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高浓度多链体系链动力学的Monte Carlo模拟——键长涨落模型和空穴扩散算法 被引量:9
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作者 陆建明 杨玉良 《中国科学(A辑)》 CSCD 1991年第11期1226-1232,共7页
本文在Larson的“键长涨落模型”的基础上提出了模拟高浓度多链体系的新算法。本算法具有如下特征:(1)除通常的微松弛模式外,还直接引入了链的Reptation运动;(2)提出了空穴扩散算法使体系随时间演化。由于本算法的这些新特征,克服了前... 本文在Larson的“键长涨落模型”的基础上提出了模拟高浓度多链体系的新算法。本算法具有如下特征:(1)除通常的微松弛模式外,还直接引入了链的Reptation运动;(2)提出了空穴扩散算法使体系随时间演化。由于本算法的这些新特征,克服了前人的算法不能运用于两维体系以及高浓度多链体系的缺点,同时也大大缩短了计算耗时。应用本文的算法,在44×44的元胞中模拟了链长为21,浓度为0.9545的体系的动力学行为。所得结果与Rouse理论的预言相符合。 展开更多
关键词 多链体系 模拟 涨落模型
原文传递
高分子链坍塌转变动力学过程的动态蒙特卡罗模拟 被引量:5
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作者 陈彦涛 丁建东 《高分子学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1238-1244,共7页
基于键长涨落格子模型和动态蒙特卡罗模拟方法,引入疏水相互作用,对均聚高分子链坍塌转变动力学过程进行了模拟研究.模拟发现,其坍塌时间呈高斯分布,而平均坍塌时间随淬火深度的变化类似于蛋白质折叠,但难以发现局部最小;另外,平均坍塌... 基于键长涨落格子模型和动态蒙特卡罗模拟方法,引入疏水相互作用,对均聚高分子链坍塌转变动力学过程进行了模拟研究.模拟发现,其坍塌时间呈高斯分布,而平均坍塌时间随淬火深度的变化类似于蛋白质折叠,但难以发现局部最小;另外,平均坍塌时间随链长呈指数形式变化.在其坍塌动力学过程中,高分子链构象先由橄榄球状演变为项链状,进而演变为香肠状,最后形成近球状的熔融球;基于团簇数目、团簇大小和非球面参数等参量,对前人提出的动力学过程四阶段划分进行了更为清晰的界定. 展开更多
关键词 坍塌转变 动力学过程 格子链 涨落模型 动态蒙特卡罗模拟
原文传递
新颖的蛋白质格点模型 被引量:2
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作者 章林溪 赵得禄 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2001年第7期1241-1243,共3页
提出了建立在键长涨落模型基础上的蛋白质格点模型 ,通过对二维蛋白质分子的构象研究 ,发现这种蛋白质分子具有更多的紧密接触对、更低的基态能量和更大的平均紧密度 .蛋白质分子的构象数与键数目 N的关系为 :Ω0 ~γN,这里γ=4 .768.
关键词 蛋白质分子 涨落模型 构象 紧密接触对 格点模型
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聚甲醛链的键长涨落模型 被引量:1
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作者 徐芸 夏阿根 《浙江大学学报(理学版)》 CAS CSCD 1999年第4期60-63,共4页
利用旋转异构态理论,建立了聚甲醛(POM)链的键长涨落模型。计算了Kuhnian键各种可能的键矢量及相对应的能量。这种模型为研究复杂聚甲醛体系提供了一种简单、有效的方法。
关键词 旋转异构态理论 聚甲醛链 涨落模型
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Effect of Interaction upon Translocation of Confined Polymer Chain Through Nanopore 被引量:1
5
作者 王瑶 谢永军 +1 位作者 杨海洋 张兴元 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 2010年第3期313-316,I0002,共5页
The effect of the interaction between nanopore and chain monomer on the translocation of a single polymer chain confined in a finite size square through an interacting nanopore to a large space has been studied by two... The effect of the interaction between nanopore and chain monomer on the translocation of a single polymer chain confined in a finite size square through an interacting nanopore to a large space has been studied by two-dimensional bond fluctuation model with Monte Carlo simulation. Results indicate that the free energy barrier before the successful translocation of the chain depends linearly on the chain length as well as the nanopore length for different pore-polymer interaction, and the attractive interaction reduces the free energy barrier, leading to the reduction of the average trapping time. 展开更多
关键词 Monte Carlo simulation Polymer translocation INTERACTION Free energy barrier
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