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药用野生稻GBSS基因的系统发育及组织特异性表达
被引量:
4
1
作者
张霞
景翔
+1 位作者
周光才
包颖
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期343-349,共7页
淀粉作为主要的碳水化合物在储藏能量方面发挥至关重要的作用。颗粒结合型淀粉合酶(GBSS)与直链淀粉的合成息息相关。尽管该酶的编码基因已在许多栽培植物中被分离和确定,但有关它们在作物野生近缘种中的序列分歧和表达的研究却相对较...
淀粉作为主要的碳水化合物在储藏能量方面发挥至关重要的作用。颗粒结合型淀粉合酶(GBSS)与直链淀粉的合成息息相关。尽管该酶的编码基因已在许多栽培植物中被分离和确定,但有关它们在作物野生近缘种中的序列分歧和表达的研究却相对较少。该研究以药用野生稻(Oryza officinalis)为研究对象,定性和定量地分析了GBSS编码基因的序列特点、与其它植物同源基因的进化关系以及在叶和种子中的表达情况。系统发育分析表明,该酶在禾本科植物中分别由GBSSI和GBSSII基因编码。在药用野生稻中,这2种基因所编码蛋白的氨基酸序列一致性为62%,并且它们在不同器官内呈现时空分化表达,其中GBSSI在种子中超强表达, GBSSII则主要在叶片表达。
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关键词
药用野生稻
颗粒结合型淀粉合酶
序列一致度
表达
分化
叶
种子
原文传递
荠菜属CaCA家族基因拷贝数变异与表达分化的研究
2
作者
郑晔
赵义勇
+1 位作者
吴丽华
林娟
《复旦学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期20-31,39,共13页
荠菜属植物是十字花科中分布较广泛的植物,其中四倍体荠菜(Capsella bursa-pastoris)是一种由祖先二倍体亲本杂交再经多倍化后形成的多倍体物种,在地域分布及多样化的逆境适应能力方面与其祖先亲本相比具有明显优势,目前四倍体荠菜对于...
荠菜属植物是十字花科中分布较广泛的植物,其中四倍体荠菜(Capsella bursa-pastoris)是一种由祖先二倍体亲本杂交再经多倍化后形成的多倍体物种,在地域分布及多样化的逆境适应能力方面与其祖先亲本相比具有明显优势,目前四倍体荠菜对于环境适应性的研究报道还不多见.植物钙/阳离子逆转运蛋白超家族(CaCAs)是一类膜定位的离子转运蛋白,在植物抗冷、抗盐等信号通路中起到重要作用.本研究通过生物信息学及表达谱分析手段,发现四倍体荠菜CaCAs的13对亚基因组基因中有4对出现了拷贝数变异,其中3对基因在其编码的氨基酸序列和蛋白质跨膜结构方面与其直系同源基因间存在较大差异,且在冷响应表达上与拟南芥相比出现了明显偏倚.此外,与四倍体荠菜的祖先亲本Capsella rubella相比,四倍体荠菜CaCAs基因的组织表达分化较为普遍.CaCAs基因在四倍体荠菜中的拷贝数变异和表达分化现象提示了CaCAs对植物环境适应性的贡献.
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关键词
四倍体荠菜
CaCAs
进化
序列
分化
表达
分化
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职称材料
4种作物果糖激酶基因的鉴定与比较分析
3
作者
刘胤如
鲁佳林
+3 位作者
唐科
李莹莹
周润
刘汉梅
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2024年第4期780-791,共12页
【目的】基于全基因组序列,鉴定与分析水稻、玉米、高粱和谷子4种作物的果糖激酶(fructokinase, FRK)家族基因,明确其复制起源方式、系统发生关系、序列及表达分化特征等,为深入开展FRK基因功能研究、改良作物产量和品质等提供数据。【...
【目的】基于全基因组序列,鉴定与分析水稻、玉米、高粱和谷子4种作物的果糖激酶(fructokinase, FRK)家族基因,明确其复制起源方式、系统发生关系、序列及表达分化特征等,为深入开展FRK基因功能研究、改良作物产量和品质等提供数据。【方法】采用基因组搜索、基因组内及组间比较等多种方法,分析4种作物FRK家族成员的基因结构、保守基序、系统进化、复制扩张和基因表达分化等。【结果】鉴定到水稻13个、玉米16个、高粱14个、谷子16个FRK基因家族成员,其中水稻11个、玉米7个、高粱12个、谷子13个基因为离散复制基因,水稻、高粱和谷子各有1对ρWGD基因,玉米有8个WGD基因(1个ρWGD基因,7个mWGD基因)。该家族成员亚家族间基因结构差异大,但在亚家族内具有保守性。基因表达模式分析发现,直系同源基因间的表达模式相似,ρWGD基因对发生了明显的表达分化,而玉米物种特异的mWGD基因对的表达差异较小。【结论】探明了4种作物基因组包含的FRK家族基因,揭示了其复制起源、基因结构、序列及表达模式的演化特征。
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关键词
禾本科作物
果糖激酶基因
基因复制
序列及
表达
分化
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职称材料
急性ST段抬高型心肌梗死PCI术后血小板CD40L及血小板指标临床相关性分析
被引量:
9
4
作者
李向欣
王艳飞
+3 位作者
解俊敏
贾新未
王占启
张芳
《中国心血管病研究》
CAS
2015年第2期152-155,共4页
目的 探讨急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者经皮冠状动脉介入治疗(PCI)术后血小板CID40L及血小板指标变化的临床意义.方法 选取河北大学附属医院2013年4月至2014年4月接诊的急性ST段抬高型心肌梗死行PCI术患者63例为研究组;另选...
目的 探讨急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者经皮冠状动脉介入治疗(PCI)术后血小板CID40L及血小板指标变化的临床意义.方法 选取河北大学附属医院2013年4月至2014年4月接诊的急性ST段抬高型心肌梗死行PCI术患者63例为研究组;另选同期行健康体检者50名为对照组.两组皆采取流式细胞技术进行血小板CD40L检测,并测定血小板计数(PLT)、血小板体积分布宽度(PDW)、血小板平均体积(MPV)、血小板压积(PCT)、肌钙蛋白Ⅰ(Tn-Ⅰ)等,应用Person相关分析法分析血小板CD40L及血小板指标临床相关性,其中研究组检测时间包括术前与术后,而对照组健康者则仅为入组时.结果 ①研究组术前与对照组入组时比较,CD40L及Tn-Ⅰ明显升高(P<0.05).②研究组患者术后与对照组入组时比较,CD40L明显升高[(8.97±0.73)MFI比(0.80±0.27)MFI],差异有统计学意义(P.<0.05).研究组患者术后Tn-Ⅰ明显高于对照组入组时[(18.74±2.65) μg/L比(0.010±0.008)μg/L,P<0.05];MPV、PDW数值高于对照组入组时(P<0.05);而两组患者PLT、PCT未见统计学差异(P>0.05).③研究组患者术后CD40L、Tn-Ⅰ、MPV、PDW较术前明显升高.④PCI术后患者血小板CD40L水平与MPV及PDW呈正相关(P<0.05).结论 急性ST段抬高型心肌梗死行PCI患者的血小板形态改变属于血小板活化的主要特点,而血小板指标可能对血小板CD40L的表达产生影响,从而引发凝血及炎症反应,应加强重视.
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关键词
急性心肌梗死
经皮冠状动脉介入治疗
血小板
表达
细胞
分化
抗原40配体
血小板指标
临床相关性
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职称材料
题名
药用野生稻GBSS基因的系统发育及组织特异性表达
被引量:
4
1
作者
张霞
景翔
周光才
包颖
机构
曲阜师范大学生命科学学院
淄博市临淄区第二中学
出处
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期343-349,共7页
基金
国家自然科学基金(No.31570218)
文摘
淀粉作为主要的碳水化合物在储藏能量方面发挥至关重要的作用。颗粒结合型淀粉合酶(GBSS)与直链淀粉的合成息息相关。尽管该酶的编码基因已在许多栽培植物中被分离和确定,但有关它们在作物野生近缘种中的序列分歧和表达的研究却相对较少。该研究以药用野生稻(Oryza officinalis)为研究对象,定性和定量地分析了GBSS编码基因的序列特点、与其它植物同源基因的进化关系以及在叶和种子中的表达情况。系统发育分析表明,该酶在禾本科植物中分别由GBSSI和GBSSII基因编码。在药用野生稻中,这2种基因所编码蛋白的氨基酸序列一致性为62%,并且它们在不同器官内呈现时空分化表达,其中GBSSI在种子中超强表达, GBSSII则主要在叶片表达。
关键词
药用野生稻
颗粒结合型淀粉合酶
序列一致度
表达
分化
叶
种子
Keywords
Oryza officinalis
granule-bound starch synthase
sequence identity
expression divergence
leaf
seed
分类号
S511.9 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
荠菜属CaCA家族基因拷贝数变异与表达分化的研究
2
作者
郑晔
赵义勇
吴丽华
林娟
机构
复旦大学生命科学学院植物科学研究所
出处
《复旦学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期20-31,39,共13页
基金
国家自然科学基金(31170287)
文摘
荠菜属植物是十字花科中分布较广泛的植物,其中四倍体荠菜(Capsella bursa-pastoris)是一种由祖先二倍体亲本杂交再经多倍化后形成的多倍体物种,在地域分布及多样化的逆境适应能力方面与其祖先亲本相比具有明显优势,目前四倍体荠菜对于环境适应性的研究报道还不多见.植物钙/阳离子逆转运蛋白超家族(CaCAs)是一类膜定位的离子转运蛋白,在植物抗冷、抗盐等信号通路中起到重要作用.本研究通过生物信息学及表达谱分析手段,发现四倍体荠菜CaCAs的13对亚基因组基因中有4对出现了拷贝数变异,其中3对基因在其编码的氨基酸序列和蛋白质跨膜结构方面与其直系同源基因间存在较大差异,且在冷响应表达上与拟南芥相比出现了明显偏倚.此外,与四倍体荠菜的祖先亲本Capsella rubella相比,四倍体荠菜CaCAs基因的组织表达分化较为普遍.CaCAs基因在四倍体荠菜中的拷贝数变异和表达分化现象提示了CaCAs对植物环境适应性的贡献.
关键词
四倍体荠菜
CaCAs
进化
序列
分化
表达
分化
Keywords
Capsella bursa-pastoris
CaCAs
evolution
sequence differentiation
expression differentiation
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
4种作物果糖激酶基因的鉴定与比较分析
3
作者
刘胤如
鲁佳林
唐科
李莹莹
周润
刘汉梅
机构
四川农业大学生命科学学院
出处
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2024年第4期780-791,共12页
基金
国家自然科学青年基金(31601317)。
文摘
【目的】基于全基因组序列,鉴定与分析水稻、玉米、高粱和谷子4种作物的果糖激酶(fructokinase, FRK)家族基因,明确其复制起源方式、系统发生关系、序列及表达分化特征等,为深入开展FRK基因功能研究、改良作物产量和品质等提供数据。【方法】采用基因组搜索、基因组内及组间比较等多种方法,分析4种作物FRK家族成员的基因结构、保守基序、系统进化、复制扩张和基因表达分化等。【结果】鉴定到水稻13个、玉米16个、高粱14个、谷子16个FRK基因家族成员,其中水稻11个、玉米7个、高粱12个、谷子13个基因为离散复制基因,水稻、高粱和谷子各有1对ρWGD基因,玉米有8个WGD基因(1个ρWGD基因,7个mWGD基因)。该家族成员亚家族间基因结构差异大,但在亚家族内具有保守性。基因表达模式分析发现,直系同源基因间的表达模式相似,ρWGD基因对发生了明显的表达分化,而玉米物种特异的mWGD基因对的表达差异较小。【结论】探明了4种作物基因组包含的FRK家族基因,揭示了其复制起源、基因结构、序列及表达模式的演化特征。
关键词
禾本科作物
果糖激酶基因
基因复制
序列及
表达
分化
Keywords
gramineous crops
fructokinase
gene duplication
sequence and expression divergence
分类号
S511 [农业科学—作物学]
S513
S514
S515
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职称材料
题名
急性ST段抬高型心肌梗死PCI术后血小板CD40L及血小板指标临床相关性分析
被引量:
9
4
作者
李向欣
王艳飞
解俊敏
贾新未
王占启
张芳
机构
保定市第三医院心内科
河北大学附属医院心内科
出处
《中国心血管病研究》
CAS
2015年第2期152-155,共4页
文摘
目的 探讨急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者经皮冠状动脉介入治疗(PCI)术后血小板CID40L及血小板指标变化的临床意义.方法 选取河北大学附属医院2013年4月至2014年4月接诊的急性ST段抬高型心肌梗死行PCI术患者63例为研究组;另选同期行健康体检者50名为对照组.两组皆采取流式细胞技术进行血小板CD40L检测,并测定血小板计数(PLT)、血小板体积分布宽度(PDW)、血小板平均体积(MPV)、血小板压积(PCT)、肌钙蛋白Ⅰ(Tn-Ⅰ)等,应用Person相关分析法分析血小板CD40L及血小板指标临床相关性,其中研究组检测时间包括术前与术后,而对照组健康者则仅为入组时.结果 ①研究组术前与对照组入组时比较,CD40L及Tn-Ⅰ明显升高(P<0.05).②研究组患者术后与对照组入组时比较,CD40L明显升高[(8.97±0.73)MFI比(0.80±0.27)MFI],差异有统计学意义(P.<0.05).研究组患者术后Tn-Ⅰ明显高于对照组入组时[(18.74±2.65) μg/L比(0.010±0.008)μg/L,P<0.05];MPV、PDW数值高于对照组入组时(P<0.05);而两组患者PLT、PCT未见统计学差异(P>0.05).③研究组患者术后CD40L、Tn-Ⅰ、MPV、PDW较术前明显升高.④PCI术后患者血小板CD40L水平与MPV及PDW呈正相关(P<0.05).结论 急性ST段抬高型心肌梗死行PCI患者的血小板形态改变属于血小板活化的主要特点,而血小板指标可能对血小板CD40L的表达产生影响,从而引发凝血及炎症反应,应加强重视.
关键词
急性心肌梗死
经皮冠状动脉介入治疗
血小板
表达
细胞
分化
抗原40配体
血小板指标
临床相关性
Keywords
Acute myocardial infarction
Percutaneous coronary intervention
Platelet CD40L
Platelet index
Clinical relevance
分类号
R542.22 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
药用野生稻GBSS基因的系统发育及组织特异性表达
张霞
景翔
周光才
包颖
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
原文传递
2
荠菜属CaCA家族基因拷贝数变异与表达分化的研究
郑晔
赵义勇
吴丽华
林娟
《复旦学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
下载PDF
职称材料
3
4种作物果糖激酶基因的鉴定与比较分析
刘胤如
鲁佳林
唐科
李莹莹
周润
刘汉梅
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
4
急性ST段抬高型心肌梗死PCI术后血小板CD40L及血小板指标临床相关性分析
李向欣
王艳飞
解俊敏
贾新未
王占启
张芳
《中国心血管病研究》
CAS
2015
9
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
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