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CsCAT3克隆与其在冷驯化诱导采后黄瓜耐冷性中的作用初探
被引量:
7
1
作者
王斌
武春爽
+3 位作者
何金明
王光
曲姗姗
朱世江
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期2267-2276,共10页
为研究CsCAT3基因在冷驯化诱导采后黄瓜耐冷性中的作用,采用同源克隆法克隆了CsCAT3基因,并对其基本特性进行分析,研究了冷驯化处理对采后黄瓜CsCAT3表达、CAT活性和过氧化氢(H_(2)O_(2))含量的影响。结果表明,CsCAT3基因的开放阅读框...
为研究CsCAT3基因在冷驯化诱导采后黄瓜耐冷性中的作用,采用同源克隆法克隆了CsCAT3基因,并对其基本特性进行分析,研究了冷驯化处理对采后黄瓜CsCAT3表达、CAT活性和过氧化氢(H_(2)O_(2))含量的影响。结果表明,CsCAT3基因的开放阅读框长度为1 476 bp,编码492个氨基酸残基。CsCAT3的理论分子量为57.01 kDa,等电点为6.84,为亲水性蛋白质,无跨膜结构域,定位在过氧化物酶体。CsCAT3与4种模式植物CAT3的同源性介于69.29%-71.82%之间,物种间CsCAT3的同源性和保守性很高。冷驯化处理可明显上调CsCAT3在转录和蛋白水平上的表达,提高CAT活性,降低H_(2)O_(2)含量,表明CsCAT3基因在冷驯化诱导的耐冷性中具有重要作用。本研究为进一步解析CsCAT3在采后黄瓜诱导耐冷性中的功能奠定了基础。
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关键词
采
后
黄瓜
耐冷性
CAT3基因
抗氧化活性
过氧化氢
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职称材料
黄瓜果实CsMYB62克隆及其对CsGR-RBP3表达的调控
被引量:
5
2
作者
王斌
武春爽
+4 位作者
汤冰琳
王光
何金明
曲姗姗
朱世江
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期907-917,共11页
本研究前期证实,低温诱导的CsGR-RBP3表达与黄瓜果实耐冷性密切相关,但调控其表达的具体机理尚不清楚。为鉴定调控CsGR-RBP3表达的MYB转录因子,本研究采用转录组测序,分析了黄瓜果实在5℃低温处理后的转录组变化,并通过共表达趋势分析,...
本研究前期证实,低温诱导的CsGR-RBP3表达与黄瓜果实耐冷性密切相关,但调控其表达的具体机理尚不清楚。为鉴定调控CsGR-RBP3表达的MYB转录因子,本研究采用转录组测序,分析了黄瓜果实在5℃低温处理后的转录组变化,并通过共表达趋势分析,鉴定了与CsGR-RBP3表达趋势一致的MYB基因。结果发现,CsMYB62与CsGR-RBP3表达的相关性很高,且低温处理能诱导黄瓜果实CsMYB62和CsGR-RBP3表达,推测CsMYB62转录因子可能调控CsGR-RBP3表达。为进一步分析CsMYB62基因的功能,从黄瓜果皮中克隆了CsMYB62基因全长序列。结果显示,CsMYB62基因全长834 bp,编码277个氨基酸残基。CsMYB62蛋白含有SANT保守域和MYB DNA结合域,定位在细胞核,在进化过程中高度保守。CsMYB62蛋白具有转录激活活性,能直接绑定到CsGR-RBP3启动子,增强CsGR-RBP3启动子活性,表明CsMYB62通过直接调控CsGR-RBP3表达而增强黄瓜果实耐冷性。本研究结果丰富了MYB调控网络,为进一步解析CsMYB62功能奠定了理论基础。
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关键词
采
后
黄瓜
耐冷性
MYB转录因子
富甘氨酸RNA结合蛋白
转录调控
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职称材料
黄瓜GR-RBP3启动子克隆及低温对其活性的诱导
被引量:
5
3
作者
王斌
黄泳谚
+1 位作者
易景怡
原远
《山东农业科学》
北大核心
2022年第7期15-23,共9页
低温诱导的富甘氨酸RNA结合蛋白GR-RBP3表达与采后黄瓜(Cucumis sativus)耐冷性密切相关。低温处理明显上调采后黄瓜的CsGR-RBP3表达,表明该基因是一个低温诱导型基因。为探究低温处理对CsGR-RBP3表达和启动子活性的诱导作用,本研究以...
低温诱导的富甘氨酸RNA结合蛋白GR-RBP3表达与采后黄瓜(Cucumis sativus)耐冷性密切相关。低温处理明显上调采后黄瓜的CsGR-RBP3表达,表明该基因是一个低温诱导型基因。为探究低温处理对CsGR-RBP3表达和启动子活性的诱导作用,本研究以黄瓜基因组DNA为模板,克隆了CsGR-RBP3开放阅读框上游1541 bp的启动子序列。生物信息学分析发现,克隆的启动子序列中含有真核生物典型的核心启动子元件TATA-box和CAAT-box,表明成功克隆了CsGR-RBP3启动子;含有低温响应元件LTR,推测低温可能通过影响CsGR-RBP3启动子活性激活CsGR-RBP3表达。启动子活性分析表明,CsGR-RBP3启动子能增强LUC活性,且能驱动GUS基因表达,表明该启动子具有启动基因转录的活性。在烟草和拟南芥中的转基因试验结果显示,低温处理明显提高了GUS活性和编码基因的表达,表明低温处理能增强CsGR-RBP3启动子活性。综之,低温通过诱导启动子活性进一步增强CsGR-RBP3的转录。
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关键词
采
后
黄瓜
富甘氨酸RNA结合蛋白(GR-RBP3)
低温
转录调控
启动子活性
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职称材料
采后黄瓜响应低温胁迫的转录组学分析
被引量:
2
4
作者
黄泳谚
易景怡
王斌
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2023年第1期35-48,共14页
采后黄瓜对低温敏感,在低温贮藏期间很容易发生冷害,会造成较大的采后损失。本研究采用转录组测序结合生物信息学分析的方法,分析了采后黄瓜在短时冷害温度处理后的转录组变化。结果显示,采后黄瓜在5℃贮藏期间,冷害指数和相对电导率逐...
采后黄瓜对低温敏感,在低温贮藏期间很容易发生冷害,会造成较大的采后损失。本研究采用转录组测序结合生物信息学分析的方法,分析了采后黄瓜在短时冷害温度处理后的转录组变化。结果显示,采后黄瓜在5℃贮藏期间,冷害指数和相对电导率逐渐增加,叶绿素荧光逐渐降低,表明采后黄瓜在5℃贮藏期间产生了明显的冷害。与处理前相比(0 h),处理12 h导致1500个基因差异表达,其中706个基因表达上调,794个基因表达下调。与0 h相比,处理72 h导致7799个基因差异表达,其中3995个基因表达上调,3804个基因表达下调。KEGG富集结果显示,低温处理导致的差异表达基因显著富集在植物激素信号转导、苯丙氨酸代谢、植物与病原菌互作和苯丙烷素合成途径中。GO富集分析的结果显示,在生物过程分类下,差异表达基因主要参与以DNA为模板的转录调控、蛋白磷酸化和跨膜转运等过程;在细胞组份分类下,差异表达基因主要富集在细胞膜组份和细胞核;在分子功能分类下,差异表达基因主要与ATP结合、蛋白苏氨酸/丝氨酸激酶活性、DNA结合和转录因子活性等功能有关。在低温处理12 h时,与激素信号有关的基因显著表达。但在低温处理72 h时,与植物-病原菌互作以及苯丙烷素合成有关的基因被显著诱导,表明植物激素参与了早期的低温信号传递,诱导病程相关基因表达以及苯丙烷素合成可能是采后黄瓜提高耐冷性,应对低温胁迫的重要机制。本研究结果为采后黄瓜适应低温胁迫,并对低温胁迫作出抗性的分子机理提供了新见解,也为耐冷黄瓜新品种培育提供了重要基因资源。
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关键词
采
后
黄瓜
冷害
转录组分析
植物激素信号
苯丙烷素合成
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职称材料
采后黄瓜在冷驯化处理过程中的转录组变化
5
作者
王斌
杨盼迪
+1 位作者
王玉昆
蒋园园
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期256-270,共15页
采后黄瓜是冷敏性果菜类蔬菜,在低温贮藏时易发生冷害。前期研究结果表明,冷驯化处理通过诱导采后黄瓜耐冷性,减少冷害发生。为探究冷驯化处理诱导的转录组学变化,以采后黄瓜为试材,分析冷驯化处理期间的转录组变化。与贮藏前(0 h)相比...
采后黄瓜是冷敏性果菜类蔬菜,在低温贮藏时易发生冷害。前期研究结果表明,冷驯化处理通过诱导采后黄瓜耐冷性,减少冷害发生。为探究冷驯化处理诱导的转录组学变化,以采后黄瓜为试材,分析冷驯化处理期间的转录组变化。与贮藏前(0 h)相比,在冷驯化处理12 h和72 h时,分别鉴定到1 870和3 550个差异表达基因。基因表达验证结果表明,RT-qPCR和转录组结果高度一致,证明转录组测序数据的准确性和可靠性。GO富集分析结果显示,冷驯化处理诱导的差异表达基因主要富集在氧化还原过程、细胞膜组分和转录因子活性3个GO途径中,表明冷驯化处理通过调节细胞膜组分、细胞内氧化还原状态,增强冷藏黄瓜耐冷性。进一步分析发现,104个转录因子基因响应冷驯化低温,差异表达的转录因子主要是ERF、bZIP、WRKY和HSF家族,表明转录因子介导的转录调控在冷驯化诱导的耐冷性中发挥重要作用。研究结果为采后黄瓜诱导耐冷性提供了新见解,有助于加深对冷驯化诱导耐冷性分子机理的认识,为耐冷黄瓜培育提供了重要基因资源。
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关键词
采
后
黄瓜
耐冷性
冷驯化
转录组学分析
转录因子
下载PDF
职称材料
采后黄瓜冷害及耐冷性调控研究进展
被引量:
1
6
作者
王斌
袁晓
+2 位作者
蒋园园
王玉昆
朱世江
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第2期596-608,共13页
黄瓜是冷敏型果菜类蔬菜,采后黄瓜在低温贮藏期间很容易发生冷害,降低采后品质,缩短贮藏寿命,造成较大的采后损失。因此,探明采后黄瓜冷害发生机制,并有针对性地提出冷害防控措施,是当下果蔬采后保鲜研究领域中迫切需要解决的科技问题...
黄瓜是冷敏型果菜类蔬菜,采后黄瓜在低温贮藏期间很容易发生冷害,降低采后品质,缩短贮藏寿命,造成较大的采后损失。因此,探明采后黄瓜冷害发生机制,并有针对性地提出冷害防控措施,是当下果蔬采后保鲜研究领域中迫切需要解决的科技问题。近年来,在采后黄瓜冷害防控及耐冷性调控研究方面取得了一系列进展。本文重点从采后黄瓜冷害症状、冷害发生过程中的生理生化变化和防控技术等角度,总结了采后黄瓜冷害及耐冷性调控研究方面的进展,可以为采后黄瓜的低温贮藏和冷害防控研究提供借鉴和参考。
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关键词
采
后
黄瓜
低温贮藏
冷害
防控技术
耐冷性
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职称材料
题名
CsCAT3克隆与其在冷驯化诱导采后黄瓜耐冷性中的作用初探
被引量:
7
1
作者
王斌
武春爽
何金明
王光
曲姗姗
朱世江
机构
韶关学院英东生物与农业学院
华南农业大学园艺学院
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期2267-2276,共10页
基金
广东省基础与应用基础研究基金(2020A1515010068)
广东省教育厅青年创新人才项目(2018KQNCX231)。
文摘
为研究CsCAT3基因在冷驯化诱导采后黄瓜耐冷性中的作用,采用同源克隆法克隆了CsCAT3基因,并对其基本特性进行分析,研究了冷驯化处理对采后黄瓜CsCAT3表达、CAT活性和过氧化氢(H_(2)O_(2))含量的影响。结果表明,CsCAT3基因的开放阅读框长度为1 476 bp,编码492个氨基酸残基。CsCAT3的理论分子量为57.01 kDa,等电点为6.84,为亲水性蛋白质,无跨膜结构域,定位在过氧化物酶体。CsCAT3与4种模式植物CAT3的同源性介于69.29%-71.82%之间,物种间CsCAT3的同源性和保守性很高。冷驯化处理可明显上调CsCAT3在转录和蛋白水平上的表达,提高CAT活性,降低H_(2)O_(2)含量,表明CsCAT3基因在冷驯化诱导的耐冷性中具有重要作用。本研究为进一步解析CsCAT3在采后黄瓜诱导耐冷性中的功能奠定了基础。
关键词
采
后
黄瓜
耐冷性
CAT3基因
抗氧化活性
过氧化氢
Keywords
harvested cucumber
chilling tolerance
CAT3 gene
antioxidant activity
hydrogen peroxide
分类号
S642.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
黄瓜果实CsMYB62克隆及其对CsGR-RBP3表达的调控
被引量:
5
2
作者
王斌
武春爽
汤冰琳
王光
何金明
曲姗姗
朱世江
机构
韶关学院英东生物与农业学院
华南农业大学园艺学院
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期907-917,共11页
基金
广东省基础与应用基础研究基金(2020A1515010068)
广东省教育厅青年创新人才项目(2018KQNCX231)
韶关学院博士科研启动项目(99000602)。
文摘
本研究前期证实,低温诱导的CsGR-RBP3表达与黄瓜果实耐冷性密切相关,但调控其表达的具体机理尚不清楚。为鉴定调控CsGR-RBP3表达的MYB转录因子,本研究采用转录组测序,分析了黄瓜果实在5℃低温处理后的转录组变化,并通过共表达趋势分析,鉴定了与CsGR-RBP3表达趋势一致的MYB基因。结果发现,CsMYB62与CsGR-RBP3表达的相关性很高,且低温处理能诱导黄瓜果实CsMYB62和CsGR-RBP3表达,推测CsMYB62转录因子可能调控CsGR-RBP3表达。为进一步分析CsMYB62基因的功能,从黄瓜果皮中克隆了CsMYB62基因全长序列。结果显示,CsMYB62基因全长834 bp,编码277个氨基酸残基。CsMYB62蛋白含有SANT保守域和MYB DNA结合域,定位在细胞核,在进化过程中高度保守。CsMYB62蛋白具有转录激活活性,能直接绑定到CsGR-RBP3启动子,增强CsGR-RBP3启动子活性,表明CsMYB62通过直接调控CsGR-RBP3表达而增强黄瓜果实耐冷性。本研究结果丰富了MYB调控网络,为进一步解析CsMYB62功能奠定了理论基础。
关键词
采
后
黄瓜
耐冷性
MYB转录因子
富甘氨酸RNA结合蛋白
转录调控
Keywords
harvested cucumber
chilling tolerance
MYB transcription factor
glycine-rich RNA-binding protein
transcriptional regulation
分类号
S642.2 [农业科学—蔬菜学]
下载PDF
职称材料
题名
黄瓜GR-RBP3启动子克隆及低温对其活性的诱导
被引量:
5
3
作者
王斌
黄泳谚
易景怡
原远
机构
广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室
韶关学院英东生物与农业学院
出处
《山东农业科学》
北大核心
2022年第7期15-23,共9页
基金
广东省基础与应用基础研究基金资助项目(2020A1515010068,2022A1515011913)
广东省教育厅青年创新人才项目(2018KQNCX231)。
文摘
低温诱导的富甘氨酸RNA结合蛋白GR-RBP3表达与采后黄瓜(Cucumis sativus)耐冷性密切相关。低温处理明显上调采后黄瓜的CsGR-RBP3表达,表明该基因是一个低温诱导型基因。为探究低温处理对CsGR-RBP3表达和启动子活性的诱导作用,本研究以黄瓜基因组DNA为模板,克隆了CsGR-RBP3开放阅读框上游1541 bp的启动子序列。生物信息学分析发现,克隆的启动子序列中含有真核生物典型的核心启动子元件TATA-box和CAAT-box,表明成功克隆了CsGR-RBP3启动子;含有低温响应元件LTR,推测低温可能通过影响CsGR-RBP3启动子活性激活CsGR-RBP3表达。启动子活性分析表明,CsGR-RBP3启动子能增强LUC活性,且能驱动GUS基因表达,表明该启动子具有启动基因转录的活性。在烟草和拟南芥中的转基因试验结果显示,低温处理明显提高了GUS活性和编码基因的表达,表明低温处理能增强CsGR-RBP3启动子活性。综之,低温通过诱导启动子活性进一步增强CsGR-RBP3的转录。
关键词
采
后
黄瓜
富甘氨酸RNA结合蛋白(GR-RBP3)
低温
转录调控
启动子活性
Keywords
Harvested cucumber
Glycine-rich RNA-binding protein(GR-RBP3)
Low temperature
Transcriptional regulation
Promoter activity
分类号
S642.2:Q785 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
采后黄瓜响应低温胁迫的转录组学分析
被引量:
2
4
作者
黄泳谚
易景怡
王斌
机构
韶关学院广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室/韶关学院英东生物与农业学院
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2023年第1期35-48,共14页
基金
广东省基础与应用基础研究基金项目(No.2022A1515011913)。
文摘
采后黄瓜对低温敏感,在低温贮藏期间很容易发生冷害,会造成较大的采后损失。本研究采用转录组测序结合生物信息学分析的方法,分析了采后黄瓜在短时冷害温度处理后的转录组变化。结果显示,采后黄瓜在5℃贮藏期间,冷害指数和相对电导率逐渐增加,叶绿素荧光逐渐降低,表明采后黄瓜在5℃贮藏期间产生了明显的冷害。与处理前相比(0 h),处理12 h导致1500个基因差异表达,其中706个基因表达上调,794个基因表达下调。与0 h相比,处理72 h导致7799个基因差异表达,其中3995个基因表达上调,3804个基因表达下调。KEGG富集结果显示,低温处理导致的差异表达基因显著富集在植物激素信号转导、苯丙氨酸代谢、植物与病原菌互作和苯丙烷素合成途径中。GO富集分析的结果显示,在生物过程分类下,差异表达基因主要参与以DNA为模板的转录调控、蛋白磷酸化和跨膜转运等过程;在细胞组份分类下,差异表达基因主要富集在细胞膜组份和细胞核;在分子功能分类下,差异表达基因主要与ATP结合、蛋白苏氨酸/丝氨酸激酶活性、DNA结合和转录因子活性等功能有关。在低温处理12 h时,与激素信号有关的基因显著表达。但在低温处理72 h时,与植物-病原菌互作以及苯丙烷素合成有关的基因被显著诱导,表明植物激素参与了早期的低温信号传递,诱导病程相关基因表达以及苯丙烷素合成可能是采后黄瓜提高耐冷性,应对低温胁迫的重要机制。本研究结果为采后黄瓜适应低温胁迫,并对低温胁迫作出抗性的分子机理提供了新见解,也为耐冷黄瓜新品种培育提供了重要基因资源。
关键词
采
后
黄瓜
冷害
转录组分析
植物激素信号
苯丙烷素合成
Keywords
harvested cucumber
chilling injury
transcriptomic analysis
plant hormone signal
phenylpropanoid biosynthesis
分类号
S642.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
采后黄瓜在冷驯化处理过程中的转录组变化
5
作者
王斌
杨盼迪
王玉昆
蒋园园
机构
韶关学院广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室
韶关学院生物与农业学院
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期256-270,共15页
基金
广东省基础与应用基础研究基金(2022A1515011913)。
文摘
采后黄瓜是冷敏性果菜类蔬菜,在低温贮藏时易发生冷害。前期研究结果表明,冷驯化处理通过诱导采后黄瓜耐冷性,减少冷害发生。为探究冷驯化处理诱导的转录组学变化,以采后黄瓜为试材,分析冷驯化处理期间的转录组变化。与贮藏前(0 h)相比,在冷驯化处理12 h和72 h时,分别鉴定到1 870和3 550个差异表达基因。基因表达验证结果表明,RT-qPCR和转录组结果高度一致,证明转录组测序数据的准确性和可靠性。GO富集分析结果显示,冷驯化处理诱导的差异表达基因主要富集在氧化还原过程、细胞膜组分和转录因子活性3个GO途径中,表明冷驯化处理通过调节细胞膜组分、细胞内氧化还原状态,增强冷藏黄瓜耐冷性。进一步分析发现,104个转录因子基因响应冷驯化低温,差异表达的转录因子主要是ERF、bZIP、WRKY和HSF家族,表明转录因子介导的转录调控在冷驯化诱导的耐冷性中发挥重要作用。研究结果为采后黄瓜诱导耐冷性提供了新见解,有助于加深对冷驯化诱导耐冷性分子机理的认识,为耐冷黄瓜培育提供了重要基因资源。
关键词
采
后
黄瓜
耐冷性
冷驯化
转录组学分析
转录因子
Keywords
Harvested cucumber
Chilling tolerance
Cold acclimation
Transcriptomic analysis
Transcriptional factor
分类号
S642.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
采后黄瓜冷害及耐冷性调控研究进展
被引量:
1
6
作者
王斌
袁晓
蒋园园
王玉昆
朱世江
机构
韶关学院广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室
韶关学院英东生物与农业学院
华南农业大学园艺学院
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第2期596-608,共13页
基金
广东省基础与应用基础研究基金项目(2022A1515011913)。
文摘
黄瓜是冷敏型果菜类蔬菜,采后黄瓜在低温贮藏期间很容易发生冷害,降低采后品质,缩短贮藏寿命,造成较大的采后损失。因此,探明采后黄瓜冷害发生机制,并有针对性地提出冷害防控措施,是当下果蔬采后保鲜研究领域中迫切需要解决的科技问题。近年来,在采后黄瓜冷害防控及耐冷性调控研究方面取得了一系列进展。本文重点从采后黄瓜冷害症状、冷害发生过程中的生理生化变化和防控技术等角度,总结了采后黄瓜冷害及耐冷性调控研究方面的进展,可以为采后黄瓜的低温贮藏和冷害防控研究提供借鉴和参考。
关键词
采
后
黄瓜
低温贮藏
冷害
防控技术
耐冷性
Keywords
harvested cucumber
cold storage
chilling injury
prevention techniques
chilling tolerance
分类号
S642.2 [农业科学—蔬菜学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CsCAT3克隆与其在冷驯化诱导采后黄瓜耐冷性中的作用初探
王斌
武春爽
何金明
王光
曲姗姗
朱世江
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
7
下载PDF
职称材料
2
黄瓜果实CsMYB62克隆及其对CsGR-RBP3表达的调控
王斌
武春爽
汤冰琳
王光
何金明
曲姗姗
朱世江
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
5
下载PDF
职称材料
3
黄瓜GR-RBP3启动子克隆及低温对其活性的诱导
王斌
黄泳谚
易景怡
原远
《山东农业科学》
北大核心
2022
5
下载PDF
职称材料
4
采后黄瓜响应低温胁迫的转录组学分析
黄泳谚
易景怡
王斌
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2023
2
下载PDF
职称材料
5
采后黄瓜在冷驯化处理过程中的转录组变化
王斌
杨盼迪
王玉昆
蒋园园
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
6
采后黄瓜冷害及耐冷性调控研究进展
王斌
袁晓
蒋园园
王玉昆
朱世江
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2023
1
下载PDF
职称材料
已选择
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