乙型肝炎病毒新开放读码框架的确定及其意义 被引量：11

1

作者 董菁 成军 杨倩 《世界华人消化杂志》 CAS 2004年第4期757-762,共6页

乙型肝炎病毒(HBV)是一种嗜肝部分双链DNA病毒,基因组长度只有3.2 kb,结构基因与调节基因序列之间重叠, 甚至结构基因序列之间重叠,因此HBV DNA序列的利用率之高实属罕见.1979年首次报告HBV DNA的全基因序列并确定4个主要的开放读码框架... 乙型肝炎病毒(HBV)是一种嗜肝部分双链DNA病毒,基因组长度只有3.2 kb,结构基因与调节基因序列之间重叠, 甚至结构基因序列之间重叠,因此HBV DNA序列的利用率之高实属罕见.1979年首次报告HBV DNA的全基因序列并确定4个主要的开放读码框架(ORF)之后,一直沿用至今. 我们在中国流行株HBV基因序列的分析中,在前-Sl和X 基因之前,分别发现了2段编码基因序列:前-前-S基因长度135 bp,编码产物为45 aa;前-X基因长度168 bp, 编码产物为56 aa.在前-前-S基因、前-X基因的上游存在启动子序列,具有指导报告基因表达的活性.对15例慢性乙型肝炎(CHB)患者基因型C型9例、B型1例、B/C混合型5例,共31个克隆测序结果,发现均存在前-前-S基因区.17例CHB患者A型1例、B型3例、C型10例、B/ C混合型3例,共测序45个克隆,C型编码前-X区的克隆数占总编码克隆数的60%,C型不能编码前-X区的原因主要是A2608→C/T替换突变或C/A2733→T替换突变单一突变;而B型、B/C型都不能编码前-X区蛋白,主要因为双突变的存在.在HBV基因组中发现前-前-S和前-X基因序列的存在改写了HBV DNA编码基因序列研究的历史. 展开更多

关键词 乙型肝炎病毒 HBV 读码框架 DNA病毒 基因序列

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应用生物信息学方法分析人HCA56基因 被引量：9

2

作者 杨美香 曲迅 +2 位作者 韩克军 冯进波 陈慰峰 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2005年第2期169-172,共4页

目的利用生物信息学对新克隆的人ligatin样基因HCA 5 6的基因和蛋白序列进行分析,探讨生物信息学在新基因研究中的作用。方法以人类基因组数据库为基础,利用电子PCR和SAGE数据库对HCA 5 6进行染色体定位和组织表达分布分析;BLAST程序进... 目的利用生物信息学对新克隆的人ligatin样基因HCA 5 6的基因和蛋白序列进行分析,探讨生物信息学在新基因研究中的作用。方法以人类基因组数据库为基础,利用电子PCR和SAGE数据库对HCA 5 6进行染色体定位和组织表达分布分析;BLAST程序进行HCA 5 6的基因结构分析和相似序列搜索;ORFfinder和GeneRunner3 0 5程序对HCA 5 6编码蛋白进行序列预测和功能分析。结果得出HCA 5 6的全长cDNA为2 0 2 1bp ,定位于染色体1q31 q32 ,其最长的开放读码框架为175 5bp ,编码5 84个氨基酸,编码氨基酸含有一个亮氨酸拉链和一假定的RNA结合保守序列。相似性搜索发现HCA 5 6基因片段与人ligatin基因片段具有很高的相似性(99% )。SAGE结果显示HCA 5 6在多种组织中都有表达。结论生物信息学是进行新基因研究的有效方法;HCA 5 6很可能是ligatin的全长编码基因。 展开更多

关键词 生物信息学 新基因 蛋白序列 读码框架 编码基因 表达 方法分析 SAGE 人类基因组 序列预测

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人胸苷激酶基因cDNA克隆 被引量：7

3

作者 丁克祥 郑永晨 +4 位作者 吴朝阳 王攀 张杰 胡燕祝 吕沅津 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第10期932-934,共3页

目的　克隆人胸苷激酶基因cDNA。方法采用逆转录PCR方法扩增胸苷激酶cDNA ,用十二烷基氟波酯 (TPA)刺激人外周血细胞的mRNA为模板 ;扩增的PCR产物经TA克隆重组和内切酶鉴定 ,以及DNA序列分析确定克隆基因的序列。结果经逆转录PCR扩增出... 目的　克隆人胸苷激酶基因cDNA。方法采用逆转录PCR方法扩增胸苷激酶cDNA ,用十二烷基氟波酯 (TPA)刺激人外周血细胞的mRNA为模板 ;扩增的PCR产物经TA克隆重组和内切酶鉴定 ,以及DNA序列分析确定克隆基因的序列。结果经逆转录PCR扩增出一个 70 0bp左右的DNA片段 ,TA克隆出现 1 6个阳性克隆 ,选择其中的一个克隆 (TKTA8)进行DNA序列分析 ,序列分析结果表明TKTA8克隆重组的序列是人胸苷激酶的cDNA序列。结论从外周血细胞中得到了hTK完整的开放读码框架。 展开更多

关键词 胸苷激酶基因 逆转录PCR 扩增 DNA序列分析 克隆基因 人外周血 读码框架 阳性克隆 CDNA克隆 PCR产物

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开放读码框架50基因介导HIV-1感染相关的肝细胞生长因子诱导人类疱疹病毒8型复制 被引量：1

4

作者 卢春 曾怡 +1 位作者 钱超 唐桂霞 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期184-188,共5页

目的　研究人类疱疹病毒 8型 (HHV 8)开放读码框架 (ORF) 5 0基因启动子在HIV 1感染相关细胞因子肝细胞生长因子 /驱散因子 (HGF/SF)诱导原发性渗出性淋巴瘤 (PEL)BC 3中潜伏感染的HHV 8复制过程中的作用。方法　将HGF/SF连续加入到体... 目的　研究人类疱疹病毒 8型 (HHV 8)开放读码框架 (ORF) 5 0基因启动子在HIV 1感染相关细胞因子肝细胞生长因子 /驱散因子 (HGF/SF)诱导原发性渗出性淋巴瘤 (PEL)BC 3中潜伏感染的HHV 8复制过程中的作用。方法　将HGF/SF连续加入到体外培养的BC 3中 ,分别于培养第 3天和第 7天收集刺激细胞 ,电子显微镜观察成熟HHV 8病毒的形成 ;提取细胞总RNA ,North ernblot和定量聚合酶链反应 (PCR)法检查HHV 8次要衣壳蛋白ORF2 6mRNA转录。同时 ,将已构建的HHV 8ORF5 0启动子 +虫荧光素酶报告基因重组质粒和含HIV 1Tat基因重组表达质粒分别共转染BC 3和人脐静脉血管内皮细胞 (HUVECs) ,转染后 2 4h加入HGF/SF和 /或重组HIV 1gp12 0刺激 ,刺激后 2 4h收集细胞 ,进行虫荧光素酶活性检测。试验同时以佛波酯 (TPA)刺激为阳性对照。结果　HGF/SF可以上调HHV 8ORF2 6mRNA表达 ,且于刺激的第 7天 ,ORF2 6mRNA表达上升了 4 .1倍 ,BC 3细胞中同时可观察到成熟的HHV 8病毒粒子 ;HGF/SF能够诱导ORF5 0启动子活性 ,但HIV 1Tat和 gp12 0蛋白与HGF/SF协同上调ORF5 0启动子活性的能力较弱。 结论　HIV 1感染相关细胞因子HGF/SF诱导HHV 8复制的过程至少有部分由ORF5 0启动子介导。 展开更多

关键词 疱疹病毒 读码框架 肝细胞生长因子 启动区 病毒复制

原文传递

遗传语言中的偏好模与读码框架 被引量：1

5

作者 罗辽复 纪丰民 《内蒙古大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 1997年第1期54-61,共8页

评述了ＤＮＡ核苷酸关联的几种研究途径．重点研究了偏好模分析方法，讨论了它与信息参数的联系．发现了编码区偏好用Ｓ－Ｗ（强弱键）语言，而非编码区偏好用Ｒ－Ｙ（嘌呤嘧啶）语言，解释了这种区分的意义．找到了编码区常用模（＊Ｗ... 评述了ＤＮＡ核苷酸关联的几种研究途径．重点研究了偏好模分析方法，讨论了它与信息参数的联系．发现了编码区偏好用Ｓ－Ｗ（强弱键）语言，而非编码区偏好用Ｒ－Ｙ（嘌呤嘧啶）语言，解释了这种区分的意义．找到了编码区常用模（＊ＷＳ）的规律性，指出这种偏好性可能与ｔ－ＲＮＡ丰度有关．研究了如何寻找读码框架及非编码区中是否存在隐蔽框架的问题． 展开更多

关键词 遗传语言 偏好模 读码框架 核苷酸关联 DNA

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丙型肝炎病毒基因编码的蛋白及其功能 被引量：1

6

作者 段学章 庄辉 《国外医学（病毒学分册）》 2002年第3期82-85,共4页

关键词 丙型肝炎病毒 白及 HCV 基因编码 前体蛋白 读码框架 非编码区 碱基对 基因组 RNA

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人巨细胞病毒DNA序列多态性及其意义

7

作者 卢颖 阮强 《锦州医学院学报》 2004年第5期54-57,共4页

关键词 人巨细胞病毒 多态性 读码框架 DNA病毒 HCMV DNA序列 疱疹病毒 亚科 双链 基因组

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HCV感染的血清学和病毒学试验

8

作者 陆志檬 《肝脏》 1996年第3期177-179,共3页

丙型肝炎病毒(HCV)是有囊膜的RNA病毒，属黄病毒科，它的基因组是由一条至少10000个核苷酸组成的正单链RNA，为一个连续翻译的开放读码框架(ORF)。编码一长约3011个氨基酸的多聚蛋白．经加工切割后分离为结构蛋白和非结构蛋白。

关键词 HCV感染 病毒学 血清学 读码框架 丙型肝炎病毒 囊膜 非结构蛋白 RNA 单链 核苷酸

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克隆基因的表达

9

作者 曹明富 《杭州师范学院学报》 1988年第6期79-88,共10页

外源基因在新的遗传背景中要成功地表达,取决于基因在新的宿主细胞内能有效地转录正确地翻译及异源蛋白质不被酶水解。基因转录水平的高低决定于克隆基因使用的启动子和基因拷贝数。基因在新宿主内表达效率的高低取决于mRNA的有效翻译... 外源基因在新的遗传背景中要成功地表达,取决于基因在新的宿主细胞内能有效地转录正确地翻译及异源蛋白质不被酶水解。基因转录水平的高低决定于克隆基因使用的启动子和基因拷贝数。基因在新宿主内表达效率的高低取决于mRNA的有效翻译、翻译后的蛋白质在细胞内的稳定性、mRNA的SD顺序与翻译起始密码AUG间的间距及附近的核苷酸结构、顺序和mRNA简并密码子选用频率等因素。因此在基因操作中要精密设计合适的载体DNA顺序,组装入最理想的基因调控元件、保持克隆基因原有的读码框架,以获得所需要的功能蛋白质。 展开更多

关键词 基因转录 基因调控 启动子 外源基因 MRNA 宿主细胞 蛋白质 遗传背景 有效翻译 读码框架

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戊型肝炎病毒结构区ORF2蛋白在巴氏毕赤酵母中的胞内表达与纯化的初步研究 被引量：11

10

作者 佟玉品 毕胜利 +1 位作者 江永珍 詹美云 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期34-37,共4页

为寻求新型表达系统来研制戊型肝炎基因工程疫苗 ,利用甲醇营养型酵母 pichiapastoris表达系统表达戊型肝炎病毒 (HEV)结构区ORF2蛋白。采用PCR方法从HEVcDNA中扩增得到的ORF2基因克隆到酵母表达载体pPIC3.5K上 ,构建成重组质粒 pPIC3.5... 为寻求新型表达系统来研制戊型肝炎基因工程疫苗 ,利用甲醇营养型酵母 pichiapastoris表达系统表达戊型肝炎病毒 (HEV)结构区ORF2蛋白。采用PCR方法从HEVcDNA中扩增得到的ORF2基因克隆到酵母表达载体pPIC3.5K上 ,构建成重组质粒 pPIC3.5KORF2。该质粒转化酵母菌GS115 ,经G418筛选得到高拷贝转化子。转化菌株经Mut表型鉴定后 ,用含甲醇的培养基诱导表达 ,SDS PAGE及ELISA筛选高表达活性菌株 ,放大培养后进行亲合层析纯化。在该系统中成功地表达了高生物活性的HEVORF2蛋白 ,经亲和层析纯化后扫描分析重组蛋白分子量约为 5 9kD ,纯度可达 96 %。Westernblotting证实 ,它与HEVORF2单克隆抗体有特异性反应。HEV结构区ORF2蛋白在甲醇营养型酵母中的成功表达 ,以及初步纯化得到的具有强免疫学活性的重组蛋白 。 展开更多

关键词 戊型肝炎病毒 开放读码框架 异源基因表达 蛋白纯化 巴氏毕赤酵母 胞内表达

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新型冠状病毒感染诊疗方案(试行第十版) 被引量：6

11

《心肺血管病杂志》 CAS 2023年第1期1-8,共8页

为进一步做好新型冠状病毒感染(COVID-19)诊疗工作,我们组织专家在《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第九版)》基础上,制定了《新型冠状病毒感染诊疗方案(试行第十版)》。一、病原学特点新型冠状病毒(以下简称新冠病毒,SARS-CoV-2)为β... 为进一步做好新型冠状病毒感染(COVID-19)诊疗工作,我们组织专家在《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第九版)》基础上,制定了《新型冠状病毒感染诊疗方案(试行第十版)》。一、病原学特点新型冠状病毒(以下简称新冠病毒,SARS-CoV-2)为β属冠状病毒,有包膜,颗粒呈圆形或椭圆形,直径60~140nm,病毒颗粒中包含4种结构蛋白:刺突蛋白(spike,S)、包膜蛋白(envelope,E)、膜蛋白(membrane,M)、核壳蛋白(nucleocapsid,N)。新型冠状病毒基因组为单股正链RNA,全长约29.9kb,基因组所包含的开放读码框架依次排列为5′-复制酶(ORF1a/ORF1b)-S-ORF3a-ORF3b-E-M-ORF6-ORF7a-ORF7b-ORF8-N-ORF9a-ORF9b-ORF10-3′。 展开更多

关键词 冠状病毒感染 开放读码框架 病毒颗粒 ORF3 复制酶 结构蛋白 诊疗方案 诊疗工作

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痘苗病毒天坛株基因组旁侧区结构及开放读码框架的分析 被引量：8

12

作者 金奇 陈南海 +2 位作者 姚二梅 黄静 侯云德 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第1期1-5,共5页

本文分析了我国痘苗病毒天坛株基因组两端的ＨｉｎｄⅢ－Ｃ和－Ｂ片段所编码的多肽，并与其他痘苗病毒株和正痘病毒进行了比较。结果表明，天坛株基因组ＨｉｎｄＩＩ－Ｃ和－Ｂ片段共有４６个主要的开放读码框架（ＰＲＦｓ），其中一个... 本文分析了我国痘苗病毒天坛株基因组两端的ＨｉｎｄⅢ－Ｃ和－Ｂ片段所编码的多肽，并与其他痘苗病毒株和正痘病毒进行了比较。结果表明，天坛株基因组ＨｉｎｄＩＩ－Ｃ和－Ｂ片段共有４６个主要的开放读码框架（ＰＲＦｓ），其中一个ＯＲＦ属于痘苗病毒基因组中第一次发现的与天花病毒相似的基因编码区。此外，天坛株基因组丝氨酸蛋白酶抑制剂Ⅱ的编码区由于移码变异而分成两个不同ＯＲＦｓ。与其他痘苗病毒株相比，天坛株基因组有多个ＯＲＦｓ的缺失，以上现象提示，天坛株在生物学性状上与其他毒株的差异可能与此有关。 展开更多

关键词 痘苗病毒 天坛株 基因组 旁侧区 开放读码框架

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LincRNA-PVT1在甲状腺癌组织中的表达及意义 被引量：8

13

作者 翁侠 洪晓明 《实用肿瘤杂志》 CAS 2017年第1期57-61,共5页

目的研究长链非编码RNA-PVT1(large intergenic non-coding RNA-PVT1,LincRNA-PVT1)在甲状腺癌中的表达及意义。方法选取甲状腺癌组织70例,甲状腺良性结节组织50例,分别选取距离肿瘤(良性结节)边缘>2 cm的癌旁(结节旁)组织作为对照。... 目的研究长链非编码RNA-PVT1(large intergenic non-coding RNA-PVT1,LincRNA-PVT1)在甲状腺癌中的表达及意义。方法选取甲状腺癌组织70例,甲状腺良性结节组织50例,分别选取距离肿瘤(良性结节)边缘>2 cm的癌旁(结节旁)组织作为对照。SYBR green实时荧光定量PCR法检测LincRNA-PVT1在甲状腺癌、癌旁、良性结节和结节旁4类组织中的相对表达量,分析甲状腺癌中LincRNA-PVT1的相对表达与临床病理特征的关联。结果甲状腺癌、癌旁、良性结节、结节旁组织中LincRNA-PVT1的相对表达量分别为3.27±0.43、2.39±0.99、2.57±0.54、2.45±0.76,甲状腺癌组织中PVT1的相对表达量高于其他三组(均P<0.05),其他三组间比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。甲状腺癌中LincRNA-PVT1的相对表达量在TNM分期方面差异具有统计学意义(P<0.05),而在年龄、性别、游离三碘甲原氨酸(free triiodothyronine antigen,FT3)水平方面差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论 LincRNA-PVT1在甲状腺癌组织中表达升高,其表达与患者TNM分期有关。 展开更多

关键词 甲状腺肿瘤/病理学 开放读码框架 基因表达 基因表达调控

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RT-nPCR检测屠宰场胆汁中猪戊型肝炎病毒 被引量：6

14

作者 张维谊 刘健 +1 位作者 鞠厚斌 周锦萍 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2009年第11期29-31,共3页

关键词 戊型肝炎病毒 PCR检测 屠宰场 中猪 胆汁 开放读码框架 virus ORF2

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天津地区汉坦病毒分离株TJJ16 S基因片段克隆和序列分析 被引量：5

15

作者 李力 杨东靖 +4 位作者 陈锦英 丁建清 苏旭 田永琴 魏骏飞 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期652-655,共4页

目的了解天津地区汉坦病毒分离株TJJ16S基因的分子特征。方法采用细胞培养法从鼠肺标本中分离汉坦病毒,命名为TJJ16,提取TJJ16感染VeroE6细胞的总RNA,经逆转录扩增病毒cDNA,继而进行PCR扩增S基因片段,纯化后克隆于pMD18T载体,测定核苷... 目的了解天津地区汉坦病毒分离株TJJ16S基因的分子特征。方法采用细胞培养法从鼠肺标本中分离汉坦病毒,命名为TJJ16,提取TJJ16感染VeroE6细胞的总RNA,经逆转录扩增病毒cDNA,继而进行PCR扩增S基因片段,纯化后克隆于pMD18T载体,测定核苷酸序列并进行分析。结果天津地区首次从社鼠中分离出汉坦病毒TJJ16,其S基因片段全序列长为1701nt。只有1个编码N蛋白的开放读码框架(ORF),起始密码子为第37nt,终止于1326nt,推导其编码的蛋白长为429个氨基酸。经核苷酸系统发生树分析,TJJ16株应归属为汉坦病毒的汉滩型(HTN型)毒株,与HTN型新亚型A16株同属一个亚型。结论TJJ16病毒株的分离与S基因片段序列分析,证实在天津市鼠间存在HTN型汉坦病毒感染,对临床和流行病学的研究具有重要意义。 展开更多

关键词 汉坦病毒 S基因片段 序列分析 病毒分离株 天津地区 汉坦病毒感染 VERO-E6细胞 核苷酸序列 克隆 开放读码框架

原文传递

单纯疱疹病毒2型潜伏相关转录体开放读码框3对Vero细胞凋亡的影响 被引量：4

16

作者 杨慧兰 薛礼长 +3 位作者 樊建勇 张发洲 龙朝钦 张玲 《中华皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期186-190,共5页

目的研究单纯疱疹病毒2型（HSV-2）潜伏相关转录体（LAT）开放读码框3（ORF3）对顺铂诱导的非洲绿猴肾细胞（Vero细胞）凋亡的影响。方法构建重组质粒pEGPF—ORF3，并转染Vero细胞，逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）验证目的基因的表达。... 目的研究单纯疱疹病毒2型（HSV-2）潜伏相关转录体（LAT）开放读码框3（ORF3）对顺铂诱导的非洲绿猴肾细胞（Vero细胞）凋亡的影响。方法构建重组质粒pEGPF—ORF3，并转染Vero细胞，逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）验证目的基因的表达。顺铂诱导Vero细胞凋亡，通过荧光显微镜观察凋亡小体，Giemsa染色检测细胞核形态，噻唑蓝法（MTr法）检测细胞增殖，流式细胞仪分析细胞凋亡情况。实验结果采用SPSSl3．0进行分析，各组间两两比较采用单因素方差分析和t检验。结果成功克隆HSV-2333株ORF3基因，构建pEGFP—ORF3真核表达载体，RT—PCR验证该真核表达载体能在Vero细胞中高效表达。转染pEGFP—ORF3的Vero细胞经顺铂诱导凋亡后Giemsa染色，显示胞核蓝染，胞质淡浅，细胞形态正常。M．rr法分析显示，细胞增殖在转染pEGFP—ORF3组（2．56±0．21）与未经任何处理的正常对照组（2．66±0．13）比较，差异无统计学意义（P〉0．05），但高于顺铂诱导凋亡的正常对照组（1．65±0．11）和pEGFP—C2组（1．56±0．18），差异均有统计学意义（P〈0．05）；流式细胞仪分析细胞凋亡率，转染pEGFP—ORF3组（4．03％±1．04％）与正常对照组（2．13％±0．09％）比较，差异无统计学意义（P〉0．05），但低于空质粒pEGFP—C2组（19．45％±2．05％），且差异有统计学意义（P〈0．05）。结论HSV-2LATORF3在Vero细胞中具有抗顺铂诱导的凋亡作用。 展开更多

关键词 疱疹病毒2型 人 开放读码框架 潜伏相关转录体 Vero细胞 顺铂 细胞凋亡

原文传递

片段的序列测定与分析 被引量：3

17

作者 金宁一 郭志儒 +2 位作者 罗坤 石毅 殷震 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 1999年第17期1826-1831,共6页

对经亚克隆后的鸡痘病毒 (fowlpoxvirus,FPV) 2 82E4株 7.3kbBamHⅠ片段 ,用ABI377DNA测序仪荧光标记法进行了序列测定 ,并应用DNAsis软件同GenBank中已知的FPV序列和痘苗病毒 (vacciniavirus,VV)Copenhagen株的全序列进行了同源性比较 ... 对经亚克隆后的鸡痘病毒 (fowlpoxvirus,FPV) 2 82E4株 7.3kbBamHⅠ片段 ,用ABI377DNA测序仪荧光标记法进行了序列测定 ,并应用DNAsis软件同GenBank中已知的FPV序列和痘苗病毒 (vacciniavirus,VV)Copenhagen株的全序列进行了同源性比较 ,发现与鸡痘病毒MunichHP 438株 1 1 .2kbBamHⅠ片段的序列同源 .此外 ,对所测序列的开放读码框架 (openreadingframes,ORFs)所编码的氨基酸序列同上述VV株中所有ORF的氨基酸序列进行了同源性比较 ,并对各ORF编码蛋白的信号肽。 展开更多

关键词 鸡痘病毒 基因组片段 序列分析 开放读码框架

原文传递

感染人类的Borna病毒第二开放读码框架的核苷酸序列及其变异

18

作者 谢鹏 岩田泰秀 +1 位作者 高桥和郎 森则夫 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 1997年第4期355-357,共3页

对经套式逆转录－聚合酶链反应（ｎｅｓｔｅｄＲＴ－ＰＣＲ）证实周围血单核细胞（ＰＢＭＣ）中存在Ｂｏｒｎａ病毒（ＢＤＶ）第二开放读码框架（ＯＲＦⅡ）基因片段的５例精神病人和３例健康献血者共４０个样品进行测序，并与ＢＤＶ／... 对经套式逆转录－聚合酶链反应（ｎｅｓｔｅｄＲＴ－ＰＣＲ）证实周围血单核细胞（ＰＢＭＣ）中存在Ｂｏｒｎａ病毒（ＢＤＶ）第二开放读码框架（ＯＲＦⅡ）基因片段的５例精神病人和３例健康献血者共４０个样品进行测序，并与ＢＤＶ／ＭＤＣＫ（Ｍａｄｉｎ－Ｄａｒｂｙｃａｎｎｉｎｅｋｉｄｎｅｙ）标准病毒株比较。结果发现，所有样品在１１个核苷酸位点与文献报道的ＨＥ８０－１病毒株比较有点变异，但来源于人类的样品与ＢＤＶ／ＭＤＣＫ株之间无差异。２例情感障碍病人的１０个样品在１７０１位点处出现Ｔ→Ｃ的转换，３例健康献血者的１５个样品在１６９６位点处出现Ａ→Ｔ的转换。 展开更多

关键词 Borna病毒 核苷酸类分析 病毒基因 开放读码框架

原文传递

新型戊肝病毒ORF3和部分ORF1基因的序列分析 被引量：2

19

作者 王佑春 张华远 +3 位作者 辜文杰 RogerLing 李河民 TimJHarrison 《中国病毒学》 CSCD 2001年第1期28-33,共6页

用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因... 用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因型 ,但不同于已报道的HEVI型、II型和III型 ,为一新的基因型。T1和T11与I型在该区的核苷酸同源性为 79%～ 82 % ;与II型的同源性为 80 %～ 81% ;和III型的同源性为 83%～ 85 % 展开更多

关键词 戊型肝炎病毒 基因型 同源性 开放读码框架 序列分析

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乙肝病毒基因型的研究现状 被引量：2

20

作者 王道理 张建军 《泸州医学院学报》 2006年第3期271-273,共3页

关键词 乙肝病毒基因型 乙型肝炎病毒(HBV) HBV感染者 开放读码框架 DNA病毒 基因组结构 双链DNA HBV复制 慢性肝病 细胞核内

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