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大豆ZF-HD蛋白家族的全基因组序列特征分析 被引量：4
1
作者 张大勇 王长彪 +4 位作者 易金鑫 徐照龙 何晓兰 朱虹润 马鸿翔 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2011年第3期675-677,共3页
同源异形盒基因家族的同源域蛋白在植物、动物和真菌发育过程中作为转录因子起着重要的作用[1]。自从1993年Schinder首次发现植物同源结构域（PHD,Plant home-odomain）以来,还发现在拟南芥蛋白HAT3.1和HOXIA内含有一段富含半胱氨酸的... 同源异形盒基因家族的同源域蛋白在植物、动物和真菌发育过程中作为转录因子起着重要的作用[1]。自从1993年Schinder首次发现植物同源结构域（PHD,Plant home-odomain）以来,还发现在拟南芥蛋白HAT3.1和HOXIA内含有一段富含半胱氨酸的保守序列,此序列与金属离子结合结构域（Metal-binding domains）非常相似[2]。 展开更多
关键词 ZF-HD 基因结构 染色体定位 蛋白结构域 系统进化
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尼瓦拉野生稻(Oryza nivara)小粒基因GS3-N的克隆及功能分析
2
作者 常桂梅 张潇 +9 位作者 吴子豪 万金鹏 杨君 吴锋玲 王飞军 周家武 陶大云 王芳 余迪求 徐鹏 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第20期6638-6648,共11页
水稻粒型是影响产量的一个重要因素,为挖掘和利用野生稻中粒型相关基因并解析其功能机制,本研究以尼瓦拉野生稻(Oryza nivara)为供体亲本,粳稻品种‘滇粳优1号’(DJY1)为轮回亲本,构建了一个极小粒近等基因系NIL-J155。图位克隆获得了... 水稻粒型是影响产量的一个重要因素,为挖掘和利用野生稻中粒型相关基因并解析其功能机制,本研究以尼瓦拉野生稻(Oryza nivara)为供体亲本,粳稻品种‘滇粳优1号’(DJY1)为轮回亲本,构建了一个极小粒近等基因系NIL-J155。图位克隆获得了尼瓦拉野生稻中负调控籽粒大小的GS3基因的一个新的单倍型,命名为GS3-N(GS3 from O.nivara)。GS3-N定位在细胞膜,且在不同生长阶段的不同组织中均有表达。序列分析表明,小粒单倍型GS3-NJ155第5个外显子处有312 bp的插入和缺失,其编码的蛋白含有植物特有的器官大小调控区(OSR)和跨膜结构域,而大粒单倍型GS3-NDJY1由于第2个外显子处的无义突变,导致编码蛋白只含有部分OSR结构域。进一步的研究表明,在J155背景下分别敲除OSR和跨膜结构域都能显著增加其粒长和粒重,过表达植株则表现粒长明显变短,株高降低,穗长变短,证明GS3-N可能具有一因多效的作用。本研究结果表明作为调控粒长的负调节子,GS3-N编码蛋白和转录表达水平的差异是引起J155和DJY1粒型差异的原因,这不仅为水稻粒型驯化机制提供新的理论基础,还将为现代水稻栽培种提供更多的粒型遗传资源。 展开更多
关键词 粒型 GS3-N 尼瓦拉野生稻 蛋白结构域 野生稻
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斑翅果蝇解毒代谢相关基因的鉴定与分析
3
作者 王正磊 刘凯扬 +2 位作者 袁琳琳 李芬 吴少英 《热带生物学报》 2023年第6期660-667,共8页
根据斑翅果蝇(Drosophila suzukii Matsumura)的转录组数据,通过序列分析、进化分析、结构域及保守氨基酸分析,鉴定出5种斑翅果蝇的解毒代谢基因,包括ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporter,ABCs)、细胞色素P450单加氧酶(cytoch... 根据斑翅果蝇(Drosophila suzukii Matsumura)的转录组数据,通过序列分析、进化分析、结构域及保守氨基酸分析,鉴定出5种斑翅果蝇的解毒代谢基因,包括ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporter,ABCs)、细胞色素P450单加氧酶(cytochrome P450,CYPs)、谷胱甘肽-S-转移酶(glutathione S-transferases,GSTs)、羧酸酯酶(carboxylesterases,CarEs)、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶(UDP-glucuronosyl transferases,UGTs)。进化分析结果显示,斑翅果蝇的CYPs基因分布于CYP3、CYP4、CYP6、CYP9四个进化分支,ABCs基因分布于ABCC、ABCD、ABCF、ABCG四个亚家族,GSTs基因分布于GST-Delta、GST-Epsilon、GST-Theta以及GST-Zeta四个进化分支,斑翅果蝇的CarEs基因和UGTs基因与亚艳丽果蝇(Drosophila subpulchrella)的遗传距离最近;结构域及保守氨基酸分析结果表明所有的CYPs均包含P450结构域;ABCs中都包含ABC2结构域;在GSTs中都含有GST结构域;在CarEs中包含Coesterases结构域;在UGTs中含有UDPGT结构域。CYPs的保守基序为EEGGKKRNDFLDLLJZLKKEG,ABCs的保守基序为DCPSASNPADYIIE,GSTs的保守基序为LYPKDLVKRAVVDQRLHFE。 展开更多
关键词 斑翅果蝇 代谢解毒基因 进化分析 蛋白结构域 氨基酸残基
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A结构域阳性纤维连接蛋白促进破骨细胞形成及根尖囊肿骨质破坏 被引量：2
4
作者 陈雅文 王海丞 董伟杰 《口腔医学研究》 CAS 北大核心 2018年第9期952-955,共4页
目的:检测纤维连接蛋白(fibronectin,FN)可变剪接亚型蛋白在根尖囊肿纤维囊壁中的表达,研究每种亚型在体外诱导形成破骨细胞的能力,探讨FN的可变剪接亚型与根尖囊肿病变的进展和骨破坏的关系。方法:选择8例经病理诊断确诊为根尖囊肿患... 目的:检测纤维连接蛋白(fibronectin,FN)可变剪接亚型蛋白在根尖囊肿纤维囊壁中的表达,研究每种亚型在体外诱导形成破骨细胞的能力,探讨FN的可变剪接亚型与根尖囊肿病变的进展和骨破坏的关系。方法:选择8例经病理诊断确诊为根尖囊肿患者手术标本,采用免疫组织化学方法,研究每种FN亚型在病变组织中表达强度,分离成纤维细胞,采用反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-poymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测总FN及其3种亚型(EDA+FN、EDB+FN、CS1-FN)mRNA的表达水平,并采用条件培养基体外诱导破骨细胞分化。根据每种FN亚型的相对表达情况,研究FN亚型与破骨细胞分化之间的关系。结果:在FN产生的亚型中,含蛋白结构域A的纤维连接蛋白(EDA+FN)在纤维囊壁中染色强度高于EDB+FN和CS1-FN。囊壁成纤维细胞中,EDA+FN的mRNA水平显著高于EDB+FN(P=0.007)和CS1-FN(P=0.003),且EDA+FN/总FN值在成纤维细胞的所有亚型中都是最高的(EDB+FN/总FN,P<0.001;CS1-FN/总FN,P<0.001)。体外诱导破骨细胞形成结果显示,EDA+FN/总FN与破骨细胞生成数量呈正相关(R=0.776,P=0.024)。结论:根尖囊肿囊壁成纤维细胞产生各种FN亚型,EDA+FN为主要类型,且EDA+FN/总FN与成纤维细胞诱导破骨细胞效率呈正相关。提示成纤维细胞产生的EDA+FN有利于导致微环境中破骨细胞形成,促进根尖囊肿的骨破坏。 展开更多
关键词 纤维连接蛋白 蛋白结构域A 破骨细胞 根尖囊肿
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西瓜CBL家族基因的鉴定与特征分析 被引量：2
5
作者 朱强龙 赵玉龙 +2 位作者 吕慧玲 栾非时 高鹏 《北方园艺》 CAS 北大核心 2017年第15期18-24,共7页
CBL基因在植物逆境应答过程中具有重要作用,但在西瓜作物的抗逆育种研究中鲜有相关报道。该研究利用生物信息学的分析方法从已发表的西瓜全基因组中鉴定出7个CBL基因(ClaCBL1~ClaCBL7),并分析了它们在全基因组范围内的分布情况、分子结... CBL基因在植物逆境应答过程中具有重要作用,但在西瓜作物的抗逆育种研究中鲜有相关报道。该研究利用生物信息学的分析方法从已发表的西瓜全基因组中鉴定出7个CBL基因(ClaCBL1~ClaCBL7),并分析了它们在全基因组范围内的分布情况、分子结构特征、顺式元件以及系统进化等基本特征,为进一步研究西瓜CBL基因的功能提供参考。结果表明:西瓜CBL基因在全基因组中的分布是不均匀的,其中仅ClaCBL4基因有9个外显子,其余基因均为8个外显子,编码区序列大小在639~738bp。在进化上西瓜CBL基因分为3个不同的类群;它们编码区域内的氨基酸序列均含有能与CIPK互作的FSPF高保守性位点及能与钙离子结合的3个EF-hand结构;除了ClaCBL1预测定位在胞外基质中,其余的ClaCBL定位在细胞内的不同部位;在西瓜CBL基因启动子上游的序列中存在多个应答不同逆境和植物激素的顺式元件,而且CBL家族不同成员基因含有的顺式元件的种类和数目各不相同。上述分析显示,西瓜CBL可能参与多种生物学过程,而且不同成员存在功能上的分化。 展开更多
关键词 西瓜 CBL基因 分子结构特征 蛋白结构域 遗传多样性聚类 顺式元件
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空肠弯曲菌flaA基因序列及功能预测分析 被引量：1
6
作者 訾臣 曾德新 +3 位作者 蒋鲁岩 袁飞 蒋原 薛峰 《安徽农业科学》 CAS 2017年第32期156-160,183,共6页
[目的]对空肠弯曲菌空肠弯曲菌flaA基因的序列及功能进行预测分析。[方法]分析了多个空肠弯曲菌flaA核酸及氨基酸序列组成和序列差异性;预测分析了flaA基因密码子使用偏好性、蛋白结构和功能域、Fla A与相关功能蛋白的互作情况。[结果]... [目的]对空肠弯曲菌空肠弯曲菌flaA基因的序列及功能进行预测分析。[方法]分析了多个空肠弯曲菌flaA核酸及氨基酸序列组成和序列差异性;预测分析了flaA基因密码子使用偏好性、蛋白结构和功能域、Fla A与相关功能蛋白的互作情况。[结果]不同菌株的flaA基因序列存在差异性,且差异主要存在于序列的中间区域。不同空肠弯曲菌菌株的同一基因在密码子选择上存在差异。Fla A与多个蛋白存在不同形式的相互作用。[结论]该研究可为空肠弯曲菌flaA基因序列分析和功能研究应用提供基础和依据。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 flaA基因 密码子偏好 蛋白结构域 蛋白互作
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含蛋白结构域A的纤维连接蛋白在根尖囊肿中的表达及作用机制 被引量：1
7
作者 陈柚杉 王海丞 《检验医学与临床》 CAS 2020年第24期3553-3556,共4页
目的探讨在根尖囊肿中含蛋白结构域A的纤维连接蛋白(EDA+FN)与成纤维细胞破骨作用之间的关系。方法采用免疫组织化学法对根尖囊肿标本进行染色,分析EDA+FN染色强度与根尖囊肿颌骨病变范围的关系。分别培养从根尖囊肿标本(研究组,20例)... 目的探讨在根尖囊肿中含蛋白结构域A的纤维连接蛋白(EDA+FN)与成纤维细胞破骨作用之间的关系。方法采用免疫组织化学法对根尖囊肿标本进行染色,分析EDA+FN染色强度与根尖囊肿颌骨病变范围的关系。分别培养从根尖囊肿标本(研究组,20例)和正常颌骨标本(对照组,6例)分离出的成纤维细胞,并制作条件培养基,诱导破骨细胞形成。用CRISPR/Cas9系统敲除成纤维细胞的蛋白结构域A(EDA)外显子,比较EDA敲除组与非EDA敲除组破骨相关因子mRNA表达水平。结果EDA+FN的染色强度与根尖囊肿颌骨病变范围呈正相关(r=0.594,P=0.006)。研究组EDA+FN mRNA的表达水平明显高于对照组(P<0.05)。研究组成纤维细胞诱导的破骨细胞数与EDA+FN mRNA表达水平呈正相关(r=0.817,P<0.001)。EDA敲除组成纤维细胞诱导的破骨细胞数明显少于非EDA敲除组(P<0.05)。EDA敲除组成纤维细胞中白细胞介素-6、巨噬细胞集落刺激因子、肿瘤坏死因子-α、血管内皮生长因子A、核因子-κB受体活化因子配体(RANKL)和RANKL/骨骼保护素的mRNA表达水平均低于非EDA敲除组(P<0.05)。结论根尖囊肿成纤维细胞能分泌EDA+FN,促进骨破坏,而敲除EDA外显子可抑制骨破坏。 展开更多
关键词 蛋白结构域A 纤维连接蛋白 破骨细胞 根尖囊肿
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连翘ARF基因家族的鉴定及生物信息学分析
8
作者 栗谦 王帆 +4 位作者 王淑晨 吴琼 杨雅琳 袁王俊 李永 《石河子大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2022年第6期719-728,共10页
本研究基于连翘[Forsythia suspensa(Thunb.) Vahl]基因组鉴定了连翘ARF(Auxin Response Factor)基因家族成员,并对FsARF基因进行生物信息学分析与功能预测。利用生物信息学的方法,对FsARF基因家族成员的基本性质、染色体定位、进化树... 本研究基于连翘[Forsythia suspensa(Thunb.) Vahl]基因组鉴定了连翘ARF(Auxin Response Factor)基因家族成员,并对FsARF基因进行生物信息学分析与功能预测。利用生物信息学的方法,对FsARF基因家族成员的基本性质、染色体定位、进化树、基因结构、结构域、顺式作用元件、不同组织表达模式进行分析。共鉴定出35个FsARF基因(FsARF1-35),它们在染色体上均有分布,其中3个分别分布在未挂载的片段,FsARF基因可分为5个亚族。35个ARF基因编码的蛋白质由326~1086 aa组成,连翘ARF基因编码的35个蛋白均为亲水性蛋白,其亚细胞定位在细胞核内。FsARF蛋白的二级结构主要由无规则卷曲构成。35个FsARF蛋白均含有DBD、Auxin_resp结构域,其中20个含有CTD结构域。35个FsARF基因启动子顺式作用元件与植物激素、生长发育、防御与胁迫、次级代谢产物合成相关。FsARF基因在不同组织部位差异表达。FsARF基因在植物生长发育过程中、应对激素与非生物胁迫时起着重要调控作用,其中FsARF2可能对花生长发育,FsARF6、FsARF14对果实发育起着重要调控作用。 展开更多
关键词 连翘 ARF基因家族 蛋白结构域 基因组
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菜粉蝶osiris基因家族鉴定与发育动态 被引量：1
9
作者 赵磊 夏昊 +2 位作者 钱强 徐圆 李凯 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期1319-1325,共7页
osiris基因家族是昆虫特异性基因,迄今尚未在昆虫纲以外的物种中发现同源基因。本研究利用菜粉蝶转录组数据,鉴定了菜粉蝶16个osiris基因家族成员,分属11个亚家族。通过与菜粉蝶基因组比对,发现菜粉蝶osiris基因均为断裂基因,外显子数量... osiris基因家族是昆虫特异性基因,迄今尚未在昆虫纲以外的物种中发现同源基因。本研究利用菜粉蝶转录组数据,鉴定了菜粉蝶16个osiris基因家族成员,分属11个亚家族。通过与菜粉蝶基因组比对,发现菜粉蝶osiris基因均为断裂基因,外显子数量为3-15个;通过结构域分析,发现菜粉蝶Osiris完整编码蛋白含有信号肽和一个未知功能结构域DUF1676,且多数Osiris蛋白含跨膜结构域。系统发育分析表明,osiris基因家族成员与其他昆虫种类相应成员更似直系同源,而非种内基因扩张,再次验证了osiris基因是在昆虫物种分化之前就已形成的多基因家族。发育转录组基因表达分析表明,osiris家族不同成员表达量在不同发育阶段趋势几乎完全一致,多在菜粉蝶1龄幼虫和5龄幼虫高表达,卵期、蛹期与成虫期低表达,预示着osiris基因家族不同成员转录调控机制的相似性与发育的相关性。 展开更多
关键词 osiris基因家族 菜粉蝶 蛋白结构域 系统进化 发育
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家蚕Osiris基因家族成员的系统进化与组织表达芯片分析 被引量：1
10
作者 胡文波 朱晓南 +6 位作者 刘春 程廷才 黄小凤 蒋礼 夏菊 张洁 夏庆友 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期26-32,共7页
昆虫特有基因对于维持昆虫特有的形态、行为及生活习性起关键作用,同时也是防治有害昆虫的靶标基因。基于家蚕基因组数据,对昆虫特有基因Osiris(Osi)家族进行了分析。通过同源比对,发现家蚕的Osi家族含有22个成员,其中21个基因串联分布... 昆虫特有基因对于维持昆虫特有的形态、行为及生活习性起关键作用,同时也是防治有害昆虫的靶标基因。基于家蚕基因组数据,对昆虫特有基因Osiris(Osi)家族进行了分析。通过同源比对,发现家蚕的Osi家族含有22个成员,其中21个基因串联分布在26号染色体,1个基因位于4号染色体。共线性分析发现,家蚕与黑腹果蝇有18个Osi基因表现为共线性关系。系统进化分析表明Osi基因家族是在昆虫物种分化前已形成的多基因家族,家蚕与果蝇的Osi家族亲缘关系相对较近。家蚕的4个Osi基因(BmOsi9-1、BmOsi9-3、BmOsi9-4和BmOsi9-5)聚成一个进化枝,且在基因组上呈串联分布,暗示其是在物种分化后通过基因复制产生的,属特有基因。结构域分析发现,家蚕Osi蛋白均含有一个功能未知的结构域DUF1676,是Osi基因家族的典型特征。组织芯片分析表明,BmOsi20和BmOsi17分别在家蚕5龄幼虫的中肠和精巢中特异性高量表达,BmO-si18和BmOsi9-1分别在马氏管和丝腺中特异表达。 展开更多
关键词 家蚕基因组 Osi基因家族 昆虫特有基因 共线性 蛋白结构域 系统进化 表达谱
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黄瓜苋科凝集素基因的表达分析与逆境调控
11
作者 赵菲 党刘毅 +3 位作者 魏敏惠 刘春莹 冷伟 尚琛晶 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期183-190,共8页
凝集素是一类具有特异性糖结合活性的蛋白质,通常具有1个或多个非催化的糖结合结构域。凝集素在植物对病原菌的防御反应中发挥重要作用。由于其抗细菌、真菌、病毒和昆虫等的活性,凝集素在农业和生物医药领域都具有很大的应用潜力。作... 凝集素是一类具有特异性糖结合活性的蛋白质,通常具有1个或多个非催化的糖结合结构域。凝集素在植物对病原菌的防御反应中发挥重要作用。由于其抗细菌、真菌、病毒和昆虫等的活性,凝集素在农业和生物医药领域都具有很大的应用潜力。作为最小的凝集素家族之一,苋科凝集素的研究较少。该文通过对重要经济作物黄瓜(Cucumissativus)的基因组进行分析,对16种苋科凝集素基因在黄瓜基因组中的分布和位置进行研究,并分析相关基因的外显子/内含子组成。进一步通过启动子分析,阐明了苋科凝集素基因对非生物胁迫的响应情况。最后,通过实时荧光定量PCR,检测了黄瓜中4种苋科凝集素基因对低温、高盐、干旱和ABA处理的响应情况。研究结果可为揭示苋科凝集素的生理功能及其在植物胁迫响应中的作用提供参考。 展开更多
关键词 非生物胁迫 苋科凝集素 启动子 蛋白结构域
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锌指蛋白703的结构和功能
12
作者 李丁 刘阁玲 《海南医学》 CAS 2017年第10期1665-1668,共4页
本文简述了锌指蛋白703(ZNF703)的结构域及其功能,初步探讨了ZNF703在肿瘤中的关系及作用机制,为临床诊断、预后及药物治疗提供一定的研究价值。
关键词 ZNF703 蛋白结构域 雌激素 肿瘤
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人脑内一含有ACP样结构域新基因的发现 被引量：95
13
作者 邓艳春 药立波 +4 位作者 刘新平 聂晓燕 王吉村 张晓光 苏成芝 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第1期72-76,共5页
为寻找脑内新基因 ,以正常成人全脑cDNA为模板 ,采用锚定PCR方法进行扩增 ,将经琼脂糖DNA电泳鉴定获得的一约 12 0 0bp大小的特异性条带回收 ,并克隆入Teasy载体 .用 310GeneticAnalyzer进行自动测序 .所得序列进行生物信息学分析 :BLAS... 为寻找脑内新基因 ,以正常成人全脑cDNA为模板 ,采用锚定PCR方法进行扩增 ,将经琼脂糖DNA电泳鉴定获得的一约 12 0 0bp大小的特异性条带回收 ,并克隆入Teasy载体 .用 310GeneticAnalyzer进行自动测序 .所得序列进行生物信息学分析 :BLAST相似性分析结果证明所得序列为新序列 ,读框分析表明 ,该序列中存在一完整编码区 ,编码含 35 7个氨基酸的蛋白质 .ProDom软件分析发现其含有酰基携带蛋白 (ACP)样结构域 .随后 ,经 3′RACE法克隆到该基因的全长cDNA ,其全长为 2 0 2 4bp ,染色体定位在 14q11 2 ,含有 16个外显子 ,15个内含子 ,该基因已登录到GenBank .经设计编码区引物 ,从Teasy载体扩增出编码区后再克隆入pGEX 4T1表达载体 ,经异丙基硫代 D 乳糖苷 (IPTG)化学诱导表达 .其编码区克隆入 pGEX 4T1表达载体后 ,转入JM10 9宿主菌 ,经IPTG诱导已得到表达 .点杂交及RNA印迹表明 ,该基因在正常成人脑内广泛高表达 . 展开更多
关键词 基因 脑 乙酰基载体蛋白结构域 生物信息学
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百合地黄汤抑制NLRP3炎症小体激活改善焦虑性抑郁症模型大鼠海马神经元损伤 被引量：26
14
作者 赵洪庆 唐林 +7 位作者 吴碧茹 孟盼 刘检 杨蕙 王宇红 龙红萍 李春艳 徐仪昕 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第20期7-14,共8页
目的:从NOD样受体热蛋白结构域3(NLRP3)炎症小体探讨经典名方百合地黄汤抗焦虑性抑郁症的作用机制。方法:50只SD大鼠随机分为正常组、模型组、文拉法辛组(13.5 mg·kg^(-1)),百合地黄汤高、低剂量组(16,4 g·kg^(-1)),每组10只... 目的:从NOD样受体热蛋白结构域3(NLRP3)炎症小体探讨经典名方百合地黄汤抗焦虑性抑郁症的作用机制。方法:50只SD大鼠随机分为正常组、模型组、文拉法辛组(13.5 mg·kg^(-1)),百合地黄汤高、低剂量组(16,4 g·kg^(-1)),每组10只。采用28 d慢性束缚应激(6 h)联合皮下注射皮质酮(30 mg·kg^(-1))的方法建立焦虑性抑郁症大鼠模型,并从造模第8天起各给药组分别灌胃给予相应药物,正常组和模型组给予等体积蒸馏水,连续给药21 d。采用高架十字迷宫评价大鼠焦虑行为,旷场实验评价抑郁行为,酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测血清及海马匀浆液中炎症因子白细胞介素-1β(IL-1β),白细胞介素-6(IL-6),白细胞介素-18(IL-18)的含量,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测海马NLRP3,凋亡相关斑点样蛋白(ASC),半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶-1(Caspase-1)蛋白的相对表达量,苏木素-伊红(HE)染色观察海马组织病理形态,免疫荧光法检测NLRP3,ASC,Caspase-1的平均荧光强度,电镜观察神经元超微结构。结果:与正常组比较,模型组大鼠总穿臂次数(TE),进入高架十字迷宫开放臂比(OE%),开放臂停留时间比(OT%)及自主活动评分均显著降低(P<0.01),焦虑和抑郁样行为显著,血清及海马中IL-1β,IL-6,IL-18含量显著升高(P<0.01),NLRP3,ASC,Caspase-1蛋白表达显著增加(P<0.01),NLRP3炎症小体激活,海马神经元明显损伤;与模型组比较,百合地黄汤高剂量组大鼠焦虑、抑郁行为均显著改善(P<0.01),血清及海马IL-1β,IL-6,IL-18含量均明显降低(P<0.05,P<0.01),海马NLRP3,ASC,Caspase-1蛋白表达显著降低(P<0.01),海马神经元损伤情况得以缓解。结论:百合地黄汤能够通过抑制NLRP3炎症小体的过度激活改善焦虑性抑郁症神经元损伤。 展开更多
关键词 百合地黄汤 焦虑性抑郁症 NOD样受体热蛋白结构域3(NLRP3) 炎症小体 海马 神经元
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旋覆代赭汤对RE模型大鼠NLRP3/Caspase-1的影响 被引量：23
15
作者 柳媛 刘菊 +3 位作者 刘亚婷 苗嘉萌 袁红霞 于盼盼 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第20期13-18,共6页
目的:通过观察旋覆代赭汤对反流性食管炎(RE)模型大鼠炎症小体组成成分及相关炎症因子表达的影响,探究NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)/半胱氨酸蛋白酶(Caspase)-1信号通路与食管炎症的相关性,阐明旋覆代赭汤治疗RE的作用机制。... 目的:通过观察旋覆代赭汤对反流性食管炎(RE)模型大鼠炎症小体组成成分及相关炎症因子表达的影响,探究NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)/半胱氨酸蛋白酶(Caspase)-1信号通路与食管炎症的相关性,阐明旋覆代赭汤治疗RE的作用机制。方法:将60只健康雄性Wistar大鼠,随机分为4组,分别为正常组,模型组,旋覆代赭汤组(9. 89 g·kg-1),阳性药组(奥美拉唑镁肠溶片+枸橼酸莫沙必利片,2. 58 mg·kg-1),每组15只。除正常组外,其余各组大鼠行'4. 2 mm幽门夹+2/3胃底结扎术'方法造模。从术后第8天开始,给予相应的药物进行灌胃干预,每日2次,共14 d,第15天处死取动脉血及食管组织。肉眼及光镜下观察食管组织病理学形态,应用酶联免疫吸附测定(ELISA)检测血清中Caspase-1,白细胞介素-1β(IL-1β)的分泌情况,采用蛋白免疫印迹法(Western blot)检测食管组织中NLRP3,Caspase-1,IL-1β的蛋白表达情况。结果:食管黏膜肉眼及镜下观察,与正常组比较,模型组损伤最为严重,积分最高。与正常组比较,模型组大鼠血清中Caspase-1,IL-1β的含量和食管组织中NLRP3,Caspase-1,IL-1β的蛋白表达明显升高(P <0. 05,P <0. 01);与模型组比较,旋覆代赭汤可明显降低大鼠血清中Caspase-1,IL-1β的含量,下调食管组织中NLRP3,Caspase-1,IL-1β的蛋白表达水平(P <0. 05,P <0. 01)。结论:旋覆代赭汤可以下调炎症小体蛋白组分NLRP3,Caspase-1的表达,降低炎症因子IL-1β的含量,表明此方可能通过抑制NLRP3/Caspase-1信号通路的激活,拮抗食管炎症反应,减少食管炎症损伤,治疗RE。 展开更多
关键词 反流性食管炎 旋覆代赭汤 NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3 (NLRP3) 半胱氨酸蛋白酶(Caspase)-1 白细胞介素-1β(IL-1β)
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复方银花解毒颗粒对脂多糖致幼龄大鼠急性肺炎模型的抗炎作用及TLR4/NF-κB/NLRP3信号通路的影响 被引量：20
16
作者 徐颖 王爽 +3 位作者 秦婷婷 马占强 傅强 马世平 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期203-210,共8页
目的研究复方银花解毒颗粒(Compound Yinhua Jiedu Granule)对脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)致幼龄大鼠急性肺炎模型的抗炎作用及Toll样受体4(Tolllikereceptor4,TLR4)/核转录因子-κB(nuclearfactor-κB,NF-κB)/NOD样受体热蛋白结... 目的研究复方银花解毒颗粒(Compound Yinhua Jiedu Granule)对脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)致幼龄大鼠急性肺炎模型的抗炎作用及Toll样受体4(Tolllikereceptor4,TLR4)/核转录因子-κB(nuclearfactor-κB,NF-κB)/NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NOD-like receptor thermal protein domain associated protein 3,NLRP3)信号通路的影响。方法将120只幼龄大鼠随机分为6组,分别为对照组、模型组、布洛芬颗粒组(0.8g/kg)及复方银花解毒颗粒低、中、高剂量(1.25、2.5、5 g/kg)组,ig给药1周,末次给药1 h后尾iv LPS(1 mg/kg)制备急性肺炎模型,6 h后采用麻醉后颈椎脱臼处死。采用ELISA试剂盒检测各组大鼠肺泡灌洗液及血清中炎症因子白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)、IL-17、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)水平的变化;HE染色观察肺组织形态学变化;运用免疫组化染色法检测肺组织TLR4,入核NF-κB和NLRP3蛋白的表达,Westernblotting法检测肺组织中TLR4、磷酸化NF-κB(p-NF-κB)、磷酸化核转录因子-κB抑制蛋白α(nuclear factor-κB inhibitor proteinα,p-IκBα)和NLRP3蛋白的表达。结果复方银花解毒颗粒预处理对LPS诱导幼龄大鼠急性肺损伤具有较强的保护作用,可降低模型大鼠肺泡灌洗液及血清中炎症因子IL-1β、IL-17、TNF-α的水平,减少肺组织中TLR4、NF-κB的激活和NLRP3蛋白的表达。结论复方银花解毒颗粒对LPS致幼龄大鼠急性肺炎模型具有抗炎作用,其机制可能与下调TLR4/NF-κB/NLRP3炎症信号通路有关。 展开更多
关键词 复方银花解毒颗粒 LPS 急性肺炎 炎症因子 Toll样受体4 核转录因子-ΚB NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3
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NLRP3炎症小体与抑郁症的关系及中医药的干预作用 被引量：16
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作者 张楠 许二平 陈玉龙 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期186-193,共8页
抑郁症是全球高发性精神疾病,严重威胁人们健康,带来严重的社会经济负担。近年来,随着研究的逐步深入,有关抑郁症的发病机制研究已经不再局限于神经递质、下丘脑-垂体-肾上腺轴、氧化应激等方面,神经炎症在抑郁症发病机制中的重要作用... 抑郁症是全球高发性精神疾病,严重威胁人们健康,带来严重的社会经济负担。近年来,随着研究的逐步深入,有关抑郁症的发病机制研究已经不再局限于神经递质、下丘脑-垂体-肾上腺轴、氧化应激等方面,神经炎症在抑郁症发病机制中的重要作用日益受到重视。研究发现,NOD样受体热蛋白结构域3(NLRP3)炎症小体作为连接心理应激和抑郁症的桥梁,可以启动炎症级联反应,介导抑郁症的产生。该文通过探讨NLRP3炎症小体与抑郁症的关系,挖掘其在抑郁症中可能存在的调控机制及作用靶点,总结中医药通过调控NLRP3炎症小体,减少炎症细胞因子释放,发挥抗抑郁的作用机制,以期为抑郁症的防治提供新的思路。 展开更多
关键词 NOD样受体热蛋白结构域3(NLRP3)炎症小体 抑郁症 中医药 研究进展
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T细胞免疫球蛋白和黏蛋白结构域蛋白-3对慢性心力衰竭患者T细胞功能的调控作用 被引量：18
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作者 禹海文 董炎炎 党瑜华 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第17期1315-1319,共5页
目的观察慢性心衰患者中T细胞免疫球蛋白和黏蛋白结构域蛋白-3(TIM-3)的表达及其对T细胞的调控作用。方法收集2018年1至10月在郑州大学第一附属医院心血管内科住院治疗的慢性心衰患者86例(心衰组)和在郑州大学第一附属医院接受查体的健... 目的观察慢性心衰患者中T细胞免疫球蛋白和黏蛋白结构域蛋白-3(TIM-3)的表达及其对T细胞的调控作用。方法收集2018年1至10月在郑州大学第一附属医院心血管内科住院治疗的慢性心衰患者86例(心衰组)和在郑州大学第一附属医院接受查体的健康对照32名(健康对照组),分离外周血单个核细胞,流式细胞术检测CD4+T细胞和CD8+T细胞中TIM-3的表达。分选CD4+T细胞和CD8+T细胞,使用抗TIM-3抗体刺激培养。酶联免疫吸附试验检测CD4+T细胞培养上清中干扰素-γ(IFN-γ)、白细胞介素(IL)-4、IL-10、IL-35、IL-17、IL-22水平和CD8^+T细胞培养上清中肿瘤坏死因子(TNF-α)和IFN-γ水平,实时定量PCR法检测CD4+T细胞中转录因子T-bet、GATA-3、FoxP3、RORγt和CD8+T细胞中穿孔素、颗粒酶B mRNA相对表达量。组间比较采用t检验或配对t检验进行。结果心衰组TIM-3^+CD4^+T细胞比例高于健康对照组(3.47%±1.06%比0.92%±0.27%,P<0.001),心衰组TIM-3^+CD8^+T细胞比例亦高于健康对照组(6.12%±1.91%比1.77%±0.63%,P<0.001)。慢性心衰患者存在CD4+T细胞和CD8+T细胞功能不全,表现为心衰组CD4^+T细胞分泌IFN-γ、IL-17和IL-22水平低于健康对照组,分泌IL-10和IL-35水平高于健康对照组(均P<0.05)。心衰组CD4^+T细胞中T-bet和RORγt mRNA相对表达量低于健康对照组(均P<0.01),FoxP3 mRNA相对表达量高于健康对照组(1.93±0.88比0.97±0.28,P=0.031)。心衰组CD8+T细胞分泌TNF-α和IFN-γ水平低于健康对照组(均P<0.05),穿孔素和颗粒酶B mRNA相对表达量亦低于健康对照组(均P<0.05)。抗TIM-3抗体刺激慢性心衰患者纯化的CD4+T细胞,分泌IFN-γ、IL-17和IL-22水平高于无抗TIM-3抗体刺激(均P<0.05),分泌IL-35水平则低于无抗TIM-3抗体刺激[(61±13)ng/ml比(72±17)ng/ml,P=0.029]。抗TIM-3抗体刺激后CD4+T细胞中T-bet和RORγt mRNA相对表达量高于无TIM-3抗体刺激(均P<0.05)。抗TIM-3抗体刺激慢性心衰患者纯化的CD8+T细胞后, 展开更多
关键词 T细胞免疫球蛋白和黏蛋白结构域蛋白-3 心力衰竭 T淋巴细胞 免疫调控
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电针“上巨虚”和“天枢”对溃疡性结肠炎大鼠核转录因子-κB/NOD样受体热蛋白结构域3信号通路相关蛋白表达的影响 被引量：17
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作者 曹倩茹 凌晨 +2 位作者 刘梦君 张泓 邓石峰 《针刺研究》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期314-320,共7页
目的:观察电针“上巨虚”“天枢”对2-4-6三硝基苯磺酸(TNBS)/乙醇诱导的溃疡性结肠炎(UC)大鼠核转录因子-κB(NF-κB)/NOD样受体热蛋白结构域3(NLRP3)炎性小体信号通路相关蛋白表达的影响,探讨电针治疗UC的部分作用机制。方法:SD大鼠... 目的:观察电针“上巨虚”“天枢”对2-4-6三硝基苯磺酸(TNBS)/乙醇诱导的溃疡性结肠炎(UC)大鼠核转录因子-κB(NF-κB)/NOD样受体热蛋白结构域3(NLRP3)炎性小体信号通路相关蛋白表达的影响,探讨电针治疗UC的部分作用机制。方法:SD大鼠随机分成空白组、模型组、美沙拉嗪组和电针组,每组12只。采用TNBS/乙醇灌肠法制备UC大鼠模型。电针组予电针双侧“上巨虚”“天枢”穴,每日1次,每次20 min,共10次;美沙拉嗪组予美沙拉嗪混悬液(0.2 g/kg)灌胃,每日1次,共10次。观察大鼠一般情况,计算大鼠疾病活动指数(DAI);肉眼结合HE染色观察结肠黏膜损伤情况及结肠组织形态学变化,并评估结肠形态损伤指数(CMDI);酶联免疫吸附法检测血清白细胞介素-1β(IL-1β)、NLRP3及肿瘤坏死因子-α(TNF-α)的含量;分别采用免疫组织化学法、Western blot法检测结肠组织中NF-κB及NLRP3表达水平。结果:与空白组比较,模型组一般情况较差,肠黏膜坏死,形成明显溃疡面,并有大量炎细胞浸润,DAI及CMDI评分显著升高(P<0.05),血清IL-1β、NLRP3、TNF-α含量及结肠组织NF-κB、NLRP3相对表达量均显著升高(P<0.05)。与模型组比较,美沙拉嗪组和电针组一般情况明显好转,肠黏膜坏死、炎细胞浸润程度明显减轻,DAI及CMDI评分显著降低(P<0.05),血清IL-1β、NLRP3、TNF-α含量及结肠组织NF-κB、NLRP3相对表达量显著降低(P<0.05)。与美沙拉嗪组比较,电针组CMDI评分及血清IL-1β含量显著降低(P<0.05)。结论:电针对UC具有一定的治疗作用,其作用机制可能与下调NF-κB/NLRP3信号通路IL-1β、TNF-α、NF-κB及NLRP3炎性小体的表达有关。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 电针 核转录因子 NOD样受体热蛋白结构域3 结肠组织
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C_2H_2型锌指蛋白的研究进展 被引量：13
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作者 周畅 李麓芸 《生命科学研究》 CAS CSCD 2004年第3期215-220,共6页
锌指基因家族是人体中最大的基因家族,它参与细胞分化、胚胎发育,并与许多疾病的发生相关.根据半胱氨酸(C)和组氨酸(H)的数目和位置可将锌指蛋白分为C2H2、C2HC、C2C2、C2HCC2C2、C2C2C2C2等亚类.C2H2型锌指是最普遍的类型,它们作为重... 锌指基因家族是人体中最大的基因家族,它参与细胞分化、胚胎发育,并与许多疾病的发生相关.根据半胱氨酸(C)和组氨酸(H)的数目和位置可将锌指蛋白分为C2H2、C2HC、C2C2、C2HCC2C2、C2C2C2C2等亚类.C2H2型锌指是最普遍的类型,它们作为重要的转录调控因子参与许多的生理过程.C2H2型锌指蛋白包含的锌指数目从1个到30多个不等.依据锌指的数量以及在蛋白中的分布情况,大多数C2H2型锌指蛋白属于下列3类之一:1)含3个C2H2锌指的蛋白(tC2H2);2)含多个锌指的C2H2型锌指结构蛋白(maC2H2);3)锌指成对间隔排列的C2H2型锌指蛋白(spC2H2).一些C2H2型锌指蛋白能识别并结合特异性RNA或DNA片段,另一些则只能与RNA结合.通常锌指蛋白含锌指数目越多,它选择结合的能力就越强. 展开更多
关键词 转录因子 C2H2锌指蛋白 DNA结合蛋白结构域
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