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优质油菜籽粕蛋白质分类研究 被引量:19
1
作者 熊志勇 夏伏建 陆师国 《武汉植物学研究》 CAS CSCD 2001年第3期259-261,共3页
关键词 油菜 蛋白分类 氨基酸 SDS-PAGE 菜籽粕
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常见植物蛋白的分类组成和性质研究概述 被引量:1
2
作者 董阳 李晓敏 +1 位作者 史玉东 季国志 《农产品加工》 2024年第2期84-92,共9页
在植物蛋白的开发应用过程中,选择合适的植物蛋白原料的细分品类或者对其性质进行改良,对产品的质构和感官特性至关重要。然而在对不同植物蛋白性质的分类研究中,由于蛋白分离提取技术和方式不同,植物蛋白的分类标准并不统一。因此,根... 在植物蛋白的开发应用过程中,选择合适的植物蛋白原料的细分品类或者对其性质进行改良,对产品的质构和感官特性至关重要。然而在对不同植物蛋白性质的分类研究中,由于蛋白分离提取技术和方式不同,植物蛋白的分类标准并不统一。因此,根据植物蛋白的研究进程,整理了植物蛋白现有的不同分类方法及其性质依据,同时梳理了几种常用植物蛋白原料的蛋白质构成和加工特性,以期给植物蛋白成分的性质研究和加工应用提供参考依据。 展开更多
关键词 植物蛋白 蛋白分类 Osbern分类 沉降系数分类 免疫学分类 加工性质
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大豆籽粒蛋白代谢途径及相关调控机制研究进展 被引量:2
3
作者 敖雁 王安 +4 位作者 吴启 冯梦诗 蒋莹 吴薇 常庆涛 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期794-802,共9页
氮是大豆生长发育不可缺少的一种元素,主要通过大豆根部-根瘤体系等一系列途径转化为籽粒蛋白。大豆籽粒蛋白含量远高于其它作物,因其独特的营养价值和保健功能被广泛应用。本文介绍了大豆籽粒蛋白的特性和分类、综述了其主要代谢途径... 氮是大豆生长发育不可缺少的一种元素,主要通过大豆根部-根瘤体系等一系列途径转化为籽粒蛋白。大豆籽粒蛋白含量远高于其它作物,因其独特的营养价值和保健功能被广泛应用。本文介绍了大豆籽粒蛋白的特性和分类、综述了其主要代谢途径和调控机制等方面的研究进展,并提出以高蛋白大豆为主要育种目标的有效途径,以期为大豆的营养改良提供参考。 展开更多
关键词 大豆蛋白 蛋白分类 代谢途径 调控机制
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基于独立成分分析(ICA)的分类研究及在蛋白分类中的应用
4
作者 王玲玲 张湜 周春红 《化工自动化及仪表》 CAS 北大核心 2010年第12期86-89,共4页
独立成分分析方法(ICA)一般用于特征提取、过程监控,很少用于分类。本文建立了一个ICA用于分类的工具包,并应用专家库下载的嗜热蛋白和常温蛋白作为实验数据,用来检验该分类工具的性能。本文的检验工作分为如下几个步骤:首先对训练数据... 独立成分分析方法(ICA)一般用于特征提取、过程监控,很少用于分类。本文建立了一个ICA用于分类的工具包,并应用专家库下载的嗜热蛋白和常温蛋白作为实验数据,用来检验该分类工具的性能。本文的检验工作分为如下几个步骤:首先对训练数据进行特征提取;然后利用核函数确定嗜热蛋白的置信线;再计算测试数据的统计量。由测试数据判断是否超过置信线,不超出则认为是嗜热蛋白。该检验的结果是:对嗜热数据的漏检率为10%,误检率为30%,预测的正确率可达到80%。由此可说明,ICA可用作一种分类方法,本文所建立的分类工具也是有效的。 展开更多
关键词 独立成分分析(ICA) 分类方法 分类工具 蛋白分类
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ESCRT机制对阿尔茨海默病作用的研究进展
5
作者 欧阳燕玲 梁建文 +2 位作者 刘宗鑫 谢荣鑫 王晋平 《医学综述》 CAS 2022年第20期3978-3984,共7页
阿尔茨海默病(AD)是人类衰老过程中影响老年人智力、自理能力以及致残和新的致死病因的重大疾病之一。神经元中tau蛋白的过度磷酸化以及β淀粉样蛋白(Aβ)的沉积是AD发病的主要假说,目前仍无有效治疗AD的方案。转运必需内体分选复合物(E... 阿尔茨海默病(AD)是人类衰老过程中影响老年人智力、自理能力以及致残和新的致死病因的重大疾病之一。神经元中tau蛋白的过度磷酸化以及β淀粉样蛋白(Aβ)的沉积是AD发病的主要假说,目前仍无有效治疗AD的方案。转运必需内体分选复合物(ESCRT)在蛋白质降解及维持细胞结构完整、功能稳定方面发挥重要作用。ESCRT识别分类泛素化的病理tau蛋白及Aβ产生多囊泡体进入溶酶体降解或分泌,从而减轻tau蛋白及Aβ的神经元毒性作用。此外,ESCRT还能修复神经元突触的损伤,减少神经元的凋亡。因此,ESCRT机制的研究可能为治疗和延缓AD的进展提供新的研究思路和方向。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 转运体必需内体分选复合物 多囊泡体 蛋白分类
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大红袍花椒籽种仁蛋白的分类研究 被引量:21
6
作者 杨令叶 田呈瑞 权麻玉 《中国油脂》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期16-18,共3页
对大红袍花椒种仁蛋白质进行了Osborne蛋白质分类,分离出花椒种仁清蛋白16.38%、球蛋白41.09%、醇溶蛋白2.53%、谷蛋白33.29%,然后将分类后的各种花椒种仁蛋白质进行SDS-PAGE电泳分析测定亚基大小。结果表明,蛋白质组分中含有大量盐溶... 对大红袍花椒种仁蛋白质进行了Osborne蛋白质分类,分离出花椒种仁清蛋白16.38%、球蛋白41.09%、醇溶蛋白2.53%、谷蛋白33.29%,然后将分类后的各种花椒种仁蛋白质进行SDS-PAGE电泳分析测定亚基大小。结果表明,蛋白质组分中含有大量盐溶性的球蛋白和碱溶性的谷蛋白,易采用盐溶法或稀碱提取;并且花椒种仁中各蛋白质组分的相对分子质量较小,有利于人体对蛋白质的消化吸收。 展开更多
关键词 大红袍花椒种仁蛋白 Osborne蛋白分类 SDS—PAGE
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老年肺结核患者外周血中VPS33A水平表达与临床预后的相关性研究
7
作者 胡静 甘红辉 +1 位作者 刘学礼 戴刚 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第5期162-167,共6页
目的检测空泡蛋白分类相关蛋白33A(vacuolar protein sorting-associated protein 33A,VPS33A)在老年肺结核患者外周血中的表达情况,并探讨其与临床预后的相关性。方法收集麻城市人民医院2019年2月~2021年2月收治的95例老年肺结核患者... 目的检测空泡蛋白分类相关蛋白33A(vacuolar protein sorting-associated protein 33A,VPS33A)在老年肺结核患者外周血中的表达情况,并探讨其与临床预后的相关性。方法收集麻城市人民医院2019年2月~2021年2月收治的95例老年肺结核患者为研究组,另外选取同期健康体检者90例为对照组。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测外周血中VPS33A,Toll样受体2(TLR2)表达情况,酶联免疫吸附法(ELISA)检测外周血中白细胞介素-6(IL-6)水平。肺结核患者给予标准化抗结核方案治疗(2HRZE/4HR),治疗后随访12个月,根据患者预后将其分为预后良好组(n=58)和预后不良组(n=37),采用受试者工作特征(ROC)曲线分析VPS33A对患者预后不良的预测价值;Pearson法分析预后不良组血清VPS33A与IL-6,TLR2的相关性;Logistic回归分析老年肺结核患者预后不良的影响因素。结果与对照组比较,治疗前研究组外周血VPS33A(0.87±0.22vs1.02±0.23)水平明显降低,IL-6(22.13±5.36 pg/mlvs18.53±4.68pg/ml),TLR2(1.26±0.25vs0.99±0.21)水平明显升高,差异具有统计学意义(t=6.170,6.682,11.241,均P<0.05);与治疗前研究组比较,治疗后研究组外周血VPS33A(0.95±0.25)水平明显升高,IL-6(19.66±5.44 pg/ml),TLR2(1.11±0.2)水平明显降低,差异具有统计学意义(t-3.336,4.648,6.331,均P<0.05)。预后不良组外周血VPS33A水平(0.71±0.16)显著低于预后良好组(0.97±0.22);IL-6(26.41±7.16pg/ml),TLR2(1.35±0.26)水平显著高于预后良好组(19.40±4.21pg/ml,1.20±0.24),差异具有统计学意义(t=5.555,6.012,2.875,均P<0.05)。经Pearson法分析发现,治疗前外周血VPS33A分别与IL-6,TLR2水平呈负相关(r=-0.649,-0.634,均P<0.05)。ROC曲线分析结果显示VPS33A,IL-6和TLR2预测老年肺结核预后的AUC分别为0.805,0.842和0.882,三者联合AUC为0.971,明显高于三者单独预测(Z=4.010,3.136,2.285,P=0.001,0.002,0.022);Logistic回归分析显示外周血VPS33A,IL-6和TLR2是老年肺结核患者预后不良的影响因素 展开更多
关键词 空泡蛋白分类相关蛋白3A 肺结核
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基于加权支持向量机的膜蛋白类型预测中不平衡问题处理 被引量:2
8
作者 刘国平 姚莉秀 +1 位作者 杨杰 王猛 《上海交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1676-1679,1684,共5页
针对膜蛋白类型预测中普遍存在的不平衡样本问题,分析一般支持向量机(SVM)在处理不平衡样本时的缺陷,引入加权SVM来补偿由于训练集中的类别差异引起的分类结果偏向于多样本类别的问题.采用统计预测中的一致测试、交叉校验和独立测试方... 针对膜蛋白类型预测中普遍存在的不平衡样本问题,分析一般支持向量机(SVM)在处理不平衡样本时的缺陷,引入加权SVM来补偿由于训练集中的类别差异引起的分类结果偏向于多样本类别的问题.采用统计预测中的一致测试、交叉校验和独立测试方法进行测试.实验表明,不平衡处理后的效果非常理想,该方法可以成为现有方法一个有效的补充分析工具. 展开更多
关键词 生物膜蛋白分类预测 生物信息学 支持向量机 不平衡样本
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脑卒中并糖代谢异常患者血浆高密度脂蛋白胆固醇颗粒亚型分布特点
9
作者 涂志兰 储新娟 +4 位作者 杨化兰 叶军 周杭 陈阳 侯双兴 《中国药业》 CAS 2019年第S02期93-94,共2页
目的探讨脂蛋白亚型在脑卒中并糖代谢异常患者血浆中的分布特点及其与脑卒中糖代谢异常的关系。方法选取医院2015年10月至2017年9月收治的首发缺血性脑卒中患者150例,按空腹血糖水平分为正常糖耐量组(对照组)、糖尿病前期组和糖尿病组... 目的探讨脂蛋白亚型在脑卒中并糖代谢异常患者血浆中的分布特点及其与脑卒中糖代谢异常的关系。方法选取医院2015年10月至2017年9月收治的首发缺血性脑卒中患者150例,按空腹血糖水平分为正常糖耐量组(对照组)、糖尿病前期组和糖尿病组。采用LIPOPRINT脂蛋白分类检测系统检测高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)颗粒亚型,观察其在脑卒中并糖代谢异常患者血浆中的分布特点,同时收集2年卒中发生率等资料,分析HDL-C颗粒亚型与脑卒中糖代谢异常的相关性。结果糖尿病前期组和糖尿病组的大颗粒HDL浓度比正常糖耐量组分别下降了15.9%和22.5%(P<0.05);小颗粒HDL浓度比正常糖耐量组分别增加了11.6%和20.3%(P<0.05)。大颗粒HDL-C对2年脑卒中再发生事件有预测价值(HR=0.042,P<0.05)。结论脑卒中并糖代谢异常患者血浆HDL-C颗粒亚型分布具有大颗粒HDL-C波长降低,小颗粒HDL-C波长增加的特点,大颗粒HDL-C浓度可预测2年脑卒中再发生事件,可作为脑血管病早期发现糖代谢异常和卒中风险的预测指标。 展开更多
关键词 脑卒中 糖代谢异常 高密度脂蛋白胆固醇亚型 蛋白分类
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高脂血症的防治
10
作者 韩俊杰 常晓英 +2 位作者 乔锦 王俊峰 韩丹 《地质勘探安全》 1999年第1期46-48,共3页
关键词 高脂血症 防治措施 蛋白分类 早期治疗
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隐马尔可夫模型用于蛋白质序列分析 被引量:8
11
作者 吴晓明 宋长新 +1 位作者 王波 程敬之 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 2002年第3期455-458,共4页
隐马尔可夫模型 (Hidden Markov model,HMM)用于蛋白质研究是生物信息学研究的新领域。目前 ,人们已经得到大量的蛋白质序列和结构数据 ,传统研究蛋白质的方法已经不再实用 ,生物学家已经转向能够处理大量数据的统计方法来进行研究。隐... 隐马尔可夫模型 (Hidden Markov model,HMM)用于蛋白质研究是生物信息学研究的新领域。目前 ,人们已经得到大量的蛋白质序列和结构数据 ,传统研究蛋白质的方法已经不再实用 ,生物学家已经转向能够处理大量数据的统计方法来进行研究。隐马尔可夫模型可以通过训练 ,识别同一特征的蛋白质序列。从 SCOP数据库中选择了一个蛋白质族 ,由它得到了能够代表该族特征的隐马尔可夫模型 ,并用该模型对一些蛋白质序列进行分析。结果表明 ,HMM能够较好的表示同一族的蛋白质 。 展开更多
关键词 隐马尔可夫模型 SCOP数据库 蛋白分类 序列分析
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基于主成分分析的朴素贝叶斯噬菌体病毒蛋白分类
12
作者 徐思蓉 叶仁玉 冷婷 《皖西学院学报》 2024年第2期44-48,共5页
噬菌体病毒蛋白质分类是生物信息学热点问题之一。对朴素贝斯分类中的特征独立性假设以及病毒蛋白质特征提取问题,提出一种结合伪氨基酸组成(PAAC)和k间隔氨基酸组成(CKSAAP)的混合特征提取法,且将主成分分析朴素贝叶斯分类模型(PNBC)... 噬菌体病毒蛋白质分类是生物信息学热点问题之一。对朴素贝斯分类中的特征独立性假设以及病毒蛋白质特征提取问题,提出一种结合伪氨基酸组成(PAAC)和k间隔氨基酸组成(CKSAAP)的混合特征提取法,且将主成分分析朴素贝叶斯分类模型(PNBC)应用于噬菌体病毒蛋白分类问题。实证分析表明,相比于朴素贝叶斯和支持向量机模型,主成分分析朴素贝叶斯模型分类准确率达80%,效果最优。 展开更多
关键词 主成分分析 朴素贝叶斯 噬菌体 蛋白分类
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基于深度学习的蛋白质二级结构预测 被引量:5
13
作者 张安胜 王爱平 《计算机仿真》 CSCD 北大核心 2015年第1期392-396,共5页
后基因组时代的到来,蛋白质的数据量急剧增长。为对蛋白质结构进行准确预测,提出了一种深度学习的方法,来预测蛋白质的二级结构分类问题。采用由近似熵、疏水模式以及图像特征组成的伪氨基酸组分方法,来提取蛋白质序列的特征;预测模型... 后基因组时代的到来,蛋白质的数据量急剧增长。为对蛋白质结构进行准确预测,提出了一种深度学习的方法,来预测蛋白质的二级结构分类问题。采用由近似熵、疏水模式以及图像特征组成的伪氨基酸组分方法,来提取蛋白质序列的特征;预测模型采用了5层的深度玻尔兹曼机(DBM)+分类层,5层的DBM组成了4个RBM,分类层采用softmax分类器;同时采用了非监督学习和监督学习作为预测模型的训练策略。与现有预测方法相比,提出的预测方法,比目前较好的支持向量机(SVM),人工神经网络(ANN)精度均要高。实验结果表明,提出的改进方法具有很好的可行性和有效性。 展开更多
关键词 深度学习 蛋白质结构预测 伪氨基酸组分 蛋白分类
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结合位点进化距离与支持向量机的蛋白质分类方法 被引量:2
14
作者 李玉岗 张法 刘志勇 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2008年第1期43-50,共8页
生物信息学的一个关键的研究课题是理解细胞的分子机制,这依赖于对基因所决定的每一条蛋白质的含义或者功能的理解.一般通过与一条或多条功能已知的蛋白质的相似性比较来推测未知蛋白质的功能,其中,基于支持向量机的一些算法取得了很好... 生物信息学的一个关键的研究课题是理解细胞的分子机制,这依赖于对基因所决定的每一条蛋白质的含义或者功能的理解.一般通过与一条或多条功能已知的蛋白质的相似性比较来推测未知蛋白质的功能,其中,基于支持向量机的一些算法取得了很好的成果.SVM-pairwise算法是当前最好的基于支持向量机的算法中的一个,该方法利用两条序列的相似性来将蛋白质序列转化为固定长度的向量.文中提出了一种新的利用支持向量机算法对蛋白质序列进行分类的方法,这种方法使用位点进化距离代替两条序列的比对得分,该方法比SVM-pairwise有着显著的改善,在蛋白质结构分类数据库(SCOP)上进行的实验表明,该方法具有比SVM-pairwise更好的分类性能. 展开更多
关键词 生物信息学 内核 位点进化距离 支持向量机 蛋白质结构分类数据库
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基于网络模块性的蛋白质序列聚类 被引量:5
15
作者 梅娟 何胜 +2 位作者 王正祥 石贵阳 李炜疆 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期123-127,共5页
蛋白质的远同源性探测是结构基因组学和功能基因组学的主要研究任务之一。一些具有一定相似结构和功能、但序列相似性却较低的蛋白质组成蛋白质超家族,则远同源性探测问题等价于对蛋白质超家族的识别问题。作者提出了一种基于模块性的... 蛋白质的远同源性探测是结构基因组学和功能基因组学的主要研究任务之一。一些具有一定相似结构和功能、但序列相似性却较低的蛋白质组成蛋白质超家族,则远同源性探测问题等价于对蛋白质超家族的识别问题。作者提出了一种基于模块性的聚类算法ModuleFind,该方法通过最大化蛋白质网络的模块性来寻找具有较强集团结构的划分。在蛋白质结构分类数据库(SCOP)超家族层次上进行的实验表明,该方法得到的聚类结果更接近分类基准,且具有较高的F-测度值。 展开更多
关键词 蛋白质网络 序列相似性 远同源性 模块性 聚类 蛋白质结构分类数据库
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HIPPs响应植物重金属胁迫的调控机制
16
作者 臧辉 毕晓静 +3 位作者 何君毅 蔺超 张琪 张蕴薇 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期2276-2291,共16页
重金属相关异戊二烯化植物蛋白(HIPPs)是维管植物特征性蛋白之一,包含重金属相关结构域(HMA)和蛋白质C端异戊二烯化位点(CaaX基序)两种保守结构,在植物响应生物胁迫和非生物胁迫中发挥重要作用。本文分析了HIPPs蛋白质结构特征及其在不... 重金属相关异戊二烯化植物蛋白(HIPPs)是维管植物特征性蛋白之一,包含重金属相关结构域(HMA)和蛋白质C端异戊二烯化位点(CaaX基序)两种保守结构,在植物响应生物胁迫和非生物胁迫中发挥重要作用。本文分析了HIPPs蛋白质结构特征及其在不同植物中的进化与分类,概述了不同植物中HIPPs蛋白质亚细胞定位和HIPPs基因受重金属诱导表达情况,并对拟南芥(Arabidopsisthaliana)、水稻(Oryzasativa)及其他植物中不同HIPPs响应重金属胁迫的功能及调控机制进行了总结。通过综述不同HIPPs蛋白质结构分类与其响应重金属胁迫功能机制的关系,为后续不同植物HIPPs响应重金属胁迫的功能鉴定及机制解析提供理论依据。草类植物的抗逆研究对于改善生态环境具有重要意义,挖掘并鉴定草类植物中HIPPs蛋白质功能,为解析草类植物的逆境调控网络提供重要研究价值。 展开更多
关键词 HMA结构域 异戊二烯化 金属伴侣 维管植物 蛋白分类 蛋白质功能 重金属胁迫
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国内外反刍动物蛋白质营养价值评定体系的综述 被引量:2
17
作者 王玉婷 祁宏伟 +2 位作者 郎朝丽 吕阳 冯培功 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第8期69-70,共2页
国内外长期沿用的蛋白质营养价值评定体系,如可消化蛋白、粗蛋白和蛋白质生物学价值体系,虽然在动物生产中具有科学性,但也存在一些不足。自20世纪70年代以来,各国分别提出了新的蛋白质营养价值评定体系并不断进行完善。文章对国内外反... 国内外长期沿用的蛋白质营养价值评定体系,如可消化蛋白、粗蛋白和蛋白质生物学价值体系,虽然在动物生产中具有科学性,但也存在一些不足。自20世纪70年代以来,各国分别提出了新的蛋白质营养价值评定体系并不断进行完善。文章对国内外反刍动物常用的蛋白质营养价值评定体系进行综述。 展开更多
关键词 反刍动物 蛋白 营养价值 评定体系 蛋白分类
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蛋白质序列混沌特性的研究 被引量:2
18
作者 管维红 张立婷 +1 位作者 徐振源 朱平 《生物信息学》 2008年第4期148-151,共4页
为了研究蛋白质序列的特性,首先采用非线性预测方法,得到蛋白质序列的总体误差平均值图。并通过与随机序列,混沌序列的总体误差平均值图相比较,发现蛋白质序列有别于随机序列,和混沌序列很相似,则猜测蛋白质序列具有混沌特性。为了验证... 为了研究蛋白质序列的特性,首先采用非线性预测方法,得到蛋白质序列的总体误差平均值图。并通过与随机序列,混沌序列的总体误差平均值图相比较,发现蛋白质序列有别于随机序列,和混沌序列很相似,则猜测蛋白质序列具有混沌特性。为了验证该猜测,将蛋白质序列通过混沌随机游走描述方法转化为时间序列,并计算其最大Lyapunov指数。在选取的时间延迟和嵌入维数下,每类蛋白质序列的最大Lyapunov指数都大于零,从而得出蛋白质序列具有混沌特性的结论。 展开更多
关键词 蛋白质序列 非线性预测方法 混沌 最大LYAPUNOV指数 蛋白分类
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用非线性预测方法研究蛋白质序列的特性(Ⅰ) 被引量:1
19
作者 管维红 徐振源 朱平 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期71-75,共5页
通过详细HP模型将一条蛋白质序列构造为3个特征序列。其中蛋白质序列取自蛋白质分类数据库CATH,该库将蛋白质序列根据不同结构域分为4类(α主类,β主类,αβ类,低二级结构类)。然后采用非线性预测方法,研究每类蛋白质序列的特征序列,得... 通过详细HP模型将一条蛋白质序列构造为3个特征序列。其中蛋白质序列取自蛋白质分类数据库CATH,该库将蛋白质序列根据不同结构域分为4类(α主类,β主类,αβ类,低二级结构类)。然后采用非线性预测方法,研究每类蛋白质序列的特征序列,得到特征序列的误差比值(E-D)图。从图形上发现,每类蛋白质序列的每条特征序列的曲线起伏波动不断,具有特异性,且4类蛋白质序列对应特征序列的E-D图之间也有很大不同。 展开更多
关键词 非线性预测方法 蛋白质序列 蛋白分类
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超速离心高效液相色谱测定血清脂蛋白亚类和脂蛋白(a)胆固醇 被引量:1
20
作者 董军 国汉邦 +4 位作者 李红霞 满咏 王抒 黎健 陈文祥 《中国动脉硬化杂志》 CAS CSCD 2007年第7期539-540,共2页
关键词 生物化学 蛋白/分类 蛋白(a) 超速离心法 高效液相色谱法
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