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11株螨虫分离株的ITS-2序列分析与系统关系研究
被引量:
6
1
作者
古小彬
张晓谦
+2 位作者
杨光友
贾小勇
王帅
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期235-242,共8页
为探讨动物体上一些常见寄生螨虫的分类地位,对11株螨虫分离株的核糖体第二内部转录间隔区(ITS-2)基因序列进行测定,并从GenBank下载21条螨虫的ITS-2序列,用UPGMA法构建分子系统树。序列分析结果显示:6株疥螨分离株ITS-2基因全...
为探讨动物体上一些常见寄生螨虫的分类地位,对11株螨虫分离株的核糖体第二内部转录间隔区(ITS-2)基因序列进行测定,并从GenBank下载21条螨虫的ITS-2序列,用UPGMA法构建分子系统树。序列分析结果显示:6株疥螨分离株ITS-2基因全长均为361bp,含有335个保守性位点,15个变异位点和9个简约信息位点;序列间的同源性为96.9%~99.7%。5株足螨分离株ITS-2基因存在长度上的变异(225~232bp),序列中包括184个保守性位点,44个变异位点,9个简约信息位点;分离自黄牛和奶牛的4株足螨分离株的ITS-2序列同源性为92.4%~97.3%,而熊猫足螨分离株同黄牛、奶牛足螨分离株的同源性较低(78.7%~82.6%)。UPGMA显示:32株螨虫分离株分成2个支系,第1个支系包括疥螨科的疥螨属Sarcoptes和背肛螨属Notoedres;第2个支系包括痒螨科的足螨属Chorioptes和痒螨属Psoroptes。从分析结果来看,笔者支持疥螨的单种说法;而足螨属中分离自熊猫的足螨和痒螨属中分离自水牛的痒螨的分类地位还有待进一步探讨。
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关键词
螨虫
分离
株
核糖体ITS-2基因
序列分析
分子系统发生
下载PDF
职称材料
题名
11株螨虫分离株的ITS-2序列分析与系统关系研究
被引量:
6
1
作者
古小彬
张晓谦
杨光友
贾小勇
王帅
机构
四川农业大学动物医学院
绵阳市畜牧兽医局
北京实验动物研究中心
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期235-242,共8页
基金
四川省学术和技术带头人培养基金(SZ0082)
文摘
为探讨动物体上一些常见寄生螨虫的分类地位,对11株螨虫分离株的核糖体第二内部转录间隔区(ITS-2)基因序列进行测定,并从GenBank下载21条螨虫的ITS-2序列,用UPGMA法构建分子系统树。序列分析结果显示:6株疥螨分离株ITS-2基因全长均为361bp,含有335个保守性位点,15个变异位点和9个简约信息位点;序列间的同源性为96.9%~99.7%。5株足螨分离株ITS-2基因存在长度上的变异(225~232bp),序列中包括184个保守性位点,44个变异位点,9个简约信息位点;分离自黄牛和奶牛的4株足螨分离株的ITS-2序列同源性为92.4%~97.3%,而熊猫足螨分离株同黄牛、奶牛足螨分离株的同源性较低(78.7%~82.6%)。UPGMA显示:32株螨虫分离株分成2个支系,第1个支系包括疥螨科的疥螨属Sarcoptes和背肛螨属Notoedres;第2个支系包括痒螨科的足螨属Chorioptes和痒螨属Psoroptes。从分析结果来看,笔者支持疥螨的单种说法;而足螨属中分离自熊猫的足螨和痒螨属中分离自水牛的痒螨的分类地位还有待进一步探讨。
关键词
螨虫
分离
株
核糖体ITS-2基因
序列分析
分子系统发生
Keywords
mite isolate
the second internal transcribed spacer (ITS-2)
sequence analysis
molecular phylogenetics
分类号
S852.746 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
11株螨虫分离株的ITS-2序列分析与系统关系研究
古小彬
张晓谦
杨光友
贾小勇
王帅
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
6
下载PDF
职称材料
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