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基于转录组测序研究CatSper1在版纳微型猪近交系睾丸组织中的转录调控特征
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作者 张霞 王配 +4 位作者 刘志朋 霍海龙 代红梅 赵筱 霍金龙 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期619-628,共10页
目的CatSper1是精子特定的电压门控Ca^(2+)通道蛋白,在精子生成和受精过程中具有重要作用。本研究旨在分析CatSper1基因在版纳微型猪近交系(BMI)的表达调控模式、序列特征与潜在的生物学功能。方法取成年BMI公猪睾丸进行转录组测序;采用... 目的CatSper1是精子特定的电压门控Ca^(2+)通道蛋白,在精子生成和受精过程中具有重要作用。本研究旨在分析CatSper1基因在版纳微型猪近交系(BMI)的表达调控模式、序列特征与潜在的生物学功能。方法取成年BMI公猪睾丸进行转录组测序;采用RT-PCR技术克隆CatSper1的完整编码序列;分析CatSper1的序列、结构特征及相互作用蛋白;利用转录组测序数据构建CatSper1的lncRNA和miRNA调控网络,并进行GO功能注释。结果RNA-seq获得CatSper1基因的平均表达量和平均TPM值分别为2817.5和33.6。CatSper1 CDS区全长为2166 bp(GenBank登录号:OK042306),编码721个氨基酸,含有233个氨基酸残基组成的Ion_trans保守结构域以及与精子生成相关的保守跨膜螺旋结构。CatSper1蛋白与10个雄性育性相关蛋白质存在相互作用,尤其与该基因家族成员CatSper2-4蛋白互作最为紧密。CatSper1基因受10个miRNAs靶向调控,分别有16个和14个lncRNAs与CatSper1竞争性结合ssc-miR-1343和ssc-miR-744。GO注释发现CatSper1基因在分子功能(MF)、生物学过程(BP)、细胞成分(CC)等方面均具有重要功能。结论本研究报道了CatSper1在BMI睾丸中的表达,基因的分子结构特征和表达调控网络,为深入研究CatSper1基因在BMI精子发生、精子获能和顶体反应等重要生物学过程中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 版纳微型猪近交系 阳离子通道精子相关蛋白1 转录组测序 精子生成 转录调控
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