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流式BMRC:基于算术编码的pcDNA存储方案
1
作者
崔竞松
李嘉伟
+2 位作者
王兰兰
郭迟
齐浩
《武汉大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期787-795,共9页
生物学研究表明,DNA蛋白质编码(protein-coding DNA,pcDNA)是一种具有一定的容量但不均匀的信息,受限于多种生物学条件,其存储介质模型不同于传统的计算机二进制存储。现有方案或无法高效利用其存储空间,或计算复杂度偏高。针对上述问题...
生物学研究表明,DNA蛋白质编码(protein-coding DNA,pcDNA)是一种具有一定的容量但不均匀的信息,受限于多种生物学条件,其存储介质模型不同于传统的计算机二进制存储。现有方案或无法高效利用其存储空间,或计算复杂度偏高。针对上述问题,提出了一种基于算术编码的编码方法——流式BMRC算法,使用重整化技术并通过输出符号的概率分布拟合,实现蛋白质编码DNA中的低复杂度、高效利用信息空间的任意信息存储。分析表明,该算法可以高效利用蛋白质编码DNA在生物学条件限制下的信息容量,且具有线性计算复杂度,技术优势明显。
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关键词
dna
存储
算术
编码
非均匀存储
蛋白质
编码
dna
原文传递
题名
流式BMRC:基于算术编码的pcDNA存储方案
1
作者
崔竞松
李嘉伟
王兰兰
郭迟
齐浩
机构
空天信息安全与可信计算教育部重点实验室
湖北珞珈实验室/武汉大学卫星导航定位技术研究中心
系统生物工程教育部重点实验室/天津大学化工学院
出处
《武汉大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期787-795,共9页
基金
湖北省科技重大项目(2021AAA010)
湖北省首批青年拔尖人才培养计划。
文摘
生物学研究表明,DNA蛋白质编码(protein-coding DNA,pcDNA)是一种具有一定的容量但不均匀的信息,受限于多种生物学条件,其存储介质模型不同于传统的计算机二进制存储。现有方案或无法高效利用其存储空间,或计算复杂度偏高。针对上述问题,提出了一种基于算术编码的编码方法——流式BMRC算法,使用重整化技术并通过输出符号的概率分布拟合,实现蛋白质编码DNA中的低复杂度、高效利用信息空间的任意信息存储。分析表明,该算法可以高效利用蛋白质编码DNA在生物学条件限制下的信息容量,且具有线性计算复杂度,技术优势明显。
关键词
dna
存储
算术
编码
非均匀存储
蛋白质
编码
dna
Keywords
dna
storage
arithmetic coding
non-uniform storage
pc
dna
(protein-coding
dna
)
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
流式BMRC:基于算术编码的pcDNA存储方案
崔竞松
李嘉伟
王兰兰
郭迟
齐浩
《武汉大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
已选择
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参考文献
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