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膀胱癌组织某一特异性EST片段全长扩增及生物信息学分析
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作者 赵振理 胡少华 +2 位作者 郝川 史舒 任来成 《山东医药》 CAS 2018年第12期18-21,共4页
目的对膀胱癌组织某一特异性表达序列标签(EST)片段进行全长扩增及生物信息学分析。方法收集1例进行手术的膀胱癌患者(病理证实为膀胱移行细胞癌)的癌组织,从新鲜的膀胱癌组织中提取RNA,利用RACE方法获取前期研究发现的某一特异性EST片... 目的对膀胱癌组织某一特异性表达序列标签(EST)片段进行全长扩增及生物信息学分析。方法收集1例进行手术的膀胱癌患者(病理证实为膀胱移行细胞癌)的癌组织,从新鲜的膀胱癌组织中提取RNA,利用RACE方法获取前期研究发现的某一特异性EST片段5'端和3'端DNA序列,通过Gene Tool软件合成RACE测序结果。对全长序列及其相应蛋白进行生物信息学分析,利用sequin软件编辑分析结果,并向NCBI提交获取基因号及蛋白号。结果成功获得该特异性EST片段的5'端和3'端,利用Gene Tool软件合成一个1 839 bp的全长序列,初步分析其含有完整的开放阅读框(ORF),染色体定位于17p13.3。该序列在Gene Bank获得基因号为KR780251,ORF翻译的多肽序列获得蛋白ID为AKO62675。结论该膀胱癌组织特异性EST片段基因号为KR780251,全长序列为1 839 bp,含有完整的ORF,其编码蛋白AKO62675可能是正常膀胱组织的基因突变体。 展开更多
关键词 膀胱癌 基因 表达序列标签片段 变异 KR780251 AKO62675 生物信息学
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