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茶树金属耐受蛋白基因CsMTP11的克隆及功能分析
被引量:
6
1
作者
袁连玉
陈应娟
+1 位作者
魏旭
童华荣
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期708-717,共10页
金属耐受蛋白MTP(metal tolerance protein)是阳离子转运蛋白(CDF)家族的重要成员,在植物重金属转运过程中发挥重要调控作用。本研究以中茶108茶树为试验材料,通过RT-PCR和RACE方法克隆到茶树重金属耐受蛋白基因CsMTP11(Gen Bank登录号...
金属耐受蛋白MTP(metal tolerance protein)是阳离子转运蛋白(CDF)家族的重要成员,在植物重金属转运过程中发挥重要调控作用。本研究以中茶108茶树为试验材料,通过RT-PCR和RACE方法克隆到茶树重金属耐受蛋白基因CsMTP11(Gen Bank登录号为KX450265),其全长c DNA为1197 bp,编码398个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为44.85 k D,等电点为5.34。在线软件分析表明,CsMTP11蛋白具有5个跨膜结构域,且含有CDF家族的其他保守结构域。系统进化树分析结果表明,茶树CsMTP11与葡萄VvMTP11进化同源性最近,其氨基酸序列相似度高达90%。基因表达模式分析表明,CsMTP11基因在茶树老叶中的表达量最高,根中的表达量最低,另外,CsMTP11基因受重金属Mn和Co离子胁迫诱导表达。CsMTP11-YFP融合蛋白在拟南芥原生质体共定位试验表明,CsMTP11-YFP融合蛋白定位于质膜。CsMTP11在酿酒酵母及其突变株中的异源表达可以提高其对重金属Mn和Co离子的耐受性。综上所述,茶树CsMTP11属于Mn-CDF亚家族,可能参与茶树对重金属锰和钴的转运过程。
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关键词
茶树
重金属
耐受
蛋白
基因克隆
锰
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职称材料
芸薹属AC基因组MTP1基因的生物信息学分析
被引量:
5
2
作者
李施蒙
《广东农业科学》
CAS
2018年第9期21-27,共7页
以拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtMTP1基因序列为参考,利用白菜(Brassica rapa)、甘蓝(Brassica oleracea)、甘蓝型油菜(Brassica napus)全基因组数据对MTP1基因进行全基因组水平鉴定,通过Blastn比对和保守结构域分析,在芸薹属AC基因...
以拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtMTP1基因序列为参考,利用白菜(Brassica rapa)、甘蓝(Brassica oleracea)、甘蓝型油菜(Brassica napus)全基因组数据对MTP1基因进行全基因组水平鉴定,通过Blastn比对和保守结构域分析,在芸薹属AC基因组中共鉴定到8个MTP1基因,其中白菜1个、甘蓝3个、甘蓝型油菜4个(A亚基因组3个、C亚基因组1个)。生物信息学分析结果表明,在蛋白质理化性质、二级结构、跨膜结构域、磷酸化位点等方面,3个物种中的MTP1基因间各有差异,并使用甘蓝型油菜转录组数据比较分析4个BnMTP1基因在不同组织部位的表达模式。
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关键词
甘蓝型油菜
MTP1基因
重金属
耐受
蛋白
锌
CDF家族
生物信息学
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职称材料
题名
茶树金属耐受蛋白基因CsMTP11的克隆及功能分析
被引量:
6
1
作者
袁连玉
陈应娟
魏旭
童华荣
机构
西南大学食品科学学院
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期708-717,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31400583)
重庆市基础与前沿研究计划一般项目(cstc2014jcyjA80011)
中央高校基本业务费专项(XDJK2014C070)资助~~
文摘
金属耐受蛋白MTP(metal tolerance protein)是阳离子转运蛋白(CDF)家族的重要成员,在植物重金属转运过程中发挥重要调控作用。本研究以中茶108茶树为试验材料,通过RT-PCR和RACE方法克隆到茶树重金属耐受蛋白基因CsMTP11(Gen Bank登录号为KX450265),其全长c DNA为1197 bp,编码398个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为44.85 k D,等电点为5.34。在线软件分析表明,CsMTP11蛋白具有5个跨膜结构域,且含有CDF家族的其他保守结构域。系统进化树分析结果表明,茶树CsMTP11与葡萄VvMTP11进化同源性最近,其氨基酸序列相似度高达90%。基因表达模式分析表明,CsMTP11基因在茶树老叶中的表达量最高,根中的表达量最低,另外,CsMTP11基因受重金属Mn和Co离子胁迫诱导表达。CsMTP11-YFP融合蛋白在拟南芥原生质体共定位试验表明,CsMTP11-YFP融合蛋白定位于质膜。CsMTP11在酿酒酵母及其突变株中的异源表达可以提高其对重金属Mn和Co离子的耐受性。综上所述,茶树CsMTP11属于Mn-CDF亚家族,可能参与茶树对重金属锰和钴的转运过程。
关键词
茶树
重金属
耐受
蛋白
基因克隆
锰
Keywords
Camellia sinensis
Heavy metal tolerance
Gene clone
Mn
分类号
S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]
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职称材料
题名
芸薹属AC基因组MTP1基因的生物信息学分析
被引量:
5
2
作者
李施蒙
机构
西藏自治区农牧科学院农业研究所
出处
《广东农业科学》
CAS
2018年第9期21-27,共7页
基金
西藏自治区农牧科学院农业研究所青年基金(2017NKS-QNJJ)
文摘
以拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtMTP1基因序列为参考,利用白菜(Brassica rapa)、甘蓝(Brassica oleracea)、甘蓝型油菜(Brassica napus)全基因组数据对MTP1基因进行全基因组水平鉴定,通过Blastn比对和保守结构域分析,在芸薹属AC基因组中共鉴定到8个MTP1基因,其中白菜1个、甘蓝3个、甘蓝型油菜4个(A亚基因组3个、C亚基因组1个)。生物信息学分析结果表明,在蛋白质理化性质、二级结构、跨膜结构域、磷酸化位点等方面,3个物种中的MTP1基因间各有差异,并使用甘蓝型油菜转录组数据比较分析4个BnMTP1基因在不同组织部位的表达模式。
关键词
甘蓝型油菜
MTP1基因
重金属
耐受
蛋白
锌
CDF家族
生物信息学
Keywords
Brassica napus L.
MTP1 gene
metal tolerance protein
Zn
cation diffuse facilitator proteins family
bioinformatics
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
茶树金属耐受蛋白基因CsMTP11的克隆及功能分析
袁连玉
陈应娟
魏旭
童华荣
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
6
下载PDF
职称材料
2
芸薹属AC基因组MTP1基因的生物信息学分析
李施蒙
《广东农业科学》
CAS
2018
5
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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