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茉莉花香气相关基因JsGDS启动子的克隆及功能分析
被引量:
6
1
作者
崔萌
刘志钦
+1 位作者
叶乃兴
陈桂信
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第2期441-447,共7页
大根香叶烯合成酶在植物萜类化合物合成中具有重要作用。前期从茉莉花cDNA文库中克隆获得香气相关基因Js GDS基因,但是其表达调控机制还不是很清楚,本研究拟采用染色体步移法从茉莉花基因组中克隆了Js GDS上游1 646 bp的启动子序列。生...
大根香叶烯合成酶在植物萜类化合物合成中具有重要作用。前期从茉莉花cDNA文库中克隆获得香气相关基因Js GDS基因,但是其表达调控机制还不是很清楚,本研究拟采用染色体步移法从茉莉花基因组中克隆了Js GDS上游1 646 bp的启动子序列。生物信息学分析表明,该启动子片段中包含启动子的基本元件TATA-box和CAAT-box以及光调控元件、赤霉素应答元件、ABA应答元件、MeJA应答元件等多个与生长发育或者逆境胁迫相关的顺式作用元件。利用Gateway技术构建Js GDS启动子的GUS融合载体及其系列缺失体,并获得拟南芥遗传转化植株。对转基因拟南芥进行GUS组织化学染色。结果表明,Js GDS启动子及缺失体均具有驱动下游基因转录的活性。本研究为进一步探究Js GDS基因的调控和表达机制提供理论依据。
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关键词
茉莉花
(
jasminum
sambac)
大根香叶烯合成酶
启动子
GUS染色
原文传递
茉莉花MK基因及启动子克隆与表达分析
被引量:
2
2
作者
陈笛
郑玉成
+4 位作者
林浥
郑知临
王鹏杰
陈桂信
叶乃兴
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期772-779,共8页
甲羟戊酸激酶在植物萜类化合物合成中具有重要作用。本研究以茉莉花转录组测序数据为基础,利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,从双瓣茉莉花中获得甲羟戊酸激酶(mevalonate kinase,MK)基因,命名为JsMK(GenBank登录号为MH311040)。测...
甲羟戊酸激酶在植物萜类化合物合成中具有重要作用。本研究以茉莉花转录组测序数据为基础,利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,从双瓣茉莉花中获得甲羟戊酸激酶(mevalonate kinase,MK)基因,命名为JsMK(GenBank登录号为MH311040)。测序结果显示JsMK全长cDNA为1608 bp,包含开放阅读框(ORF)1164 bp,编码387个氨基酸。生物信息学分析结果表明该基因编码的蛋白可能定位于细胞质中,为非亲水性稳定蛋白,含有与其他MK蛋白所共有的3个保守区,以及GHMP家族特有的N端保守区和C端保守区。Blast比对和系统进化树分析结果表明,JsMK蛋白与野生油橄榄、长春花等多种植物的MK蛋白同源性较高。采用染色体步移技术(Genenome walking technique)扩增MK基因5’端上游调控序列,获得709 bp启动子序列,PlantCare分析表明该序列含有大量基本顺式作用元件TATAbox、CAATbox,还存在生长素(IAA)、茉莉酸甲酯(MeJA)、脱落酸(ABA)等激素响应激素及多个光响应顺式调控元件。利用实时荧光定量PCR检测Js MK在IAA、MeJA、ABA处理下的表达水平。结果表明,JsMK同时受IAA、MeJA及ABA不同程度的诱导表达,其中MeJA对其诱导最明显。本研究通过从茉莉花中克隆并分析JsMK基因及其启动子序列,为进一步研究JsMK基因在萜类合成调控的功能提供科学依据。
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关键词
茉莉花
(
jasminum
sambac)
MVA途径
甲羟戊酸激酶基因
启动子
表达分析
原文传递
基于GC-MS和网络药理学探究茉莉花根挥发油镇静安神作用
3
作者
陈睿
潘小芳
+3 位作者
杨楠
霍丽妮
陈姎玲
梁天坚
《湖北农业科学》
2023年第11期84-91,96,共9页
基于GC-MS(气相色谱质谱联用仪,Gaschromatography-mass spectrometry)和网络药理学探究茉莉花(Jasminum sambac)根挥发油镇静安神的作用机制。利用GC-MS技术分析茉莉花根挥发油成分;借助TCMSP、Swiss Target Prediction等数据库筛选出...
基于GC-MS(气相色谱质谱联用仪,Gaschromatography-mass spectrometry)和网络药理学探究茉莉花(Jasminum sambac)根挥发油镇静安神的作用机制。利用GC-MS技术分析茉莉花根挥发油成分;借助TCMSP、Swiss Target Prediction等数据库筛选出潜在靶点,再通过CTD(http://ctdbase.org/)数据库查询“insomnia”的相关靶点;利用Venny作图软件(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index. html)取交集靶点,利用STRING数据库(https://string-db. org/cgi/input. pl)构建蛋白互作网络(Protein-protein interaction network,PPI),筛选核心作用靶点;利用Cytoscape 3.7.2软件绘制活性成分-靶点-通路网络图,经GO注释和KEGG富集分析预测主要靶点及信号通路;最后,利用分子对接软件SYBYL对主要活性成分与其核心靶点进行对接验证。结果表明,从茉莉花根中共鉴定23个化合物,筛选出12个活性成分,77个靶点。主要作用于CYP19A1、NCOA2、PTGS1、AR、SLC6A2、CA1等多个靶点,影响神经活性配体受体相互作用、癌症通路等多条信号通路,从而发挥作用。分子对接结果显示,大部分活性成分与其核心靶点结合性能较好,主要通过疏水键和氢键相互作用。
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关键词
茉莉花
(
jasminum
sambac)
根
挥发油
GC-MS(气相色谱质谱联用仪)
网络药理学
镇静安神作用
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职称材料
题名
茉莉花香气相关基因JsGDS启动子的克隆及功能分析
被引量:
6
1
作者
崔萌
刘志钦
叶乃兴
陈桂信
机构
福建农林大学园艺学院
福建农林大学农学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第2期441-447,共7页
基金
福州市科技计划项目(2017-N-30)
福建省自然科学基金(2016J01110)共同资助。
文摘
大根香叶烯合成酶在植物萜类化合物合成中具有重要作用。前期从茉莉花cDNA文库中克隆获得香气相关基因Js GDS基因,但是其表达调控机制还不是很清楚,本研究拟采用染色体步移法从茉莉花基因组中克隆了Js GDS上游1 646 bp的启动子序列。生物信息学分析表明,该启动子片段中包含启动子的基本元件TATA-box和CAAT-box以及光调控元件、赤霉素应答元件、ABA应答元件、MeJA应答元件等多个与生长发育或者逆境胁迫相关的顺式作用元件。利用Gateway技术构建Js GDS启动子的GUS融合载体及其系列缺失体,并获得拟南芥遗传转化植株。对转基因拟南芥进行GUS组织化学染色。结果表明,Js GDS启动子及缺失体均具有驱动下游基因转录的活性。本研究为进一步探究Js GDS基因的调控和表达机制提供理论依据。
关键词
茉莉花
(
jasminum
sambac)
大根香叶烯合成酶
启动子
GUS染色
Keywords
jasminum
sambac
Germacrene D synthase
Promoter
GUS staining
分类号
S685.16 [农业科学—观赏园艺]
原文传递
题名
茉莉花MK基因及启动子克隆与表达分析
被引量:
2
2
作者
陈笛
郑玉成
林浥
郑知临
王鹏杰
陈桂信
叶乃兴
机构
福建农林大学园艺学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期772-779,共8页
基金
福州市科技计划项目(2017-N-30)
福建省自然科学基金(2016J01110)
福建农林大学科技创新专项基金项目(CXZX2018077)共同资助。
文摘
甲羟戊酸激酶在植物萜类化合物合成中具有重要作用。本研究以茉莉花转录组测序数据为基础,利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,从双瓣茉莉花中获得甲羟戊酸激酶(mevalonate kinase,MK)基因,命名为JsMK(GenBank登录号为MH311040)。测序结果显示JsMK全长cDNA为1608 bp,包含开放阅读框(ORF)1164 bp,编码387个氨基酸。生物信息学分析结果表明该基因编码的蛋白可能定位于细胞质中,为非亲水性稳定蛋白,含有与其他MK蛋白所共有的3个保守区,以及GHMP家族特有的N端保守区和C端保守区。Blast比对和系统进化树分析结果表明,JsMK蛋白与野生油橄榄、长春花等多种植物的MK蛋白同源性较高。采用染色体步移技术(Genenome walking technique)扩增MK基因5’端上游调控序列,获得709 bp启动子序列,PlantCare分析表明该序列含有大量基本顺式作用元件TATAbox、CAATbox,还存在生长素(IAA)、茉莉酸甲酯(MeJA)、脱落酸(ABA)等激素响应激素及多个光响应顺式调控元件。利用实时荧光定量PCR检测Js MK在IAA、MeJA、ABA处理下的表达水平。结果表明,JsMK同时受IAA、MeJA及ABA不同程度的诱导表达,其中MeJA对其诱导最明显。本研究通过从茉莉花中克隆并分析JsMK基因及其启动子序列,为进一步研究JsMK基因在萜类合成调控的功能提供科学依据。
关键词
茉莉花
(
jasminum
sambac)
MVA途径
甲羟戊酸激酶基因
启动子
表达分析
Keywords
jasminum
sambac
Mevalonate pathway
Mevalonate kinase gene
Promoter
Expression analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S685.16 [农业科学—观赏园艺]
原文传递
题名
基于GC-MS和网络药理学探究茉莉花根挥发油镇静安神作用
3
作者
陈睿
潘小芳
杨楠
霍丽妮
陈姎玲
梁天坚
机构
广西中医药大学药学院
广西中医药大学赛恩斯新医药学院
出处
《湖北农业科学》
2023年第11期84-91,96,共9页
基金
广西自然科学基金面上项目(2017JJA10613)
广西中青年教师基础能力提升项目(KY2016YB830)
+3 种基金
大学生创新课题(201913643001,201913643035,201913643003)
广西中药大学赛恩斯新医药学院课题(2019ZD01)
2020年大学生创新创业训练项目(202013643003)
广西一流学科建设项目(2018XK048)。
文摘
基于GC-MS(气相色谱质谱联用仪,Gaschromatography-mass spectrometry)和网络药理学探究茉莉花(Jasminum sambac)根挥发油镇静安神的作用机制。利用GC-MS技术分析茉莉花根挥发油成分;借助TCMSP、Swiss Target Prediction等数据库筛选出潜在靶点,再通过CTD(http://ctdbase.org/)数据库查询“insomnia”的相关靶点;利用Venny作图软件(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index. html)取交集靶点,利用STRING数据库(https://string-db. org/cgi/input. pl)构建蛋白互作网络(Protein-protein interaction network,PPI),筛选核心作用靶点;利用Cytoscape 3.7.2软件绘制活性成分-靶点-通路网络图,经GO注释和KEGG富集分析预测主要靶点及信号通路;最后,利用分子对接软件SYBYL对主要活性成分与其核心靶点进行对接验证。结果表明,从茉莉花根中共鉴定23个化合物,筛选出12个活性成分,77个靶点。主要作用于CYP19A1、NCOA2、PTGS1、AR、SLC6A2、CA1等多个靶点,影响神经活性配体受体相互作用、癌症通路等多条信号通路,从而发挥作用。分子对接结果显示,大部分活性成分与其核心靶点结合性能较好,主要通过疏水键和氢键相互作用。
关键词
茉莉花
(
jasminum
sambac)
根
挥发油
GC-MS(气相色谱质谱联用仪)
网络药理学
镇静安神作用
Keywords
jasminum
sambac
root
volatile oil
gaschromatography-mass spectrometry(GC-MS)
network pharmacology
the se⁃dation and hypnosis effect
分类号
R965.1 [医药卫生—药理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
茉莉花香气相关基因JsGDS启动子的克隆及功能分析
崔萌
刘志钦
叶乃兴
陈桂信
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021
6
原文传递
2
茉莉花MK基因及启动子克隆与表达分析
陈笛
郑玉成
林浥
郑知临
王鹏杰
陈桂信
叶乃兴
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
原文传递
3
基于GC-MS和网络药理学探究茉莉花根挥发油镇静安神作用
陈睿
潘小芳
杨楠
霍丽妮
陈姎玲
梁天坚
《湖北农业科学》
2023
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