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核酸脱氨酶的研究进展
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作者 张宇 高瞻 《生命的化学》 CAS 2023年第6期863-871,共9页
核酸脱氨酶是一类以DNA或RNA为底物,催化其胞嘧啶或腺嘌呤脱氨基的锌离子依赖酶,可引起碱基的改变,在生物体的免疫防御、神经调控等多种生理过程中扮演重要角色,并且已有多种脱氨酶被开发为精准高效的碱基编辑器。该文就核酸脱氨酶的结... 核酸脱氨酶是一类以DNA或RNA为底物,催化其胞嘧啶或腺嘌呤脱氨基的锌离子依赖酶,可引起碱基的改变,在生物体的免疫防御、神经调控等多种生理过程中扮演重要角色,并且已有多种脱氨酶被开发为精准高效的碱基编辑器。该文就核酸脱氨酶的结构与功能特征进行系统概述,并探讨了该类酶的起源与演化,为后续有关研究与应用提供参考。 展开更多
关键词 胞苷脱氨酶 苷脱氨酶 胞嘧啶碱基编辑器 腺嘌呤碱基编辑器 进化
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基于CRISPR/Cas系统的DNA碱基编辑技术及其在生物医学和农业中的应用 被引量:4
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作者 余传照 莫健新 +2 位作者 赵鑫 李国玲 张献伟 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期3071-3087,共17页
近年来,基于成簇的规律间隔短回文重复序列及其相关系统(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein,CRISPR/Cas)的基因编辑技术飞速发展,该系统可以利用同源定向重组(Homology directed re... 近年来,基于成簇的规律间隔短回文重复序列及其相关系统(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein,CRISPR/Cas)的基因编辑技术飞速发展,该系统可以利用同源定向重组(Homology directed repair,HDR)来完成其介导的精准编辑,但效率极低,限制了其在农业和生物医学等领域上的推广应用。基于CRISPR/Cas系统的DNA碱基编辑技术作为一种新兴的基因组编辑技术,能在不产生双链断裂的情况下实现碱基的定向突变,相对于CRISPR/Cas介导的HDR编辑具有更高的编辑效率和特异性。目前,已开发出了可将C碱基突变为T碱基的胞嘧啶碱基编辑器(Cytidine base editors,CBE),将A碱基突变为G碱基的腺嘌呤碱基编辑器(Adenine base editors,ABE),以及可实现碱基任意变换和小片段精准插入和缺失的Prime编辑器(Prime editors,PE)。另外,能实现C到G颠换的糖基化酶碱基编辑器(Glycosylase base editors,GBE)以及能同时编辑A和C两种底物的双碱基编辑器也已被开发出来。文中主要综述了几种DNA碱基编辑器的开发历程、研究进展及各自优点和局限性;介绍了DNA碱基编辑技术在生物医学以及农业中的成功应用案例,以期为DNA碱基编辑器的进一步优化和选择应用提供借鉴。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas 碱基编辑 胞嘧啶碱基编辑器 腺嘌呤碱基编辑器 Prime编辑器
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碱基编辑系统研究最新进展及应用 被引量:4
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作者 徐鑫 刘明军 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期2307-2321,共15页
CRISPR系统能够在基因组DNA中完成精准编辑,但依赖于细胞内的同源重组(Homologydirected recombination,HDR)修复途径,且效率极低。基于CRISPR/Cas9系统开发的碱基编辑技术(Base editing)通过将失去切割活性的核酸酶与不同碱基脱氨基酶... CRISPR系统能够在基因组DNA中完成精准编辑,但依赖于细胞内的同源重组(Homologydirected recombination,HDR)修复途径,且效率极低。基于CRISPR/Cas9系统开发的碱基编辑技术(Base editing)通过将失去切割活性的核酸酶与不同碱基脱氨基酶融合,构建了两套碱基编辑系统(Baseeditors,BE):胞嘧啶碱基编辑器(Cytosine base editor,CBE)和腺嘌呤碱基编辑器(Adenine base editor,ABE)。这两类编辑器分别能够在不产生DNA双链断裂的前提下在基因靶位点完成C>T (G>A)或A>G (T>C)的替换,最终实现精准的碱基编辑。目前碱基编辑技术已经广泛应用于基因治疗、动物模型构建、精准动物育种和基因功能分析等领域,为基础和应用研究提供了强大的技术工具。文中概括了碱基编辑技术的研发过程、技术优势、应用现状、存在问题及改进策略,以期为相关领域的科研人员了解和使用碱基编辑系统提供参考。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 碱基编辑 胞嘧啶碱基编辑器 腺嘌呤碱基编辑器
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腺嘌呤碱基编辑器ABE8e多聚体的形成机制研究及抑制策略
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作者 周项 朱海霞 黄强 《工业微生物》 CAS 2022年第6期1-9,共9页
研究腺嘌呤碱基编辑器ABE8e(以下简称ABE8e)多聚化的成因,降低其多聚体的比例,为ABE8e的制备提供技术支持。首先,运用分子建模软件分析ABE8e的三维结构,了解多聚体的成因,在此基础上构建了相应的突变体ABE8e-T,并对其进行纯化,验证理论... 研究腺嘌呤碱基编辑器ABE8e(以下简称ABE8e)多聚化的成因,降低其多聚体的比例,为ABE8e的制备提供技术支持。首先,运用分子建模软件分析ABE8e的三维结构,了解多聚体的成因,在此基础上构建了相应的突变体ABE8e-T,并对其进行纯化,验证理论分析的正确性。在确认聚集原因后,为了降低ABE8e多聚体的比例,针对性地优化了ABE8e的缓冲体系。在结构信息的指导下,发现ABE8e二聚化界面中疏水区域的曝露导致了分子间聚集。突变体ABE8e-T(R64L/R74E)的纯化结果显示,二聚化界面进一步打开后,多聚体比例增多。缓冲体系优化结果表明,在现有缓冲体系中添加0.5 mol/L精氨酸,能中和分子表面的疏水性,从而降低了ABE8e的多聚体比例。结论:在ABE8e未形成二聚体的情况下,曝露了二聚化界面的疏水性区域,导致其分子间聚集,形成了多聚体。通过在缓冲液中添加精氨酸可以减弱分子间疏水作用,降低了多聚体的比例。因此,基于结构的分析方法可以精准地分析多聚体的成因,加速了下游工艺的开发,优化后的缓冲体系可为ABE8e的纯化和制备提供有用技术支持。 展开更多
关键词 蛋白质纯化 腺嘌呤碱基编辑器 ABE8e 多聚体去除
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单碱基编辑技术在动物中的应用 被引量:1
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作者 陈力 王静 +3 位作者 吴平先 张廷焕 郭宗义 王金勇 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2023年第23期21-25,31,130-132,共9页
近年发展起来的人工核酸酶技术可引起特定位点的DNA双链断裂,断裂后通过同源重组修复机制使精准单碱基编辑成为可能。基于CRISPR/Cas9将Cas9n与胞嘧啶脱氨酶或腺苷脱氨酶融合而开发出的单碱基编辑系统可进一步提高单碱基编辑的效率和精... 近年发展起来的人工核酸酶技术可引起特定位点的DNA双链断裂,断裂后通过同源重组修复机制使精准单碱基编辑成为可能。基于CRISPR/Cas9将Cas9n与胞嘧啶脱氨酶或腺苷脱氨酶融合而开发出的单碱基编辑系统可进一步提高单碱基编辑的效率和精确度,在不造成DNA双链断裂的情况下实现精准单碱基编辑。对动物进行单碱基编辑不仅有望提高其生产性能,而且能为人类疾病研究作出重要贡献。文章回顾了单碱基编辑系统的发展历程,重点介绍了单碱基编辑系统在动物中的应用,并对单碱基编辑系统在动物中的应用前景进行了展望,以期为动物基因编辑技术的研发和应用提供理论依据和应用案例。 展开更多
关键词 同源重组 碱基编辑系统 胞嘧啶碱基编辑器 腺嘌呤碱基编辑器 糖基化酶碱基编辑器 引导编辑器
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