目的应用虚拟筛选方法预测雷公藤内酯醇作用靶标,以期阐明雷公藤治疗银屑病机制。方法根据银屑病的病理学特征,从PDTD(Potential Drug Target Database)数据库中筛选到的一批与雷公藤内酯醇可能发生相互作用的蛋白质中,选取视黄酸结合蛋...目的应用虚拟筛选方法预测雷公藤内酯醇作用靶标,以期阐明雷公藤治疗银屑病机制。方法根据银屑病的病理学特征,从PDTD(Potential Drug Target Database)数据库中筛选到的一批与雷公藤内酯醇可能发生相互作用的蛋白质中,选取视黄酸结合蛋白2、Caspase-1、蛋白S100-A9、视黄酸受体-alpha、视黄酸受体-beta、视黄酸受体-gamma、VEGFR以及血管生成素-1受体等8种可能与银屑病治疗相关的蛋白质靶标,利用Autodock 4.2分子对接软件,对雷公藤内酯醇与上述蛋白质靶标进行了逐一的精细对接和分析。结果通过比较其结合自由能、预测其抑制常数,并分析雷公藤内酯醇与蛋白质靶标的相互作用,发现雷公藤内酯醇与视黄酸结合类蛋白的相互作用最为强烈。结论雷公藤内酯醇治疗银屑病的药理学机制可能与视黄酸相关信号通路有关,我们的研究为进一步的药理学机制研究奠定了基础.展开更多
文摘目的应用虚拟筛选方法预测雷公藤内酯醇作用靶标,以期阐明雷公藤治疗银屑病机制。方法根据银屑病的病理学特征,从PDTD(Potential Drug Target Database)数据库中筛选到的一批与雷公藤内酯醇可能发生相互作用的蛋白质中,选取视黄酸结合蛋白2、Caspase-1、蛋白S100-A9、视黄酸受体-alpha、视黄酸受体-beta、视黄酸受体-gamma、VEGFR以及血管生成素-1受体等8种可能与银屑病治疗相关的蛋白质靶标,利用Autodock 4.2分子对接软件,对雷公藤内酯醇与上述蛋白质靶标进行了逐一的精细对接和分析。结果通过比较其结合自由能、预测其抑制常数,并分析雷公藤内酯醇与蛋白质靶标的相互作用,发现雷公藤内酯醇与视黄酸结合类蛋白的相互作用最为强烈。结论雷公藤内酯醇治疗银屑病的药理学机制可能与视黄酸相关信号通路有关,我们的研究为进一步的药理学机制研究奠定了基础.
