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锯角豆芫菁法尼基焦磷酸合酶的cDNA克隆、序列分析及原核表达
被引量:
6
1
作者
付楠霞
翟枫
+2 位作者
姜鸣
吕淑敏
张雅林
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期273-283,共11页
【目的】法尼基焦磷酸合酶(farnesyl pyrophosphate synthase,FPPS)是单萜和倍半萜生物合成途径分支点的关键酶,获得芫菁法尼基焦磷酸合酶基因(FPPS)是探究其与斑蝥素生物合成途径关系的基础。论文旨在克隆锯角豆芫菁(Epicauta gorhami ...
【目的】法尼基焦磷酸合酶(farnesyl pyrophosphate synthase,FPPS)是单萜和倍半萜生物合成途径分支点的关键酶,获得芫菁法尼基焦磷酸合酶基因(FPPS)是探究其与斑蝥素生物合成途径关系的基础。论文旨在克隆锯角豆芫菁(Epicauta gorhami Marseul)FPPS,预测该基因及其编码蛋白的结构、性质与功能,并实现其编码蛋白的原核表达。【方法】首先根据已知昆虫FPPS编码蛋白的保守区序列,利用CODEHOP软件设计简并引物,利用RT-PCR获得锯角豆芫菁的cDNA模板,巢式PCR扩增锯角豆芫菁FPPS保守区;随后根据所得的保守区片段设计特异性引物,运用RACE技术分别克隆锯角豆芫菁FPPS 3′和5′端序列;然后根据预测的FPPS开放阅读框(ORF)设计ORF区特异性引物,巢式PCR扩增编码区序列;最后用DNAMAN拼接获得锯角豆芫菁的全长cDNA序列。运用DNAMAN、MEGA 5.05、ProtParam及TargetP 1.1 Server等多种生物信息学软件对该基因全长cDNA序列、Fps系统进化关系及其基本理化性质、FPPS蛋白的亚细胞定位等进行分析;将锯角豆芫菁FPPS与pET28a(+)连接,构建原核表达载体pET28a(+)-EgFPPS并将其转入大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)中,IPTG诱导融合蛋白的原核表达。分别收集不同诱导时间段的菌液,SDS-PAGE检测融合蛋白的表达情况。将高效表达时段收集的菌液超声波破碎后,分离上清及沉淀并进行煮沸处理,SDS-PAGE检测融合蛋白的可溶性;Western Blot印迹杂交验证目的蛋白的表达【。结果】获得锯角豆芫菁法尼基焦磷酸合酶基因FPPS全长cDNA序列,命名为EgFPPS(GenBank登录号KC840040),序列分析结果表明,该基因全长1 857 bp,其中5′非编码区146 bp,3′非编码区436 bp,开放阅读框1 275 bp,共编码424个氨基酸,其编码的蛋白分子质量约为49.2 kD,理论等电点pI为8.89,预测分子式为C2192H3457N605O632S25,不稳定系数为38.62,总平均亲水系数为-0.429,为疏水的稳定蛋白。序列分
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关键词
锯
角
豆
芜菁
FPPS
RACE技术
生物信息学
原核表达
下载PDF
职称材料
浙贝母病虫害及其防治
被引量:
2
2
作者
韩学俭
《农村实用技术与信息》
2004年第4期27-27,共1页
关键词
浙贝母
灰霉病
黑斑病
炭疽病
锯
角
豆
芜菁
危害
防治
下载PDF
职称材料
题名
锯角豆芫菁法尼基焦磷酸合酶的cDNA克隆、序列分析及原核表达
被引量:
6
1
作者
付楠霞
翟枫
姜鸣
吕淑敏
张雅林
机构
西北农林科技大学植物保护学院植保资源与病虫害治理教育部重点实验室
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期273-283,共11页
基金
国家公益性行业(农业)科研专项(200905032)
陕西省"13115"科技创新工程重大科技专项(2007ZDKG-14)
高校基本科研业务费(QN2013010)
文摘
【目的】法尼基焦磷酸合酶(farnesyl pyrophosphate synthase,FPPS)是单萜和倍半萜生物合成途径分支点的关键酶,获得芫菁法尼基焦磷酸合酶基因(FPPS)是探究其与斑蝥素生物合成途径关系的基础。论文旨在克隆锯角豆芫菁(Epicauta gorhami Marseul)FPPS,预测该基因及其编码蛋白的结构、性质与功能,并实现其编码蛋白的原核表达。【方法】首先根据已知昆虫FPPS编码蛋白的保守区序列,利用CODEHOP软件设计简并引物,利用RT-PCR获得锯角豆芫菁的cDNA模板,巢式PCR扩增锯角豆芫菁FPPS保守区;随后根据所得的保守区片段设计特异性引物,运用RACE技术分别克隆锯角豆芫菁FPPS 3′和5′端序列;然后根据预测的FPPS开放阅读框(ORF)设计ORF区特异性引物,巢式PCR扩增编码区序列;最后用DNAMAN拼接获得锯角豆芫菁的全长cDNA序列。运用DNAMAN、MEGA 5.05、ProtParam及TargetP 1.1 Server等多种生物信息学软件对该基因全长cDNA序列、Fps系统进化关系及其基本理化性质、FPPS蛋白的亚细胞定位等进行分析;将锯角豆芫菁FPPS与pET28a(+)连接,构建原核表达载体pET28a(+)-EgFPPS并将其转入大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)中,IPTG诱导融合蛋白的原核表达。分别收集不同诱导时间段的菌液,SDS-PAGE检测融合蛋白的表达情况。将高效表达时段收集的菌液超声波破碎后,分离上清及沉淀并进行煮沸处理,SDS-PAGE检测融合蛋白的可溶性;Western Blot印迹杂交验证目的蛋白的表达【。结果】获得锯角豆芫菁法尼基焦磷酸合酶基因FPPS全长cDNA序列,命名为EgFPPS(GenBank登录号KC840040),序列分析结果表明,该基因全长1 857 bp,其中5′非编码区146 bp,3′非编码区436 bp,开放阅读框1 275 bp,共编码424个氨基酸,其编码的蛋白分子质量约为49.2 kD,理论等电点pI为8.89,预测分子式为C2192H3457N605O632S25,不稳定系数为38.62,总平均亲水系数为-0.429,为疏水的稳定蛋白。序列分
关键词
锯
角
豆
芜菁
FPPS
RACE技术
生物信息学
原核表达
Keywords
Epicauta gorhami
FPPS
RACE technique
bioinfomatics
prokaryotic expression
分类号
S476 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
下载PDF
职称材料
题名
浙贝母病虫害及其防治
被引量:
2
2
作者
韩学俭
机构
西北农林科技大学植保学院植保所(农科院校区)
出处
《农村实用技术与信息》
2004年第4期27-27,共1页
关键词
浙贝母
灰霉病
黑斑病
炭疽病
锯
角
豆
芜菁
危害
防治
分类号
S435.672 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
锯角豆芫菁法尼基焦磷酸合酶的cDNA克隆、序列分析及原核表达
付楠霞
翟枫
姜鸣
吕淑敏
张雅林
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
6
下载PDF
职称材料
2
浙贝母病虫害及其防治
韩学俭
《农村实用技术与信息》
2004
2
下载PDF
职称材料
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引证文献
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