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题名四川道地中药金龙胆草叶片转录组特性研究
被引量:10
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作者
孙蓉
刘姗
唐自钟
晋海军
李成磊
陈惠
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机构
四川农业大学生命科学学院
攀枝花学院生物与化学工程学院
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出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期2754-2760,共7页
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基金
四川省高等学校重点实验室科研项目(GR-2013-C-04)资助
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文摘
本研究以道地药材金龙胆草叶片为研究对象,利用Illumina Hi Seq 2500高通量测序技术构建了金龙胆草转录组数据库,获得了42 903 527条Reads数据,通过与Nr、GO、COG、KOG、KEGG等数据库比对,最终获得了38 199个具有注释信息的Unigenes。其中以KEGG数据库为参考,依据代谢通路将Unigenes分成117类,包括萜类骨干合成、二萜类合成、黄酮类化合物生物合成及聚糖生物合成等路径,分别有99,23,161及70个Unigenes映射到上述途径,这些Unigenes可能参与金龙胆草主要活性成分三萜皂苷、特征成分苦蒿素、金龙胆草黄酮及金龙胆草多糖的生物合成。金龙胆草转录组测序工作的完成,极大地扩充了金龙胆草的基因资源,为药用功能基因的发掘与利用、遗传改良及有效成分含量的提高等研究奠定基础。
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关键词
金龙胆草
转录组注释
代谢途径
有效成分
生物合成
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Keywords
Conyza blinii H.Lév
Transcriptome annotation
Metabolic pathway
Active components
Biosynthesis
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分类号
S567.239
[农业科学—中草药栽培]
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