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不同剂量电离辐射对人外周血淋巴细胞DNA损伤修复相关基因转录水平的影响
被引量:
10
1
作者
陈慧峰
谭斯文
+3 位作者
闫雪华
王恰
杨宇华
邹剑明
《中国辐射卫生》
2020年第1期7-12,共6页
目的阐明不同剂量电离辐射对人外周血淋巴细胞中DNA损伤修复相关基因(hOGG1、MGMT、PPP2R1A和PPP2R2D)转录水平的影响。方法抽取志愿者外周静脉血约30 mL,分置于7支肝素锂抗凝管中,以剂量率为0.38 mGy·min-1的60Coγ射线(剂量分别...
目的阐明不同剂量电离辐射对人外周血淋巴细胞中DNA损伤修复相关基因(hOGG1、MGMT、PPP2R1A和PPP2R2D)转录水平的影响。方法抽取志愿者外周静脉血约30 mL,分置于7支肝素锂抗凝管中,以剂量率为0.38 mGy·min-1的60Coγ射线(剂量分别为0、0.1、0.2、0.4、0.8、1.6和3.2 Gy)对人外周血照射后培养12 h,分离外周血淋巴细胞,提取总RNA并进行定量和纯度分析。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)的方法分析不同剂量电离辐射诱导DNA损伤修复相关基因hOGG1、MGMT、PPP2R1A和PPP2R2D基因转录水平的变化。结果 hOGG1基因、MGMT基因和PPP2R2D基因的mRNA转录水平均在0.1 Gy时达到峰值。PPP2R1A基因的mRNA转录水平在0.2 Gy剂量时达到峰值。hOGG1基因转录水平在0.1和0.2 Gy剂量组均较对照组显著增高,差异均具有统计学意义(P <0.05)。MGMT基因转录水平在0.1、0.2和0.8 Gy剂量组均明显高于对照组,差异均具有统计学意义(P <0.05)。PPP2R1A基因转录水平在0.2 Gy剂量组比对照组明显增高,在3.2Gy剂量组比对照组明显降低,差异均具有统计学意义(P <0.05)。PPP2R2D基因转录水平在0.1、0.2、0.4和0.8 Gy剂量组均明显高于对照组,3.2 Gy剂量组比对照组明显降低,差异均具有统计学意义(P <0.05)。结论不同剂量电离辐射均可诱导DNA损伤修复相关的应答基因hOGG1、MGMT、PPP2R1A和PPP2R2D的转录水平改变,适宜剂量的电离辐射(0.1~0.2 Gy)可诱导细胞产生辐射兴奋效应或适应性反应。
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关键词
低剂量电离辐射
DNA损伤修复
8-羟基脱氧鸟嘌呤DNA糖苷
酶
-1
基因
O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移
酶
基因
蛋白
磷酸酶
2A-A
α
亚基
基因
蛋白
磷酸酶
2A-Bδ
亚基
基因
原文传递
生物信息学技术分析人结直肠癌中蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)表达与患者预后及免疫浸润的关系
2
作者
梁小洁
程照翔
+2 位作者
尚维伟
陈信浩
李俊
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期591-604,共14页
目的通过分析蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)在结直肠癌(CRC)中表达水平与患者预后及免疫浸润的关系,进一步了解CRC发生和进展中的相关机制。方法基于基因芯片数据库Oncomine和肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析在CRC组织和正常组织中...
目的通过分析蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)在结直肠癌(CRC)中表达水平与患者预后及免疫浸润的关系,进一步了解CRC发生和进展中的相关机制。方法基于基因芯片数据库Oncomine和肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析在CRC组织和正常组织中PPP2CA表达水平的差异性;基于阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户(UALCAN)和基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析PPP2CA的表达水平对CRC患者预后的影响;基于LinkedOmics平台构建PPP2CA的共表达网络并进行基因本体论(GO)富集分析和京东基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析;基于TIMER和GEPIA数据库分析PPP2CA与免疫浸润之间的相关性。基于c-BioPortal平台分析结肠腺癌(COAD)中PPP2CA的基因突变情况。结果与正常结直肠组织相比,在CRC组织中PPP2CA表达下调。高表达水平的PPP2CA预示着更好的总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)。在COAD中,PPP2CA的表达水平与包括CD8^(+)T细胞、中性粒细胞和树突状细胞在内的免疫浸润细胞呈正相关。而某些免疫细胞标志物,包括B细胞的CD19和CD38、M1巨噬细胞的一氧化氮合酶2(NOS2)、M2巨噬细胞的精氨酸酶1(Arg1)和甘露糖受体C1(MRC1)、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的人类白细胞抗原G(HLA-G)和CD80、单核细胞的CD14和IgG Fc段受体Ⅲa(FCGR3A),却显示出不同的PPP2CA相关免疫浸润模式:即PPP2CA表达水平与COAD和直肠腺癌(READ)中的B细胞、巨噬细胞、单核细胞、TAM、1型辅助T(Th1)细胞、Th2细胞、调节性T细胞、衰竭T细胞和中性粒细胞均显著相关。结论PPP2CA在CRC组织表达水平下调,并且与免疫浸润密切相关。
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关键词
蛋白
磷酸酶
2A催化
亚基
α
基因
(PPP2CA)
结直肠癌(CRC)
免疫浸润
预后
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职称材料
题名
不同剂量电离辐射对人外周血淋巴细胞DNA损伤修复相关基因转录水平的影响
被引量:
10
1
作者
陈慧峰
谭斯文
闫雪华
王恰
杨宇华
邹剑明
机构
广东省职业病防治院
广东医科大学
出处
《中国辐射卫生》
2020年第1期7-12,共6页
基金
国家自然科学基金(81302387)
广东省自然科学基金(2019A1515011969)
+1 种基金
广东省医学科研基金立项课题(A2017227)
广东省职业病防治重点实验室(2017B030314152)。
文摘
目的阐明不同剂量电离辐射对人外周血淋巴细胞中DNA损伤修复相关基因(hOGG1、MGMT、PPP2R1A和PPP2R2D)转录水平的影响。方法抽取志愿者外周静脉血约30 mL,分置于7支肝素锂抗凝管中,以剂量率为0.38 mGy·min-1的60Coγ射线(剂量分别为0、0.1、0.2、0.4、0.8、1.6和3.2 Gy)对人外周血照射后培养12 h,分离外周血淋巴细胞,提取总RNA并进行定量和纯度分析。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)的方法分析不同剂量电离辐射诱导DNA损伤修复相关基因hOGG1、MGMT、PPP2R1A和PPP2R2D基因转录水平的变化。结果 hOGG1基因、MGMT基因和PPP2R2D基因的mRNA转录水平均在0.1 Gy时达到峰值。PPP2R1A基因的mRNA转录水平在0.2 Gy剂量时达到峰值。hOGG1基因转录水平在0.1和0.2 Gy剂量组均较对照组显著增高,差异均具有统计学意义(P <0.05)。MGMT基因转录水平在0.1、0.2和0.8 Gy剂量组均明显高于对照组,差异均具有统计学意义(P <0.05)。PPP2R1A基因转录水平在0.2 Gy剂量组比对照组明显增高,在3.2Gy剂量组比对照组明显降低,差异均具有统计学意义(P <0.05)。PPP2R2D基因转录水平在0.1、0.2、0.4和0.8 Gy剂量组均明显高于对照组,3.2 Gy剂量组比对照组明显降低,差异均具有统计学意义(P <0.05)。结论不同剂量电离辐射均可诱导DNA损伤修复相关的应答基因hOGG1、MGMT、PPP2R1A和PPP2R2D的转录水平改变,适宜剂量的电离辐射(0.1~0.2 Gy)可诱导细胞产生辐射兴奋效应或适应性反应。
关键词
低剂量电离辐射
DNA损伤修复
8-羟基脱氧鸟嘌呤DNA糖苷
酶
-1
基因
O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移
酶
基因
蛋白
磷酸酶
2A-A
α
亚基
基因
蛋白
磷酸酶
2A-Bδ
亚基
基因
Keywords
Low Dose Ionizing Radiation
DNA Damage Repair
hOGG1 Gene
MGMT Gene
PPP
2
R1A Gene
PPP
2
R
2
D Gene
分类号
Q691 [生物学—生物物理学]
原文传递
题名
生物信息学技术分析人结直肠癌中蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)表达与患者预后及免疫浸润的关系
2
作者
梁小洁
程照翔
尚维伟
陈信浩
李俊
机构
南京医科大学附属江宁医院普外科
南京市江宁中医院普外科
南京医科大学附属江宁医院肝胆胰外科
出处
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期591-604,共14页
基金
南京市医学科技发展项目(YKK21231,QRX17102)
南京市科技计划项目(201803071)
南京医科大学科技发展项目(NMUB20210155)。
文摘
目的通过分析蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)在结直肠癌(CRC)中表达水平与患者预后及免疫浸润的关系,进一步了解CRC发生和进展中的相关机制。方法基于基因芯片数据库Oncomine和肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析在CRC组织和正常组织中PPP2CA表达水平的差异性;基于阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户(UALCAN)和基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析PPP2CA的表达水平对CRC患者预后的影响;基于LinkedOmics平台构建PPP2CA的共表达网络并进行基因本体论(GO)富集分析和京东基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析;基于TIMER和GEPIA数据库分析PPP2CA与免疫浸润之间的相关性。基于c-BioPortal平台分析结肠腺癌(COAD)中PPP2CA的基因突变情况。结果与正常结直肠组织相比,在CRC组织中PPP2CA表达下调。高表达水平的PPP2CA预示着更好的总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)。在COAD中,PPP2CA的表达水平与包括CD8^(+)T细胞、中性粒细胞和树突状细胞在内的免疫浸润细胞呈正相关。而某些免疫细胞标志物,包括B细胞的CD19和CD38、M1巨噬细胞的一氧化氮合酶2(NOS2)、M2巨噬细胞的精氨酸酶1(Arg1)和甘露糖受体C1(MRC1)、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的人类白细胞抗原G(HLA-G)和CD80、单核细胞的CD14和IgG Fc段受体Ⅲa(FCGR3A),却显示出不同的PPP2CA相关免疫浸润模式:即PPP2CA表达水平与COAD和直肠腺癌(READ)中的B细胞、巨噬细胞、单核细胞、TAM、1型辅助T(Th1)细胞、Th2细胞、调节性T细胞、衰竭T细胞和中性粒细胞均显著相关。结论PPP2CA在CRC组织表达水平下调,并且与免疫浸润密切相关。
关键词
蛋白
磷酸酶
2A催化
亚基
α
基因
(PPP2CA)
结直肠癌(CRC)
免疫浸润
预后
Keywords
protein phosphatase
2
catalytic subunit alpha(PPP
2
CA)
colorectal cancer(CRC)
immune infiltration
prognosis
分类号
R735.34 [医药卫生—肿瘤]
Q811.4 [医药卫生—临床医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同剂量电离辐射对人外周血淋巴细胞DNA损伤修复相关基因转录水平的影响
陈慧峰
谭斯文
闫雪华
王恰
杨宇华
邹剑明
《中国辐射卫生》
2020
10
原文传递
2
生物信息学技术分析人结直肠癌中蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)表达与患者预后及免疫浸润的关系
梁小洁
程照翔
尚维伟
陈信浩
李俊
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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