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蛋白质系统突变分析及系综优化算法的计算机实现
1
作者
沈称意
李冯
+2 位作者
彭新俊
刘祥
王翼飞
《上海大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期377-382,共6页
蛋白质突变分析是研究蛋白质活性位点、蛋白质相互作用分析及蛋白质功能的重要手段,由于常规的实验方法费时费力,计算机模拟蛋白质位点系统突变,并对突变的效果作合理的评价就显得尤为重要.介绍了计算机模拟蛋白质位点系统突变的实现方...
蛋白质突变分析是研究蛋白质活性位点、蛋白质相互作用分析及蛋白质功能的重要手段,由于常规的实验方法费时费力,计算机模拟蛋白质位点系统突变,并对突变的效果作合理的评价就显得尤为重要.介绍了计算机模拟蛋白质位点系统突变的实现方法,利用系综优化算法对各突变体的自由能进行计算,并提出合理的评估标准.与现有的生物学实验结果相比较,计算机模拟计算的正确率为69.23%,假阳性率为30.77%.
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关键词
自治
系综
优化
蛋白质系统突变
突变分析
可及表面积
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职称材料
题名
蛋白质系统突变分析及系综优化算法的计算机实现
1
作者
沈称意
李冯
彭新俊
刘祥
王翼飞
机构
上海大学理学院
出处
《上海大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期377-382,共6页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(2006AA02Z190)
文摘
蛋白质突变分析是研究蛋白质活性位点、蛋白质相互作用分析及蛋白质功能的重要手段,由于常规的实验方法费时费力,计算机模拟蛋白质位点系统突变,并对突变的效果作合理的评价就显得尤为重要.介绍了计算机模拟蛋白质位点系统突变的实现方法,利用系综优化算法对各突变体的自由能进行计算,并提出合理的评估标准.与现有的生物学实验结果相比较,计算机模拟计算的正确率为69.23%,假阳性率为30.77%.
关键词
自治
系综
优化
蛋白质系统突变
突变分析
可及表面积
Keywords
self-consistent ensemble optimization
protein systematic mutation
mutation analysis
accessible surface area （ASA）
分类号
O224 [理学—运筹学与控制论]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蛋白质系统突变分析及系综优化算法的计算机实现
沈称意
李冯
彭新俊
刘祥
王翼飞
《上海大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008
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