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酵母基因上游序列中潜在的转录正调控位点分析 被引量：6
1
作者 王秀荷 张静 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第10期953-958,共6页
前期研究表明,高效转录酵母基因内含子在序列长度、寡核苷酸使用、以及位置分布等方面都有着区别于低转录内含子的特征.进一步观察发现:上游基因间区域的序列长度与基因转录频率也有与内含子序列相同的现象,转录频率高的上游基因间序列... 前期研究表明,高效转录酵母基因内含子在序列长度、寡核苷酸使用、以及位置分布等方面都有着区别于低转录内含子的特征.进一步观察发现:上游基因间区域的序列长度与基因转录频率也有与内含子序列相同的现象,转录频率高的上游基因间序列一般都比转录频率低的长.对高效转录和低效转录上游基因间序列的寡核苷酸使用频率进行统计比较分析,抽提出高转录基因上游区可能的转录正调控元件.与酵母的所有非编码序列比较,这些可能的正调控元件基本上也是过表达的(over-represented),其中多数和实验所得的一些位点特征相吻合.这些元件富含G、C,这与内含子中可能的正调控元件在碱基组成上有一定的互补性.从这些特征看,高效转录基因上游的序列结构确实有利于基因的转录. 展开更多
关键词 酵母 基因上游 转录频率 调控位点 寡核苷酸频率分析
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3’非翻译区在转录后调控中的作用 被引量：1
2
作者 张陆 惠汝太 《中国分子心脏病学杂志》 CAS 2005年第4期619-625,共7页
从生物体的能量消耗最小化原则来讲,生理意义上的基因表达调控多发生在转录水平,尤其是转录伊始不难理解--这样可以避免进行无用的转录过程和mRNA的剪切工作,从而避免了大量的资源浪费.相应地,目前被人们所熟悉的基因表达调控位点几乎... 从生物体的能量消耗最小化原则来讲,生理意义上的基因表达调控多发生在转录水平,尤其是转录伊始不难理解--这样可以避免进行无用的转录过程和mRNA的剪切工作,从而避免了大量的资源浪费.相应地,目前被人们所熟悉的基因表达调控位点几乎都集中在基因的5'端,即转录调控的主要作用位置.然而基因不只有5'端序列,其3'端序列以长度推测亦应富含信息量.目前普遍被接受的一种观点是,基因的3'端,尤其是3'非翻译区涉及了基因转录后水平的调控过程,主要参与mRNA的稳定性、基因表达的定位以及翻译效率等生理进程的调控,具体可能在干细胞增殖分化、性别决定、神经元发生、血红细胞生成等过程中发挥作用. 展开更多
关键词 基因表达调控 转录水平 非翻译区 能量消耗 生理意义 mRNA 资源浪费 调控位点 转录调控 生物体
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金黄色葡萄球菌毒力基因的调控位点 被引量：3
3
作者 康斌 《国外医学（微生物学分册）》 1999年第3期22-26,共5页
金黄色葡萄球菌的许多致病因子受到细菌的多种遗传位点的调控,各调控位点之间存在复杂相互作用,各位点的突变可降低金黄色葡萄球菌的致病力。
关键词 金黄色葡萄球菌 毒力基因 调控位点
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K^+对促进甲基对硫磷水解酶催化活性的影响
4
作者 石诚 刘松 堵国成 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期8-12,共5页
甲基对硫磷水解酶(methyl parathion hydrolase,MPH)能催化甲基对硫磷等有机磷化合物中P-O、P-F、P-CN及P-S键的水解。该研究考查了K^+对MPH催化活性的影响,并分析了K+调控酶蛋白活性的作用位点。酶活分析显示,Pseudomonas sp.WBC-3 MP... 甲基对硫磷水解酶(methyl parathion hydrolase,MPH)能催化甲基对硫磷等有机磷化合物中P-O、P-F、P-CN及P-S键的水解。该研究考查了K^+对MPH催化活性的影响,并分析了K+调控酶蛋白活性的作用位点。酶活分析显示,Pseudomonas sp.WBC-3 MPH催化活性随K+浓度增加而迅速提高,MPH在3 mol/L K^+溶液中的催化活性较无K+条件下提高13.39倍。基于MPH进行分子动力学分析,建立了MPH氨基酸残基临近区域K+分布概率的预测方法。预测结果表明,1 mol/L K^+溶液中K+倾向分布于MPH的Asp、Glu、Gln及Asn残基附近,并降低了A85-T95与V323-N329区域的柔性。将A85-T95与V323-N329柔性变化最大的E94与N329分别突变为Ala,使MPH相对活性(1 mol/L K^+溶液/0 mol/LK^+溶液)分别较野生酶降低26%与33%;两者同时突变为Ala,其催化活性降低53%。上述结果表明,K^+通过与E94、N329相互作用来调控MPH催化,为其催化活性的分子改造提供了靶点。 展开更多
关键词 甲基对硫磷水解酶 K^+ 分子动力学 离子分布概率 调控位点
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酵母基因内含子中二聚体寡核苷酸转录调控位点的统计分析 被引量：4
5
作者 胡俊 张静 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第5期449-454,共6页
对高效和低效转录酵母基因内含子序列中寡核苷酸的出现频率进行对照分析 ,结果显示高效和低效内含子序列的结构有差异 ,而且高效转录内含子序列含有较多潜在的转录因子结合位点 .观察实验获得的转录调控位点 ,发现许多调控位点不是相邻... 对高效和低效转录酵母基因内含子序列中寡核苷酸的出现频率进行对照分析 ,结果显示高效和低效内含子序列的结构有差异 ,而且高效转录内含子序列含有较多潜在的转录因子结合位点 .观察实验获得的转录调控位点 ,发现许多调控位点不是相邻接的寡核苷酸 ,而是由一对保守寡核苷酸构成 ,这对寡核苷酸被一段长度固定的非保守区域间隔开 .于是对此形式的二聚体寡核苷酸 (dyad)在高效和低效内含子序列中出现的频率进行统计比较分析 ,抽提出在高效内含子组出现的频率显著高于在低效内含子组出现频率的二聚体寡核苷酸 ,分析这些二聚体寡核苷酸在两组内含子序列中的分布特征 ,并对照实验结果 。 展开更多
关键词 酵母 内含子 二聚体寡核苷酸 频率分析 转录调控位点
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核糖体蛋白基因上游转录调控元件协同作用的分析 被引量：1
6
作者 邵斌 《生物数学学报》 CSCD 北大核心 2010年第3期484-492,共9页
在对酵母基因上游区调控位点的研究中发现,具有高转录水平的基因几乎都是编码核糖体蛋白的,在低转录水平的基因中却没有发现核糖体蛋白基因,这一现象似乎提示着核糖体蛋白基因上游序列中含有较多潜在的有利于基因转录的转录因子结合位点... 在对酵母基因上游区调控位点的研究中发现,具有高转录水平的基因几乎都是编码核糖体蛋白的,在低转录水平的基因中却没有发现核糖体蛋白基因,这一现象似乎提示着核糖体蛋白基因上游序列中含有较多潜在的有利于基因转录的转录因子结合位点.为了能对核糖体蛋白基因上游序列有一个系统全面的认识,本文采用多种统计方法从不同角度探测了核糖体蛋白基因上游序列中潜在的转录正调控位点,并对它们之间可能存在的协同作用模式进行了分析. 展开更多
关键词 核糖体蛋白基因 基因上游 寡核苷酸 频率分析 转录调控位点 协同作用
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人体Notch家族4种蛋白的结构与功能比较 被引量：2
7
作者 卢庭婷 《医学分子生物学杂志》 CAS 2013年第5期304-310,共7页
在生命有机体内，Notch信号通路是一类非常重要的通路。在哺乳动物中，特别是在人类中，存在有4种不同功能的Notch蛋白（Notch1、2、3、4）。Notch蛋白与肿瘤的发生、发展密切相关，将从4种Notch蛋白的结构域、结合位点、调控上游位点... 在生命有机体内，Notch信号通路是一类非常重要的通路。在哺乳动物中，特别是在人类中，存在有4种不同功能的Notch蛋白（Notch1、2、3、4）。Notch蛋白与肿瘤的发生、发展密切相关，将从4种Notch蛋白的结构域、结合位点、调控上游位点及组织特异性方面来阐述它们之间的相似点和差异。 展开更多
关键词 NOTCH信号通路 结构域 结合位点 调控上游位点 组织特异性
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酿酒酵母转录调控位点生物信息学研究进展
8
作者 梁丽静 《生物技术世界》 2013年第3期7-7,共1页
随着转录调控网络成为后基因组时代研究的最重要的问题之一,研究转录因子结合位点对此有着重要意义,生物信息学在转录因子结合位点的研究中也发挥着越来越关键的作用。方法:本文对目前研究最早最成熟的真核模式生物酿酒酵母基因组转录... 随着转录调控网络成为后基因组时代研究的最重要的问题之一,研究转录因子结合位点对此有着重要意义,生物信息学在转录因子结合位点的研究中也发挥着越来越关键的作用。方法:本文对目前研究最早最成熟的真核模式生物酿酒酵母基因组转录调控位点生物信息学研究现状进行分析。结果:本文总结了常用的转录因子相关的数据库、转录因子结合位点的表示方法、预测算法,并简要阐述了调控网络的类型和研究现状。结论:本研究结果为深入研究真核生物的转录水平调控模式奠定理论基础。 展开更多
关键词 酿酒酵母 转录调控位点 生物信息学
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