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东海洋山港沿岸土壤、海水样本中Ⅰ型PKS基因的初步筛选鉴定与功能分析
被引量:
3
1
作者
董晓毅
王梁华
+3 位作者
孙铭娟
宗英
焦豫良
焦炳华
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第9期1359-1366,共8页
为考察土壤和海水中Ⅰ型聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)基因的多样性和差异,本研究自行设计了一套针对PKS基因中酮缩合酶(ketosynthase,KS)片段的简并引物,使用PCR方法直接克隆东海洋山港沿岸土壤和海水DNA样本中的KS片段,去除重复...
为考察土壤和海水中Ⅰ型聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)基因的多样性和差异,本研究自行设计了一套针对PKS基因中酮缩合酶(ketosynthase,KS)片段的简并引物,使用PCR方法直接克隆东海洋山港沿岸土壤和海水DNA样本中的KS片段,去除重复序列后,共获得了23条不同的KS片段(长度为630bp^690bp),提交GenBank皆获登录号,其中19条来自土壤(DQ640993、DQ640997、DQ641926、DQ641927、DQ673137~DQ673151),4条来自海水(DQ673151,EF554859~EF554861),由核苷酸序列推断出的氨基酸序列保守,与GenBank中已知KS基因片段的相似度在45%到85%之间,种系发生分析表明,其中14条KS片段(来源于海水的KS片段皆在其中)应来源于典型的KS群,而剩余9条则来源于杂合的PKS/NRPS(Non-ribosomal peptide synthetase,非核糖体多肽合成酶)群。另外,几条KS基因特征明显,可用于进一步的研究。
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关键词
未获得培养微生物
聚
酮
合
酶
酮
缩合
酶
土壤
海水
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职称材料
麦迪霉素聚酮缩合酶基因的亚克隆及表达
被引量:
2
2
作者
朱学蔚
王以光
+1 位作者
金莲舫
徐小敏
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
1991年第4期291-299,共9页
利用与麦迪霉素生物合成有类似途径的放线紫红素聚酮缩合酶基因Act I作为探针,将来源于麦迪霉素产生菌基因文库的与Act I有同源性的阳性初级克隆pCN8B12进一步缩小,亚克隆获得了2.4kb的麦迪霉素聚酮缩合酶基因,将其插入pWHM3载体中构建...
利用与麦迪霉素生物合成有类似途径的放线紫红素聚酮缩合酶基因Act I作为探针,将来源于麦迪霉素产生菌基因文库的与Act I有同源性的阳性初级克隆pCN8B12进一步缩小,亚克隆获得了2.4kb的麦迪霉素聚酮缩合酶基因,将其插入pWHM3载体中构建了重组质粒pCG2 DNA。pCG2 DNA在放线紫红素聚酮缩合酶基因缺陷型变株天蓝色链霉菌TK17及螺旋霉素产生菌S.ambofaciens中均获得表达。前者所得产物不同于麦迪霉素和放线紫红素,可能为新的杂合抗生素;后者能使螺旋霉素产量得到提高。另外pCG2 DNA在道诺红霉素产生菌调节变株S.peucetius H6101中的表达产物经TLC及HPLC分析表明为紫红霉酮。pCG2 DNA在Tetracenomycin C产生菌S.glaucescens中亦有一定的功能表达,而在红霉素产生菌红霉内酯阻断变株Saccharapolyspora erythraea WMH15,261中未观察到活性表达。推测pCG2 DNA具有一定调节或在某些聚酮类抗生素产生菌变株中起互补的功能。
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关键词
麦迪霉素
聚
酮
缩合
酶
基因
亚克隆
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职称材料
题名
东海洋山港沿岸土壤、海水样本中Ⅰ型PKS基因的初步筛选鉴定与功能分析
被引量:
3
1
作者
董晓毅
王梁华
孙铭娟
宗英
焦豫良
焦炳华
机构
中国人民解放军第二军医大学基础医学部生物化学与分子生物学教研室
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第9期1359-1366,共8页
基金
国家"863计划"(No.2006AA09Z434)
国家自然科学基金(No.30670043)资助
文摘
为考察土壤和海水中Ⅰ型聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)基因的多样性和差异,本研究自行设计了一套针对PKS基因中酮缩合酶(ketosynthase,KS)片段的简并引物,使用PCR方法直接克隆东海洋山港沿岸土壤和海水DNA样本中的KS片段,去除重复序列后,共获得了23条不同的KS片段(长度为630bp^690bp),提交GenBank皆获登录号,其中19条来自土壤(DQ640993、DQ640997、DQ641926、DQ641927、DQ673137~DQ673151),4条来自海水(DQ673151,EF554859~EF554861),由核苷酸序列推断出的氨基酸序列保守,与GenBank中已知KS基因片段的相似度在45%到85%之间,种系发生分析表明,其中14条KS片段(来源于海水的KS片段皆在其中)应来源于典型的KS群,而剩余9条则来源于杂合的PKS/NRPS(Non-ribosomal peptide synthetase,非核糖体多肽合成酶)群。另外,几条KS基因特征明显,可用于进一步的研究。
关键词
未获得培养微生物
聚
酮
合
酶
酮
缩合
酶
土壤
海水
Keywords
Uncultured microbes, Polyketide synthase, Ketosyntase, Soil, Sea water
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
麦迪霉素聚酮缩合酶基因的亚克隆及表达
被引量:
2
2
作者
朱学蔚
王以光
金莲舫
徐小敏
机构
中国医学科学院医药生物技术研究所
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
1991年第4期291-299,共9页
文摘
利用与麦迪霉素生物合成有类似途径的放线紫红素聚酮缩合酶基因Act I作为探针,将来源于麦迪霉素产生菌基因文库的与Act I有同源性的阳性初级克隆pCN8B12进一步缩小,亚克隆获得了2.4kb的麦迪霉素聚酮缩合酶基因,将其插入pWHM3载体中构建了重组质粒pCG2 DNA。pCG2 DNA在放线紫红素聚酮缩合酶基因缺陷型变株天蓝色链霉菌TK17及螺旋霉素产生菌S.ambofaciens中均获得表达。前者所得产物不同于麦迪霉素和放线紫红素,可能为新的杂合抗生素;后者能使螺旋霉素产量得到提高。另外pCG2 DNA在道诺红霉素产生菌调节变株S.peucetius H6101中的表达产物经TLC及HPLC分析表明为紫红霉酮。pCG2 DNA在Tetracenomycin C产生菌S.glaucescens中亦有一定的功能表达,而在红霉素产生菌红霉内酯阻断变株Saccharapolyspora erythraea WMH15,261中未观察到活性表达。推测pCG2 DNA具有一定调节或在某些聚酮类抗生素产生菌变株中起互补的功能。
关键词
麦迪霉素
聚
酮
缩合
酶
基因
亚克隆
Keywords
Midecamycin
polyketide condensing enzyme gene
hybrid antibiotic
分类号
TQ465.2 [化学工程—制药化工]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
东海洋山港沿岸土壤、海水样本中Ⅰ型PKS基因的初步筛选鉴定与功能分析
董晓毅
王梁华
孙铭娟
宗英
焦豫良
焦炳华
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
3
下载PDF
职称材料
2
麦迪霉素聚酮缩合酶基因的亚克隆及表达
朱学蔚
王以光
金莲舫
徐小敏
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
1991
2
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职称材料
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