期刊文献+
共找到7篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
绵羊FSHR基因生物信息学分析及其器官表达规律研究 被引量:6
1
作者 胡斐 吕慎金 +1 位作者 金一 潘章源 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第3期24-27,31,177,共6页
为了验证及进一步研究促卵泡素受体(follicle-stimulating hormone receptor,FSHR)基因在绵羊繁殖力中的作用机制,试验采用生物信息学方法分析了绵羊FSHR基因结构、FSHR蛋白性质和结构、同源性、遗传进化、信号通路、蛋白互作网络和器... 为了验证及进一步研究促卵泡素受体(follicle-stimulating hormone receptor,FSHR)基因在绵羊繁殖力中的作用机制,试验采用生物信息学方法分析了绵羊FSHR基因结构、FSHR蛋白性质和结构、同源性、遗传进化、信号通路、蛋白互作网络和器官表达规律。结果表明:绵羊FSHR DNA全长196 149 bp,而编码蛋白质的mRNA序列全长只有2 431 bp,FSHR基因含有10个外显子;FSHR基因编码695个氨基酸,FSHR蛋白属于不稳定的脂溶性蛋白;FSHR蛋白是有7个跨膜结构的膜受体,包含LRR_5、GnRH_trans、7tm_1三种功能结构域,这三种结构域分别行使不同功能,共同激活G蛋白偶联机制,激活腺苷酸环化酶,使细胞内CAMP或Ca^(2+)内流增加,从而对细胞的生命活动进行调节;FSHR基因不但与繁殖相关基因Gdf9、Bmp15有关,还与抑制肿瘤转移基因Kiss1有关;FSHR的同源性分析和进化树构建结果显示,绵羊和山羊亲缘关系最近,其次是牛,与斑马鱼亲缘关系最远;FSHR基因在绵羊睾丸和卵巢中特异性高表达,并在各物种间的表达具有一致性。说明FSHR基因表达可能受内含子极为复杂和重要的调控,且在繁殖中起重要作用。该基因在睾丸中特异性高表达,与促卵泡生成素(FSH)对雄性动物曲细精管的发育、成熟和精子生成作用相吻合。 展开更多
关键词 绵羊 促卵泡素受体基因 生物信息学 蛋白理化性质 蛋白互作 组织表达
原文传递
猪METTL3基因生物信息学分析及靶基因预测
2
作者 秦睿 王文强 +5 位作者 韦梦姜 杨耀 焦润 王心如 杨伟炳 张娟丽 《生物技术》 CAS 2024年第4期431-438,共8页
[目的]获得猪METTL3蛋白理化性质、二、三级结构、蛋白保守性、甲基化位点及靶基因等信息,为进一步了解猪METTL3基因的功能提供了理论依据。[方法]利用生物信息学软件对猪METTL3蛋白质的理化性质、二、三级结构及保守结构域、甲基化位... [目的]获得猪METTL3蛋白理化性质、二、三级结构、蛋白保守性、甲基化位点及靶基因等信息,为进一步了解猪METTL3基因的功能提供了理论依据。[方法]利用生物信息学软件对猪METTL3蛋白质的理化性质、二、三级结构及保守结构域、甲基化位点、蛋白互作和靶基因等进行预测分析。[结果]猪METTL3为亲水性不稳定蛋白,主要由无规卷曲和α-螺旋、β-转角构成,主要存在于细胞核中,与METTL14、WTAP和POLR2B等蛋白具有互作关系。METTL3有4个高可信度m^(6)A位点,经M6A2 Target软件预测该基因与CASP1、PYCR1、RANBP2、LIRB4、APOBEC3A、ADAM19等134个基因存在靶向关系。[结论]猪METTL3是一种主要存在于细胞核中的亲水性不稳定蛋白,主要通过m^(6)A甲基化修饰作用于靶基因而发挥作用。 展开更多
关键词 METTL3基因 蛋白理化性质 保守性 亚细胞定位 甲基化位点 MOTIF 靶基因预测
原文传递
黄瓜CBP60基因家族鉴定及表达分析
3
作者 纽晓润 王金耀 +4 位作者 高阳 南江峰 张朝文 李森 邢国明 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期8-18,共11页
CBP60s(Calmodulin-binding protein 60)是植物所特有的钙调素结合蛋白家族之一,在调节黄瓜生长发育及应对盐胁迫时发挥重要作用。本研究利用生物信息学方法对黄瓜全基因组中筛选鉴定到的17个CBP60基因家族成员,进行基因序列特征、染色... CBP60s(Calmodulin-binding protein 60)是植物所特有的钙调素结合蛋白家族之一,在调节黄瓜生长发育及应对盐胁迫时发挥重要作用。本研究利用生物信息学方法对黄瓜全基因组中筛选鉴定到的17个CBP60基因家族成员,进行基因序列特征、染色体定位、亚细胞定位、基因结构、系统进化、启动子顺式作用元件和表达模式分析,探讨其基因功能及表达模式。黄瓜CBP60基因分子量为17307.87~99117.13 Da,等电点在5.55~9.96之间;17个CsCBP60基因家族成员不均匀分布在黄瓜染色体chr1、chr2、chr4、chr5上,部分基因在chr1上形成基因簇,并发生6个串联重复事件;亚细胞定位预测发现CsCBP60基因定位于叶绿体、细胞核、线粒体;CsCBP60基因均具有CaM结合结构域;CsCBP60基因家族可分为3个亚家族(ClassA-C),黄瓜与甜瓜的CBP60基因之间发生了10对共线性事件,与甜瓜亲缘最近。CsCBP60家族成员含有光响应和脱落酸响应、生长素响应、E-box、W-box等胁迫响应元件。在75 mmol/L NaCl处理24 h后,CsCBP60基因均有不同程度的响应,其中CsCBP60-1/3/7/8/9/11/15响应强烈,且在根部高表达,推测其可能在盐胁迫下发挥重要作用。本研究为进一步开展CsCBP60s功能研究提供了参考,有助于揭示该家族成员应对盐胁迫时的作用机制。 展开更多
关键词 黄瓜 CBP60基因家族 蛋白理化性质 基因结构 进化分析 盐胁迫
下载PDF
杜仲全基因组GRAS基因家族的鉴定和系统发育分析 被引量:3
4
作者 张传明 张宝会 +1 位作者 姚新转 吕立堂 《特产研究》 2021年第3期65-74,共10页
为研究杜仲中GRAS基因对杜仲生长发育及抗逆性的作用机制,本研究首先利用软件TBtools、Pfam和NCBI-CDD对杜仲GRAS基因进行了筛选和验证,随后借助ExPASy在线软件分析了杜仲GRAS蛋白的理化性质并通过软件MEGA 7.0构建了杜仲GRAS基因的系... 为研究杜仲中GRAS基因对杜仲生长发育及抗逆性的作用机制,本研究首先利用软件TBtools、Pfam和NCBI-CDD对杜仲GRAS基因进行了筛选和验证,随后借助ExPASy在线软件分析了杜仲GRAS蛋白的理化性质并通过软件MEGA 7.0构建了杜仲GRAS基因的系统进化树,最后使用在线软件MEME 5.2获得了杜仲GRAS基因的基因保守基序并通过Muscle程序和Jalview软件分析了杜仲GRAS蛋白的VHIID结构域特征。结果显示,杜仲中GRAS基因家族共含有分属于13个亚族的47个成员,其蛋白长度在388~803之间,蛋白分子量在42987~91063.2之间,等电点在4.49~9.67之间,并且都具有典型的GRAS结构域。通过对杜仲中的GRAS基因家族成员进行全面系统地分析,发现EuGRAS基因具有基因结构上的保守性和差异性,这可能与杜仲的环境适应性有关,这为进一步开展有关杜仲环境适应性机制并将其应用于濒危植物的保护等方面的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 杜仲 GRAS 蛋白理化性质 保守结构域 系统进化树
下载PDF
鸡传染性支气管炎病毒SD03株N基因的克隆、序列分析及N蛋白理化性质分析 被引量:1
5
作者 邢婧珉 陈冰 +5 位作者 李云霞 付立辉 张立霞 李亚杰 郁宏伟 杨保收 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第12期67-73,共7页
试验旨在确定国内鸡肾型传染性支气管炎病毒(IBV)流行毒株核蛋白N与市场上现用疫苗株、近年国内外分离株的差异性。本研究利用自山东某鸡场病鸡肾脏组织分离获得、经PCR鉴定为IBV阳性的毒株(命名为SD03株),参考NCBI上部分IBV毒株N基因... 试验旨在确定国内鸡肾型传染性支气管炎病毒(IBV)流行毒株核蛋白N与市场上现用疫苗株、近年国内外分离株的差异性。本研究利用自山东某鸡场病鸡肾脏组织分离获得、经PCR鉴定为IBV阳性的毒株(命名为SD03株),参考NCBI上部分IBV毒株N基因的保守区域设计引物,进行RT-PCR扩增,构建重组pMD18-T-N/DH5α菌,测序获得N基因序列。与参考株进行了核苷酸及氨基酸同源性分析,结合DNAStar软件与http://www.expasy.org/网站对该基因编码的蛋白进行理化性质分析。结果显示,SD03株为IBV肾型毒株,与LDT3、partridge/GD/S14/2003毒株(肾型)核苷酸及氨基酸同源性均在99.0%以上。与其他国内外肾型经典毒株Ma5、W93、Gray、Holte株氨基酸同源性为90.0%~94.6%,与国内外呼吸型疫苗株H120、H52、M41氨基酸同源性为89.7%~91.0%。本研究深入分析了当前流行株SD03株N蛋白的理化特性,为N蛋白亚单位疫苗在不同系统中表达及蛋白纯化提供了理论依据,为中国现阶段IBV的防控奠定了一定的理论基础。 展开更多
关键词 传染性支气管炎病毒 RT-PCR N基因 N蛋白 同源性 系统发生树 N蛋白理化性质
下载PDF
番茄OFP基因家族生物信息学分析 被引量:2
6
作者 程欣 《江苏农业科学》 北大核心 2021年第18期39-48,共10页
为了解番茄OFP基因家族的功能特征,通过生物信息学手段对番茄OFP基因家族成员进行全面的生物信息学分析,包括染色体定位、基因结构、蛋白质理化性质、二级结构、三维构象、启动子分析、亲缘关系及组织特异性分析。结果表明,番茄中的31个... 为了解番茄OFP基因家族的功能特征,通过生物信息学手段对番茄OFP基因家族成员进行全面的生物信息学分析,包括染色体定位、基因结构、蛋白质理化性质、二级结构、三维构象、启动子分析、亲缘关系及组织特异性分析。结果表明,番茄中的31个OFP基因在12条染色体上呈不均匀分布;除SlOFP6、SlOFP7、SlOFP12、SlOFP13基因以外,其余27个OFP基因均不含有内含子结构。蛋白质理化性质分析结果表明,大部分OFP蛋白为不稳定性蛋白,并且54.8%的OFP蛋白分布于细胞核中。蛋白质二级结构和三维构象显示,番茄OFP蛋白以α-螺旋和无规则卷曲为主要组成成分,表明番茄OFP蛋白之间存在保守性。启动子顺式作用元件分析结果表明,番茄OFP基因启动子上主要存在3类元件:光响应、激素响应应答以及逆境胁迫响应元件。而组织特异性分析结果表明,番茄OFP基因在各组织中的表达量差异较大,预示着番茄OFP基因生物学功能的多样性。分析结果将为后续研究番茄OFP基因家族成员的生物学功能提供参考。 展开更多
关键词 番茄(Solanum lycopersicum) OFP基因家族 生物信息学分析 蛋白理化性质 蛋白结构
下载PDF
超氧化物歧化酶在植物响应干旱、盐碱和冷害中的作用
7
作者 郭迦南 赵倚澎 +1 位作者 杨元植 管清杰 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期481-490,共10页
超氧化物歧化酶(SOD)在植物细胞中广泛存在,主要分为Mn-SOD,Fe-SOD以及Cu/Zn-SOD 3大类,它们可以在细胞中发挥不同的防御作用,增强植物的耐受力。此外在蓝细胞和海洋生物中存在的Ni-SOD有待探究。该研究根据SOD所包含金属离子的不同对... 超氧化物歧化酶(SOD)在植物细胞中广泛存在,主要分为Mn-SOD,Fe-SOD以及Cu/Zn-SOD 3大类,它们可以在细胞中发挥不同的防御作用,增强植物的耐受力。此外在蓝细胞和海洋生物中存在的Ni-SOD有待探究。该研究根据SOD所包含金属离子的不同对其理化性质和作用机制进行分析;阐述了在干旱、盐碱、冷害等胁迫下SOD在植物中发挥的作用,并对该酶在未来植物生长发育进程中的作用进行展望,为有关逆境环境下植物生长发育机制的研究提供参考。 展开更多
关键词 超氧化物歧化酶 蛋白质的理化性质 活性氧平衡作用机制 抗逆响应
下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部