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蓖麻LBD基因家族全基因组鉴定、进化和表达分析
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作者 段强 何智彪 +4 位作者 李国瑞 赵秀平 张帅 韩雯毓 陈永胜 《北方农业学报》 2021年第6期1-14,共14页
【目的】探究蓖麻LBD转录因子基因家族的组成和表达模式。【方法】通过生物信息学手段,在全基因组水平上筛选和鉴定蓖麻LBD基因家族成员,并对其基因结构、理化性质、蛋白质保守基序、进化选择压力、系统发育树和基因表达量进行分析。【... 【目的】探究蓖麻LBD转录因子基因家族的组成和表达模式。【方法】通过生物信息学手段,在全基因组水平上筛选和鉴定蓖麻LBD基因家族成员,并对其基因结构、理化性质、蛋白质保守基序、进化选择压力、系统发育树和基因表达量进行分析。【结果】鉴定得出30个蓖麻LBD基因家族成员在进化过程中高度保守,根据LBD结构域和系统发育树分析的特征,将蓖麻LBD基因家族成员分为Class 1和Class 2两类,各有24个和6个。基因结构与蛋白质保守基序分析表明,蓖麻LBD基因家族成员的基因结构与蛋白质保守基序较为简单;亚细胞定位显示,蓖麻LBD基因家族成员全部定位于细胞核,RcLBD12同时也定位于细胞膜。表达量数据分析表明,在蓖麻中,LBD基因家族成员广泛参与叶、茎、根、胚等的发育调控并响应非生物胁迫。【结论】蓖麻LBD基因家族成员在进化历程中出现了大规模片段复制的情况,经历了较强的纯化选择,并且参与调控蓖麻多个组织部位的生长发育过程,其中RcLBD6与RcLBD27可能在蓖麻抵御非生物胁迫的过程中发挥了重要作用。 展开更多
关键词 蓖麻 LBD基因家族 系统进化 进化选择压力 表达模式
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