新近分离的甲型流感病毒（H1N1）血凝素氨基酸序列分析 被引量：3

1

作者 王国戗 牛菊霞 刘彦轩 《中华临床感染病杂志》 CAS 2009年第3期133-138,共6页

2009年3月，墨西哥暴发甲型H1N1流感，随后疫情迅速蔓延。截至2009年6月5日，全球已有69个国家出现甲型H1N1流感确诊病例，共确诊21940例，死亡125例。我国确诊107例，内地61例，中国香港30例，中国台湾16例。4月30日，我国卫生部将甲型... 2009年3月，墨西哥暴发甲型H1N1流感，随后疫情迅速蔓延。截至2009年6月5日，全球已有69个国家出现甲型H1N1流感确诊病例，共确诊21940例，死亡125例。我国确诊107例，内地61例，中国香港30例，中国台湾16例。4月30日，我国卫生部将甲型H1N1流感纳入《中华人民共和国传染病防治法》规定的乙类传染病，并采取甲类传染病的预防、控制措施，同时还将其纳入了《中华人民共和国国境卫生检疫法》规定的检疫传染病管理。导致此次流感暴发的H1N1型流感病毒是变异后的新型病毒，为加深大家对此类病毒的认识，切实做好疫情的防控工作，本刊特组织了一系列甲型H1N1流感相关文章、指南和方案，供大家参考。 展开更多

关键词 流感病毒A型 H1N1亚型 血凝素类 氨基 酸序列 同源性 变异

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基因芯片检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼耐药性 被引量：6

2

作者 张瑞梅 刘成永 +1 位作者 申涛 刘汀 《淮海医药》 CAS 2009年第1期5-6,共2页

目的研究基因芯片在检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼耐药性中的应用。方法根据与利福平和异烟肼耐药相关的4条基因上的11个位点和30种单核苷酸多态性设计制作芯片,用芯片检测结核分枝杆菌的基因突变,从而判断其耐药性。结果用基因芯片... 目的研究基因芯片在检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼耐药性中的应用。方法根据与利福平和异烟肼耐药相关的4条基因上的11个位点和30种单核苷酸多态性设计制作芯片,用芯片检测结核分枝杆菌的基因突变,从而判断其耐药性。结果用基因芯片在110株异烟肼耐药株中检测出85侏(73.3%),在30株异烟肼敏感株中检测出22株(73.3%),在94株利福平耐药株中检测出77株(81.9%),在46株利福平敏感株中检测出40株(87.0%)。芯片检测结果与部分样本的测序结果完全相符。结论用DNA芯片检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼的耐药性具有较高的特异性和敏感性,该法快速、精确,可以应用于结核分枝杆菌耐药性的检测。 展开更多

关键词 寡核甘酸序列分析 分枝杆菌 结核 药物耐受性

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2型糖尿病大鼠骨骼肌基因表达谱研究 被引量：3

3

作者 温俊平 林丽香 +4 位作者 陈刚 庄维特 李连涛 林苗 林庆明 《中华内分泌代谢杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期491-492,共2页

用基因芯片技术比较2型糖尿病大鼠和正常大鼠骨骼肌基因表达谱的差异。糖尿病大鼠有157种基因下调,100种基因上调,部分基因与胰岛素抵抗、糖脂代谢相关。

关键词 胰岛素抵抗 糖尿病 2型 大鼠 Sprague—Dawley 基因表达 寡核甘酸序列分析

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汉滩病毒PS-6株的分离及其生物学性状研究 被引量：4

4

作者 姚树元 杭长寿 +5 位作者 邱建明 霍子威 石晓宏 张全福 李川 宋干 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期536-539,共4页

目的　从病人血清分离汉坦病毒Ⅰ型毒株 ,为双价疫苗的配伍提供更好的候选株。方法　从陕西HFRS患者血清 ,按常规法分离汉坦病毒。用系列单克隆抗体、空斑减少中和试验、RT PCR及部分核苷酸序列分析等检定 ,确证所分离毒株的血清 (或基... 目的　从病人血清分离汉坦病毒Ⅰ型毒株 ,为双价疫苗的配伍提供更好的候选株。方法　从陕西HFRS患者血清 ,按常规法分离汉坦病毒。用系列单克隆抗体、空斑减少中和试验、RT PCR及部分核苷酸序列分析等检定 ,确证所分离毒株的血清 (或基因 )型别。结果　从 17份HFRS患者血清中成功地分离到 1株汉坦病毒 ,定名为PS 6株。经上述方法全面鉴定确定其为汉滩病毒 (即Ⅰ型病毒 )。该毒株有较强的繁殖力 (毒力 )及较好的抗原性 ,其免疫血清对来源于不同地区的Ⅰ型病毒有较好的中和活性。结论　PS 6毒株有可能成为Ⅰ型病毒疫苗候选株 ,为双价或多价疫苗配伍。 展开更多

关键词 汉滩病毒 生物学性状 RT-PCR 核柑酸序列分析

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基于二代测序的定制化基因panel检测骨髓增殖性肿瘤突变谱 被引量：4

5

作者 黄秀 邓萱 +6 位作者 许笑 张心菊 张悦晟 马玮哲 胡婷婷 唐古生 关明 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期427-434,共8页

目的利用由50个靶基因所组成的测序panel,分析骨髓增殖性肿瘤(MPN)三种主要亚型原发性血小板增多症(ET),真性红细胞增多症(PV),以及原发性骨髓纤维化(PMF)的突变谱,以便为该病的诊断和预后提供有价值的信息。方法回顾性研究方式,收集201... 目的利用由50个靶基因所组成的测序panel,分析骨髓增殖性肿瘤(MPN)三种主要亚型原发性血小板增多症(ET),真性红细胞增多症(PV),以及原发性骨髓纤维化(PMF)的突变谱,以便为该病的诊断和预后提供有价值的信息。方法回顾性研究方式,收集2010年至2017年间来自华山医院以及长海医院血液科的MPN患者标本共53例。所有患者的诊断均符合2016年WHO的诊断标准,包括ET31例(男11例,女20例,中位数年龄55岁),PV17例(男12例,女5例,中位数年龄65岁),PMF5例(男4例,女1例,中位数年龄67岁),并进行其骨髓或者血液标本DNA的二代测序。根据COSMIC,dbSNP,Clinvar等公共数据库对测序结果进行分析,绘制MPN人群的突变谱,并结合患者的临床随访资料进行解读。结果除去典型的JAK2、CALR、MPL突变,还检测出了另外11种基因的致病性突变,以及4种与赋予个体MPN疾病易感性相关的寡核苷酸多态性(SNP)位点(rs4858647,rs9376092,rs58270997,rs621940)。平均每个患者的突变基因数目为2.3个。全部患者(53例)中,基因突变频率由高到低依次为TET2(40%),EZH2(26%),ASXL1(11%),MIR662(6%),SF3B1(6%),BARD1(6%),DNMT3A(4%),KIT(2%),RUNX1(2%),TP53(2%),NRAS(2%)。结论利用靶向基因二代测序技术,能实现一次性对多例典型的BCR-ABL阴性的MPN患者进行多基因外显子测序,检测周期可缩短至两天,可以发现除了JAK2、CALR、MPL突变之外其他的致病性突变,在临床有较好的应用前景。 展开更多

关键词 骨髓增殖性疾病 突变 高通量核昔酸序列分析

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海带cbbX基因序列特征及在雌、雄配子体之间的差异表达 被引量：3

6

作者 石微微 王丽丽 +2 位作者 陈晶 欧阳珑玲 周志刚 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期80-88,共9页

根据海带雄配子体抑制消减cDNA文库中筛选出的克隆18序列设计基因特异性引物,利用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE),克隆了一条长2087bp的cDNA序列(GenBank登陆号:EF490312),其中开放阅读框1275bp,5′-非... 根据海带雄配子体抑制消减cDNA文库中筛选出的克隆18序列设计基因特异性引物,利用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE),克隆了一条长2087bp的cDNA序列(GenBank登陆号:EF490312),其中开放阅读框1275bp,5′-非翻译区(untranslated region,UTR)长118bp,3′-UTR长694bp且具有明显的polyA尾巴。蛋白同源搜索显示,它编码的蛋白与Guillardiatheta这种隐藻核型体编码的CbbX蛋白(GenBank登录号:CAB65663)具有66%同源性。推测的海带配子体cbbX基因编码一个含有424个氨基酸的前体蛋白,前19个氨基酸为信号肽序列。酶切后的成熟蛋白由405个氨基酸组成,分子量为45.26ku,等电点为5.28。海带配子体cbbX基因被8个内含子隔离开,它们的剪切位点都遵循"GT-AG"规则。无论在cDNA或者DNA序列上,雌、雄配子体cbbX基因都没有差异。自编码蛋白的第184位Gly开始,具有一个典型的Walker ATP-结合motif。通过与其它物种共14个CbbX蛋白序列构建的neighbor-joining系统演化树可知,它与隐藻核型体及红藻核基因组编码的蛋白聚成一类,而区别于叶绿体编码蛋白。因此,推测该克隆的海带配子体,cbbX基因可能是由核基因组编码的。荧光定量PCR(Q-RT-PCR)结果证实,cbbX基因在海带雄配子体的表达量明显高于雌配子体的,且在雌、雄配子体之间存在不同的日转录图谱。实验为海带配子体cbbX这个差异表达基因的功能研究和亚细胞定位奠定了基础。 展开更多

关键词 海带 配子体 cbbX基因 核甘酸序列 转录

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广东省登革Ⅰ型病毒E/NS1基因片段核苷酸序列分析 被引量：2

7

作者 郑夔 江立敏 +2 位作者 罗会明 何剑峰 董新民 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期382-384,共3页

目的　分析广东省 1979～ 1999年不同地区登革Ⅰ型病毒地方分离株和国外毒株之间的遗传关系 ,并探讨其可能来源。方法　提取病毒RNA ,用一步法逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)扩增E/NS1连接区基因片断 ,克隆于pBluescriptⅡSK质粒上进行序... 目的　分析广东省 1979～ 1999年不同地区登革Ⅰ型病毒地方分离株和国外毒株之间的遗传关系 ,并探讨其可能来源。方法　提取病毒RNA ,用一步法逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)扩增E/NS1连接区基因片断 ,克隆于pBluescriptⅡSK质粒上进行序列测定 ,并将测序结果与Genbank中其他登革Ⅰ型病毒E/NS1基因片段的 2 4 0bp核苷酸进行比较 ,用计算机软件分析结果。结果　广东省分离到的 14株登革Ⅰ型毒株中 ,基本可分为两个基因亚型 ,它们与印度尼西亚毒株的核苷酸最大同源性为 99 2 % ,与菲律宾毒株的核苷酸最大同源性为 10 0 % ,与泰国毒株的核苷酸最大同源性为 98 8%。结论　广东省的登革Ⅰ型病毒可能来源于菲律宾、印度尼西亚和泰国等东南亚和西太平洋国家。 展开更多

关键词 广东 登革I型病毒 E/NS1基因片段 核革酸序列分析 登革热病毒 登革热 逆转录聚合酶链反应

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新疆维吾尔族宫颈癌患者基因组表达谱的Oligo芯片检测 被引量：1

8

作者 任翠玲 刘开江 +1 位作者 刘青 侯书梅 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1156-1157,共2页

关键词 宫颈肿瘤 癌 鳞状细胞 新疆[维吾尔自治区] 寡核 苷酸序列分析

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遗传性痉挛性截瘫患者ERDA1和SEF2-1基因三核苷酸重复序列的研究

9

作者 郭辉 拉布 +8 位作者 耿德勤 刘焯霖 李洵桦 王学峰 徐评议 张成 陈素琴 徐兴顺 王一鸣 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期244-247,共4页

目的　对ERDA1基因CAG/CTG和SEF2 1基因CTG重复序列数目的遗传性痉挛性截瘫 (HSP)患者及正常人群中的分布和二者在逐代传递中的动态变化进行研究。方法　采用PCR扩增 ,聚丙烯酰胺凝胶电泳 ,GeneS can和Genotype软件分析的方法 ,对 7个... 目的　对ERDA1基因CAG/CTG和SEF2 1基因CTG重复序列数目的遗传性痉挛性截瘫 (HSP)患者及正常人群中的分布和二者在逐代传递中的动态变化进行研究。方法　采用PCR扩增 ,聚丙烯酰胺凝胶电泳 ,GeneS can和Genotype软件分析的方法 ,对 7个有 2～ 3代样本的HSP家系中的 6 2名HSP患者和家系中 10 5名表型正常的患者亲属 ,2 2名散发患者和 31名散发患者的一级亲属 ,以及 116名无血缘关系的正常人检测ERDA1基因CAG/CTG和SEF2 1基因CTG重复序列的数目。结果　ERDA1基因CAG/CTG重复序列的数目在正常人中范围为 9～ 82 (平均2 6 35± 2 0 35 ) ,HSP患者为 9～ 85 (平均 2 8 35± 2 3 4 1) ,患者亲属为 9～ 87(平均 2 6 36± 2 2 0 6 )。SEF2 1基因CTG重复序列的数目在正常人中范围为 2 3～ 4 9(平均 30 90± 6 95 ) ,HSP患者为 2 4～ 5 7(平均 31 17± 7 99) ,患者亲属为 18～ 5 3(平均 30 37± 7 0 2 )。两种三核甘酸重复序列数目在HSP患者与患者亲属之间 ,以及患者与无关正常人群之间比较均无显著性差异。尽管在逐代传递中ERDA1基因CAG/CTG重复序列数目有一定的动态变化 ,但与发病年龄和疾病的严重程度无关。而SEF2 1基因CTG重复序列数目在各代间稳定传递。结论　ERDA1基因CAG/CTG和SEF2 1基因CTG重? 展开更多

关键词 遗传性痉挛性截瘫 三核甘酸序列 相关关系

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TLR9激动剂CpG-ODN对HepG2肝癌细胞增殖及侵袭的影响 被引量：1

10

作者 李鹏 张艳婷 +2 位作者 胡莹 何彩霞 杨少奇 《宁夏医科大学学报》 2015年第4期397-399,412,F0004,共5页

目的探讨Toll样受体9(TLR9)激动剂未甲基化的胞嘧啶-鸟嘌呤核苷酸序列(Cp G-ODN)对Hep G2肝癌细胞增殖及侵袭的影响。方法应用不同浓度的Cp G-ODN作用于肝癌细胞株Hep G2不同时间,采用实时荧光定量PCR法检测Hep G2中TLR9mRNA表达情况,MT... 目的探讨Toll样受体9(TLR9)激动剂未甲基化的胞嘧啶-鸟嘌呤核苷酸序列(Cp G-ODN)对Hep G2肝癌细胞增殖及侵袭的影响。方法应用不同浓度的Cp G-ODN作用于肝癌细胞株Hep G2不同时间,采用实时荧光定量PCR法检测Hep G2中TLR9mRNA表达情况,MTT法检测Hep G2细胞的增殖变化,Transwell法检测其侵袭能力变化。结果 Cp G-ODN组(4、16μg·m L-1)与阴性对照组比较可增加Hep G2细胞中TLR9mRNA的表达;Cp G-ODN(1、4、16μg·m L-1)激动TLR9后可促进Hep G2细胞增殖,且以48h最为显著,并存在剂量依赖关系;Cp G-ODN(4、16μg·m L-1)激动TLR9可增强Hep G2细胞的侵袭能力(P均<0.05)。结论 TLR9表达上调可促进肝癌细胞增殖和侵袭。 展开更多

关键词 TOLL样受体9 肝癌细胞 HEP G2 胞嘧啶-鸟嘌呤核苷酸序列

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流感病毒B/四川/379/99的核苷酸及氨基酸序列分析

11

作者 吴海燕 龙波 +4 位作者 余佳 徐西雁 许风琴 李天舒 林世华 《预防医学情报杂志》 CAS 2002年第2期104-107,共4页

目的　从分子水平研究四川省乙型流感病毒的变异规律 ,了解其变异特性和变异程度。方法　病毒分离及鉴定方法按照国家标准GB15 994-1995的方法 ;抗原分析用常量半加敏红细胞凝集抑制法 ;核苷酸序列测定采用逆转录双脱氧链终止法 ,DNA序... 目的　从分子水平研究四川省乙型流感病毒的变异规律 ,了解其变异特性和变异程度。方法　病毒分离及鉴定方法按照国家标准GB15 994-1995的方法 ;抗原分析用常量半加敏红细胞凝集抑制法 ;核苷酸序列测定采用逆转录双脱氧链终止法 ,DNA序列测定仪读序。结果　发现流感病毒B/四川 /379/99属于B/Yamagata/16 /88毒株系列 ,但与B/北京 /184/93相比抗原性发生了明显的变异 ,核苷酸序列也有 2 7处发生了点突变 ,异致氨基酸序列 12处发生突变 ,其中有 6处位于 70～ 90和 110～ 2 10这两个与抗原决定簇有关的部位。结论　流感病毒B/四川 展开更多

关键词 流感病毒 血凝素 核甘酸序列 氨基酸序列

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科技动态

12

《世界农业》 1986年第4期59-60,共2页

日本三井东压化学公司的综合研究所,最近利用原生质体培养成功能结实的水稻,并计划在1986年春季将该稻谷播种到试验田进行品质鉴定。 该公司的作法是:以“笹锦”和“日本晴”两个品种为材料,首先从种子中取出一部分组织。

关键词 科技动态 原生质体培养 基因表达 愈伤组织 牛生长激素基因 信使RNA 病毒壳蛋白 电磁传感器 输种管 核甘酸序列

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基因芯片在乳腺癌研究中的应用

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作者 杨德宏（综述） 刘红（审校） 《国际肿瘤学杂志》 CAS 2007年第10期755-758,共4页

基因芯片因能快速检测肿瘤组织和细胞中的基因表达情况而广泛应用于乳腺癌研究中。可以根据乳腺癌基因表达情况对乳腺癌进行分子分型、预测预后，且能够有效地检测内分泌治疗、化学治疗和分子靶向治疗的敏感性。基因芯片技术与乳腺癌临... 基因芯片因能快速检测肿瘤组织和细胞中的基因表达情况而广泛应用于乳腺癌研究中。可以根据乳腺癌基因表达情况对乳腺癌进行分子分型、预测预后，且能够有效地检测内分泌治疗、化学治疗和分子靶向治疗的敏感性。基因芯片技术与乳腺癌临床研究结合将会提高乳腺癌临床治疗水平。 展开更多

关键词 乳腺肿瘤 寡核甘酸序列分析 基因

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有关乙肝病毒DNA PCR检测的问答 被引量：8

14

作者 陈辉 《现代实用医学》 2003年第8期531-531,共1页

关键词 乙肝病毒 DNAPCR 检测 核苦酸序列

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三核苷酸重复及相关序列宏观弯曲的预测 被引量：2

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作者 蔡禄 罗辽复 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期595-601,共7页

给出描述36个四联体内碱基对平面间相互方位和碱基对间沿长轴方向位移的参数集。考虑到碱基对梯阶间的非紧邻相互作用 ,提出DNA宏观弯曲的经验预测规则。给出DNA宏观弯曲的定义 ,使用联系碱基对梯阶间的变换矩阵计算宏观弯曲。对18个与... 给出描述36个四联体内碱基对平面间相互方位和碱基对间沿长轴方向位移的参数集。考虑到碱基对梯阶间的非紧邻相互作用 ,提出DNA宏观弯曲的经验预测规则。给出DNA宏观弯曲的定义 ,使用联系碱基对梯阶间的变换矩阵计算宏观弯曲。对18个与人类遗传病有关的三核苷酸重复及相关序列预测了宏观弯曲。理论结果和相应的实验数据作了比较 ,对结果的理论含义作了讨论。 展开更多

关键词 三和苷酸重复序列 宏观弯曲 经验预测 TRS

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