可能性进行评价。结果对601份标本检测的结果,灵敏度为71.50%,特异度为92.01%。对发病10 d内采集临床确诊SARS病例的标本,检测的灵敏度为81.08%。结论利用SARS-CoV寡核苷酸基因芯片检测SARS患者发病早期的咽漱液或咽拭子中的SARS-CoV核酸,灵敏度较高,可作为早期基因诊断。 展开更多
关键词 SARS—CoV 基因芯片 限制性荧光标记 基因诊断
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微量核酸样品的双重限制性荧光标记技术
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作者 黄吉城 马文丽 +5 位作者 石嵘 欧阳谦 陈秋霞 周珏宇 丁大鹏 郑文岭 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2006年第5期534-537,共4页
目的采用双重限制性荧光标记技术(doub le restriction fluorescent labeling,DRFL)标记微量核酸样品,提高基因芯片用于病原体检测的灵敏度。方法以限制性显示技术处理SARS-CoV核酸样品,分别采用传统限制性荧光标记技术(直接采用荧光标... 目的采用双重限制性荧光标记技术(doub le restriction fluorescent labeling,DRFL)标记微量核酸样品,提高基因芯片用于病原体检测的灵敏度。方法以限制性显示技术处理SARS-CoV核酸样品,分别采用传统限制性荧光标记技术(直接采用荧光标记的通用引物标记)和双重限制性荧光标记技术(荧光标记的通用引物和荧光标记的dNTP的双重荧光标记)标记,进一步在同等条件下与基因芯片进行杂交、清洗和芯片扫描检测。通过对杂交结果的分析,比较2种标记方法的标记效果。结果以DRFL方法标记SARS基因片段,其荧光强度均值比传统荧光标记方法提高了3.5835倍。结论DRFL技术有效地提高单位分子标记片段的荧光强度值,提高了检测的灵敏度,可用于微量病原体核酸样品的基因芯片检测。 展开更多
关键词 双重限制性荧光标记 限制性显示技术 基因芯片
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HPV病毒检测分型芯片的研制和优化
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作者 危敏 马文丽 +3 位作者 孙朝晖 张晋芳 李凌 郑文岭 《生命科学研究》 CAS CSCD 2009年第3期240-245,共6页
研制和优化寡核苷酸芯片以初步实现对多种常见HPV(Human papillomavirus)病毒的分型检测.应用生物学软件对四型常见HPV病毒(6、11、16、18型)的全基因组序列进行分析,设计具有型特异性、熔解温度(Tm)相近的-60mer寡核苷酸探针... 研制和优化寡核苷酸芯片以初步实现对多种常见HPV(Human papillomavirus)病毒的分型检测.应用生物学软件对四型常见HPV病毒(6、11、16、18型)的全基因组序列进行分析,设计具有型特异性、熔解温度(Tm)相近的-60mer寡核苷酸探针,对玻片片基进行优化处理后,点样制备成寡核苷酸基因芯片.将含HPV全长基因序列的质粒作为阳性标准品,利用梯度限制性荧光标记技术对其进行荧光标记,标记好的样品与芯片杂交.结果显示HPV样品与相应的型特异性探针杂交有明显的荧光信号,而与阴性对照探针和空白对照探针没有杂交信号.通过对芯片片基处理和样品荧光标记方法的优化,可以提高芯片检测的杂交特异性和荧光信号强度. 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒(HPV) 寡核苷酸芯片 限制性荧光标记技术 检测
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微量核酸样品的双重限制性荧光标记技术(英文)
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作者 马文丽 孟伟 郑文岭 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期442-445,共4页
目的采用双重限制性荧光标记技术(double restriction fluorescent labeling,DRFL),标记微量核酸样品,探索提高基因芯片用于病原体检测的灵敏度。方法以限制性显示技术处理SARS-CoV核酸样品,分别采用传统限制性荧光标记技术(直接采用荧... 目的采用双重限制性荧光标记技术(double restriction fluorescent labeling,DRFL),标记微量核酸样品,探索提高基因芯片用于病原体检测的灵敏度。方法以限制性显示技术处理SARS-CoV核酸样品,分别采用传统限制性荧光标记技术(直接采用荧光标记的通用引物标记)和双重限制性荧光标记技术(荧光标记的通用引物和荧光标记的dNTP的双重荧光标记)进行处理,并进一步与基因芯片进行杂交,在同等条件下进行杂交、清洗和进行基因芯片的扫描检测。通过对杂交结果的分析,比较两种标记方法的标记效果。结果以DRFL方法标记SARS基因片段,其荧光强度均值提高了3.5835倍,但互相对应的每个探针之间的荧光信号提高程度存在差异。结论DRFL技术能有效地提高单位分子标记片段的荧光强度值,并进一步提高了检测的灵敏度,可用于微量病原体核酸样品的基因芯片检测。 展开更多
关键词 双重限制性荧光标记 聚合酶链反应 DNA芯片
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