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野生型工业酿酒酵母Miseq测序方法的建立
被引量:
1
1
作者
曹德民
张穗生
+1 位作者
罗贞贞
黄日波
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期655-660,共6页
新一代测序方法在基因组学研究应用日趋广泛,已经成为工业酿酒酵母菌株基因组学研究的重要技术平台,但对工业酿酒酵母新一代测序技术方法缺乏详细报道。Miseq是小型新一代基因组测序仪,本文报道我们自建的野生型工业酿酒酵母基因组Mise...
新一代测序方法在基因组学研究应用日趋广泛,已经成为工业酿酒酵母菌株基因组学研究的重要技术平台,但对工业酿酒酵母新一代测序技术方法缺乏详细报道。Miseq是小型新一代基因组测序仪,本文报道我们自建的野生型工业酿酒酵母基因组Miseq测序方法。该方法包括:制备分离a型和α型交配型的单倍体菌株、采用电泳和分光光度法方法监控基因组文库建立、优化上机文库浓度后测序。其中电泳和分光光度法方法为首创的文库质量监控简易方法,质控检测得到酿酒酵母工业菌株测序条件为:菌株的基因组文库DNA片段大小为250-850bp且主要集中在350-550bp,文库浓度范围为7-13ng/μL;上机测序文库的优化浓度为20pM。
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关键词
酿酒酵母
野生型
工业
菌株
Miseq
基因组测序方法
文库质量
原文传递
题名
野生型工业酿酒酵母Miseq测序方法的建立
被引量:
1
1
作者
曹德民
张穗生
罗贞贞
黄日波
机构
广西大学生命科学与技术学院
广西科学院广西生物炼制重点实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期655-660,共6页
基金
国家863课题(2012AA022106
2013AA050701)
+10 种基金
国家国际合作项目(2010DFB63590)
广西科学研究和技术开发项目(桂科重12118004-2
桂科重1348004-1
桂科重1348004-3
桂科合1346011-4)
广西自然科学基金(2011GNSFA-018113
2012AA022106)
广西八桂学者建设工程专项经费
广西科技创新能力与条件建设计划项目(桂科能12237022)
广西科学基金项目13-051-08
广西科学院基本科研业务费资助项目12YJ25SW03共同资助
文摘
新一代测序方法在基因组学研究应用日趋广泛,已经成为工业酿酒酵母菌株基因组学研究的重要技术平台,但对工业酿酒酵母新一代测序技术方法缺乏详细报道。Miseq是小型新一代基因组测序仪,本文报道我们自建的野生型工业酿酒酵母基因组Miseq测序方法。该方法包括:制备分离a型和α型交配型的单倍体菌株、采用电泳和分光光度法方法监控基因组文库建立、优化上机文库浓度后测序。其中电泳和分光光度法方法为首创的文库质量监控简易方法,质控检测得到酿酒酵母工业菌株测序条件为:菌株的基因组文库DNA片段大小为250-850bp且主要集中在350-550bp,文库浓度范围为7-13ng/μL;上机测序文库的优化浓度为20pM。
关键词
酿酒酵母
野生型
工业
菌株
Miseq
基因组测序方法
文库质量
Keywords
Saccharomyces cerevisiae
Wild-type industrial strain
Miseq
Genome sequencing method
Library quality
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
野生型工业酿酒酵母Miseq测序方法的建立
曹德民
张穗生
罗贞贞
黄日波
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
原文传递
已选择
0
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参考文献
引证文献
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