转座元件mariner 被引量：6

1

作者 张卉 王小珂 马世俊 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期756-762,共7页

自mariner转座元件在Drosophilamauritiana中首次发现至今已经在包括人类在内的多种生物体中证实了mariner及类mariner元件(MLEs)的存在。MLEs属于mariner/Tc1超家族 II型转座元件中分布最广、种类最多的超家族之一。MLEs的转座酶都具有... 自mariner转座元件在Drosophilamauritiana中首次发现至今已经在包括人类在内的多种生物体中证实了mariner及类mariner元件(MLEs)的存在。MLEs属于mariner/Tc1超家族 II型转座元件中分布最广、种类最多的超家族之一。MLEs的转座酶都具有"D,D(34)D"的结构,并能催化MLEs通过"剪切和粘贴"机制进行转座。它们的宿主广泛和多样,能够进行种系传递,这都表明MLEs的转座不需要宿主特异元件的参与。MLEs对多种生物尤其对脊椎动物的成功转化更支持了它们的不依赖宿主的转座机制,而且让人们看到了它们作为转基因载体的巨大潜能。 展开更多

关键词 MARINER MLEs 转座元件 种系转化 转化载体

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转座元件在前列腺癌中的研究进展

2

作者 吴子奕 李晶 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期561-568,共8页

由于基因组序列与编码基因之间数目极度不匹配,探究基因组非编码区的潜在功能具有重要意义。转座元件作为基因组非编码区最主要的组成部分,通过转位、顺式调控元件、RNA与蛋白质产物等多种方式,在DNA、RNA、蛋白质、三维基因组等多个层... 由于基因组序列与编码基因之间数目极度不匹配,探究基因组非编码区的潜在功能具有重要意义。转座元件作为基因组非编码区最主要的组成部分,通过转位、顺式调控元件、RNA与蛋白质产物等多种方式,在DNA、RNA、蛋白质、三维基因组等多个层面影响宿主基因的生理和病理表达,从而参与肿瘤的发生发展。本文结合近年来前列腺癌方向转座元件相关的研究结果,阐述了前列腺癌基因组工作中的转座元件相关研究部分,并探讨转座元件在前列腺癌临床诊断、临床预后、临床治疗等方面的潜在应用前景。 展开更多

关键词 转座元件 前列腺癌 临床应用

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CRISPR相关转座元件的研究及应用进展 被引量：2

3

作者 宁书晴 巫欣欣 罗云孜 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期4371-4384,共14页

CRISPR-Cas的基因编辑能力引发了人们对该系统的研究热潮。除了实现基因的敲除和插入,CRISPR-Cas系统还可以被应用于基因簇重组、单碱基编辑和基因转录调控,推动了生物工程领域的发展。然而,有限的同源重组效率使CRISPR-Cas系统的应用... CRISPR-Cas的基因编辑能力引发了人们对该系统的研究热潮。除了实现基因的敲除和插入,CRISPR-Cas系统还可以被应用于基因簇重组、单碱基编辑和基因转录调控,推动了生物工程领域的发展。然而,有限的同源重组效率使CRISPR-Cas系统的应用受到了一定的限制。与CRISPR-Cas系统相比,移动遗传元件(mobile genetic elements,MGE)在转座酶的调控下,不需要依赖同源重组即可将指定DNA片段定向插入到细胞染色体中。近几年,人们发现了具有转座机制的CRISPR相关的转座元件,它可以介导DNA靶向整合,同时其出色的重编程能力为该领域的研究带来了新的发展。本文主要介绍近年来CRISPR-Cas系统相关转座元件的研究方向和应用进展,以及人工融合的dCas9-transposase系统的应用策略。文中还提出了CRISPR相关转座元件未来的应用前景和潜在挑战,为基因编辑工具的发展方向提供了参考意见。 展开更多

关键词 转座元件 CRISPR-Cas系统 CRISPR相关转座元件 基因编辑

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比较研究啮齿类动物基因组中的散在重复序列 被引量：4

4

作者 韩丽娟 《科技通报》 北大核心 2012年第12期30-31,157,共3页

散在重复序列又称转座子元件(transposable element,TE),是细胞中能够通过切割、复制、重新整合等一系列过程改变自身位置的一段DNA序列。TEs可以影响基因组的大小,能够直接或间接促成基因组重排,还可以影响基因表达水平,改写基因调控网... 散在重复序列又称转座子元件(transposable element,TE),是细胞中能够通过切割、复制、重新整合等一系列过程改变自身位置的一段DNA序列。TEs可以影响基因组的大小,能够直接或间接促成基因组重排,还可以影响基因表达水平,改写基因调控网络,因此在基因组进化中有重要的意义。本文利用Repeatmasker软件识别小鼠,裸鼹鼠,地松鼠,兔子基因组中的散在重复序列,结合其物种进化关系,比较研究4个物种基因组中TEs类别、拷贝数等情况,为理解重复序列在啮齿类动物中的进化提供了参考信息。 展开更多

关键词 转座元件 基因组 啮齿类动物

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年轻的LINE1重塑干细胞命运

5

作者 赵欣 吕鑫屹 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第35期4740-4742,共3页

反转录转座子是通过将RNA中间体反转录成cDNA,以“复制和粘贴”机制在基因组中进行转座的DNA重复序列,在基因组稳定性和物种多样性中发挥重要作用[1].反转录转座子种类丰富,占小鼠基因组的40%左右[2].尽管大多数反转录转座子在漫长进化... 反转录转座子是通过将RNA中间体反转录成cDNA,以“复制和粘贴”机制在基因组中进行转座的DNA重复序列,在基因组稳定性和物种多样性中发挥重要作用[1].反转录转座子种类丰富,占小鼠基因组的40%左右[2].尽管大多数反转录转座子在漫长进化过程中变异、退化,但一些新进化的年轻反转录转座子仍保留转座活性.其中,长散在核元件(long interspersed nuclear element,LINE)是目前仍十分活跃的自主反转座元件,也是比例最大的一类非LTR反转座子[3]. 展开更多

关键词 反转录转座子 反转座子 DNA重复序列 干细胞 转座活性 小鼠基因组 转座元件 物种多样性

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ELL3通过LINE-1调节小鼠细胞原始多能性

6

作者 常展赫 朱学昊 +1 位作者 高绍荣 高亚威 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第33期4433-4435,共3页

人类基因组中有超过50%的序列是转座子序列(transposon elements,TE).转座子又称跳跃基因,是一类可以在基因组中进行自我复制和粘贴的DNA元件[1].转座子主要分为DNA转座子和反转录转座子,其中反转录转座子会先转录产生RNA,再反转录成DN... 人类基因组中有超过50%的序列是转座子序列(transposon elements,TE).转座子又称跳跃基因,是一类可以在基因组中进行自我复制和粘贴的DNA元件[1].转座子主要分为DNA转座子和反转录转座子,其中反转录转座子会先转录产生RNA,再反转录成DNA来完成转座.长散在重复序列(long interspersed nuclear elements-1,LINE-1)是哺乳动物基因组中最丰富的转座元件家族之一,在人类基因组中占比大约为17%[2]. 展开更多

关键词 反转录转座子 人类基因组 跳跃基因 自我复制 转座元件 多能性 小鼠细胞

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PIWI/piRNA“机器”与雄性生殖细胞发育 被引量：4

7

作者 戴鹏 苟兰涛 刘默芳 《生命的化学》 CAS CSCD 2014年第4期456-465,共10页

PIWI(P-element-induced wimpy testis)蛋白在动物生殖系细胞中特异性表达,为动物生殖细胞发育分化所必需。piRNA(PIWI-interacting RNAs)是最近在动物生殖系细胞中发现的一类非编码小分子RNA,这类小RNA特异性地与PIWI家族蛋白相互作用... PIWI(P-element-induced wimpy testis)蛋白在动物生殖系细胞中特异性表达,为动物生殖细胞发育分化所必需。piRNA(PIWI-interacting RNAs)是最近在动物生殖系细胞中发现的一类非编码小分子RNA,这类小RNA特异性地与PIWI家族蛋白相互作用。PIWI/piRNA"机器"通过沉默转座元件和调控编码mRNA等方式在动物生殖细胞发育分化过程中发挥重要作用。本文围绕PIWI/piRNA"机器"的生物学功能及分子机制,对近期取得的相关研究进展进行了系统性总结。 展开更多

关键词 PIWI PIRNA 转座元件 精子发生

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苹果微型反向重复转座元件(MITE)的分离与鉴定 被引量：1

8

作者 孙海悦 张志宏 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2014年第8期147-154,共8页

【目的】从苹果基因组中分离微型反向重复转座元件(MITE),研究其对苹果基因组进化的作用。【方法】利用PIF转座酶简并引物扩增苹果PIF转座酶基因,采用染色体步移技术获得PIF转座酶基因的未知侧翼序列,使用EMBOSS的Eiverted软件查找靶位... 【目的】从苹果基因组中分离微型反向重复转座元件(MITE),研究其对苹果基因组进化的作用。【方法】利用PIF转座酶简并引物扩增苹果PIF转座酶基因,采用染色体步移技术获得PIF转座酶基因的未知侧翼序列,使用EMBOSS的Eiverted软件查找靶位点重复(target site duplication,TSD)和末端反向重复(terminal inverted repeat,TIR)序列。【结果】苹果MITEs拥有MITEs的典型特征,包括长度短,不具有潜在的编码能力,富含A+T,易插入非编码区,有TIRs和TSDs,有形成二级结构的可能。【结论】苹果MITEs属于Tourist家族,与苹果PIF DNA转座子相关;苹果MITEs与基因相连,在基因调节上起重要作用;苹果MITEs具有潜在的转座能力,对苹果遗传多样性、进化及育种有重要作用。 展开更多

关键词 苹果 转座元件 微型反向重复转座元件

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转座元件介导的苯胺代谢基因簇的筛选和鉴定 被引量：2

9

作者 梁泉峰 陈明 +8 位作者 徐玉泉 张维 平淑珍 陆伟 宋先龙 王薇薇 耿立召 Masahiro Takeo 林敏 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第16期1720-1724,共5页

利用苯胺不完全降解时中间代谢产物,如邻苯二酚等的显色反应,建立了简便快速的苯胺代谢途径相关基因的功能筛选方法.从苯胺降解菌株AD9的基因组文库中筛选得到3个阳性重组子pDA1,pDB2和pDB11.AD和C23O酶活测定结果表明,pDA1和pDB11分别... 利用苯胺不完全降解时中间代谢产物,如邻苯二酚等的显色反应,建立了简便快速的苯胺代谢途径相关基因的功能筛选方法.从苯胺降解菌株AD9的基因组文库中筛选得到3个阳性重组子pDA1,pDB2和pDB11.AD和C23O酶活测定结果表明,pDA1和pDB11分别含有功能完整的苯胺双加氧酶或邻苯二酚双加氧酶编码基因.经核苷酸序列分析和拼接获得一个大小为24.7kb,含25个可读框的苯胺代谢基因簇,其中含有17个基因与苯胺代谢有关,包括调控基因tadR,苯胺双加氧酶基因簇tadQTA1A2B,邻苯二酚间位裂解途径酶系基因簇tadD1C1D2C2EFGIJKL.苯胺代谢基因簇两侧含有转座酶和IS1071序列. 展开更多

关键词 苯胺 生物降解 转座元件 基因簇 代谢产物 筛选方法 转座 核苷酸序列分析 鉴定 介导

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植物水平基因转移研究进展 被引量：3

10

作者 陈志文 王玉美 +2 位作者 聂虎帅 王梅燕 华金平 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期1-11,共11页

水平基因转移,一般分为细胞内部或者跨越物种边界的遗传物质交流。跨界直接介导方式,包括共生、内共生、寄生、嫁接等。细胞内的基因转移,主要包括细胞核与细胞器基因组间的相互渗透;跨越物种边界的遗传物质交流,主要涉及寄生与寄主植... 水平基因转移,一般分为细胞内部或者跨越物种边界的遗传物质交流。跨界直接介导方式,包括共生、内共生、寄生、嫁接等。细胞内的基因转移,主要包括细胞核与细胞器基因组间的相互渗透;跨越物种边界的遗传物质交流,主要涉及寄生与寄主植物的基因横向转移,寄主与寄生植物mRNA也会发生大规模的水平转移。基于基因组学研究进展,本研究综述了植物水平基因转移的迁移序列类型、迁移方向及迁移机制:首先,植物细胞的线粒体基因组能够整合细胞核转座元件以及叶绿体起源的tRNA基因,线粒体和叶绿体基因组的功能基因及间区序列能够迁移到核基因组;其次,植物种间,通过寄生、嫁接等方式转移大量的DNA(如线粒体基因、叶绿体基因和转座元件)和RNA(如mRNA)序列;迁移机制涉及到DNA介导和RNA介导方式,迁移方向包括单向和双向转移。迁移序列的基因功能活性研究是重要的后续研究方向。 展开更多

关键词 植物水平基因转移 内源基因转移 寄生 嫁接 转座元件

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原生动物基因组转座元件的研究进展 被引量：3

11

作者 许金山 周泽扬 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期967-976,共10页

转座元件是一类广泛分布于真核生物的可移动的遗传因子,可以引起基因重组和变异,在物种进化及遗传改良中起着重要作用。针对近年来原生动物全基因组序列中大量发现的转座元件,文章着重比较了转座元件在锥虫、利什曼虫、微孢子虫、变形... 转座元件是一类广泛分布于真核生物的可移动的遗传因子,可以引起基因重组和变异,在物种进化及遗传改良中起着重要作用。针对近年来原生动物全基因组序列中大量发现的转座元件,文章着重比较了转座元件在锥虫、利什曼虫、微孢子虫、变形虫和滴虫基因组序列中的存在种类、分布特征及其功能意义。原生动物转座元件以LINE和SINE为主,其次是DNA转座元件和LTR反转座元件,部分转座元件在高A+T含量区富集,预示着转座元件与基因组序列A+T含量有着紧密联系。根据不同种微孢子虫基因组之间转座元件的差异,推测在微孢子虫基因组进化过程中,至少经历了一次转座元件的丢失事件。最后对转座元件在原生动物寄生虫的进一步研究和应用作了展望。 展开更多

关键词 原生动物 转座元件 基因组 微孢子虫

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转座元件、表观遗传调控与细胞命运决定 被引量：1

12

作者 何江平 陈捷凯 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期822-834,共13页

转座元件是哺乳动物基因组内含量最多的元素。尽管转座元件的存在对基因组稳定性具有潜在的危险,但它们同时还是潜在的基因调控序列、蛋白质编码序列和染色质结构序列,并参与物种进化过程。因此,基因组中转座元件的有害性和有益性保持... 转座元件是哺乳动物基因组内含量最多的元素。尽管转座元件的存在对基因组稳定性具有潜在的危险,但它们同时还是潜在的基因调控序列、蛋白质编码序列和染色质结构序列,并参与物种进化过程。因此,基因组中转座元件的有害性和有益性保持着谨慎的平衡,并且这种平衡主要由表观遗传修饰来调控。本文详细介绍了异染色质类型表观遗传修饰如H3K9me3和DNA甲基化在转座元件沉默中的功能;转座元件作为增强子元件富集激活型表观遗传修饰如H3K4me1和H3K27ac,以及作为转录因子结合靶点、染色质构象锚点等方式参与基因表达调控的模式;从体内胚胎发育到体外细胞命运转变,阐述了转座元件在细胞命运决定中的潜在功能及作用方式;最后,对转座元件领域研究存在的挑战及潜在解决方法提出了见解。总之,本文对转座元件与表观遗传、基因表达调控以及细胞命运决定等方面的研究及存在的问题进行了较全面的综述,旨在为相关领域的研究人员提供参考。 展开更多

关键词 转座元件 表观遗传调控 细胞命运决定

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转座元件对植物基因组进化、表观遗传和适应性的作用

13

作者 顾小琳 苏应娟 王艇 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第25期3024-3035,共12页

转座元件是基因组内可移动的DNA序列,其结构和转座机制具有广泛的多样性.转座元件普遍存在于植物基因组中,特别是反转录转座子.转座元件的扩增、插入可能会改变宿主原本基因组的稳定性,因此宿主进化出了各种沉默机制防御转座元件的转座... 转座元件是基因组内可移动的DNA序列,其结构和转座机制具有广泛的多样性.转座元件普遍存在于植物基因组中,特别是反转录转座子.转座元件的扩增、插入可能会改变宿主原本基因组的稳定性,因此宿主进化出了各种沉默机制防御转座元件的转座.随着对转座元件研究的不断深入,越来越多的证据表明,转座元件的插入所带来的并不完全是破坏,它们可能是基因组多样性的驱动力,甚至在作物驯化方面起重要作用.另外,转座元件与宿主之间可能相互影响,尤其是在环境胁迫条件下.本文概述了植物基因组转座元件的相关研究,介绍了植物中常见的转座元件,并探讨了转座元件在植物基因组进化、表观遗传调控中发挥的作用以及在环境胁迫下转座元件与宿主之间存在的合作关系. 展开更多

关键词 转座元件 基因组进化 表观遗传 环境胁迫 适应性

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枣树基因组中转座元件分析 被引量：1

14

作者 郭向萌 张亚平 +1 位作者 付鹏程 押辉远 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期-,共5页

转座子是基因组演化的重要因素。为了探明转座子在枣树(Ziziphus jujuba Mill.)基因组演化中可能的作用,采用生物信息学工具对枣树基因组中的转座元件进行分析。结果表明,所有转座元件占枣树基因组的23.38%,其中DNA转座子占8.60%(包括0.... 转座子是基因组演化的重要因素。为了探明转座子在枣树(Ziziphus jujuba Mill.)基因组演化中可能的作用,采用生物信息学工具对枣树基因组中的转座元件进行分析。结果表明,所有转座元件占枣树基因组的23.38%,其中DNA转座子占8.60%(包括0.34%的MITEs)、LTR反转录转座子占12.23%、Non-LTR反转录转座子占2.30%、内源性反转录病毒占0.25%。系统进化树分析结果表明,MITEs和LTR反转录转座子在演化过程中进行过复制和扩增,这说明转座子的活动和枣树基因组的进化是相关的。本研究将有助于研究枣树基因组的遗传多样性及进行相关种质资源的鉴定。 展开更多

关键词 枣树(ZiziphusjujubaMill.) 基因组 转座元件

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PIWI/piRNA与小鼠精子发生 被引量：1

15

作者 周颖 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期4149-4158,共10页

PIWI蛋白特异性地在动物生殖系细胞中表达,对于动物生殖细胞发育分化至关重要。PIWI蛋白可以特异性地与一类被称为PIWI相互作用RNA的小分子非编码RNA结合。它们组装成功能性的复合体从而在转录水平或者转录后水平抑制转座元件的活性来... PIWI蛋白特异性地在动物生殖系细胞中表达,对于动物生殖细胞发育分化至关重要。PIWI蛋白可以特异性地与一类被称为PIWI相互作用RNA的小分子非编码RNA结合。它们组装成功能性的复合体从而在转录水平或者转录后水平抑制转座元件的活性来维持基因组的稳定性。本研究系统总结了关于PIWI蛋白功能,piRNA的产生机制及功能,以及PIWI/piRNA复合体及其他蛋白因子在小鼠精子发生过程中发挥功能的分子机制等方面的相关研究进展,这些发现有助于我们更好地了解PIWI/piRNA在精子发生中的功能机制,并为相关男性不育症的诊治提供了理论依据和方法技术。 展开更多

关键词 PIWI PIRNA 精子发生 转座元件 DNA甲基化

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家蚕LTR逆转录转座子的鉴定、分类及系统发育分析

16

作者 许红恩 韩民锦 +3 位作者 张化浩 沈以红 向仲怀 张泽 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1211-1222,共12页

转座子是真核生物基因组的重要组成成分。为了研究家蚕Bombyx mori长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)逆转录转座子的分类及进化,本研究采用denovo预测和同源性搜索相结合的方法,在家蚕基因组中共鉴定出了38个LTR逆转录转座子家... 转座子是真核生物基因组的重要组成成分。为了研究家蚕Bombyx mori长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)逆转录转座子的分类及进化,本研究采用denovo预测和同源性搜索相结合的方法,在家蚕基因组中共鉴定出了38个LTR逆转录转座子家族,序列长度占整个基因组的0.64%,远小于先前预测的11.8%,其中有6个家族为本研究的新发现。38个家族中,26个家族有表达序列标签(expression sequencetag,EST)证据,表明这些家族具有潜在的活性。对有EST证据的6个家族和没有EST证据的5个家族用RT-PCR进行了组织表达谱实验,结果表明这11个家族在一些组织中有表达,这进一步证实了这些家族具有转录活性,基于此我们推测家蚕中大部分的LTR逆转录转座子家族很可能具有潜在活性。对转座子的插入时间进行估计,结果表明绝大部分元件都是最近1百万年内插入到家蚕基因组中的。我们还比较了黑腹果蝇Drosophila melanogaster、冈比亚按蚊Anopheles gambiae和家蚕B.mori中Ty3/Gypsy超家族分支的差异,结果表明不同枝在不同昆虫中有着不同的扩张。家蚕中LTR逆转录转座子的鉴定和系统分析有助于我们理解逆转录转座子在昆虫进化中的作用。 展开更多

关键词 家蚕 基因组 转座元件 LTR逆转录转座子 系统发育分析 组织表达谱

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基于蓝藻全基因组原始数据的转座元件挖掘及组成分析

17

作者 肖鹏 李仁辉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期654-660,共7页

二代测序技术及全基因组多样性比较是现代生物学及信息科学研究的热点,对基因组中转座元件(Transposable element)的分析已成为基因组比较分析的重要组成部分。目前对于转座元件的种类、数量和组成的挖掘和分析一般是基于完全拼接后的... 二代测序技术及全基因组多样性比较是现代生物学及信息科学研究的热点,对基因组中转座元件(Transposable element)的分析已成为基因组比较分析的重要组成部分。目前对于转座元件的种类、数量和组成的挖掘和分析一般是基于完全拼接后的全基因组序列,对在此之前的海量短片段序列后期处理及拼接仍是目前基因组研究的盲点,以转座元件为主的重复序列在拼接过程中也存在着不可避免的拼接误差或丢失,给转座元件系统的分析带来不确定。文章旨在建立一套分析流程,对铜绿微囊藻NIES 843全基因组构建的罗氏(Roche)公司454测序随机模拟原始数据集的转座元件(主要类型为插入序列:Insert sequence,IS)组成进行分析,结果表明,采用对核酸探针扫描后备选序列分成3组,并分设氨基酸检测阈值的方案分析得到的结果较为可靠,结果显示铜绿微囊藻NIES843的蓝藻转座元件占基因组比例的10.38%,归属于14个IS家族,66个IS亚家族。与之前基于完整拼接基因组数据的两套不同分析流程得到的结果相比,在丰度及家族/亚家族组成上无显著差异,在转座元件序列水平上也显示了高比例的相似性序列重叠,证实了本研究流程在基于高通量测序原始数据的转座元件分析方面具可靠性及实用性。 展开更多

关键词 蓝藻基因组 插入序列 IS家族 转座元件 Roche454测序原始数据

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植物转座元件及其表观遗传调控

18

作者 于海婵 张桂芳 张根发 《北京师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期54-59,共6页

植物的转座元件对于植物基因组的组成、进化和基因表达都具有重要影响.植物绝大部分的转座元件都处于沉默状态.植物机体通过一套识别转座元件并进行表观遗传沉默的有效机制,可逆地调控着转座元件的激活与沉默.本文综述了转座元件沉默和... 植物的转座元件对于植物基因组的组成、进化和基因表达都具有重要影响.植物绝大部分的转座元件都处于沉默状态.植物机体通过一套识别转座元件并进行表观遗传沉默的有效机制,可逆地调控着转座元件的激活与沉默.本文综述了转座元件沉默和激活的表观遗传机制. 展开更多

关键词 转座元件 转座子 表观遗传 表观遗传机制

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转座元件在植物生长发育中的作用

19

作者 王姗姗 《现代农业科技》 2017年第9期142-146,共5页

转座元件依据转座机制通常分为反转座子和DNA转座子2类。将关于反转座子、DNA转座子对于基因表达和植物生长发育的影响的研究进行总结,发现转座元件主要通过以下4种方式影响基因表达:第一,通过插入基因内部,破坏基因的完整结构从而使基... 转座元件依据转座机制通常分为反转座子和DNA转座子2类。将关于反转座子、DNA转座子对于基因表达和植物生长发育的影响的研究进行总结,发现转座元件主要通过以下4种方式影响基因表达:第一,通过插入基因内部,破坏基因的完整结构从而使基因失活,如插入到基因的外显子、内含子及5′UTR区;第二,通过插入到基因的调控区而影响基因的表达水平,包括插入到基因的启动子、增强子、衰减子区,或为基因表达提供新的启动子或cis作用位点作为增强子;第三,通过一系列表观遗传机制影响基因的表达,如DNA甲基化及Si RNA;第四,通过染色体重组、基因复制、基因丢失等机制影响基因的拷贝数及表达水平,甚至产生新的基因。 展开更多

关键词 转座元件 基因表达 表型 植物生长发育

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转座元件在不同人类基因组数据库中分布情况的研究

20

作者 曹单锋 胡智强 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1144-1148,共5页

在人类基因组中,大多数的基因都含有转座元件,但是转座元件在蛋白质编码区所占的比例大约只有1%。1%这个比例很可能是被低估的。我们系统分析了转座元件在不同的人类基因组注释数据库中的变化情况。在Ref Seq数据库中,0.43%的蛋白质编... 在人类基因组中,大多数的基因都含有转座元件,但是转座元件在蛋白质编码区所占的比例大约只有1%。1%这个比例很可能是被低估的。我们系统分析了转座元件在不同的人类基因组注释数据库中的变化情况。在Ref Seq数据库中,0.43%的蛋白质编码序列被转座元件覆盖,但在Ensembl数据库中,这一比例达到了1.30%。对于Ensembl特有的蛋白质编码区,转座元件的覆盖率达到了15.3%,远远高于在Ref Seq中所对应的比例(0.43%)。这些结果表明,未被识别出的蛋白质编码序列比现有的蛋白质编码序列含有更多的转座元件,这也预示着这些蛋白质编码序列将会更加难以被识别出来。 展开更多

关键词 转座元件 Ref Seq ENSEMBL

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