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2018-2020年上海市5岁以下住院儿童病毒性腹泻病原学特征分析 被引量:13
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作者 匡小舟 肖文佳 +3 位作者 刘捷宸 张曦 滕峥 潘浩 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1069-1074,共6页
目的对2018—2020年上海市5岁以下感染性肠胃炎住院患儿进行主要病毒病原学检测,了解目标人群中病毒的分子流行病学迁移变化特征,为病毒性腹泻的防控和疫苗研发及应用提供数据支撑。方法采集上海市某儿科医院5岁以下腹泻住院患儿的粪便... 目的对2018—2020年上海市5岁以下感染性肠胃炎住院患儿进行主要病毒病原学检测,了解目标人群中病毒的分子流行病学迁移变化特征,为病毒性腹泻的防控和疫苗研发及应用提供数据支撑。方法采集上海市某儿科医院5岁以下腹泻住院患儿的粪便标本,并收集相关流行病学资料。采用ELISA、荧光PCR以及巢式PCR方法对轮状病毒、杯状病毒(包括诺如病毒和札如病毒)、星状病毒和肠道腺病毒进行检测和分子分型。结果共采集粪便标本805份(男性543份,女性262份),病毒检出率为47.33%,检出率最高的病毒为杯状病毒(31.18%),其次为A组轮状病毒(17.64%);杯状病毒中诺如病毒GⅡ型的占比最高(95.62%)。轮状病毒以G9P[8]为主要流行型别(占比90.85%)。诺如病毒GⅡ型以GⅡ.4[P31]和GⅡ.3[P12]为主要流行株(占比分别为32.08%和19.58%);但2020年以来,新兴亚型GⅡ.4[P16]和GⅡ.2[P16]检出率明显高于2018和2019年(χ^(2)=17.337,P<0.001;χ^(2)=11.044,P=0.001)。此外本地首次从1名4月龄患儿粪便中发现1株乐儿德轮状病毒疫苗株。结论杯状病毒检出率高于轮状病毒的趋势加剧,使杯状病毒(主要是诺如病毒)疫苗的研发和上市需求愈发迫切。研究首次揭示了住院儿童中诺如病毒GⅡ型的主要流行和新兴亚型,为多效价的诺如疫苗研发提供了参考依据。轮状病毒G9型别近年检出率升高,需要对轮状病毒型别变化保持警戒、追踪和深究。 展开更多
关键词 婴幼儿 住院 病毒性腹泻 A组轮状病毒 病毒g
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诺如病毒GⅡ型流行病学研究进展 被引量:7
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作者 于晓楠 王斌 《健康教育与健康促进》 2020年第6期648-651,共4页
诺如病毒是导致人类非细菌性急性胃肠炎的主要病原体之一,给全球的社会医疗和公众健康带来了严重负担。监测显示,全球75%~100%的诺如病毒病例都是由GⅡ型引起。诺如病毒GⅡ型急性肠胃炎已成为公共卫生领域的热点问题。本文对诺如病毒G... 诺如病毒是导致人类非细菌性急性胃肠炎的主要病原体之一,给全球的社会医疗和公众健康带来了严重负担。监测显示,全球75%~100%的诺如病毒病例都是由GⅡ型引起。诺如病毒GⅡ型急性肠胃炎已成为公共卫生领域的热点问题。本文对诺如病毒GⅡ型病原学、流行概况及流行病学特征等方面研究进行综述。 展开更多
关键词 病毒g 流行特征 研究进展
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2021—2022年上海<5岁住院儿童病毒性腹泻的病原学特征
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作者 匡小舟 肖文佳 +2 位作者 潘浩 陈敏 滕峥 《上海预防医学》 CAS 2024年第2期143-149,共7页
【目的】了解新型冠状病毒感染(简称“新冠”)疫情防控期间住院儿童病毒性腹泻病原谱变化及主要病原体基因型别的流行变迁。【方法】采集上海市某哨点儿科医院本地<5岁腹泻住院患儿的粪便标本,采用荧光聚合酶链反应(PCR)方法对轮状... 【目的】了解新型冠状病毒感染(简称“新冠”)疫情防控期间住院儿童病毒性腹泻病原谱变化及主要病原体基因型别的流行变迁。【方法】采集上海市某哨点儿科医院本地<5岁腹泻住院患儿的粪便标本,采用荧光聚合酶链反应(PCR)方法对轮状病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒和肠道腺病毒进行分子检测,对主要病原体进行分子分型和序列分析。【结果】共收集546份标本,总体病毒阳性检出率为37.55%,依次为诺如病毒GⅡ型(22.16%)、A组轮状病毒(16.12%)、星状病毒(2.93%)、肠道腺病毒(2.38%)、札如病毒(0.92%)和诺如病毒GⅠ型(0.18%)。诺如病毒GⅡ型以GⅡ.4[P31]和GⅡ.4[P16]为主要流行株(占比分别为24.79%和14.05%),其中GⅡ.4[P31]检出占比明显下降(χ2=16.140,P<0.001)。此外,还发现国内罕见轮状病毒基因型G8P[8]型在本地的首次流行,且占比呈上升趋势,总体达到7.95%。该基因型代表株在基因进化分析上与东南亚的DS⁃1⁃like G8P[8]毒株进化距离更近。【结论】诺如病毒基因亚型的分布变化和轮状病毒罕见型别的发现都凸显持续性病原监测和基因分型检测的重要性。少见株的本地化流行对上市疫苗的效果评价和潜在疫苗的开发提出了新的要求。 展开更多
关键词 住院儿童 A组轮状病毒 基因 病毒g
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实时逆转录环介导等温扩增检测GⅡ.4型诺如病毒的研究 被引量:3
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作者 赵剑虹 张登城 +3 位作者 高艳 焦洋 张士尧 李书明 《中国卫生检验杂志》 CAS 2018年第8期945-948,960,共5页
目的建立快速检测诺如病毒GⅡ.4型的实时逆转录环介导等温扩增方法(RT-LAMP)。方法选取GⅡ.4型诺如病毒的ORF1与ORF2接头处较为保守的基因序列设计RT-LAMP引物并进行筛选,优化反应条件,分析方法的灵敏度、分析特异性和稳定性,采用优化... 目的建立快速检测诺如病毒GⅡ.4型的实时逆转录环介导等温扩增方法(RT-LAMP)。方法选取GⅡ.4型诺如病毒的ORF1与ORF2接头处较为保守的基因序列设计RT-LAMP引物并进行筛选,优化反应条件,分析方法的灵敏度、分析特异性和稳定性,采用优化的方法检测40例临床病毒性腹泻样本,结果与实时荧光逆转录PCR(RT-PCR)比较。结果该研究建立的诺如病毒GⅡ.4型RT-LAMP的最佳反应温度为65℃;该方法检测GⅠ型和GⅡ非诺如病毒4型、轮状病毒、札如病毒、星状病毒、腺病毒、CA16、EV71、CA6和CA10等常见10种其他腹泻病毒的结果为阴性;该方法对诺如病毒GⅡ.4型的检测能力与实时荧光RT-PCR相当;与实时荧光RT-PCR相比,该研究建立的RT-LAMP法检测诺如病毒GⅡ.4型阳性样本和诺如病毒阴性样本的符合率为100%。结论该研究建立的诺如病毒GⅡ.4型RT-LAMP快速检测方法灵敏度高,特异性好,为建立诺如病毒其他基因型的RT-LAMP检测方法奠定了基础。 展开更多
关键词 病毒g.4 实时逆转录环介导等温扩增 检测
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青岛市GⅡ.15型诺如病毒的分子流行病学特征
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作者 赵丹 于维森 +3 位作者 张晓月 苏志磊 孙睿 汪照国 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 2019年第12期754-759,共6页
目的了解青岛市GⅡ.15型诺如病毒的分子流行病学特征。方法收集2016年1月至2018年12月青岛市疑似诺如病毒腹泻患者的粪便标本1412份,采用实时定量聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)进行诺如病毒检测,反转录PCR扩增诺如病毒... 目的了解青岛市GⅡ.15型诺如病毒的分子流行病学特征。方法收集2016年1月至2018年12月青岛市疑似诺如病毒腹泻患者的粪便标本1412份,采用实时定量聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)进行诺如病毒检测,反转录PCR扩增诺如病毒可读框1和2结合区基因片段和VP1基因全长,进行序列测定、系统进化分析和同源建模。结果共7株GⅡ.15型诺如病毒株被检出,散发性病例4例和聚集性疫情1起,其VP1基因高度同源,与早期毒株J23/US/1999相比变异不大。青岛市GⅡ.15型毒株之间的氨基酸差异主要有位点第300位天冬酰胺和天冬氨酸的转换及第302位脯氨酸和丝氨酸的转换。同源建模推测,GⅡ.15型毒株VP1蛋白质由S区和P区(P1区包括第224位至276位和第431位至555位;P2区包括第277位至430位)组成。S区包含8个反平行β-夹心和2个α-螺旋;P1区包含1个α-螺旋和7个β-折叠片;P2区中6个反平行β-折叠形成桶状结构。P2区具有精氨酸-甘氨酸-缬氨酸模体(第289至291位)和第313位谷氨酰胺、第349位天冬酰胺、第389位谷氨酰胺3个特异性位点。天冬酰胺-甘氨酸-精氨酸模体位于精氨酸-甘氨酸-缬氨酸模体上游22个氨基酸处(第265至267位)。与人组织性血型抗原(histo-blood group antigens,HBGA)结合界面的主要特征位点分为位点Ⅰ(丝氨酸-苏氨酸-精氨酸-丙氨酸-组氨酸,第357至361位)、位点Ⅱ(第388位天冬氨酸)和位点Ⅲ(甘氨酸-甘氨酸,第454至455位),可能与GⅡ.4型VA387毒株和HBGA结合模式类似。结论GⅡ.15型诺如病毒虽然变异不大,但仍具有成为流行株的风险,需要对其加强监控和进一步研究。 展开更多
关键词 病毒g.15 流行病学 分子
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一起诺如病毒GⅡ型引起的学校感染性腹泻聚集性疫情流行病学
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作者 吴明雄 《医学食疗与健康》 2018年第6期120-120,共1页
2017年12月,湖北省天门市某小学发生一起其它感染性腹泻疫情.12月4日至12月10日,该校共有10名学生发病,罹患率0.78%.病原学检测结果为诺如病毒 GⅡ型.
关键词 病毒g 感染性腹泻 学校 流行病学调查.
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