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蛋白质组学在评价人子宫内膜容受性中的应用进展
1
作者
马丽娜
漆海宁
+5 位作者
秦莹
刘洋
罗凤娟
罗蓉
吴效科
邢建红
《现代妇产科进展》
2024年第6期473-476,共4页
良好的子宫内膜容受性是胚胎着床的必要条件,容受期子宫内膜组织的特异性蛋白表达与容受性密切相关。通过蛋白组测序技术可获得月经不同时期子宫内膜组织的蛋白表达图谱,结合生物信息学分析,可更好地了解容受期子宫内膜特异蛋白表达,并...
良好的子宫内膜容受性是胚胎着床的必要条件,容受期子宫内膜组织的特异性蛋白表达与容受性密切相关。通过蛋白组测序技术可获得月经不同时期子宫内膜组织的蛋白表达图谱,结合生物信息学分析,可更好地了解容受期子宫内膜特异蛋白表达,并为其调控机制研究提供技术支持。蛋白质组学技术的发展为生理病理条件下的子宫内膜功能特征研究提供了便捷有效的分析方法。同时,对于准确判断不孕症患者及反复植入失败患者的子宫内膜容受性,进一步指导患者的个体化胚胎移植,具有非常重要的临床应用价值。对蛋白质组学测序技术在人子宫内膜容受性相关研究中的应用进行系统综述,旨在深入了解子宫内膜容受性,以期提高辅助生殖技术周期中妊娠率和减少生育治疗费用。
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关键词
子宫内膜容受性
蛋白组学
测序
技术
种植窗
胚胎移植
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职称材料
口腔肿瘤干细胞样细胞中锌指蛋白750的潜在靶蛋白筛选
2
作者
姜博
于水
+3 位作者
杨一昆
徐聪
杨红莉
陈海英
《山东医药》
CAS
2023年第15期38-42,共5页
目的筛选锌指蛋白750(ZNF750)在口腔肿瘤干细胞样细胞(CSC-like cell)中的潜在靶蛋白。方法(1)CSC-like cell的富集:采用肿瘤球形成实验富集口腔鳞癌(OSCC)细胞系TCA-83及CAL-27细胞中CSC-like cell细胞。(2)CSC-like cell细胞中ZNF750...
目的筛选锌指蛋白750(ZNF750)在口腔肿瘤干细胞样细胞(CSC-like cell)中的潜在靶蛋白。方法(1)CSC-like cell的富集:采用肿瘤球形成实验富集口腔鳞癌(OSCC)细胞系TCA-83及CAL-27细胞中CSC-like cell细胞。(2)CSC-like cell细胞中ZNF750潜在靶蛋白筛选:将CSC-like cell分为oe-Con组(转导空载体慢病毒)及oeZNF750组(转导过表达ZNF750慢病毒),采用TMT标记定量蛋白质组学技术筛选两组差异表达蛋白,对差异表达蛋白进行生物信息学分析[GO、KEGG及IPR(结构域)分析],从差异表达蛋白中选择与ZNF750关系密切的候选蛋白[角鲨烯合酶(FDFT1)、与糖代谢相关的糖原合成酶(GYS1)、与核糖体相关的核糖体蛋白RPL15及40S核糖体蛋白RPS7以及具有结构分子活性的角蛋白6A、17(KRT6A、KRT17)]进行实时荧光定量PCR(qPCR)验证。从与ZNF750关系密切的候选蛋白中选择FDFT1(与类固醇生物合成有关兼具酶转运活性)作为兴趣蛋白,采用qPCR检测CSC-like cell、口腔鳞癌(OSCC)细胞、正常口腔上皮细胞中FDFT1 mRNA的相对表达量,蛋白质印迹法检测过表达或敲减ZNF750基因的CSC-like cell中FDFT1蛋白相对表达量。结果(1)转导过表达ZNF750基因的CSC-like cell细胞中差异表达蛋白的筛选结果:与oe-Con组相比,oe-ZNF750组中差异表达蛋白共26个,其中上调9个,下调17个。(2)差异表达蛋白生信分析结果及其中与ZNF750关系密切的差异表达蛋白验证结果:GO分析结果显示,差异表达蛋白主要位于细胞内和细胞内非膜结合细胞器,参与生物合成及生物大分子的合成过程;涉及的生物功能包含结构分子活性、糖原合成酶活性、糖脂转运及糖脂结合功能;KEGG信号通路分析结果显示,差异表达蛋白显著富集在类固醇生物合成及糖代谢过程中;IPR分析证明富集的结构域包含糖脂转移蛋白结构域。qPCR结果显示,ZNF750可降低FDFT1、GYS1、RPL15、RPS7、KRT6A、KRT17基因的表达(P均<0.05)。(3)CSC-like
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关键词
锌指
蛋白
750
角鲨烯合酶
胆固醇代谢
肿瘤干细胞
蛋白组学
测序
技术
同位素标记定量
技术
口腔鳞癌
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职称材料
题名
蛋白质组学在评价人子宫内膜容受性中的应用进展
1
作者
马丽娜
漆海宁
秦莹
刘洋
罗凤娟
罗蓉
吴效科
邢建红
机构
山东中医药大学附属医院
山东中医药大学博士后流动站
黑龙江中医药大学附属第一医院
黑龙江中医药大学
江西省妇幼保健院
出处
《现代妇产科进展》
2024年第6期473-476,共4页
基金
国家重点研发计划项目(No:2019YFC1709500)
国家重大疑难疾病中西医临床协作试点项目(国中医药办医政发[2018]3号)
山东省中医药科技项目重点项目(No:Z-2023075)
文摘
良好的子宫内膜容受性是胚胎着床的必要条件,容受期子宫内膜组织的特异性蛋白表达与容受性密切相关。通过蛋白组测序技术可获得月经不同时期子宫内膜组织的蛋白表达图谱,结合生物信息学分析,可更好地了解容受期子宫内膜特异蛋白表达,并为其调控机制研究提供技术支持。蛋白质组学技术的发展为生理病理条件下的子宫内膜功能特征研究提供了便捷有效的分析方法。同时,对于准确判断不孕症患者及反复植入失败患者的子宫内膜容受性,进一步指导患者的个体化胚胎移植,具有非常重要的临床应用价值。对蛋白质组学测序技术在人子宫内膜容受性相关研究中的应用进行系统综述,旨在深入了解子宫内膜容受性,以期提高辅助生殖技术周期中妊娠率和减少生育治疗费用。
关键词
子宫内膜容受性
蛋白组学
测序
技术
种植窗
胚胎移植
分类号
R711.5 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
口腔肿瘤干细胞样细胞中锌指蛋白750的潜在靶蛋白筛选
2
作者
姜博
于水
杨一昆
徐聪
杨红莉
陈海英
机构
聊城市人民医院中心实验室
聊城市人民医院样本库
出处
《山东医药》
CAS
2023年第15期38-42,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(81773759)。
文摘
目的筛选锌指蛋白750(ZNF750)在口腔肿瘤干细胞样细胞(CSC-like cell)中的潜在靶蛋白。方法(1)CSC-like cell的富集:采用肿瘤球形成实验富集口腔鳞癌(OSCC)细胞系TCA-83及CAL-27细胞中CSC-like cell细胞。(2)CSC-like cell细胞中ZNF750潜在靶蛋白筛选:将CSC-like cell分为oe-Con组(转导空载体慢病毒)及oeZNF750组(转导过表达ZNF750慢病毒),采用TMT标记定量蛋白质组学技术筛选两组差异表达蛋白,对差异表达蛋白进行生物信息学分析[GO、KEGG及IPR(结构域)分析],从差异表达蛋白中选择与ZNF750关系密切的候选蛋白[角鲨烯合酶(FDFT1)、与糖代谢相关的糖原合成酶(GYS1)、与核糖体相关的核糖体蛋白RPL15及40S核糖体蛋白RPS7以及具有结构分子活性的角蛋白6A、17(KRT6A、KRT17)]进行实时荧光定量PCR(qPCR)验证。从与ZNF750关系密切的候选蛋白中选择FDFT1(与类固醇生物合成有关兼具酶转运活性)作为兴趣蛋白,采用qPCR检测CSC-like cell、口腔鳞癌(OSCC)细胞、正常口腔上皮细胞中FDFT1 mRNA的相对表达量,蛋白质印迹法检测过表达或敲减ZNF750基因的CSC-like cell中FDFT1蛋白相对表达量。结果(1)转导过表达ZNF750基因的CSC-like cell细胞中差异表达蛋白的筛选结果:与oe-Con组相比,oe-ZNF750组中差异表达蛋白共26个,其中上调9个,下调17个。(2)差异表达蛋白生信分析结果及其中与ZNF750关系密切的差异表达蛋白验证结果:GO分析结果显示,差异表达蛋白主要位于细胞内和细胞内非膜结合细胞器,参与生物合成及生物大分子的合成过程;涉及的生物功能包含结构分子活性、糖原合成酶活性、糖脂转运及糖脂结合功能;KEGG信号通路分析结果显示,差异表达蛋白显著富集在类固醇生物合成及糖代谢过程中;IPR分析证明富集的结构域包含糖脂转移蛋白结构域。qPCR结果显示,ZNF750可降低FDFT1、GYS1、RPL15、RPS7、KRT6A、KRT17基因的表达(P均<0.05)。(3)CSC-like
关键词
锌指
蛋白
750
角鲨烯合酶
胆固醇代谢
肿瘤干细胞
蛋白组学
测序
技术
同位素标记定量
技术
口腔鳞癌
Keywords
Zinc finger protein 750
squalene synthase(or farnesyl diphosphate farnesyltransferase,FDFT1)
cho⁃lesterol metabolism
cancer stem cells
proteomics sequencing technology
isotope labeling quantitative technology
oral squamous-cell carcinoma
分类号
R739.8 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蛋白质组学在评价人子宫内膜容受性中的应用进展
马丽娜
漆海宁
秦莹
刘洋
罗凤娟
罗蓉
吴效科
邢建红
《现代妇产科进展》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
口腔肿瘤干细胞样细胞中锌指蛋白750的潜在靶蛋白筛选
姜博
于水
杨一昆
徐聪
杨红莉
陈海英
《山东医药》
CAS
2023
0
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职称材料
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